MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015955	CGACGT	2	12	570276	570287	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007333
12502	NC_015955	TGGCAA	2	12	570402	570413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007333
12503	NC_015955	GAC	2	6	570480	570485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007333
12504	NC_015955	CGG	2	6	570495	570500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007333
12505	NC_015955	CCT	2	6	570518	570523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007333
12506	NC_015955	CT	3	6	570649	570654	0 %	50 %	0 %	50 %	345007333
12507	NC_015955	ACG	2	6	570806	570811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_015955	C	6	6	570830	570835	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12509	NC_015955	ACGAG	2	10	570840	570849	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12510	NC_015955	GGT	2	6	570859	570864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_015955	TCG	2	6	570945	570950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_015955	GTG	2	6	571064	571069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_015955	TCC	2	6	571127	571132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12514	NC_015955	AG	3	6	571156	571161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_015955	GCAC	2	8	571230	571237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12516	NC_015955	CCAG	2	8	571279	571286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12517	NC_015955	CTGG	2	8	571292	571299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12518	NC_015955	AGC	2	6	571370	571375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007334
12519	NC_015955	CGCAG	2	10	571401	571410	20 %	0 %	40 %	40 %	345007334
12520	NC_015955	ACG	2	6	571493	571498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007334
12521	NC_015955	GTC	3	9	571542	571550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007334
12522	NC_015955	CCGG	2	8	571583	571590	0 %	0 %	50 %	50 %	345007334
12523	NC_015955	GAC	2	6	571617	571622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007334
12524	NC_015955	GAG	2	6	571669	571674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007334
12525	NC_015955	CAG	2	6	571675	571680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007334
12526	NC_015955	GTG	2	6	571772	571777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007334
12527	NC_015955	ACA	2	6	571820	571825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007334
12528	NC_015955	AT	3	6	571855	571860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_015955	GGT	2	6	571871	571876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_015955	TGA	2	6	571888	571893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007335
12531	NC_015955	CGG	2	6	571901	571906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007335
12532	NC_015955	ACT	2	6	572029	572034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007335
12533	NC_015955	TCG	2	6	572219	572224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007336
12534	NC_015955	CGC	2	6	572227	572232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007336
12535	NC_015955	CGG	2	6	572289	572294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007336
12536	NC_015955	CGC	2	6	572358	572363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007336
12537	NC_015955	GCG	2	6	572376	572381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007336
12538	NC_015955	TGCT	2	8	572393	572400	0 %	50 %	25 %	25 %	345007336
12539	NC_015955	C	6	6	572508	572513	0 %	0 %	0 %	100 %	345007336
12540	NC_015955	GTC	2	6	572545	572550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007336
12541	NC_015955	GCC	2	6	572564	572569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007336
12542	NC_015955	CGGT	2	8	572588	572595	0 %	25 %	50 %	25 %	345007336
12543	NC_015955	GTC	2	6	572659	572664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007336
12544	NC_015955	GTC	2	6	572728	572733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007336
12545	NC_015955	TGG	2	6	572736	572741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007336
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12548	NC_015955	GCC	2	6	572915	572920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007336
12549	NC_015955	CTG	2	6	573001	573006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007336
12550	NC_015955	CGGA	2	8	573011	573018	25 %	0 %	50 %	25 %	345007336
12551	NC_015955	TCC	2	6	573029	573034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007336
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12553	NC_015955	GAG	2	6	573079	573084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007336
12554	NC_015955	CA	3	6	573094	573099	50 %	0 %	0 %	50 %	345007336
12555	NC_015955	GTA	2	6	573127	573132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007336
12556	NC_015955	CGG	2	6	573198	573203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007336
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12558	NC_015955	GGT	2	6	573271	573276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007336
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12563	NC_015955	GAG	2	6	573403	573408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007336
12564	NC_015955	TCG	2	6	573425	573430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007336
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12566	NC_015955	ACT	2	6	573548	573553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_015955	TAG	2	6	573575	573580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_015955	CAG	2	6	573629	573634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12569	NC_015955	GTG	2	6	573697	573702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_015955	GGT	2	6	573905	573910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_015955	GCT	2	6	573970	573975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_015955	GGA	2	6	574048	574053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_015955	TCGA	2	8	574153	574160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12574	NC_015955	CGT	2	6	574248	574253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_015955	GTTT	2	8	574280	574287	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12578	NC_015955	CCCT	2	8	574401	574408	0 %	25 %	0 %	75 %	345007337
12579	NC_015955	TCG	2	6	574486	574491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007337
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12589	NC_015955	CAG	2	6	575106	575111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007338
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12592	NC_015955	TCG	3	9	575227	575235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007338
12593	NC_015955	CTGA	2	8	575249	575256	25 %	25 %	25 %	25 %	345007338
12594	NC_015955	AGT	2	6	575264	575269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007338
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12602	NC_015955	TCA	2	6	575508	575513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007339
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12611	NC_015955	GA	3	6	576000	576005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_015955	GCA	2	6	576079	576084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12615	NC_015955	GTC	2	6	576128	576133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12616	NC_015955	GA	3	6	576146	576151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_015955	ACGT	2	8	576205	576212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12618	NC_015955	ATG	2	6	576270	576275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12851	NC_015955	GACG	2	8	587253	587260	25 %	0 %	50 %	25 %	345007348
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12854	NC_015955	CT	3	6	587358	587363	0 %	50 %	0 %	50 %	345007348
12855	NC_015955	CGA	2	6	587491	587496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007348
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12982	NC_015955	AGAGG	2	10	593683	593692	40 %	0 %	60 %	0 %	345007352
12983	NC_015955	TTG	2	6	593707	593712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007352
12984	NC_015955	GTT	2	6	593737	593742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007352
12985	NC_015955	TGG	2	6	593781	593786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007352
12986	NC_015955	CGAG	2	8	593832	593839	25 %	0 %	50 %	25 %	345007352
12987	NC_015955	CAC	2	6	593858	593863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007352
12988	NC_015955	TGAT	2	8	593873	593880	25 %	50 %	25 %	0 %	345007352
12989	NC_015955	ACA	2	6	593894	593899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007352
12990	NC_015955	AGA	2	6	593904	593909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007352
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12992	NC_015955	CTC	2	6	593996	594001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12993	NC_015955	CAG	2	6	594003	594008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12994	NC_015955	ATCA	2	8	594054	594061	50 %	25 %	0 %	25 %	345007353
12995	NC_015955	CTTA	2	8	594062	594069	25 %	50 %	0 %	25 %	345007353
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12998	NC_015955	AT	4	8	594218	594225	50 %	50 %	0 %	0 %	345007353
12999	NC_015955	ACC	2	6	594251	594256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007353
13000	NC_015955	TG	3	6	594428	594433	0 %	50 %	50 %	0 %	345007353

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