MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar02

Total Repeats: 587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015959	CGG	2	6	20700	20705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345133557
502	NC_015959	TGG	2	6	20716	20721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345133557
503	NC_015959	CCG	2	6	20783	20788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345133557
504	NC_015959	TGG	2	6	20826	20831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345133557
505	NC_015959	TG	4	8	20839	20846	0 %	50 %	50 %	0 %	345133557
506	NC_015959	ATCC	2	8	20869	20876	25 %	25 %	0 %	50 %	345133557
507	NC_015959	TGT	2	6	20882	20887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015959	G	6	6	20899	20904	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015959	ACAG	2	8	20926	20933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_015959	TTG	2	6	20934	20939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015959	ACG	2	6	20947	20952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_015959	TAC	2	6	21055	21060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015959	CGA	3	9	21072	21080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_015959	ACA	2	6	21097	21102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_015959	CTC	2	6	21168	21173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345133558
516	NC_015959	TCG	2	6	21184	21189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345133558
517	NC_015959	CTC	2	6	21198	21203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345133558
518	NC_015959	TCGGCG	2	12	21238	21249	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345133558
519	NC_015959	CAGTCG	2	12	21256	21267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345133558
520	NC_015959	CTT	2	6	21308	21313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345133558
521	NC_015959	GTG	3	9	21316	21324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345133558
522	NC_015959	ACC	2	6	21452	21457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_015959	GTA	2	6	21529	21534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015959	GGCG	2	8	21563	21570	0 %	0 %	75 %	25 %	345133559
525	NC_015959	CGA	3	9	21586	21594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345133559
526	NC_015959	CGG	2	6	21639	21644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345133559
527	NC_015959	GAG	2	6	21704	21709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345133559
528	NC_015959	G	6	6	21737	21742	0 %	0 %	100 %	0 %	345133559
529	NC_015959	GTG	2	6	21754	21759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345133559
530	NC_015959	TCG	2	6	21762	21767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345133559
531	NC_015959	GC	3	6	21793	21798	0 %	0 %	50 %	50 %	345133559
532	NC_015959	AGG	2	6	21804	21809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345133559
533	NC_015959	CGAC	2	8	21835	21842	25 %	0 %	25 %	50 %	345133559
534	NC_015959	AC	3	6	21852	21857	50 %	0 %	0 %	50 %	345133559
535	NC_015959	GGC	2	6	21914	21919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345133559
536	NC_015959	CGA	2	6	21928	21933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345133559
537	NC_015959	GT	3	6	21934	21939	0 %	50 %	50 %	0 %	345133559
538	NC_015959	GTC	2	6	21944	21949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345133559
539	NC_015959	CGC	2	6	21952	21957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345133559
540	NC_015959	CGG	2	6	21979	21984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345133559
541	NC_015959	TCG	2	6	22002	22007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345133559
542	NC_015959	ACG	2	6	22038	22043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345133559
543	NC_015959	GTG	2	6	22093	22098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345133559
544	NC_015959	CGA	2	6	22132	22137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345133559
545	NC_015959	CAC	2	6	22149	22154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345133559
546	NC_015959	CGGC	2	8	22203	22210	0 %	0 %	50 %	50 %	345133559
547	NC_015959	GGA	2	6	22228	22233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345133559
548	NC_015959	GGAC	2	8	22252	22259	25 %	0 %	50 %	25 %	345133560
549	NC_015959	ACG	2	6	22260	22265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345133560
550	NC_015959	CCG	2	6	22305	22310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345133560
551	NC_015959	TCG	2	6	22326	22331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345133560
552	NC_015959	GGA	2	6	22384	22389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345133560
553	NC_015959	GTTC	2	8	22390	22397	0 %	50 %	25 %	25 %	345133560
554	NC_015959	CG	3	6	22463	22468	0 %	0 %	50 %	50 %	345133560
555	NC_015959	GAG	2	6	22490	22495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345133560
556	NC_015959	TAC	2	6	22515	22520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_015959	TG	3	6	22579	22584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015959	CCCG	2	8	22615	22622	0 %	0 %	25 %	75 %	345133561
559	NC_015959	CGT	2	6	22624	22629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345133561
560	NC_015959	GAC	2	6	22646	22651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345133561
561	NC_015959	CG	3	6	22663	22668	0 %	0 %	50 %	50 %	345133561
562	NC_015959	GGCGT	2	10	22682	22691	0 %	20 %	60 %	20 %	345133561
563	NC_015959	GCCC	2	8	22830	22837	0 %	0 %	25 %	75 %	345133561
564	NC_015959	ACG	2	6	22863	22868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_015959	TCC	2	6	22872	22877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_015959	AC	3	6	22886	22891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_015959	CCG	2	6	22972	22977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345133562
568	NC_015959	CTC	2	6	22987	22992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345133562
569	NC_015959	CAG	2	6	23038	23043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345133562
570	NC_015959	CGT	2	6	23055	23060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345133562
571	NC_015959	CGC	2	6	23097	23102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345133562
572	NC_015959	CTC	2	6	23128	23133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345133562
573	NC_015959	GCTC	2	8	23151	23158	0 %	25 %	25 %	50 %	345133562
574	NC_015959	ACATCA	2	12	23193	23204	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	345133562
575	NC_015959	CTC	2	6	23245	23250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345133562
576	NC_015959	CCT	2	6	23286	23291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345133562
577	NC_015959	GTT	2	6	23299	23304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345133562
578	NC_015959	GTT	2	6	23308	23313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345133562
579	NC_015959	GAG	2	6	23353	23358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345133562
580	NC_015959	TCG	2	6	23394	23399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345133562
581	NC_015959	CG	3	6	23398	23403	0 %	0 %	50 %	50 %	345133562
582	NC_015959	GAA	2	6	23404	23409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345133562
583	NC_015959	CGCC	2	8	23457	23464	0 %	0 %	25 %	75 %	345133562
584	NC_015959	GCCG	2	8	23508	23515	0 %	0 %	50 %	50 %	345133562
585	NC_015959	CTG	2	6	23560	23565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345133562
586	NC_015959	CCG	2	6	23568	23573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345133562
587	NC_015959	CTA	2	6	23642	23647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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