MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_015955	AGG	2	6	525726	525731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007289
11503	NC_015955	AGT	2	6	525745	525750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007289
11504	NC_015955	CGA	2	6	525757	525762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007289
11505	NC_015955	CGG	2	6	525782	525787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007289
11506	NC_015955	TCG	2	6	525816	525821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007289
11507	NC_015955	GTG	2	6	525858	525863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007289
11508	NC_015955	ATC	2	6	525866	525871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007289
11509	NC_015955	GATC	2	8	525901	525908	25 %	25 %	25 %	25 %	345007289
11510	NC_015955	TGCGG	2	10	525910	525919	0 %	20 %	60 %	20 %	345007289
11511	NC_015955	CGG	2	6	525999	526004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007289
11512	NC_015955	CAG	2	6	526046	526051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007289
11513	NC_015955	GGT	2	6	526059	526064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007289
11514	NC_015955	GAA	2	6	526090	526095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007289
11515	NC_015955	GGC	2	6	526096	526101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007289
11516	NC_015955	CGG	2	6	526128	526133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007289
11517	NC_015955	AGG	2	6	526140	526145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007289
11518	NC_015955	TGA	2	6	526149	526154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007289
11519	NC_015955	GCG	2	6	526180	526185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007289
11520	NC_015955	A	6	6	526187	526192	100 %	0 %	0 %	0 %	345007289
11521	NC_015955	GAG	2	6	526211	526216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007289
11522	NC_015955	GAT	2	6	526224	526229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007289
11523	NC_015955	CGT	2	6	526243	526248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007290
11524	NC_015955	CTG	2	6	526339	526344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007290
11525	NC_015955	G	6	6	526359	526364	0 %	0 %	100 %	0 %	345007290
11526	NC_015955	GAC	2	6	526398	526403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007290
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11528	NC_015955	GGT	2	6	526417	526422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007290
11529	NC_015955	CAG	2	6	526436	526441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007290
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11531	NC_015955	TCAG	2	8	526580	526587	25 %	25 %	25 %	25 %	345007290
11532	NC_015955	GAT	2	6	526633	526638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007290
11533	NC_015955	TCT	2	6	526686	526691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007290
11534	NC_015955	GAT	2	6	526707	526712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007290
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11540	NC_015955	CGG	2	6	527078	527083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007290
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11544	NC_015955	GAT	2	6	527467	527472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007290
11545	NC_015955	GAA	2	6	527520	527525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_015955	AG	3	6	527537	527542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_015955	CGG	2	6	527547	527552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_015955	AGC	3	9	527577	527585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_015955	TTC	2	6	527667	527672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_015955	GTC	2	6	527697	527702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_015955	CTG	2	6	527782	527787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_015955	CCT	2	6	527877	527882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11553	NC_015955	GAA	2	6	527890	527895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_015955	CGC	2	6	527956	527961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11555	NC_015955	CG	3	6	527983	527988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11556	NC_015955	CAG	2	6	528013	528018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_015955	CCGTGA	2	12	528030	528041	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_015955	GTC	2	6	528100	528105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_015955	CGA	2	6	528108	528113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_015955	TCC	2	6	528134	528139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11561	NC_015955	CAC	2	6	528140	528145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11562	NC_015955	TGA	2	6	528177	528182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_015955	CCT	2	6	528183	528188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11564	NC_015955	GAGC	2	8	528196	528203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11565	NC_015955	GAA	2	6	528265	528270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_015955	CCGG	2	8	528310	528317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11567	NC_015955	ATG	2	6	528344	528349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_015955	CGC	2	6	528363	528368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11569	NC_015955	CCT	2	6	528444	528449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11570	NC_015955	TGA	2	6	528477	528482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_015955	GTCG	2	8	528493	528500	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11572	NC_015955	CGG	2	6	528603	528608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_015955	GTC	2	6	528632	528637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_015955	TCGGTA	2	12	528725	528736	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11575	NC_015955	CGA	2	6	528813	528818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11577	NC_015955	TTGGAG	2	12	528919	528930	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_015955	AATG	2	8	529040	529047	50 %	25 %	25 %	0 %	345007291
11579	NC_015955	GACG	2	8	529141	529148	25 %	0 %	50 %	25 %	345007291
11580	NC_015955	GAAC	2	8	529172	529179	50 %	0 %	25 %	25 %	345007291
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11592	NC_015955	CCGT	2	8	529861	529868	0 %	25 %	25 %	50 %	345007292
11593	NC_015955	GAA	2	6	529878	529883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007292
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11595	NC_015955	GTG	2	6	529948	529953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_015955	GTG	2	6	529955	529960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_015955	AT	3	6	530044	530049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_015955	T	6	6	530064	530069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_015955	TC	3	6	530117	530122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11600	NC_015955	TGGAT	2	10	530177	530186	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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11603	NC_015955	TG	3	6	530546	530551	0 %	50 %	50 %	0 %	345007293
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11607	NC_015955	CGA	2	6	530716	530721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007293
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11610	NC_015955	GTC	2	6	530922	530927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007293
11611	NC_015955	AT	3	6	531021	531026	50 %	50 %	0 %	0 %	345007293
11612	NC_015955	CGCT	2	8	531036	531043	0 %	25 %	25 %	50 %	345007293
11613	NC_015955	TCA	2	6	531057	531062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007293
11614	NC_015955	AATTC	2	10	531079	531088	40 %	40 %	0 %	20 %	345007293
11615	NC_015955	GAG	2	6	531143	531148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007293
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11617	NC_015955	ACTG	2	8	531294	531301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11618	NC_015955	CGG	2	6	531313	531318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_015955	GGT	2	6	531438	531443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_015955	CAA	2	6	531474	531479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_015955	GCG	2	6	531485	531490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_015955	GAC	2	6	531556	531561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007294
11623	NC_015955	CCG	2	6	531644	531649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007294
11624	NC_015955	GGA	2	6	531672	531677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007294
11625	NC_015955	GTC	2	6	531679	531684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007294
11626	NC_015955	GC	3	6	531696	531701	0 %	0 %	50 %	50 %	345007294
11627	NC_015955	ATC	2	6	531703	531708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007294
11628	NC_015955	GTC	2	6	531745	531750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007294
11629	NC_015955	TTCGAC	2	12	531778	531789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345007294
11630	NC_015955	CCA	2	6	531812	531817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007294
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11632	NC_015955	CAG	2	6	531862	531867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007294
11633	NC_015955	GCT	2	6	531891	531896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007294
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11635	NC_015955	CGA	2	6	531972	531977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007294
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11639	NC_015955	GTCG	2	8	532143	532150	0 %	25 %	50 %	25 %	345007294
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11642	NC_015955	CAAACC	2	12	532330	532341	50 %	0 %	0 %	50 %	345007294
11643	NC_015955	CAC	2	6	532378	532383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007294
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11646	NC_015955	ACA	2	6	532424	532429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007294
11647	NC_015955	TCGA	2	8	532468	532475	25 %	25 %	25 %	25 %	345007294
11648	NC_015955	CAC	2	6	532503	532508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007294
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11652	NC_015955	GCG	2	6	532610	532615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007294
11653	NC_015955	CGA	2	6	532617	532622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007294
11654	NC_015955	ACGTAC	2	12	532624	532635	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007294
11655	NC_015955	ACG	2	6	532757	532762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007294
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11658	NC_015955	CGT	2	6	532851	532856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007294
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11662	NC_015955	CTT	2	6	532954	532959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11663	NC_015955	CAT	2	6	533005	533010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007295
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11695	NC_015955	CACC	2	8	535021	535028	25 %	0 %	0 %	75 %	345007297
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11729	NC_015955	GGC	2	6	536890	536895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11730	NC_015955	CAG	2	6	536904	536909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11988	NC_015955	CGG	2	6	547973	547978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007311
11989	NC_015955	CGT	2	6	547982	547987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007311
11990	NC_015955	GTC	2	6	548103	548108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007311
11991	NC_015955	GGT	2	6	548143	548148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007311
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