MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_015955	ATG	2	6	548599	548604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007311
12003	NC_015955	ACC	3	9	548611	548619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007311
12004	NC_015955	TCG	2	6	548629	548634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007311
12005	NC_015955	CAG	2	6	548637	548642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007311
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12007	NC_015955	GTC	2	6	548655	548660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007311
12008	NC_015955	GA	3	6	548669	548674	50 %	0 %	50 %	0 %	345007311
12009	NC_015955	GCG	2	6	548740	548745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007311
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12011	NC_015955	GAG	2	6	548793	548798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007311
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12013	NC_015955	AGGCG	2	10	548867	548876	20 %	0 %	60 %	20 %	345007311
12014	NC_015955	ACC	2	6	548886	548891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007311
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12017	NC_015955	CGA	2	6	549020	549025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007311
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12118	NC_015955	CGT	2	6	553375	553380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007313
12119	NC_015955	CGC	2	6	553416	553421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007313
12120	NC_015955	CGC	2	6	553443	553448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007313
12121	NC_015955	GTA	2	6	553565	553570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007313
12122	NC_015955	CTG	2	6	553577	553582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007313
12123	NC_015955	TC	3	6	553600	553605	0 %	50 %	0 %	50 %	345007313
12124	NC_015955	TC	3	6	553615	553620	0 %	50 %	0 %	50 %	345007313
12125	NC_015955	GAG	2	6	553631	553636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007313
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12127	NC_015955	AGTTC	2	10	553750	553759	20 %	40 %	20 %	20 %	345007313
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12129	NC_015955	CTT	2	6	554005	554010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007313
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12142	NC_015955	CGT	2	6	554497	554502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007314
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12155	NC_015955	CCA	2	6	555215	555220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007314
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12159	NC_015955	CTCAT	2	10	555457	555466	20 %	40 %	0 %	40 %	345007315
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12187	NC_015955	AG	3	6	557198	557203	50 %	0 %	50 %	0 %	345007316
12188	NC_015955	TCGA	2	8	557220	557227	25 %	25 %	25 %	25 %	345007316
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12193	NC_015955	GTC	3	9	557354	557362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007316
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12195	NC_015955	CGA	2	6	557521	557526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007316
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12198	NC_015955	GGAC	2	8	557671	557678	25 %	0 %	50 %	25 %	345007316
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12203	NC_015955	TTC	2	6	557894	557899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007316
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12215	NC_015955	GGCT	2	8	558390	558397	0 %	25 %	50 %	25 %	345007317
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12222	NC_015955	CGGCG	2	10	558607	558616	0 %	0 %	60 %	40 %	345007318
12223	NC_015955	TTG	2	6	558743	558748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12224	NC_015955	AAAT	2	8	558764	558771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12225	NC_015955	TCT	2	6	558773	558778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12226	NC_015955	GTT	2	6	558818	558823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12227	NC_015955	GATC	2	8	558860	558867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12228	NC_015955	GT	3	6	558877	558882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12229	NC_015955	AGT	2	6	558920	558925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12230	NC_015955	TGAC	2	8	558934	558941	25 %	25 %	25 %	25 %	345007319
12231	NC_015955	ACA	2	6	558956	558961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007319
12232	NC_015955	CCGCA	2	10	558989	558998	20 %	0 %	20 %	60 %	345007319
12233	NC_015955	CGA	2	6	559031	559036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007319
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12235	NC_015955	GCAA	2	8	559094	559101	50 %	0 %	25 %	25 %	345007319
12236	NC_015955	CAG	2	6	559102	559107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007319
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12347	NC_015955	GTCG	2	8	563695	563702	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12348	NC_015955	CGC	2	6	563710	563715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12349	NC_015955	CT	3	6	563765	563770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12350	NC_015955	GA	4	8	563787	563794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12351	NC_015955	AG	3	6	563825	563830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12352	NC_015955	CCA	2	6	563843	563848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12353	NC_015955	CCGT	2	8	563887	563894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12354	NC_015955	TCG	2	6	563900	563905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12355	NC_015955	CCG	2	6	563938	563943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12356	NC_015955	ATC	2	6	563970	563975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007323
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12359	NC_015955	CGA	2	6	564110	564115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007323
12360	NC_015955	CCT	2	6	564116	564121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007323
12361	NC_015955	CGA	2	6	564151	564156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007323
12362	NC_015955	CGTG	2	8	564170	564177	0 %	25 %	50 %	25 %	345007323
12363	NC_015955	CGAC	2	8	564178	564185	25 %	0 %	25 %	50 %	345007323
12364	NC_015955	ATC	2	6	564243	564248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007323
12365	NC_015955	CGA	3	9	564331	564339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007323
12366	NC_015955	CCG	2	6	564340	564345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007323
12367	NC_015955	TCC	2	6	564424	564429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007323
12368	NC_015955	GAC	2	6	564489	564494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007323
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12370	NC_015955	GTC	2	6	564555	564560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007323
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12373	NC_015955	CGA	2	6	564616	564621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007323
12374	NC_015955	TCA	2	6	564631	564636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007323
12375	NC_015955	CGA	2	6	564704	564709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007323
12376	NC_015955	TCC	2	6	564727	564732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007323
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12378	NC_015955	GCT	2	6	564757	564762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007323
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12381	NC_015955	GAC	2	6	564948	564953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007323
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12383	NC_015955	TCG	2	6	565117	565122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007323
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12387	NC_015955	CCA	2	6	565449	565454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12388	NC_015955	GAT	2	6	565483	565488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12389	NC_015955	TC	3	6	565491	565496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12390	NC_015955	ACG	2	6	565514	565519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12391	NC_015955	TC	3	6	565529	565534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12392	NC_015955	GTC	2	6	565579	565584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007324
12393	NC_015955	CCTC	2	8	565636	565643	0 %	25 %	0 %	75 %	345007324
12394	NC_015955	CA	3	6	565676	565681	50 %	0 %	0 %	50 %	345007324
12395	NC_015955	TCG	2	6	565718	565723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007324
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12399	NC_015955	CG	3	6	565825	565830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12400	NC_015955	CGT	3	9	565852	565860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12401	NC_015955	GTC	2	6	566016	566021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007325
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12403	NC_015955	TCCT	2	8	566156	566163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12404	NC_015955	GCG	2	6	566245	566250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12405	NC_015955	ATATCG	2	12	566331	566342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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12408	NC_015955	GTCGG	2	10	566535	566544	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12409	NC_015955	C	6	6	566565	566570	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12410	NC_015955	GTG	2	6	566580	566585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12411	NC_015955	TCGA	2	8	566673	566680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12412	NC_015955	GGT	2	6	566688	566693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12426	NC_015955	GCG	2	6	567265	567270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007327
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12428	NC_015955	TGC	2	6	567434	567439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007328
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12434	NC_015955	GTC	2	6	567594	567599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007328
12435	NC_015955	GGTGC	2	10	567600	567609	0 %	20 %	60 %	20 %	345007328
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12444	NC_015955	CCG	2	6	568007	568012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12445	NC_015955	CCG	2	6	568163	568168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12450	NC_015955	ACAT	2	8	568327	568334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12451	NC_015955	AGT	2	6	568353	568358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12472	NC_015955	CTG	2	6	569018	569023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007331
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12478	NC_015955	GGTC	2	8	569271	569278	0 %	25 %	50 %	25 %	345007331
12479	NC_015955	CGAC	2	8	569326	569333	25 %	0 %	25 %	50 %	345007331
12480	NC_015955	TCGG	2	8	569374	569381	0 %	25 %	50 %	25 %	345007331
12481	NC_015955	GAC	2	6	569428	569433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007331
12482	NC_015955	TCA	2	6	569515	569520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007331
12483	NC_015955	CGT	2	6	569554	569559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007331
12484	NC_015955	GAC	2	6	569621	569626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007331
12485	NC_015955	CAC	2	6	569643	569648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007331
12486	NC_015955	GAG	2	6	569666	569671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007331
12487	NC_015955	GAG	2	6	569792	569797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12488	NC_015955	TACT	2	8	569819	569826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12489	NC_015955	GAA	2	6	569912	569917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007332
12490	NC_015955	GCT	2	6	569921	569926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007332
12491	NC_015955	TCC	2	6	569929	569934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007332
12492	NC_015955	TGT	2	6	569961	569966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007332
12493	NC_015955	AT	3	6	569980	569985	50 %	50 %	0 %	0 %	345007332
12494	NC_015955	TGAC	2	8	570044	570051	25 %	25 %	25 %	25 %	345007333
12495	NC_015955	AC	3	6	570101	570106	50 %	0 %	0 %	50 %	345007333
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12497	NC_015955	CTGG	2	8	570154	570161	0 %	25 %	50 %	25 %	345007333
12498	NC_015955	CGGGA	2	10	570186	570195	20 %	0 %	60 %	20 %	345007333
12499	NC_015955	GAG	2	6	570217	570222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007333
12500	NC_015955	GAT	2	6	570259	570264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007333

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