MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015955	TC	3	6	594440	594445	0 %	50 %	0 %	50 %	345007353
13002	NC_015955	ACC	2	6	594449	594454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007353
13003	NC_015955	CGA	2	6	594476	594481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007353
13004	NC_015955	GCT	2	6	594536	594541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007353
13005	NC_015955	TAATCG	2	12	594553	594564	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345007353
13006	NC_015955	CTC	2	6	594570	594575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007353
13007	NC_015955	GTTC	2	8	594695	594702	0 %	50 %	25 %	25 %	345007353
13008	NC_015955	AG	3	6	594713	594718	50 %	0 %	50 %	0 %	345007353
13009	NC_015955	TTC	2	6	594766	594771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007353
13010	NC_015955	GCA	2	6	594782	594787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007353
13011	NC_015955	CAAT	2	8	594883	594890	50 %	25 %	0 %	25 %	345007353
13012	NC_015955	ACA	2	6	594903	594908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007353
13013	NC_015955	TTG	2	6	595107	595112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_015955	GTT	2	6	595152	595157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_015955	CAA	2	6	595228	595233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_015955	TCG	2	6	595275	595280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_015955	TTG	2	6	595302	595307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_015955	TA	3	6	595334	595339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_015955	GAA	2	6	595352	595357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_015955	CCT	2	6	595366	595371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13021	NC_015955	GGAT	2	8	595418	595425	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_015955	GAT	2	6	595467	595472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_015955	GCT	2	6	595489	595494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_015955	GC	3	6	595558	595563	0 %	0 %	50 %	50 %	345007354
13025	NC_015955	TGT	2	6	595615	595620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007354
13026	NC_015955	TGC	2	6	595632	595637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007354
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13028	NC_015955	TCGT	2	8	595881	595888	0 %	50 %	25 %	25 %	345007354
13029	NC_015955	TCT	2	6	595992	595997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007354
13030	NC_015955	CT	3	6	595996	596001	0 %	50 %	0 %	50 %	345007354
13031	NC_015955	GAA	2	6	596081	596086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007354
13032	NC_015955	AT	3	6	596246	596251	50 %	50 %	0 %	0 %	345007354
13033	NC_015955	CTT	2	6	596311	596316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007354
13034	NC_015955	TAA	2	6	596348	596353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345007354
13035	NC_015955	TA	3	6	596360	596365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_015955	T	7	7	596367	596373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_015955	TAT	2	6	596377	596382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_015955	GGTA	2	8	596424	596431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_015955	GATT	2	8	596454	596461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_015955	TCT	2	6	596500	596505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_015955	ATC	2	6	596523	596528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_015955	GGT	2	6	596553	596558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_015955	TCG	2	6	596629	596634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007355
13044	NC_015955	CTA	2	6	596684	596689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007355
13045	NC_015955	ATC	2	6	596709	596714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007355
13046	NC_015955	GATC	2	8	596744	596751	25 %	25 %	25 %	25 %	345007355
13047	NC_015955	ACG	2	6	596791	596796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007355
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13049	NC_015955	CAG	2	6	596856	596861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007355
13050	NC_015955	CTG	2	6	596922	596927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007355
13051	NC_015955	CTACGA	2	12	596948	596959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007355
13052	NC_015955	CGA	2	6	596966	596971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007355
13053	NC_015955	ACC	2	6	597020	597025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007355
13054	NC_015955	CT	3	6	597053	597058	0 %	50 %	0 %	50 %	345007356
13055	NC_015955	G	6	6	597059	597064	0 %	0 %	100 %	0 %	345007356
13056	NC_015955	CA	3	6	597092	597097	50 %	0 %	0 %	50 %	345007356
13057	NC_015955	AAC	2	6	597105	597110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007356
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13059	NC_015955	CAT	2	6	597187	597192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007356
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13062	NC_015955	CAT	2	6	597268	597273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007356
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13074	NC_015955	CGT	2	6	597600	597605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007356
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13088	NC_015955	GA	3	6	598086	598091	50 %	0 %	50 %	0 %	345007356
13089	NC_015955	ATC	2	6	598120	598125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007357
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13093	NC_015955	TGA	2	6	598187	598192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007357
13094	NC_015955	TCC	2	6	598220	598225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007357
13095	NC_015955	ACGC	2	8	598247	598254	25 %	0 %	25 %	50 %	345007357
13096	NC_015955	ACT	2	6	598256	598261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007357
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13101	NC_015955	GCC	2	6	598567	598572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007358
13102	NC_015955	GATG	2	8	598685	598692	25 %	25 %	50 %	0 %	345007358
13103	NC_015955	ACGA	2	8	598699	598706	50 %	0 %	25 %	25 %	345007358
13104	NC_015955	GCGA	2	8	598710	598717	25 %	0 %	50 %	25 %	345007358
13105	NC_015955	CGCT	2	8	598746	598753	0 %	25 %	25 %	50 %	345007358
13106	NC_015955	GCA	2	6	598879	598884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007358
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13111	NC_015955	GAC	2	6	599130	599135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007358
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13120	NC_015955	CGG	2	6	599471	599476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007359
13121	NC_015955	GATC	3	12	599488	599499	25 %	25 %	25 %	25 %	345007359
13122	NC_015955	CGA	2	6	599522	599527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007359
13123	NC_015955	GCT	2	6	599547	599552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007359
13124	NC_015955	CGC	2	6	599556	599561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007359
13125	NC_015955	GAC	2	6	599644	599649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007359
13126	NC_015955	ACC	2	6	599696	599701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007359
13127	NC_015955	GAC	2	6	599718	599723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007359
13128	NC_015955	CAA	2	6	599757	599762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007359
13129	NC_015955	ACA	2	6	599775	599780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007359
13130	NC_015955	TCA	2	6	599804	599809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007359
13131	NC_015955	CGC	3	9	599814	599822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007359
13132	NC_015955	ACA	2	6	599939	599944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007359
13133	NC_015955	GAC	3	9	600010	600018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007359
13134	NC_015955	GGA	2	6	600033	600038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007359
13135	NC_015955	TAC	2	6	600145	600150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007359
13136	NC_015955	CGA	2	6	600166	600171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007360
13137	NC_015955	ACG	2	6	600252	600257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007360
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13139	NC_015955	GA	3	6	600279	600284	50 %	0 %	50 %	0 %	345007360
13140	NC_015955	CGG	2	6	600316	600321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007360
13141	NC_015955	CGA	2	6	600370	600375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007360
13142	NC_015955	GTC	3	9	600392	600400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007360
13143	NC_015955	GTCGA	2	10	600455	600464	20 %	20 %	40 %	20 %	345007360
13144	NC_015955	C	6	6	600559	600564	0 %	0 %	0 %	100 %	345007360
13145	NC_015955	GAG	2	6	600612	600617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007360
13146	NC_015955	CTC	2	6	600672	600677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007361
13147	NC_015955	GTA	2	6	600699	600704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007361
13148	NC_015955	CGT	2	6	600725	600730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007361
13149	NC_015955	CAC	2	6	600737	600742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007361
13150	NC_015955	GTC	3	9	600855	600863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007361
13151	NC_015955	TGA	2	6	600926	600931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007361
13152	NC_015955	CGGC	2	8	600943	600950	0 %	0 %	50 %	50 %	345007361
13153	NC_015955	CGT	2	6	600956	600961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007361
13154	NC_015955	CGA	2	6	600962	600967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007361
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13156	NC_015955	ACCG	2	8	601053	601060	25 %	0 %	25 %	50 %	345007361
13157	NC_015955	CCG	3	9	601108	601116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007361
13158	NC_015955	TCG	2	6	601195	601200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007361
13159	NC_015955	TCG	2	6	601210	601215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007361
13160	NC_015955	CGT	2	6	601235	601240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007361
13161	NC_015955	CGCC	2	8	601246	601253	0 %	0 %	25 %	75 %	345007361
13162	NC_015955	CGC	3	9	601271	601279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007361
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13164	NC_015955	CG	3	6	601328	601333	0 %	0 %	50 %	50 %	345007361
13165	NC_015955	CGG	2	6	601348	601353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007361
13166	NC_015955	TCGGA	2	10	601355	601364	20 %	20 %	40 %	20 %	345007361
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13170	NC_015955	GTTGCT	2	12	601466	601477	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345007361
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13172	NC_015955	GAG	2	6	601536	601541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007361
13173	NC_015955	CGAG	2	8	601569	601576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13174	NC_015955	CG	3	6	601604	601609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13175	NC_015955	CCGA	2	8	601645	601652	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13176	NC_015955	GA	4	8	601651	601658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13177	NC_015955	GAT	2	6	601744	601749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13178	NC_015955	CGT	3	9	601776	601784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13179	NC_015955	GTCG	2	8	601896	601903	0 %	25 %	50 %	25 %	345007362
13180	NC_015955	TCG	2	6	601931	601936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007362
13181	NC_015955	AGCG	2	8	601954	601961	25 %	0 %	50 %	25 %	345007362
13182	NC_015955	GCC	2	6	602007	602012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007362
13183	NC_015955	GGT	2	6	602013	602018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007362
13184	NC_015955	CGA	2	6	602024	602029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007362
13185	NC_015955	GCGATG	2	12	602038	602049	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007362
13186	NC_015955	GAC	2	6	602070	602075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007362
13187	NC_015955	CGG	2	6	602109	602114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007363
13188	NC_015955	ACG	2	6	602140	602145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007363
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13190	NC_015955	GAC	2	6	602169	602174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007363
13191	NC_015955	GCC	2	6	602186	602191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007363
13192	NC_015955	G	6	6	602216	602221	0 %	0 %	100 %	0 %	345007363
13193	NC_015955	CAGT	2	8	602222	602229	25 %	25 %	25 %	25 %	345007363
13194	NC_015955	CGATCA	2	12	602231	602242	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007363
13195	NC_015955	GAC	2	6	602259	602264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007363
13196	NC_015955	TCGA	2	8	602275	602282	25 %	25 %	25 %	25 %	345007363
13197	NC_015955	CGA	2	6	602306	602311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007363
13198	NC_015955	TCG	2	6	602312	602317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007363
13199	NC_015955	CGA	3	9	602339	602347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007363
13200	NC_015955	CGC	2	6	602356	602361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007363
13201	NC_015955	GAAC	3	12	602379	602390	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13202	NC_015955	ATC	2	6	602456	602461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007364
13203	NC_015955	CCG	2	6	602529	602534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007364
13204	NC_015955	ACG	2	6	602549	602554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007364
13205	NC_015955	GGC	2	6	602579	602584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007364
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13208	NC_015955	CT	3	6	602726	602731	0 %	50 %	0 %	50 %	345007364
13209	NC_015955	ACCG	2	8	602902	602909	25 %	0 %	25 %	50 %	345007364
13210	NC_015955	TCT	2	6	602910	602915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007364
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13212	NC_015955	TCG	2	6	602996	603001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007364
13213	NC_015955	CCGTT	2	10	603085	603094	0 %	40 %	20 %	40 %	345007364
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13222	NC_015955	CGG	2	6	603418	603423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007364
13223	NC_015955	TTG	2	6	603426	603431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007364
13224	NC_015955	CGT	3	9	603481	603489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007364
13225	NC_015955	TGG	2	6	603517	603522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007364
13226	NC_015955	CAC	2	6	603567	603572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007364
13227	NC_015955	GAG	2	6	603596	603601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007364
13228	NC_015955	GCG	2	6	603603	603608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007364
13229	NC_015955	CGC	2	6	603645	603650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007364
13230	NC_015955	GTTT	2	8	603719	603726	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13231	NC_015955	TCCAG	2	10	603837	603846	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13232	NC_015955	GTC	2	6	603938	603943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007365
13233	NC_015955	CGC	2	6	603949	603954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007365
13234	NC_015955	ACGG	2	8	604084	604091	25 %	0 %	50 %	25 %	345007365
13235	NC_015955	CG	3	6	604096	604101	0 %	0 %	50 %	50 %	345007365
13236	NC_015955	CGG	2	6	604129	604134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007365
13237	NC_015955	GACTG	2	10	604135	604144	20 %	20 %	40 %	20 %	345007365
13238	NC_015955	TCG	2	6	604167	604172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007365
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13240	NC_015955	TCG	2	6	604227	604232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007365
13241	NC_015955	CGG	2	6	604291	604296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007365
13242	NC_015955	TCG	2	6	604308	604313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007365
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13246	NC_015955	GTA	2	6	604526	604531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13249	NC_015955	ACGG	2	8	604623	604630	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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13253	NC_015955	CACT	2	8	604687	604694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13254	NC_015955	TCGG	2	8	604707	604714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13255	NC_015955	GTC	2	6	604733	604738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007366
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13359	NC_015955	CAT	2	6	609356	609361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007369
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13361	NC_015955	TGAG	2	8	609451	609458	25 %	25 %	50 %	0 %	345007369
13362	NC_015955	ATGC	2	8	609532	609539	25 %	25 %	25 %	25 %	345007369
13363	NC_015955	CGC	2	6	609548	609553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007369
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13368	NC_015955	ATC	2	6	609768	609773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007370
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13376	NC_015955	TCTG	2	8	610168	610175	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13379	NC_015955	ATG	2	6	610285	610290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13382	NC_015955	ACA	2	6	610357	610362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13384	NC_015955	TCC	2	6	610416	610421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13435	NC_015955	ACGG	2	8	613200	613207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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13471	NC_015955	CATCAC	2	12	614916	614927	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	345007373
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13482	NC_015955	TCT	2	6	615375	615380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007373
13483	NC_015955	TCC	2	6	615388	615393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007373
13484	NC_015955	GGT	2	6	615469	615474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13485	NC_015955	CGA	2	6	615477	615482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13486	NC_015955	GA	3	6	615481	615486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13487	NC_015955	CGA	2	6	615492	615497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13488	NC_015955	GCTGTC	2	12	615509	615520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13489	NC_015955	GGC	3	9	615521	615529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13490	NC_015955	GCC	2	6	615531	615536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13491	NC_015955	GTC	2	6	615599	615604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007374
13492	NC_015955	TGA	2	6	615673	615678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007374
13493	NC_015955	C	6	6	615710	615715	0 %	0 %	0 %	100 %	345007374
13494	NC_015955	CGG	2	6	615717	615722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007374
13495	NC_015955	CAC	2	6	615779	615784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007374
13496	NC_015955	CAG	2	6	615791	615796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007374
13497	NC_015955	GTC	2	6	615822	615827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007374
13498	NC_015955	GTG	2	6	615901	615906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007374
13499	NC_015955	GCG	2	6	615927	615932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007374
13500	NC_015955	TCG	2	6	615957	615962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007374

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