MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015955	TCC	2	6	186840	186845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006977
4002	NC_015955	ATC	2	6	186876	186881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006977
4003	NC_015955	AG	3	6	186889	186894	50 %	0 %	50 %	0 %	345006977
4004	NC_015955	AGT	2	6	186970	186975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015955	CG	3	6	186991	186996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_015955	CT	3	6	187005	187010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_015955	AGC	2	6	187016	187021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006978
4008	NC_015955	GAA	2	6	187048	187053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006978
4009	NC_015955	GTGG	2	8	187077	187084	0 %	25 %	75 %	0 %	345006978
4010	NC_015955	GCA	2	6	187096	187101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006978
4011	NC_015955	CCG	2	6	187142	187147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006978
4012	NC_015955	CAA	2	6	187159	187164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006978
4013	NC_015955	CGT	2	6	187297	187302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006978
4014	NC_015955	GC	3	6	187326	187331	0 %	0 %	50 %	50 %	345006978
4015	NC_015955	CAA	2	6	187333	187338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006978
4016	NC_015955	CGA	2	6	187345	187350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006978
4017	NC_015955	AT	3	6	187378	187383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_015955	TGG	2	6	187417	187422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_015955	CTG	2	6	187442	187447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006979
4020	NC_015955	AGA	2	6	187493	187498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006979
4021	NC_015955	GCT	2	6	187554	187559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006979
4022	NC_015955	CGA	2	6	187620	187625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006979
4023	NC_015955	ACGAT	2	10	187631	187640	40 %	20 %	20 %	20 %	345006979
4024	NC_015955	GCG	2	6	187654	187659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006979
4025	NC_015955	CGG	2	6	187660	187665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006979
4026	NC_015955	GGGA	2	8	187713	187720	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015955	AT	3	6	187767	187772	50 %	50 %	0 %	0 %	345006980
4028	NC_015955	GAG	2	6	187773	187778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006980
4029	NC_015955	GTTC	2	8	187802	187809	0 %	50 %	25 %	25 %	345006980
4030	NC_015955	GAG	2	6	187854	187859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006980
4031	NC_015955	TCA	2	6	187952	187957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006980
4032	NC_015955	ATGG	2	8	188172	188179	25 %	25 %	50 %	0 %	345006980
4033	NC_015955	TGA	2	6	188186	188191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006980
4034	NC_015955	GCA	2	6	188194	188199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006980
4035	NC_015955	AAG	2	6	188206	188211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006980
4036	NC_015955	ACTG	2	8	188231	188238	25 %	25 %	25 %	25 %	345006980
4037	NC_015955	CTG	2	6	188250	188255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006980
4038	NC_015955	GTC	2	6	188343	188348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006981
4039	NC_015955	TCG	2	6	188354	188359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006981
4040	NC_015955	TTC	2	6	188373	188378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006981
4041	NC_015955	GT	3	6	188401	188406	0 %	50 %	50 %	0 %	345006981
4042	NC_015955	CGT	2	6	188413	188418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006981
4043	NC_015955	CGA	2	6	188450	188455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006981
4044	NC_015955	GCC	2	6	188478	188483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006981
4045	NC_015955	TCA	2	6	188578	188583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006981
4046	NC_015955	GCT	2	6	188775	188780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006982
4047	NC_015955	GT	3	6	188829	188834	0 %	50 %	50 %	0 %	345006982
4048	NC_015955	CAC	2	6	188861	188866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006982
4049	NC_015955	TCGTCA	2	12	188867	188878	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345006982
4050	NC_015955	GA	3	6	188978	188983	50 %	0 %	50 %	0 %	345006982
4051	NC_015955	GT	3	6	189029	189034	0 %	50 %	50 %	0 %	345006982
4052	NC_015955	GC	3	6	189123	189128	0 %	0 %	50 %	50 %	345006982
4053	NC_015955	CAT	2	6	189145	189150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006982
4054	NC_015955	CAC	2	6	189171	189176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006982
4055	NC_015955	TCC	2	6	189290	189295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006982
4056	NC_015955	CGG	2	6	189380	189385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006982
4057	NC_015955	TCA	2	6	189407	189412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006982
4058	NC_015955	GT	3	6	189414	189419	0 %	50 %	50 %	0 %	345006982
4059	NC_015955	AGTTTC	2	12	189579	189590	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4060	NC_015955	TA	3	6	189608	189613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015955	GTCACA	2	12	189662	189673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_015955	CTCC	2	8	189676	189683	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4063	NC_015955	ACG	2	6	189697	189702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006983
4064	NC_015955	TC	3	6	189712	189717	0 %	50 %	0 %	50 %	345006983
4065	NC_015955	CGAT	2	8	189752	189759	25 %	25 %	25 %	25 %	345006983
4066	NC_015955	CGAGAC	2	12	189774	189785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006983
4067	NC_015955	CAG	2	6	189791	189796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006983
4068	NC_015955	CTG	2	6	189879	189884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006984
4069	NC_015955	CGG	2	6	189921	189926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006984
4070	NC_015955	GAT	2	6	189948	189953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006984
4071	NC_015955	ATC	2	6	189984	189989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006984
4072	NC_015955	TGG	2	6	190045	190050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006985
4073	NC_015955	CCA	2	6	190063	190068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006985
4074	NC_015955	CAA	2	6	190148	190153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006985
4075	NC_015955	TTG	2	6	190159	190164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006985
4076	NC_015955	TGA	2	6	190186	190191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_015955	GA	3	6	190276	190281	50 %	0 %	50 %	0 %	345006986
4078	NC_015955	GTC	2	6	190284	190289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006986
4079	NC_015955	CGG	2	6	190366	190371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006986
4080	NC_015955	CGA	2	6	190403	190408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006986
4081	NC_015955	GT	3	6	190409	190414	0 %	50 %	50 %	0 %	345006986
4082	NC_015955	GTA	2	6	190455	190460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006986
4083	NC_015955	TCC	2	6	190471	190476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006986
4084	NC_015955	CGG	2	6	190596	190601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_015955	TGA	2	6	190613	190618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_015955	ATG	2	6	190709	190714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006987
4087	NC_015955	AC	3	6	190716	190721	50 %	0 %	0 %	50 %	345006987
4088	NC_015955	GAC	2	6	190733	190738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006987
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4090	NC_015955	AGA	2	6	190834	190839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006987
4091	NC_015955	GATC	2	8	190876	190883	25 %	25 %	25 %	25 %	345006987
4092	NC_015955	TGG	2	6	190918	190923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006987
4093	NC_015955	CCG	2	6	190932	190937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006987
4094	NC_015955	TGT	3	9	190960	190968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006987
4095	NC_015955	AATC	2	8	191070	191077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_015955	GAG	2	6	191083	191088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_015955	CGA	2	6	191096	191101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_015955	ATT	2	6	191110	191115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_015955	T	6	6	191114	191119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_015955	TCC	2	6	191125	191130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_015955	ATA	2	6	191150	191155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015955	GCG	2	6	191157	191162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_015955	TGGTA	2	10	191179	191188	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_015955	CGC	2	6	191211	191216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006988
4105	NC_015955	ACAG	2	8	191283	191290	50 %	0 %	25 %	25 %	345006988
4106	NC_015955	CTG	2	6	191299	191304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006988
4107	NC_015955	CTAC	2	8	191319	191326	25 %	25 %	0 %	50 %	345006988
4108	NC_015955	CAG	2	6	191364	191369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006988
4109	NC_015955	AGA	2	6	191384	191389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006988
4110	NC_015955	TGA	2	6	191423	191428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006988
4111	NC_015955	CTG	2	6	191431	191436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006988
4112	NC_015955	TGAT	2	8	191560	191567	25 %	50 %	25 %	0 %	345006988
4113	NC_015955	AT	3	6	191605	191610	50 %	50 %	0 %	0 %	345006988
4114	NC_015955	CGA	2	6	191774	191779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006988
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4117	NC_015955	CGA	2	6	191981	191986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006988
4118	NC_015955	GAT	2	6	191991	191996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006988
4119	NC_015955	GAA	2	6	192159	192164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006988
4120	NC_015955	TGA	2	6	192235	192240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006988
4121	NC_015955	TTAG	2	8	192264	192271	25 %	50 %	25 %	0 %	345006988
4122	NC_015955	TGCT	2	8	192278	192285	0 %	50 %	25 %	25 %	345006988
4123	NC_015955	GT	3	6	192290	192295	0 %	50 %	50 %	0 %	345006989
4124	NC_015955	CTT	2	6	192337	192342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006989
4125	NC_015955	CTG	2	6	192407	192412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006989
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4156	NC_015955	CGACGC	2	12	193960	193971	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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4233	NC_015955	ATCT	2	8	198498	198505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4238	NC_015955	AC	3	6	198612	198617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4239	NC_015955	TCT	2	6	198621	198626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4245	NC_015955	GTC	2	6	198915	198920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006996
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4247	NC_015955	GTT	2	6	199065	199070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006996
4248	NC_015955	ATC	2	6	199154	199159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4249	NC_015955	CGT	2	6	199167	199172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006997
4250	NC_015955	GTA	2	6	199173	199178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006997
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4253	NC_015955	GGCAT	2	10	199226	199235	20 %	20 %	40 %	20 %	345006997
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4321	NC_015955	AT	4	8	202780	202787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4353	NC_015955	TC	3	6	204023	204028	0 %	50 %	0 %	50 %	345007002
4354	NC_015955	GAC	2	6	204187	204192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007002
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4362	NC_015955	GACT	2	8	204633	204640	25 %	25 %	25 %	25 %	345007002
4363	NC_015955	TGCG	2	8	204725	204732	0 %	25 %	50 %	25 %	345007002
4364	NC_015955	CCGA	2	8	204766	204773	25 %	0 %	25 %	50 %	345007002
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4366	NC_015955	GGTGA	2	10	204847	204856	20 %	20 %	60 %	0 %	345007002
4367	NC_015955	TCG	2	6	204868	204873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007003
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4369	NC_015955	TGC	2	6	204997	205002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007003
4370	NC_015955	TGC	2	6	205019	205024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007003
4371	NC_015955	TTG	2	6	205047	205052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007003
4372	NC_015955	TCG	2	6	205144	205149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007004
4373	NC_015955	GTA	2	6	205161	205166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007004
4374	NC_015955	CTG	2	6	205220	205225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007004
4375	NC_015955	CCG	2	6	205356	205361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007004
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4377	NC_015955	CT	3	6	205425	205430	0 %	50 %	0 %	50 %	345007004
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4379	NC_015955	CGC	2	6	205455	205460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007004
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4393	NC_015955	CGG	2	6	205936	205941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007004
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4402	NC_015955	GTCA	2	8	206530	206537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4403	NC_015955	TCCGT	2	10	206549	206558	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4407	NC_015955	TCC	2	6	206750	206755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4410	NC_015955	GCG	2	6	206836	206841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4411	NC_015955	CAT	2	6	206845	206850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4414	NC_015955	GCG	2	6	207037	207042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4483	NC_015955	GCA	2	6	210677	210682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007008
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4488	NC_015955	TCA	2	6	210854	210859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007008
4489	NC_015955	CGAT	2	8	210950	210957	25 %	25 %	25 %	25 %	345007008
4490	NC_015955	GCC	2	6	210974	210979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007008
4491	NC_015955	GTT	2	6	211013	211018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007008
4492	NC_015955	GGC	2	6	211089	211094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007008
4493	NC_015955	GAC	2	6	211095	211100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007008
4494	NC_015955	CGT	2	6	211122	211127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007008
4495	NC_015955	TCC	2	6	211163	211168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007008
4496	NC_015955	CTGA	2	8	211194	211201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4497	NC_015955	GTATA	2	10	211269	211278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4498	NC_015955	TCTG	2	8	211341	211348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4499	NC_015955	TGA	2	6	211379	211384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007009
4500	NC_015955	GAT	2	6	211425	211430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007009

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