MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015955	TCT	2	6	638200	638205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14002	NC_015955	TCG	2	6	638307	638312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_015955	TCG	2	6	638355	638360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_015955	ACG	2	6	638432	638437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_015955	CGT	2	6	638472	638477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_015955	CGT	2	6	638482	638487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14007	NC_015955	TAA	2	6	638519	638524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_015955	TCC	2	6	638593	638598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14009	NC_015955	ACC	2	6	638630	638635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14010	NC_015955	TGAT	2	8	638681	638688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_015955	TGC	2	6	638726	638731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_015955	TCGC	2	8	638757	638764	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14013	NC_015955	CGT	2	6	638774	638779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_015955	CCG	2	6	638788	638793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14015	NC_015955	CCT	2	6	638851	638856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14016	NC_015955	CTC	2	6	638888	638893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14017	NC_015955	ACG	2	6	638908	638913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_015955	CGA	2	6	638982	638987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_015955	TTG	2	6	639035	639040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_015955	AG	3	6	639079	639084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_015955	GCT	2	6	639098	639103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_015955	GTG	2	6	639140	639145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_015955	CTGGA	2	10	639168	639177	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14024	NC_015955	GA	3	6	639194	639199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_015955	TCG	2	6	639216	639221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007388
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14027	NC_015955	TGA	2	6	639299	639304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007388
14028	NC_015955	CAC	2	6	639350	639355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007388
14029	NC_015955	CGA	2	6	639428	639433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007388
14030	NC_015955	TCGA	2	8	639528	639535	25 %	25 %	25 %	25 %	345007388
14031	NC_015955	CGG	2	6	639638	639643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007388
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14034	NC_015955	CGT	2	6	639680	639685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007388
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14036	NC_015955	CGG	2	6	639770	639775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007388
14037	NC_015955	CCCCGG	2	12	639839	639850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007388
14038	NC_015955	ACCC	2	8	639888	639895	25 %	0 %	0 %	75 %	345007388
14039	NC_015955	CGT	2	6	639932	639937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007388
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14042	NC_015955	CGC	2	6	639976	639981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007388
14043	NC_015955	GTCC	2	8	639994	640001	0 %	25 %	25 %	50 %	345007388
14044	NC_015955	CAG	2	6	640022	640027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007388
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14048	NC_015955	ACTC	2	8	640090	640097	25 %	25 %	0 %	50 %	345007388
14049	NC_015955	CGA	2	6	640177	640182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007388
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14051	NC_015955	GTC	2	6	640286	640291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007388
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14053	NC_015955	GTA	2	6	640478	640483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007388
14054	NC_015955	GTC	2	6	640493	640498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007388
14055	NC_015955	GTCCC	2	10	640514	640523	0 %	20 %	20 %	60 %	345007388
14056	NC_015955	CCAC	2	8	640599	640606	25 %	0 %	0 %	75 %	345007388
14057	NC_015955	TCG	2	6	640674	640679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007388
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14059	NC_015955	ACG	3	9	640773	640781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007388
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14062	NC_015955	GTCG	2	8	640856	640863	0 %	25 %	50 %	25 %	345007388
14063	NC_015955	GTC	2	6	640871	640876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007388
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14070	NC_015955	GGT	2	6	641319	641324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007389
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14077	NC_015955	CGGT	2	8	641534	641541	0 %	25 %	50 %	25 %	345007390
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14093	NC_015955	GAC	2	6	642131	642136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007390
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14101	NC_015955	GT	3	6	642476	642481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_015955	GTC	2	6	642514	642519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_015955	CGG	2	6	642536	642541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14104	NC_015955	GT	3	6	642602	642607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_015955	GAG	2	6	642639	642644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_015955	TG	3	6	642648	642653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_015955	CCA	2	6	642704	642709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14108	NC_015955	GCCG	2	8	642742	642749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14109	NC_015955	AATG	2	8	642848	642855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_015955	ATA	2	6	642878	642883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345007391
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14113	NC_015955	CTG	2	6	642969	642974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007391
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14117	NC_015955	TAA	2	6	643208	643213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_015955	AAT	2	6	643230	643235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_015955	CTC	2	6	643301	643306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14120	NC_015955	CGA	2	6	643477	643482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007392
14121	NC_015955	GGA	3	9	643483	643491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007392
14122	NC_015955	GAC	2	6	643496	643501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007392
14123	NC_015955	AGCC	2	8	643525	643532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14124	NC_015955	GACG	2	8	643590	643597	25 %	0 %	50 %	25 %	345007393
14125	NC_015955	CTG	2	6	643630	643635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007393
14126	NC_015955	ACC	2	6	643655	643660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007393
14127	NC_015955	CGGC	2	8	643719	643726	0 %	0 %	50 %	50 %	345007393
14128	NC_015955	TCG	2	6	643748	643753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007393
14129	NC_015955	A	6	6	643768	643773	100 %	0 %	0 %	0 %	345007393
14130	NC_015955	GAA	2	6	643822	643827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007393
14131	NC_015955	GC	3	6	643837	643842	0 %	0 %	50 %	50 %	345007393
14132	NC_015955	CGC	2	6	643914	643919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14133	NC_015955	GCC	2	6	643955	643960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007394
14134	NC_015955	GGT	2	6	643976	643981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007394
14135	NC_015955	TGA	2	6	643988	643993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007394
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14139	NC_015955	GAC	2	6	644075	644080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007395
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14144	NC_015955	CTG	2	6	644213	644218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007395
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14151	NC_015955	TTCG	2	8	644553	644560	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14152	NC_015955	CTG	2	6	644584	644589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14153	NC_015955	GAGCTG	2	12	644681	644692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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14155	NC_015955	GGGT	2	8	644721	644728	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14156	NC_015955	TCG	2	6	644748	644753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14157	NC_015955	TCG	2	6	644769	644774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14158	NC_015955	CGG	2	6	644782	644787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14159	NC_015955	CGA	2	6	644794	644799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14160	NC_015955	GC	3	6	644803	644808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14161	NC_015955	TCT	2	6	644842	644847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14162	NC_015955	CGT	2	6	644848	644853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14163	NC_015955	GGC	2	6	644854	644859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14164	NC_015955	CCAGCG	2	12	644896	644907	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14165	NC_015955	GCCG	2	8	644924	644931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14166	NC_015955	GC	3	6	644974	644979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14167	NC_015955	GAA	2	6	645017	645022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14168	NC_015955	GCT	2	6	645035	645040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14171	NC_015955	AGC	2	6	645180	645185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14172	NC_015955	GAG	2	6	645204	645209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14173	NC_015955	CGT	2	6	645262	645267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14174	NC_015955	GCGT	2	8	645313	645320	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14175	NC_015955	ACC	2	6	645390	645395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14178	NC_015955	GCT	2	6	645481	645486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14179	NC_015955	G	6	6	645561	645566	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14180	NC_015955	CGT	2	6	645589	645594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14181	NC_015955	CG	3	6	645618	645623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14182	NC_015955	GCC	2	6	645627	645632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14183	NC_015955	GCT	2	6	645634	645639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14184	NC_015955	GA	3	6	645766	645771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14185	NC_015955	TCGG	2	8	645806	645813	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14186	NC_015955	ACG	2	6	645826	645831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14188	NC_015955	GTC	2	6	645857	645862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14189	NC_015955	GCG	2	6	645880	645885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14190	NC_015955	CG	3	6	645894	645899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14191	NC_015955	TCGG	2	8	645914	645921	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14192	NC_015955	CGA	2	6	645922	645927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14196	NC_015955	TCG	2	6	646154	646159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007396
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14221	NC_015955	TCA	2	6	647194	647199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007396
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14225	NC_015955	TAG	2	6	647293	647298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14226	NC_015955	AGT	2	6	647316	647321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14227	NC_015955	ACC	2	6	647342	647347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14228	NC_015955	TGGG	2	8	647374	647381	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14229	NC_015955	TCG	2	6	647387	647392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14230	NC_015955	G	6	6	647396	647401	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14231	NC_015955	CGTG	2	8	647403	647410	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14232	NC_015955	ACCG	2	8	647431	647438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14233	NC_015955	CGC	2	6	647490	647495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14234	NC_015955	ACC	2	6	647501	647506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14235	NC_015955	AC	3	6	647618	647623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14236	NC_015955	CCCT	2	8	647646	647653	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14237	NC_015955	GTCCC	2	10	647683	647692	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14238	NC_015955	CGAT	2	8	647702	647709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14239	NC_015955	GAAC	2	8	647716	647723	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14240	NC_015955	GGC	2	6	647733	647738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14241	NC_015955	TGGT	2	8	647765	647772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14242	NC_015955	CGGC	2	8	647902	647909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14243	NC_015955	TAAC	2	8	647960	647967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14244	NC_015955	AAGC	2	8	647977	647984	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14245	NC_015955	ACA	2	6	648002	648007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14246	NC_015955	AGG	2	6	648009	648014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14247	NC_015955	ACC	2	6	648015	648020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14248	NC_015955	ATG	2	6	648114	648119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14249	NC_015955	TGC	2	6	648125	648130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14250	NC_015955	TAA	2	6	648131	648136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14251	NC_015955	TAC	2	6	648140	648145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14252	NC_015955	ACA	2	6	648167	648172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007397
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14266	NC_015955	CGG	2	6	648749	648754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14267	NC_015955	CGG	3	9	648769	648777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14268	NC_015955	GCC	2	6	648781	648786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14310	NC_015955	CGCTA	2	10	650704	650713	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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14489	NC_015955	CAGT	2	8	659337	659344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14490	NC_015955	A	6	6	659346	659351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14491	NC_015955	AC	3	6	659383	659388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14492	NC_015955	GGA	2	6	659440	659445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14493	NC_015955	TCA	2	6	659448	659453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14494	NC_015955	TCC	2	6	659478	659483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14495	NC_015955	CGAG	2	8	659536	659543	25 %	0 %	50 %	25 %	345007409
14496	NC_015955	GTC	2	6	659605	659610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007409
14497	NC_015955	GAA	2	6	659682	659687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007409
14498	NC_015955	ACGTG	2	10	659689	659698	20 %	20 %	40 %	20 %	345007409
14499	NC_015955	GAA	2	6	659763	659768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14500	NC_015955	TCG	2	6	659874	659879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007410

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