MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015955	GAA	2	6	297656	297661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007076
6502	NC_015955	AGT	2	6	297711	297716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007076
6503	NC_015955	TTC	2	6	297729	297734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007076
6504	NC_015955	GCT	2	6	297812	297817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007076
6505	NC_015955	ATC	2	6	297849	297854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007076
6506	NC_015955	GTAC	2	8	297976	297983	25 %	25 %	25 %	25 %	345007076
6507	NC_015955	CGC	2	6	298028	298033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007076
6508	NC_015955	CAC	2	6	298054	298059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007076
6509	NC_015955	ACT	2	6	298075	298080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007076
6510	NC_015955	CGACAA	2	12	298132	298143	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345007076
6511	NC_015955	GCT	2	6	298163	298168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007076
6512	NC_015955	GTG	3	9	298173	298181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007076
6513	NC_015955	GGCG	2	8	298245	298252	0 %	0 %	75 %	25 %	345007076
6514	NC_015955	TGG	3	9	298260	298268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007076
6515	NC_015955	CGA	2	6	298296	298301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007076
6516	NC_015955	GAC	2	6	298356	298361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007076
6517	NC_015955	ACC	2	6	298376	298381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007076
6518	NC_015955	GAGT	2	8	298399	298406	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_015955	CGG	2	6	298423	298428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_015955	CCG	3	9	298433	298441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6521	NC_015955	TCCG	2	8	298463	298470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6522	NC_015955	TC	3	6	298475	298480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6523	NC_015955	CTC	2	6	298686	298691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007077
6524	NC_015955	CG	3	6	298770	298775	0 %	0 %	50 %	50 %	345007077
6525	NC_015955	CGA	2	6	298823	298828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007077
6526	NC_015955	TTC	2	6	298848	298853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007077
6527	NC_015955	ACG	2	6	298933	298938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007077
6528	NC_015955	ACGAG	2	10	298964	298973	40 %	0 %	40 %	20 %	345007077
6529	NC_015955	CGGAG	2	10	299090	299099	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6530	NC_015955	TTC	2	6	299153	299158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_015955	CGA	2	6	299206	299211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_015955	GGC	2	6	299221	299226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_015955	GCC	2	6	299278	299283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6534	NC_015955	TTC	2	6	299302	299307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_015955	ACCG	2	8	299319	299326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6536	NC_015955	CCGA	2	8	299353	299360	25 %	0 %	25 %	50 %	345007078
6537	NC_015955	GGC	2	6	299406	299411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007078
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6540	NC_015955	CGA	2	6	299593	299598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007079
6541	NC_015955	GTC	2	6	299654	299659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007079
6542	NC_015955	GTTC	2	8	299686	299693	0 %	50 %	25 %	25 %	345007079
6543	NC_015955	CGT	2	6	299707	299712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007079
6544	NC_015955	CGA	2	6	299716	299721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007079
6545	NC_015955	GCCG	2	8	299737	299744	0 %	0 %	50 %	50 %	345007079
6546	NC_015955	CGT	2	6	299767	299772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007079
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6548	NC_015955	GTC	2	6	299823	299828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007079
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6550	NC_015955	TCG	2	6	299983	299988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007079
6551	NC_015955	GTC	2	6	300032	300037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007079
6552	NC_015955	GA	3	6	300126	300131	50 %	0 %	50 %	0 %	345007079
6553	NC_015955	ATC	2	6	300156	300161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007079
6554	NC_015955	GCT	2	6	300206	300211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007079
6555	NC_015955	TTC	2	6	300231	300236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007079
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6557	NC_015955	GTC	2	6	300368	300373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007079
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6559	NC_015955	TCG	2	6	300420	300425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007079
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6565	NC_015955	GTC	2	6	300776	300781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007079
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6570	NC_015955	TCG	2	6	301017	301022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007079
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6574	NC_015955	TCGC	2	8	301203	301210	0 %	25 %	25 %	50 %	345007079
6575	NC_015955	CTTCC	2	10	301221	301230	0 %	40 %	0 %	60 %	345007079
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6581	NC_015955	TA	3	6	301613	301618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_015955	GA	3	6	301654	301659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6585	NC_015955	TAAC	2	8	301888	301895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6587	NC_015955	CGA	2	6	301940	301945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_015955	AGT	2	6	301969	301974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6590	NC_015955	TGC	2	6	302021	302026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_015955	GTGGC	2	10	302036	302045	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6592	NC_015955	TGG	2	6	302120	302125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_015955	CT	3	6	302142	302147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6594	NC_015955	TAG	2	6	302152	302157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_015955	TCG	2	6	302241	302246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_015955	CCA	2	6	302270	302275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6597	NC_015955	AT	3	6	302386	302391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_015955	GTA	2	6	302401	302406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_015955	CCGA	2	8	302430	302437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6600	NC_015955	CAAA	2	8	302446	302453	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6601	NC_015955	CTCC	2	8	302489	302496	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6602	NC_015955	GATC	2	8	302535	302542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6603	NC_015955	CAGT	2	8	302567	302574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6604	NC_015955	GTC	2	6	302600	302605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_015955	CTA	2	6	302665	302670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_015955	ACTC	2	8	302695	302702	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6607	NC_015955	TAA	2	6	302715	302720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_015955	GC	4	8	302763	302770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6609	NC_015955	TGA	2	6	302785	302790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_015955	TAG	2	6	302860	302865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_015955	AACC	2	8	302883	302890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6612	NC_015955	TCGA	2	8	302907	302914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6613	NC_015955	GTA	2	6	303007	303012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_015955	AGT	2	6	303060	303065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_015955	GTC	2	6	303154	303159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_015955	GAC	2	6	303186	303191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_015955	GTA	2	6	303278	303283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_015955	TCCG	2	8	303330	303337	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6619	NC_015955	TGA	2	6	303349	303354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_015955	CGC	2	6	303417	303422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6621	NC_015955	AATGG	2	10	303423	303432	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_015955	G	6	6	303439	303444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_015955	CCGAT	2	10	303455	303464	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6624	NC_015955	CT	3	6	303513	303518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6625	NC_015955	GAAC	2	8	303567	303574	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6627	NC_015955	GACC	2	8	303662	303669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6992	NC_015955	TCG	2	6	317886	317891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6993	NC_015955	TTC	2	6	317925	317930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6994	NC_015955	GGT	2	6	318007	318012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6995	NC_015955	CGA	2	6	318049	318054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007092
6996	NC_015955	CGA	2	6	318085	318090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007092
6997	NC_015955	GGC	2	6	318179	318184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007092
6998	NC_015955	GCTCG	2	10	318202	318211	0 %	20 %	40 %	40 %	345007092
6999	NC_015955	GGTG	2	8	318235	318242	0 %	25 %	75 %	0 %	345007092
7000	NC_015955	CG	3	6	318320	318325	0 %	0 %	50 %	50 %	345007092

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