MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015955	CT	3	6	256588	256593	0 %	50 %	0 %	50 %	345007041
5502	NC_015955	CGG	2	6	256627	256632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007041
5503	NC_015955	ACC	2	6	256705	256710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007041
5504	NC_015955	CCTG	2	8	256734	256741	0 %	25 %	25 %	50 %	345007041
5505	NC_015955	CTG	2	6	256758	256763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
5506	NC_015955	TGG	2	6	256791	256796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007041
5507	NC_015955	GAG	2	6	256929	256934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007041
5508	NC_015955	GAG	2	6	257001	257006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007041
5509	NC_015955	CTG	2	6	257049	257054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
5510	NC_015955	CTG	2	6	257109	257114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
5511	NC_015955	GAA	2	6	257133	257138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007041
5512	NC_015955	CATT	2	8	257205	257212	25 %	50 %	0 %	25 %	345007041
5513	NC_015955	TCC	2	6	257284	257289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007041
5514	NC_015955	CTG	2	6	257292	257297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
5515	NC_015955	CTG	2	6	257301	257306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007041
5516	NC_015955	CTACAA	2	12	257396	257407	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	345007041
5517	NC_015955	GAA	2	6	257409	257414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007041
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5520	NC_015955	CGG	2	6	257537	257542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007041
5521	NC_015955	AAG	2	6	257692	257697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007041
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5534	NC_015955	GAT	2	6	258468	258473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007041
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5539	NC_015955	ATCA	2	8	258755	258762	50 %	25 %	0 %	25 %	345007041
5540	NC_015955	TCC	2	6	258805	258810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007041
5541	NC_015955	CAGT	2	8	258826	258833	25 %	25 %	25 %	25 %	345007041
5542	NC_015955	TAT	2	6	258848	258853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345007041
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5552	NC_015955	CGG	2	6	259236	259241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007041
5553	NC_015955	GAT	2	6	259248	259253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007041
5554	NC_015955	GCAG	2	8	259271	259278	25 %	0 %	50 %	25 %	345007041
5555	NC_015955	GAA	2	6	259335	259340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007041
5556	NC_015955	CT	3	6	259364	259369	0 %	50 %	0 %	50 %	345007041
5557	NC_015955	GAA	2	6	259404	259409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007041
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5570	NC_015955	TGG	2	6	260109	260114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007042
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5591	NC_015955	CA	3	6	260789	260794	50 %	0 %	0 %	50 %	345007043
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5608	NC_015955	CGAA	2	8	261432	261439	50 %	0 %	25 %	25 %	345007043
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5619	NC_015955	TCG	2	6	261980	261985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007043
5620	NC_015955	GCAC	2	8	261993	262000	25 %	0 %	25 %	50 %	345007043
5621	NC_015955	GAG	2	6	262015	262020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007043
5622	NC_015955	TCG	2	6	262061	262066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007043
5623	NC_015955	GCA	2	6	262205	262210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007043
5624	NC_015955	ACG	2	6	262307	262312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007043
5625	NC_015955	CAT	2	6	262323	262328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007043
5626	NC_015955	CTA	2	6	262374	262379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007043
5627	NC_015955	CGA	2	6	262392	262397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007043
5628	NC_015955	CAT	2	6	262464	262469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007043
5629	NC_015955	TC	3	6	262512	262517	0 %	50 %	0 %	50 %	345007043
5630	NC_015955	CGA	2	6	262557	262562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007043
5631	NC_015955	CCG	2	6	262570	262575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007043
5632	NC_015955	GAC	2	6	262627	262632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007043
5633	NC_015955	CGA	2	6	262650	262655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007043
5634	NC_015955	CGA	2	6	262677	262682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007043
5635	NC_015955	ATCCA	2	10	262709	262718	40 %	20 %	0 %	40 %	345007043
5636	NC_015955	TTC	2	6	262853	262858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007044
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5639	NC_015955	CCG	2	6	263051	263056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007044
5640	NC_015955	GCTCCA	2	12	263082	263093	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007044
5641	NC_015955	CTCG	2	8	263133	263140	0 %	25 %	25 %	50 %	345007044
5642	NC_015955	AGCG	2	8	263198	263205	25 %	0 %	50 %	25 %	345007044
5643	NC_015955	GAC	2	6	263215	263220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007044
5644	NC_015955	CGCA	2	8	263271	263278	25 %	0 %	25 %	50 %	345007044
5645	NC_015955	TCG	2	6	263300	263305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007044
5646	NC_015955	AGA	2	6	263321	263326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007044
5647	NC_015955	CTT	2	6	263349	263354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007044
5648	NC_015955	CGC	3	9	263401	263409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007044
5649	NC_015955	GAG	2	6	263416	263421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007044
5650	NC_015955	ACC	2	6	263441	263446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007044
5651	NC_015955	TCC	2	6	263471	263476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007044
5652	NC_015955	GAA	2	6	263482	263487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007044
5653	NC_015955	CGA	2	6	263502	263507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007044
5654	NC_015955	CGT	2	6	263520	263525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007044
5655	NC_015955	GTC	2	6	263527	263532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007044
5656	NC_015955	CA	3	6	263540	263545	50 %	0 %	0 %	50 %	345007044
5657	NC_015955	GCG	2	6	263558	263563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007044
5658	NC_015955	ACG	2	6	263645	263650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007044
5659	NC_015955	TCG	2	6	263699	263704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007044
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5661	NC_015955	TGA	2	6	263744	263749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007044
5662	NC_015955	CTAT	2	8	263768	263775	25 %	50 %	0 %	25 %	345007044
5663	NC_015955	GAC	3	9	263776	263784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007044
5664	NC_015955	GAG	2	6	263842	263847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007044
5665	NC_015955	AGC	2	6	263903	263908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007044
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5668	NC_015955	CAACCA	2	12	264026	264037	50 %	0 %	0 %	50 %	345007044
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5676	NC_015955	CGAC	2	8	264443	264450	25 %	0 %	25 %	50 %	345007044
5677	NC_015955	CAGC	2	8	264452	264459	25 %	0 %	25 %	50 %	345007044
5678	NC_015955	CAT	2	6	264489	264494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007044
5679	NC_015955	CGA	2	6	264699	264704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007044
5680	NC_015955	TCA	2	6	264722	264727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007044
5681	NC_015955	ATCC	2	8	264732	264739	25 %	25 %	0 %	50 %	345007044
5682	NC_015955	ACG	2	6	264743	264748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007044
5683	NC_015955	CGA	2	6	264761	264766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007044
5684	NC_015955	AAG	2	6	264767	264772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007044
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5686	NC_015955	CGA	2	6	264789	264794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007044
5687	NC_015955	ACG	2	6	264844	264849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007044
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5692	NC_015955	GCA	2	6	265137	265142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007044
5693	NC_015955	CGTT	2	8	265187	265194	0 %	50 %	25 %	25 %	345007044
5694	NC_015955	GGACG	2	10	265236	265245	20 %	0 %	60 %	20 %	345007044
5695	NC_015955	GAG	2	6	265261	265266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007044
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5698	NC_015955	CAT	2	6	265344	265349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007044
5699	NC_015955	GAG	2	6	265360	265365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007044
5700	NC_015955	CTC	2	6	265381	265386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007044
5701	NC_015955	CGAG	2	8	265392	265399	25 %	0 %	50 %	25 %	345007044
5702	NC_015955	AT	3	6	265422	265427	50 %	50 %	0 %	0 %	345007044
5703	NC_015955	CAG	2	6	265462	265467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007044
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5705	NC_015955	GCA	2	6	265485	265490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007044
5706	NC_015955	CGT	2	6	265654	265659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007044
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5708	NC_015955	TTG	2	6	265824	265829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5709	NC_015955	AC	3	6	265837	265842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5710	NC_015955	GGTC	2	8	265890	265897	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5711	NC_015955	GAG	2	6	265900	265905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5712	NC_015955	ACT	2	6	265948	265953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5713	NC_015955	CCG	2	6	265965	265970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5714	NC_015955	ACG	2	6	265972	265977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5715	NC_015955	GCA	2	6	266045	266050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5716	NC_015955	ACGAT	2	10	266057	266066	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5717	NC_015955	GTC	2	6	266077	266082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5718	NC_015955	CGT	2	6	266154	266159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007045
5719	NC_015955	CTC	2	6	266212	266217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007045
5720	NC_015955	CGA	2	6	266322	266327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007045
5721	NC_015955	CCG	2	6	266341	266346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007045
5722	NC_015955	ATC	2	6	266378	266383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007045
5723	NC_015955	GTC	2	6	266407	266412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007045
5724	NC_015955	CGTG	2	8	266532	266539	0 %	25 %	50 %	25 %	345007045
5725	NC_015955	TCG	2	6	266564	266569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007045
5726	NC_015955	GGA	2	6	266619	266624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007045
5727	NC_015955	CGTCG	2	10	266830	266839	0 %	20 %	40 %	40 %	345007045
5728	NC_015955	GT	3	6	266903	266908	0 %	50 %	50 %	0 %	345007045
5729	NC_015955	ACT	2	6	266923	266928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007045
5730	NC_015955	CGT	3	9	266938	266946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007045
5731	NC_015955	CGG	2	6	266982	266987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007045
5732	NC_015955	TTG	2	6	267014	267019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007045
5733	NC_015955	TG	3	6	267107	267112	0 %	50 %	50 %	0 %	345007045
5734	NC_015955	TTG	2	6	267152	267157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007045
5735	NC_015955	GAT	2	6	267327	267332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007045
5736	NC_015955	AAC	2	6	267395	267400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007045
5737	NC_015955	CTT	2	6	267408	267413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007045
5738	NC_015955	GTCG	2	8	267415	267422	0 %	25 %	50 %	25 %	345007045
5739	NC_015955	CGG	2	6	267472	267477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007046
5740	NC_015955	TCGTC	2	10	267500	267509	0 %	40 %	20 %	40 %	345007046
5741	NC_015955	TGA	2	6	267512	267517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007046
5742	NC_015955	ATC	2	6	267543	267548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007046
5743	NC_015955	GAT	2	6	267612	267617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007046
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5747	NC_015955	GTT	2	6	267789	267794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007046
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5749	NC_015955	TGA	2	6	267833	267838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007046
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5752	NC_015955	CGG	2	6	267913	267918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007046
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5776	NC_015955	GAG	2	6	268728	268733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007046
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5782	NC_015955	CGGA	2	8	268876	268883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5783	NC_015955	TG	3	6	268995	269000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5812	NC_015955	AT	3	6	270599	270604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5813	NC_015955	TAC	2	6	270617	270622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5844	NC_015955	CA	3	6	271984	271989	50 %	0 %	0 %	50 %	345007052
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5857	NC_015955	CAG	2	6	272897	272902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007052
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5859	NC_015955	ACGC	2	8	272951	272958	25 %	0 %	25 %	50 %	345007052
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5982	NC_015955	ACG	2	6	277632	277637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007055
5983	NC_015955	CGA	2	6	277657	277662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007055
5984	NC_015955	CATC	2	8	277670	277677	25 %	25 %	0 %	50 %	345007055
5985	NC_015955	CGA	2	6	277706	277711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007055
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5987	NC_015955	CGC	2	6	277748	277753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007055
5988	NC_015955	GGGT	2	8	277799	277806	0 %	25 %	75 %	0 %	345007055
5989	NC_015955	GTC	2	6	277863	277868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007055
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