MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015948	TCG	2	6	59812	59817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210364
1502	NC_015948	CGT	2	6	59828	59833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210364
1503	NC_015948	TAAC	2	8	59844	59851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_015948	GTCA	2	8	59858	59865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_015948	AGGTCG	2	12	59988	59999	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344210365
1506	NC_015948	GCG	2	6	60018	60023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210365
1507	NC_015948	ACG	2	6	60030	60035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210365
1508	NC_015948	GAG	2	6	60068	60073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210365
1509	NC_015948	GTCGGT	2	12	60098	60109	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344210365
1510	NC_015948	CGT	2	6	60130	60135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210365
1511	NC_015948	ATC	2	6	60162	60167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210365
1512	NC_015948	CGA	2	6	60206	60211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210365
1513	NC_015948	GAT	2	6	60230	60235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210365
1514	NC_015948	CGT	2	6	60244	60249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210365
1515	NC_015948	TGA	2	6	60289	60294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210365
1516	NC_015948	GGT	2	6	60319	60324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210365
1517	NC_015948	TCT	2	6	60354	60359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210365
1518	NC_015948	C	6	6	60451	60456	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1519	NC_015948	CAG	2	6	60518	60523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_015948	TAG	3	9	60529	60537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015948	GGC	2	6	60583	60588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210366
1522	NC_015948	AGG	2	6	60591	60596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210366
1523	NC_015948	CGA	2	6	60601	60606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210366
1524	NC_015948	GAAGA	2	10	60611	60620	60 %	0 %	40 %	0 %	344210366
1525	NC_015948	TCC	2	6	60630	60635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210366
1526	NC_015948	CTC	2	6	60733	60738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210366
1527	NC_015948	GGACCC	2	12	60781	60792	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344210366
1528	NC_015948	GC	3	6	60931	60936	0 %	0 %	50 %	50 %	344210366
1529	NC_015948	CGC	2	6	60961	60966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210366
1530	NC_015948	TTC	2	6	60980	60985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210366
1531	NC_015948	CGA	2	6	61014	61019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210366
1532	NC_015948	ACG	2	6	61029	61034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210366
1533	NC_015948	CGG	2	6	61036	61041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210366
1534	NC_015948	CAT	2	6	61090	61095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210366
1535	NC_015948	CAC	2	6	61136	61141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210366
1536	NC_015948	ACG	3	9	61179	61187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210366
1537	NC_015948	GTC	2	6	61226	61231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210366
1538	NC_015948	ACG	2	6	61356	61361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210366
1539	NC_015948	GAC	2	6	61364	61369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210366
1540	NC_015948	CCG	2	6	61404	61409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210366
1541	NC_015948	GCAC	2	8	61420	61427	25 %	0 %	25 %	50 %	344210366
1542	NC_015948	GCCG	2	8	61546	61553	0 %	0 %	50 %	50 %	344210366
1543	NC_015948	CGT	2	6	61599	61604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210366
1544	NC_015948	CGC	2	6	61624	61629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210366
1545	NC_015948	GAC	2	6	61676	61681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210366
1546	NC_015948	CGA	2	6	61708	61713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210366
1547	NC_015948	GAG	2	6	61724	61729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210366
1548	NC_015948	CAC	2	6	61738	61743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210366
1549	NC_015948	GAC	2	6	61784	61789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210366
1550	NC_015948	TCG	2	6	61833	61838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210366
1551	NC_015948	TCG	2	6	61869	61874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210366
1552	NC_015948	AGC	2	6	62001	62006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210367
1553	NC_015948	GC	3	6	62170	62175	0 %	0 %	50 %	50 %	344210367
1554	NC_015948	GAT	2	6	62369	62374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210367
1555	NC_015948	CGG	2	6	62386	62391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210367
1556	NC_015948	GCC	2	6	62432	62437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210367
1557	NC_015948	GTGGC	2	10	62457	62466	0 %	20 %	60 %	20 %	344210367
1558	NC_015948	GCC	2	6	62523	62528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210367
1559	NC_015948	GTGG	2	8	62543	62550	0 %	25 %	75 %	0 %	344210367
1560	NC_015948	GGC	2	6	62565	62570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210367
1561	NC_015948	ACG	2	6	62601	62606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210367
1562	NC_015948	GCGACG	2	12	62610	62621	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344210367
1563	NC_015948	AGC	2	6	62625	62630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210367
1564	NC_015948	CAG	2	6	62702	62707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210367
1565	NC_015948	TGA	2	6	62749	62754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210367
1566	NC_015948	AAC	2	6	62760	62765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210367
1567	NC_015948	ACG	2	6	62766	62771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210367
1568	NC_015948	CGA	2	6	62847	62852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210368
1569	NC_015948	ACCG	2	8	62887	62894	25 %	0 %	25 %	50 %	344210368
1570	NC_015948	ATC	2	6	62897	62902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210368
1571	NC_015948	GTA	2	6	62971	62976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210368
1572	NC_015948	CGG	3	9	63056	63064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210368
1573	NC_015948	CTC	2	6	63163	63168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210368
1574	NC_015948	GT	3	6	63222	63227	0 %	50 %	50 %	0 %	344210368
1575	NC_015948	CTCA	2	8	63244	63251	25 %	25 %	0 %	50 %	344210368
1576	NC_015948	TGT	2	6	63281	63286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210368
1577	NC_015948	AGG	2	6	63368	63373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210368
1578	NC_015948	CCG	2	6	63377	63382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210368
1579	NC_015948	AGC	2	6	63443	63448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210368
1580	NC_015948	GCC	2	6	63485	63490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210368
1581	NC_015948	GTA	2	6	63520	63525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210368
1582	NC_015948	AGGA	2	8	63533	63540	50 %	0 %	50 %	0 %	344210368
1583	NC_015948	GCCC	2	8	63624	63631	0 %	0 %	25 %	75 %	344210368
1584	NC_015948	ACG	2	6	63638	63643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210368
1585	NC_015948	GCC	2	6	63646	63651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210368
1586	NC_015948	CGA	2	6	63669	63674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210368
1587	NC_015948	CCGT	2	8	63698	63705	0 %	25 %	25 %	50 %	344210368
1588	NC_015948	GC	3	6	63753	63758	0 %	0 %	50 %	50 %	344210368
1589	NC_015948	GACGCC	2	12	63769	63780	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344210368
1590	NC_015948	AGC	2	6	63830	63835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210368
1591	NC_015948	CGCC	2	8	63900	63907	0 %	0 %	25 %	75 %	344210368
1592	NC_015948	CGA	2	6	63915	63920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210368
1593	NC_015948	CAA	2	6	63931	63936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210368
1594	NC_015948	GTA	2	6	63961	63966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210368
1595	NC_015948	GCCG	2	8	63973	63980	0 %	0 %	50 %	50 %	344210368
1596	NC_015948	CCT	3	9	63993	64001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210368
1597	NC_015948	GAC	2	6	64015	64020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210368
1598	NC_015948	CGT	2	6	64111	64116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_015948	GTC	2	6	64138	64143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210369
1600	NC_015948	TAG	2	6	64205	64210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210369
1601	NC_015948	CGAG	2	8	64242	64249	25 %	0 %	50 %	25 %	344210369
1602	NC_015948	GCG	2	6	64272	64277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210369
1603	NC_015948	CGC	2	6	64356	64361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210369
1604	NC_015948	GCC	2	6	64384	64389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210369
1605	NC_015948	GGCG	2	8	64476	64483	0 %	0 %	75 %	25 %	344210369
1606	NC_015948	AGC	2	6	64502	64507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210369
1607	NC_015948	CGC	2	6	64510	64515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210369
1608	NC_015948	TCGCC	2	10	64569	64578	0 %	20 %	20 %	60 %	344210369
1609	NC_015948	CGA	2	6	64605	64610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210369
1610	NC_015948	GCT	2	6	64612	64617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210369
1611	NC_015948	AGC	2	6	64652	64657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210369
1612	NC_015948	ACG	2	6	64676	64681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210369
1613	NC_015948	ACG	2	6	64691	64696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210369
1614	NC_015948	CGA	2	6	64713	64718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210369
1615	NC_015948	CG	3	6	64748	64753	0 %	0 %	50 %	50 %	344210369
1616	NC_015948	CCA	2	6	64764	64769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210369
1617	NC_015948	CCGGA	2	10	64837	64846	20 %	0 %	40 %	40 %	344210369
1618	NC_015948	CGA	2	6	64941	64946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210369
1619	NC_015948	GAC	2	6	64993	64998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210369
1620	NC_015948	CGC	2	6	65001	65006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210369
1621	NC_015948	CGT	2	6	65034	65039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210369
1622	NC_015948	GCG	2	6	65078	65083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210369
1623	NC_015948	CGA	2	6	65100	65105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210369
1624	NC_015948	CGA	2	6	65151	65156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210369
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1997	NC_015948	ACG	2	6	79452	79457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210387
1998	NC_015948	CCGG	2	8	79459	79466	0 %	0 %	50 %	50 %	344210387
1999	NC_015948	CA	3	6	79474	79479	50 %	0 %	0 %	50 %	344210387
2000	NC_015948	CTCG	2	8	79501	79508	0 %	25 %	25 %	50 %	344210387

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