MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015955	TCCAGA	2	12	453749	453760	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007232
10002	NC_015955	AACC	2	8	453772	453779	50 %	0 %	0 %	50 %	345007232
10003	NC_015955	GAA	2	6	453813	453818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007232
10004	NC_015955	ATG	2	6	453868	453873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007232
10005	NC_015955	AGTC	2	8	453878	453885	25 %	25 %	25 %	25 %	345007232
10006	NC_015955	GCG	2	6	453911	453916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007232
10007	NC_015955	TGA	2	6	453971	453976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007232
10008	NC_015955	GCG	2	6	454000	454005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007232
10009	NC_015955	TCG	2	6	454051	454056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007232
10010	NC_015955	GAA	2	6	454086	454091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007232
10011	NC_015955	GGA	2	6	454106	454111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007232
10012	NC_015955	ATC	2	6	454123	454128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007232
10013	NC_015955	CCG	2	6	454148	454153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007232
10014	NC_015955	GA	3	6	454165	454170	50 %	0 %	50 %	0 %	345007232
10015	NC_015955	TCCG	2	8	454204	454211	0 %	25 %	25 %	50 %	345007232
10016	NC_015955	AGC	2	6	454225	454230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007232
10017	NC_015955	CGA	2	6	454247	454252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007232
10018	NC_015955	GGT	2	6	454293	454298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007232
10019	NC_015955	CAT	2	6	454417	454422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007233
10020	NC_015955	GTC	2	6	454489	454494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007233
10021	NC_015955	GGAT	2	8	454543	454550	25 %	25 %	50 %	0 %	345007233
10022	NC_015955	CGA	2	6	454590	454595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007233
10023	NC_015955	AGT	2	6	454635	454640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007233
10024	NC_015955	AC	3	6	454647	454652	50 %	0 %	0 %	50 %	345007233
10025	NC_015955	CTT	2	6	454705	454710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007233
10026	NC_015955	CG	3	6	454716	454721	0 %	0 %	50 %	50 %	345007233
10027	NC_015955	TCG	2	6	454742	454747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007233
10028	NC_015955	ACT	2	6	454753	454758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007233
10029	NC_015955	C	7	7	454804	454810	0 %	0 %	0 %	100 %	345007233
10030	NC_015955	CGT	2	6	454887	454892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007233
10031	NC_015955	GCAT	2	8	454901	454908	25 %	25 %	25 %	25 %	345007233
10032	NC_015955	GTT	2	6	454963	454968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007233
10033	NC_015955	GTC	2	6	454972	454977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007233
10034	NC_015955	CCA	2	6	454986	454991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007233
10035	NC_015955	CGT	2	6	455058	455063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007233
10036	NC_015955	C	6	6	455092	455097	0 %	0 %	0 %	100 %	345007233
10037	NC_015955	CCG	2	6	455186	455191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007233
10038	NC_015955	CGC	2	6	455207	455212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007233
10039	NC_015955	TTG	2	6	455219	455224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007233
10040	NC_015955	TAA	2	6	455277	455282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_015955	TTAG	2	8	455304	455311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_015955	CTT	2	6	455347	455352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_015955	CGC	2	6	455535	455540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007234
10044	NC_015955	GGGT	2	8	455610	455617	0 %	25 %	75 %	0 %	345007234
10045	NC_015955	TCG	2	6	455663	455668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007234
10046	NC_015955	CGA	2	6	455679	455684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007234
10047	NC_015955	TC	3	6	455775	455780	0 %	50 %	0 %	50 %	345007234
10048	NC_015955	GAG	2	6	455803	455808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007234
10049	NC_015955	CGA	2	6	455877	455882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007234
10050	NC_015955	AC	3	6	455887	455892	50 %	0 %	0 %	50 %	345007234
10051	NC_015955	GTT	2	6	455940	455945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007234
10052	NC_015955	CCG	2	6	455967	455972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007234
10053	NC_015955	CGG	2	6	455994	455999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007234
10054	NC_015955	GGCGCG	2	12	456062	456073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007234
10055	NC_015955	AGC	2	6	456092	456097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007234
10056	NC_015955	CGT	2	6	456210	456215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007234
10057	NC_015955	CGA	2	6	456237	456242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007234
10058	NC_015955	GA	3	6	456270	456275	50 %	0 %	50 %	0 %	345007234
10059	NC_015955	AGTTG	2	10	456324	456333	20 %	40 %	40 %	0 %	345007234
10060	NC_015955	CTG	2	6	456430	456435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007234
10061	NC_015955	CGA	2	6	456477	456482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007234
10062	NC_015955	CCG	2	6	456493	456498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007234
10063	NC_015955	GCG	2	6	456508	456513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007234
10064	NC_015955	TCC	2	6	456539	456544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007234
10065	NC_015955	CCG	2	6	456577	456582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007234
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10067	NC_015955	CGCT	2	8	456647	456654	0 %	25 %	25 %	50 %	345007234
10068	NC_015955	AATGC	2	10	456828	456837	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10069	NC_015955	CT	3	6	456843	456848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10070	NC_015955	GT	3	6	456874	456879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_015955	GAA	2	6	456906	456911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_015955	TAT	2	6	456985	456990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_015955	CAG	2	6	456993	456998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_015955	CAGC	2	8	457123	457130	25 %	0 %	25 %	50 %	345007235
10075	NC_015955	CGT	2	6	457212	457217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007235
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10077	NC_015955	CGAC	2	8	457347	457354	25 %	0 %	25 %	50 %	345007235
10078	NC_015955	CCG	2	6	457372	457377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007235
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10081	NC_015955	GAA	2	6	457480	457485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007235
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10086	NC_015955	CACAC	2	10	457812	457821	40 %	0 %	0 %	60 %	345007235
10087	NC_015955	ATC	2	6	457840	457845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007235
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10089	NC_015955	GGAA	2	8	457974	457981	50 %	0 %	50 %	0 %	345007235
10090	NC_015955	TCC	2	6	458035	458040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10091	NC_015955	CGA	2	6	458142	458147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_015955	GTC	2	6	458160	458165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_015955	CGA	2	6	458262	458267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_015955	CGGCA	2	10	458290	458299	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10095	NC_015955	AGC	2	6	458301	458306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_015955	CGT	2	6	458359	458364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_015955	CTG	2	6	458390	458395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_015955	CA	3	6	458412	458417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10099	NC_015955	ATC	2	6	458431	458436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_015955	CGAG	2	8	458496	458503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10101	NC_015955	CTT	2	6	458562	458567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_015955	CCT	2	6	458591	458596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10103	NC_015955	TCA	2	6	458616	458621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_015955	AAT	2	6	458627	458632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_015955	GAA	2	6	458666	458671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007236
10106	NC_015955	AGG	2	6	458769	458774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007236
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10108	NC_015955	CTG	2	6	458844	458849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007236
10109	NC_015955	CAA	2	6	459001	459006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_015955	ACC	2	6	459143	459148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007237
10111	NC_015955	ACG	2	6	459161	459166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007237
10112	NC_015955	CAC	2	6	459171	459176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007237
10113	NC_015955	AG	3	6	459291	459296	50 %	0 %	50 %	0 %	345007237
10114	NC_015955	ACG	2	6	459323	459328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007237
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10116	NC_015955	AGTA	2	8	459419	459426	50 %	25 %	25 %	0 %	345007237
10117	NC_015955	CAGT	2	8	459438	459445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10118	NC_015955	ACA	2	6	459564	459569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007238
10119	NC_015955	AAC	2	6	459570	459575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007238
10120	NC_015955	GAC	2	6	459591	459596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007238
10121	NC_015955	GCA	2	6	459612	459617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007238
10122	NC_015955	CAC	2	6	459745	459750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007238
10123	NC_015955	AC	3	6	459767	459772	50 %	0 %	0 %	50 %	345007238
10124	NC_015955	GAG	2	6	459879	459884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007238
10125	NC_015955	ATC	2	6	459888	459893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007238
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10128	NC_015955	ACG	3	9	460059	460067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007238
10129	NC_015955	ATC	2	6	460075	460080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007238
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10132	NC_015955	ATT	2	6	460248	460253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345007238
10133	NC_015955	GAC	2	6	460262	460267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007238
10134	NC_015955	CAG	2	6	460303	460308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007238
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10136	NC_015955	ACG	2	6	460393	460398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007238
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10228	NC_015955	GT	4	8	464909	464916	0 %	50 %	50 %	0 %	345007241
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10234	NC_015955	TCGAT	2	10	465169	465178	20 %	40 %	20 %	20 %	345007241
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10237	NC_015955	CGA	2	6	465253	465258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007241
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10239	NC_015955	CTT	2	6	465380	465385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007241
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10241	NC_015955	CTC	2	6	465479	465484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007241
10242	NC_015955	GGC	2	6	465537	465542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007241
10243	NC_015955	TCG	2	6	465576	465581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007241
10244	NC_015955	CGA	2	6	465586	465591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007241
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10250	NC_015955	CGT	2	6	465851	465856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007241
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10261	NC_015955	TCG	2	6	466365	466370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007241
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10350	NC_015955	CTG	2	6	471238	471243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007245
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10353	NC_015955	TTC	2	6	471457	471462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007245
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10485	NC_015955	GA	3	6	478401	478406	50 %	0 %	50 %	0 %	345007251
10486	NC_015955	AGTTG	2	10	478455	478464	20 %	40 %	40 %	0 %	345007251
10487	NC_015955	CTG	2	6	478561	478566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007251
10488	NC_015955	CGA	2	6	478608	478613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007251
10489	NC_015955	CCG	2	6	478624	478629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007251
10490	NC_015955	GCG	2	6	478639	478644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007251
10491	NC_015955	TCC	2	6	478670	478675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007251
10492	NC_015955	CCG	2	6	478708	478713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007251
10493	NC_015955	AGA	2	6	478742	478747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007251
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10500	NC_015955	ACA	2	6	479237	479242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007252

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