MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori ELS37 chromosome

Total Repeats: 34667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017063	TGAG	2	8	27	34	25 %	25 %	50 %	0 %	383749064
2	NC_017063	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383749064
3	NC_017063	TTCT	2	8	259	266	0 %	75 %	0 %	25 %	383749064
4	NC_017063	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749064
5	NC_017063	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	383749064
6	NC_017063	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	383749064
7	NC_017063	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749064
8	NC_017063	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383749064
9	NC_017063	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	383749064
10	NC_017063	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383749065
11	NC_017063	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	383749065
12	NC_017063	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383749065
13	NC_017063	CT	3	6	691	696	0 %	50 %	0 %	50 %	383749065
14	NC_017063	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749065
15	NC_017063	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	383749065
16	NC_017063	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383749065
17	NC_017063	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	383749066
18	NC_017063	TCA	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749066
19	NC_017063	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383749066
20	NC_017063	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383749066
21	NC_017063	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383749066
22	NC_017063	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	383749066
23	NC_017063	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	383749066
24	NC_017063	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	383749066
25	NC_017063	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	383749066
26	NC_017063	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383749066
27	NC_017063	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	383749066
28	NC_017063	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	383749066
29	NC_017063	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383749066
30	NC_017063	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749066
31	NC_017063	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017063	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017063	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017063	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017063	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017063	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017063	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017063	T	7	7	1976	1982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017063	TTC	2	6	1985	1990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017063	TGG	2	6	2044	2049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017063	TCA	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017063	G	6	6	2190	2195	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017063	GATTA	2	10	2249	2258	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017063	ATTC	2	8	2350	2357	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017063	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	383749067
46	NC_017063	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	383749067
47	NC_017063	TGA	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383749067
48	NC_017063	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	383749067
49	NC_017063	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	383749067
50	NC_017063	GAA	3	9	2877	2885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383749067
51	NC_017063	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	383749067
52	NC_017063	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383749067
53	NC_017063	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383749067
54	NC_017063	AAG	2	6	3094	3099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383749067
55	NC_017063	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383749067
56	NC_017063	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383749067
57	NC_017063	AG	3	6	3228	3233	50 %	0 %	50 %	0 %	383749068
58	NC_017063	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	383749068
59	NC_017063	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	383749068
60	NC_017063	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	383749068
61	NC_017063	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749068
62	NC_017063	CTA	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749068
63	NC_017063	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749068
64	NC_017063	ACA	2	6	3774	3779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383749068
65	NC_017063	ATAG	2	8	3834	3841	50 %	25 %	25 %	0 %	383749068
66	NC_017063	A	7	7	3866	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	383749068
67	NC_017063	TGT	2	6	3918	3923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749068
68	NC_017063	TGG	2	6	3976	3981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383749068
69	NC_017063	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017063	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017063	TGG	2	6	4174	4179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017063	TGG	2	6	4304	4309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017063	GTG	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017063	ACC	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017063	GGT	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017063	T	8	8	4607	4614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017063	AAC	2	6	4687	4692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017063	ATA	2	6	4735	4740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017063	GTTAGT	2	12	4764	4775	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017063	TAA	2	6	4813	4818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017063	TTA	2	6	4822	4827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017063	T	7	7	4839	4845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017063	A	6	6	4850	4855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017063	A	6	6	4866	4871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017063	TGT	2	6	4905	4910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017063	TTTTA	2	10	4924	4933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017063	AAG	2	6	4999	5004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017063	T	6	6	5008	5013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017063	CTTAA	2	10	5025	5034	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017063	ACTA	2	8	5048	5055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017063	C	7	7	5091	5097	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_017063	A	7	7	5098	5104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017063	A	6	6	5113	5118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017063	A	6	6	5129	5134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017063	CCT	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017063	A	8	8	5160	5167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017063	A	7	7	5193	5199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017063	A	6	6	5222	5227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017063	A	7	7	5230	5236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017063	C	6	6	5241	5246	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_017063	A	6	6	5257	5262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017063	TGC	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383749069
103	NC_017063	TCGC	2	8	5423	5430	0 %	25 %	25 %	50 %	383749069
104	NC_017063	ATTC	2	8	5452	5459	25 %	50 %	0 %	25 %	383749069
105	NC_017063	CATT	2	8	5496	5503	25 %	50 %	0 %	25 %	383749069
106	NC_017063	ATT	2	6	5518	5523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383749069
107	NC_017063	TGG	2	6	5616	5621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383749069
108	NC_017063	TGA	2	6	5631	5636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383749069
109	NC_017063	A	6	6	5728	5733	100 %	0 %	0 %	0 %	383749069
110	NC_017063	TCT	2	6	5755	5760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749069
111	NC_017063	T	6	6	5760	5765	0 %	100 %	0 %	0 %	383749069
112	NC_017063	A	6	6	5770	5775	100 %	0 %	0 %	0 %	383749069
113	NC_017063	GTT	2	6	5818	5823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749069
114	NC_017063	TAA	2	6	5887	5892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383749069
115	NC_017063	TTA	2	6	5945	5950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383749069
116	NC_017063	GTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383749069
117	NC_017063	GTT	2	6	6034	6039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749069
118	NC_017063	GTGC	2	8	6074	6081	0 %	25 %	50 %	25 %	383749069
119	NC_017063	GTT	2	6	6190	6195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749069
120	NC_017063	CAT	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749069
121	NC_017063	T	6	6	6286	6291	0 %	100 %	0 %	0 %	383749069
122	NC_017063	GCTTGC	2	12	6320	6331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383749069
123	NC_017063	CAG	2	6	6366	6371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383749069
124	NC_017063	TCA	2	6	6560	6565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749069
125	NC_017063	TGT	2	6	6675	6680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749069
126	NC_017063	TAC	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749069
127	NC_017063	GCTA	2	8	6691	6698	25 %	25 %	25 %	25 %	383749069
128	NC_017063	ATT	2	6	6703	6708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383749069
129	NC_017063	CTA	2	6	6710	6715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383749069
130	NC_017063	CAC	2	6	6738	6743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383749069
131	NC_017063	CAG	2	6	6753	6758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383749069
132	NC_017063	TTTG	2	8	6759	6766	0 %	75 %	25 %	0 %	383749069
133	NC_017063	GTAGGT	2	12	6772	6783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383749069
134	NC_017063	CTT	2	6	6831	6836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749069
135	NC_017063	TTG	2	6	6844	6849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749069
136	NC_017063	TGGT	2	8	6958	6965	0 %	50 %	50 %	0 %	383749069
137	NC_017063	AAC	2	6	6973	6978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383749069
138	NC_017063	TGCCAT	2	12	6999	7010	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383749069
139	NC_017063	CCG	2	6	7053	7058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383749069
140	NC_017063	T	6	6	7101	7106	0 %	100 %	0 %	0 %	383749069
141	NC_017063	ATCG	2	8	7141	7148	25 %	25 %	25 %	25 %	383749069
142	NC_017063	GCT	2	6	7168	7173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383749069
143	NC_017063	CGTT	2	8	7176	7183	0 %	50 %	25 %	25 %	383749069
144	NC_017063	GTT	2	6	7198	7203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383749069
145	NC_017063	A	6	6	7315	7320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017063	GA	9	18	7354	7371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017063	T	7	7	7381	7387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017063	ATT	2	6	7461	7466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017063	T	12	12	7481	7492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017063	T	6	6	7523	7528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017063	GTTT	2	8	7533	7540	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017063	GGT	2	6	7542	7547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017063	TTTG	2	8	7606	7613	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017063	C	6	6	7651	7656	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
155	NC_017063	AAG	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017063	A	6	6	7674	7679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_017063	GA	3	6	12890	12895	50 %	0 %	50 %	0 %	383749074
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453	NC_017063	T	6	6	22026	22031	0 %	100 %	0 %	0 %	383749082
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459	NC_017063	AGA	2	6	22352	22357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383749082
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464	NC_017063	A	7	7	22602	22608	100 %	0 %	0 %	0 %	383749082
465	NC_017063	A	6	6	22624	22629	100 %	0 %	0 %	0 %	383749082
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477	NC_017063	TTTA	2	8	23187	23194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_017063	A	6	6	23201	23206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_017063	T	6	6	23219	23224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_017063	A	6	6	23244	23249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_017063	TGG	2	6	23257	23262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017063	A	6	6	23263	23268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_017063	A	6	6	23271	23276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_017063	A	6	6	23331	23336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_017063	A	6	6	23350	23355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_017063	A	6	6	23366	23371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_017063	CCATG	2	10	23515	23524	20 %	20 %	20 %	40 %	383749084
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498	NC_017063	GC	3	6	24206	24211	0 %	0 %	50 %	50 %	383749084
499	NC_017063	T	6	6	24255	24260	0 %	100 %	0 %	0 %	383749084
500	NC_017063	TC	3	6	24274	24279	0 %	50 %	0 %	50 %	383749084

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