MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_015948	CGCTC	2	10	710421	710430	0 %	20 %	20 %	60 %	344211043
18002	NC_015948	AGC	2	6	710433	710438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211043
18003	NC_015948	GAC	3	9	710543	710551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211043
18004	NC_015948	GCC	2	6	710597	710602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211043
18005	NC_015948	CCG	2	6	710624	710629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211043
18006	NC_015948	GC	3	6	710656	710661	0 %	0 %	50 %	50 %	344211043
18007	NC_015948	CAG	3	9	710663	710671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211043
18008	NC_015948	CAC	2	6	710672	710677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344211043
18009	NC_015948	AGC	2	6	710742	710747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211043
18010	NC_015948	CGA	3	9	710764	710772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211043
18011	NC_015948	CAG	2	6	710789	710794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211043
18012	NC_015948	GCCGA	2	10	710844	710853	20 %	0 %	40 %	40 %	344211043
18013	NC_015948	CGG	2	6	710932	710937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344211043
18014	NC_015948	CCA	2	6	710960	710965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344211043
18015	NC_015948	CAG	2	6	710975	710980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211043
18016	NC_015948	CGGT	2	8	711000	711007	0 %	25 %	50 %	25 %	344211043
18017	NC_015948	CAA	2	6	711062	711067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344211043
18018	NC_015948	GAG	2	6	711074	711079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344211043
18019	NC_015948	GCG	2	6	711171	711176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344211043
18020	NC_015948	ACC	2	6	711207	711212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344211043
18021	NC_015948	TCG	2	6	711228	711233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211043
18022	NC_015948	CGTC	2	8	711250	711257	0 %	25 %	25 %	50 %	344211043
18023	NC_015948	GTCG	2	8	711260	711267	0 %	25 %	50 %	25 %	344211043
18024	NC_015948	GAC	2	6	711296	711301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211043
18025	NC_015948	GGC	2	6	711308	711313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344211043
18026	NC_015948	ACG	2	6	711333	711338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211043
18027	NC_015948	AGT	2	6	711346	711351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344211043
18028	NC_015948	GAC	2	6	711395	711400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211043
18029	NC_015948	GCC	2	6	711410	711415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211043
18030	NC_015948	CGA	2	6	711478	711483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211043
18031	NC_015948	GCGA	2	8	711528	711535	25 %	0 %	50 %	25 %	344211043
18032	NC_015948	GCC	2	6	711576	711581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211043
18033	NC_015948	CGA	2	6	711663	711668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211044
18034	NC_015948	CCCT	2	8	711675	711682	0 %	25 %	0 %	75 %	344211044
18035	NC_015948	GTC	2	6	711688	711693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211044
18036	NC_015948	TTCG	2	8	711714	711721	0 %	50 %	25 %	25 %	344211044
18037	NC_015948	GTC	2	6	711746	711751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211044
18038	NC_015948	GAC	2	6	711763	711768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211044
18039	NC_015948	CGC	2	6	711802	711807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211044
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18041	NC_015948	GTC	2	6	711820	711825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211044
18042	NC_015948	CTCG	2	8	711856	711863	0 %	25 %	25 %	50 %	344211044
18043	NC_015948	CGC	2	6	711894	711899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211044
18044	NC_015948	CCG	2	6	711946	711951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211044
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18048	NC_015948	CGG	2	6	712101	712106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344211044
18049	NC_015948	CACC	2	8	712107	712114	25 %	0 %	0 %	75 %	344211044
18050	NC_015948	TGTCCA	2	12	712119	712130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344211044
18051	NC_015948	GCCGA	2	10	712136	712145	20 %	0 %	40 %	40 %	344211044
18052	NC_015948	CTG	2	6	712147	712152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211044
18053	NC_015948	TGA	2	6	712230	712235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344211044
18054	NC_015948	GCC	2	6	712241	712246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211044
18055	NC_015948	CGTC	2	8	712374	712381	0 %	25 %	25 %	50 %	344211044
18056	NC_015948	GTC	2	6	712454	712459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211044
18057	NC_015948	GAC	2	6	712510	712515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211044
18058	NC_015948	CGT	2	6	712683	712688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211044
18059	NC_015948	AGCGTC	2	12	712694	712705	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344211044
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18063	NC_015948	GTC	2	6	712907	712912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211044
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18065	NC_015948	CGT	2	6	712948	712953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211045
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18068	NC_015948	CGGGT	2	10	713031	713040	0 %	20 %	60 %	20 %	344211045
18069	NC_015948	GCC	2	6	713049	713054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211045
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18072	NC_015948	CGTC	2	8	713078	713085	0 %	25 %	25 %	50 %	344211045
18073	NC_015948	GCC	3	9	713110	713118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211045
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18076	NC_015948	TCG	2	6	713251	713256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211045
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18083	NC_015948	ACG	2	6	713446	713451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211045
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18086	NC_015948	ACG	2	6	713527	713532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211045
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18091	NC_015948	CCGC	2	8	713738	713745	0 %	0 %	25 %	75 %	344211046
18092	NC_015948	GTT	2	6	713769	713774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344211046
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18096	NC_015948	CGT	2	6	713923	713928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211046
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18101	NC_015948	CCGA	2	8	714132	714139	25 %	0 %	25 %	50 %	344211046
18102	NC_015948	CCG	2	6	714171	714176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211046
18103	NC_015948	CGA	2	6	714215	714220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211046
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18105	NC_015948	GCG	2	6	714234	714239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344211046
18106	NC_015948	CCG	2	6	714292	714297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211046
18107	NC_015948	GAC	2	6	714299	714304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211046
18108	NC_015948	GAG	2	6	714323	714328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344211046
18109	NC_015948	AGT	2	6	714339	714344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344211046
18110	NC_015948	GCC	2	6	714381	714386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211046
18111	NC_015948	ACCG	2	8	714395	714402	25 %	0 %	25 %	50 %	344211046
18112	NC_015948	CCG	2	6	714417	714422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211046
18113	NC_015948	GTCGCT	2	12	714522	714533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211046
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18117	NC_015948	CGT	2	6	714607	714612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211046
18118	NC_015948	GCTC	3	12	714640	714651	0 %	25 %	25 %	50 %	344211046
18119	NC_015948	CTCGA	2	10	714669	714678	20 %	20 %	20 %	40 %	344211046
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18223	NC_015948	CT	3	6	718761	718766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18224	NC_015948	GCGG	2	8	718771	718778	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18225	NC_015948	GCCG	2	8	718793	718800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18227	NC_015948	CGG	2	6	718871	718876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344211051
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18230	NC_015948	CCGCG	2	10	719052	719061	0 %	0 %	40 %	60 %	344211051
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18233	NC_015948	CG	3	6	719178	719183	0 %	0 %	50 %	50 %	344211051
18234	NC_015948	GGCC	2	8	719220	719227	0 %	0 %	50 %	50 %	344211051
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18237	NC_015948	TCG	2	6	719372	719377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211051
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18239	NC_015948	TGA	2	6	719444	719449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344211051
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18355	NC_015948	GCC	2	6	723909	723914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344211056
18356	NC_015948	GTC	2	6	723930	723935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211056
18357	NC_015948	GCG	2	6	723937	723942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344211056
18358	NC_015948	CGT	2	6	723989	723994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211056
18359	NC_015948	CGATGT	2	12	724046	724057	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344211056
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18362	NC_015948	CGA	2	6	724172	724177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211056
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18474	NC_015948	GTA	2	6	728647	728652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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