MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori ELS37 plasmid pHPELS37

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017064	AAC	2	6	14	19	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017064	T	6	6	40	45	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017064	CAA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017064	AAAG	3	12	121	132	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017064	TAG	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017064	CAA	2	6	214	219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017064	T	6	6	315	320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017064	AG	3	6	348	353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017064	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017064	GCAT	2	8	407	414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017064	C	6	6	423	428	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_017064	TG	3	6	538	543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017064	AAC	2	6	589	594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017064	A	7	7	717	723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017064	A	6	6	730	735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017064	AAACA	2	10	781	790	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017064	AGG	2	6	801	806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017064	TCA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017064	A	6	6	863	868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017064	CAGA	2	8	869	876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017064	TAG	2	6	920	925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017064	A	6	6	942	947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017064	AATC	2	8	997	1004	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017064	CAA	2	6	1008	1013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017064	T	6	6	1038	1043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017064	ACAA	2	8	1049	1056	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017064	TTG	2	6	1116	1121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017064	TTAAA	2	10	1142	1151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017064	TTAG	2	8	1313	1320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017064	GGT	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017064	T	7	7	1419	1425	0 %	100 %	0 %	0 %	383750636
32	NC_017064	GTT	2	6	1438	1443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750636
33	NC_017064	T	6	6	1448	1453	0 %	100 %	0 %	0 %	383750636
34	NC_017064	T	6	6	1459	1464	0 %	100 %	0 %	0 %	383750636
35	NC_017064	CAAC	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	383750636
36	NC_017064	A	6	6	1498	1503	100 %	0 %	0 %	0 %	383750636
37	NC_017064	CTAC	2	8	1515	1522	25 %	25 %	0 %	50 %	383750636
38	NC_017064	A	6	6	1528	1533	100 %	0 %	0 %	0 %	383750636
39	NC_017064	A	6	6	1537	1542	100 %	0 %	0 %	0 %	383750636
40	NC_017064	CA	3	6	1549	1554	50 %	0 %	0 %	50 %	383750636
41	NC_017064	AAGAA	2	10	1578	1587	80 %	0 %	20 %	0 %	383750636
42	NC_017064	TGT	2	6	1653	1658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750637
43	NC_017064	ATG	2	6	1706	1711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750637
44	NC_017064	ATT	2	6	1723	1728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750637
45	NC_017064	ATG	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750637
46	NC_017064	TTG	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750637
47	NC_017064	TTG	2	6	1902	1907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750637
48	NC_017064	T	6	6	1936	1941	0 %	100 %	0 %	0 %	383750637
49	NC_017064	ACC	2	6	1945	1950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383750637
50	NC_017064	TCA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750637
51	NC_017064	T	6	6	2020	2025	0 %	100 %	0 %	0 %	383750637
52	NC_017064	CAAG	2	8	2034	2041	50 %	0 %	25 %	25 %	383750637
53	NC_017064	TGAT	2	8	2060	2067	25 %	50 %	25 %	0 %	383750637
54	NC_017064	ATC	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750637
55	NC_017064	T	7	7	2102	2108	0 %	100 %	0 %	0 %	383750637
56	NC_017064	ATTTG	2	10	2196	2205	20 %	60 %	20 %	0 %	383750637
57	NC_017064	TTCT	2	8	2237	2244	0 %	75 %	0 %	25 %	383750637
58	NC_017064	GCAT	2	8	2277	2284	25 %	25 %	25 %	25 %	383750637
59	NC_017064	GTA	2	6	2299	2304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750638
60	NC_017064	TTC	2	6	2318	2323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750638
61	NC_017064	TTG	2	6	2444	2449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750638
62	NC_017064	CAA	2	6	2578	2583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750638
63	NC_017064	T	6	6	2590	2595	0 %	100 %	0 %	0 %	383750638
64	NC_017064	T	6	6	2658	2663	0 %	100 %	0 %	0 %	383750638
65	NC_017064	G	6	6	2666	2671	0 %	0 %	100 %	0 %	383750638
66	NC_017064	T	6	6	2672	2677	0 %	100 %	0 %	0 %	383750638
67	NC_017064	CATG	2	8	2694	2701	25 %	25 %	25 %	25 %	383750638
68	NC_017064	T	7	7	2711	2717	0 %	100 %	0 %	0 %	383750638
69	NC_017064	TTGTTT	2	12	2899	2910	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383750638
70	NC_017064	T	6	6	2989	2994	0 %	100 %	0 %	0 %	383750638
71	NC_017064	CT	3	6	3103	3108	0 %	50 %	0 %	50 %	383750638
72	NC_017064	AAG	2	6	3219	3224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750638
73	NC_017064	TTG	2	6	3248	3253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750638
74	NC_017064	CT	3	6	3391	3396	0 %	50 %	0 %	50 %	383750638
75	NC_017064	CAC	2	6	3414	3419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383750638
76	NC_017064	TGT	2	6	3423	3428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750638
77	NC_017064	T	6	6	3437	3442	0 %	100 %	0 %	0 %	383750638
78	NC_017064	AAT	2	6	3452	3457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750638
79	NC_017064	TTA	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750638
80	NC_017064	GGT	2	6	3628	3633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383750638
81	NC_017064	GGT	2	6	3685	3690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383750638
82	NC_017064	TTG	2	6	3702	3707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750638
83	NC_017064	TTTTTC	2	12	3715	3726	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383750638
84	NC_017064	TTTTGT	2	12	3821	3832	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383750638
85	NC_017064	TTC	2	6	3868	3873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750638
86	NC_017064	TAA	2	6	3874	3879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750638
87	NC_017064	ATA	2	6	3974	3979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017064	TTA	2	6	4023	4028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017064	ACT	2	6	4079	4084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017064	CCT	2	6	4108	4113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017064	TTA	2	6	4218	4223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017064	TAA	2	6	4241	4246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017064	AAG	2	6	4263	4268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017064	AAG	2	6	4285	4290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017064	AAG	2	6	4307	4312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017064	AAG	2	6	4329	4334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017064	AAG	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017064	CG	4	8	4438	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017064	A	6	6	4464	4469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017064	TAA	2	6	4491	4496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017064	AAC	2	6	4498	4503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017064	AGTTTT	2	12	4529	4540	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017064	T	6	6	4547	4552	0 %	100 %	0 %	0 %	383750639
104	NC_017064	CGCTT	2	10	4662	4671	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017064	TCTTGT	2	12	4817	4828	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383750640
106	NC_017064	ATC	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750640
107	NC_017064	TAAC	2	8	4977	4984	50 %	25 %	0 %	25 %	383750640
108	NC_017064	AC	3	6	5077	5082	50 %	0 %	0 %	50 %	383750640
109	NC_017064	A	6	6	5102	5107	100 %	0 %	0 %	0 %	383750640
110	NC_017064	TTG	2	6	5120	5125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750640
111	NC_017064	A	7	7	5174	5180	100 %	0 %	0 %	0 %	383750640
112	NC_017064	ATC	2	6	5203	5208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750640
113	NC_017064	T	7	7	5211	5217	0 %	100 %	0 %	0 %	383750640

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.