MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015948	GCC	2	6	632663	632668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210958
16002	NC_015948	GCC	2	6	632671	632676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210958
16003	NC_015948	CGG	2	6	632705	632710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210958
16004	NC_015948	CGC	2	6	632751	632756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210958
16005	NC_015948	CCG	2	6	632763	632768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210958
16006	NC_015948	CGC	2	6	632779	632784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210958
16007	NC_015948	CAA	2	6	632814	632819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210958
16008	NC_015948	GGC	2	6	632922	632927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210959
16009	NC_015948	CGG	2	6	633024	633029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210959
16010	NC_015948	AAC	2	6	633041	633046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210959
16011	NC_015948	GTC	2	6	633116	633121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210959
16012	NC_015948	GTCG	2	8	633186	633193	0 %	25 %	50 %	25 %	344210959
16013	NC_015948	CGTC	2	8	633266	633273	0 %	25 %	25 %	50 %	344210959
16014	NC_015948	ACG	2	6	633366	633371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210959
16015	NC_015948	CAG	2	6	633387	633392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210959
16016	NC_015948	GCC	2	6	633464	633469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210959
16017	NC_015948	GGT	2	6	633480	633485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210959
16018	NC_015948	CAG	2	6	633490	633495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210959
16019	NC_015948	CGA	3	9	633609	633617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210959
16020	NC_015948	CGT	3	9	633636	633644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210959
16021	NC_015948	CG	3	6	633685	633690	0 %	0 %	50 %	50 %	344210959
16022	NC_015948	CGA	2	6	633717	633722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210959
16023	NC_015948	TCG	2	6	633725	633730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210959
16024	NC_015948	GTC	2	6	633733	633738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210959
16025	NC_015948	A	6	6	633794	633799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_015948	CCG	2	6	633836	633841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16027	NC_015948	GCT	2	6	633885	633890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210960
16028	NC_015948	CGT	2	6	633930	633935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210960
16029	NC_015948	CCGG	2	8	634024	634031	0 %	0 %	50 %	50 %	344210960
16030	NC_015948	CTGG	2	8	634069	634076	0 %	25 %	50 %	25 %	344210960
16031	NC_015948	GAC	2	6	634156	634161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210960
16032	NC_015948	CGG	3	9	634176	634184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210960
16033	NC_015948	AGC	2	6	634190	634195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210960
16034	NC_015948	GTCT	2	8	634234	634241	0 %	50 %	25 %	25 %	344210960
16035	NC_015948	GTC	2	6	634246	634251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210960
16036	NC_015948	TTC	2	6	634391	634396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210960
16037	NC_015948	GTC	2	6	634429	634434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210960
16038	NC_015948	TCG	2	6	634439	634444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210960
16039	NC_015948	GGC	2	6	634483	634488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210960
16040	NC_015948	CGG	2	6	634494	634499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210960
16041	NC_015948	TCA	2	6	634509	634514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210960
16042	NC_015948	CGGT	2	8	634528	634535	0 %	25 %	50 %	25 %	344210960
16043	NC_015948	CCG	2	6	634536	634541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210960
16044	NC_015948	GCTG	2	8	634545	634552	0 %	25 %	50 %	25 %	344210960
16045	NC_015948	GAC	2	6	634636	634641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210960
16046	NC_015948	AG	3	6	634720	634725	50 %	0 %	50 %	0 %	344210960
16047	NC_015948	CGA	2	6	634734	634739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210960
16048	NC_015948	GCC	2	6	634855	634860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210960
16049	NC_015948	GTC	3	9	634888	634896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210960
16050	NC_015948	CGT	2	6	634941	634946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210960
16051	NC_015948	GACG	2	8	634969	634976	25 %	0 %	50 %	25 %	344210960
16052	NC_015948	CCG	2	6	635006	635011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210960
16053	NC_015948	GAC	2	6	635020	635025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210960
16054	NC_015948	GGT	2	6	635028	635033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210960
16055	NC_015948	CAC	2	6	635053	635058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210960
16056	NC_015948	CG	3	6	635077	635082	0 %	0 %	50 %	50 %	344210960
16057	NC_015948	CCG	2	6	635125	635130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16058	NC_015948	CCGG	2	8	635190	635197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16059	NC_015948	CGC	2	6	635211	635216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16060	NC_015948	ACA	2	6	635315	635320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210961
16061	NC_015948	GAG	2	6	635350	635355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210961
16062	NC_015948	CGC	2	6	635356	635361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210961
16063	NC_015948	GC	3	6	635370	635375	0 %	0 %	50 %	50 %	344210961
16064	NC_015948	GCGG	2	8	635394	635401	0 %	0 %	75 %	25 %	344210961
16065	NC_015948	GCC	2	6	635412	635417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210961
16066	NC_015948	GCCG	2	8	635589	635596	0 %	0 %	50 %	50 %	344210961
16067	NC_015948	CGT	2	6	635646	635651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210961
16068	NC_015948	GCC	2	6	635656	635661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210961
16069	NC_015948	GAC	3	9	635749	635757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210961
16070	NC_015948	ATC	2	6	635785	635790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210961
16071	NC_015948	CCG	2	6	635835	635840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210961
16072	NC_015948	GGC	2	6	635844	635849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210961
16073	NC_015948	ACG	2	6	635885	635890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210961
16074	NC_015948	AC	3	6	635911	635916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16075	NC_015948	CGG	2	6	635935	635940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16076	NC_015948	CA	3	6	635969	635974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16077	NC_015948	CGAA	2	8	635986	635993	50 %	0 %	25 %	25 %	344210962
16078	NC_015948	GAG	2	6	635996	636001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210962
16079	NC_015948	GACG	2	8	636073	636080	25 %	0 %	50 %	25 %	344210962
16080	NC_015948	CG	3	6	636096	636101	0 %	0 %	50 %	50 %	344210962
16081	NC_015948	GACA	2	8	636133	636140	50 %	0 %	25 %	25 %	344210962
16082	NC_015948	GCT	2	6	636166	636171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210962
16083	NC_015948	CGG	2	6	636190	636195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210962
16084	NC_015948	CGG	2	6	636208	636213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210962
16085	NC_015948	AGCG	2	8	636287	636294	25 %	0 %	50 %	25 %	344210962
16086	NC_015948	GGCG	2	8	636316	636323	0 %	0 %	75 %	25 %	344210962
16087	NC_015948	GCG	3	9	636330	636338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210962
16088	NC_015948	CTC	2	6	636356	636361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210962
16089	NC_015948	CGC	2	6	636370	636375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210962
16090	NC_015948	ACT	2	6	636444	636449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210962
16091	NC_015948	GCT	2	6	636530	636535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16092	NC_015948	CGT	2	6	636564	636569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16093	NC_015948	CCT	2	6	636627	636632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16094	NC_015948	GTCA	2	8	636710	636717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16095	NC_015948	ATA	2	6	636721	636726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_015948	TCT	2	6	636775	636780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16097	NC_015948	TCA	2	6	636874	636879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210963
16098	NC_015948	CTC	2	6	636933	636938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210963
16099	NC_015948	GCC	2	6	636993	636998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210963
16100	NC_015948	GCC	2	6	637002	637007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210963
16101	NC_015948	TCG	2	6	637021	637026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210963
16102	NC_015948	GAT	2	6	637097	637102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210963
16103	NC_015948	CGG	2	6	637112	637117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210963
16104	NC_015948	CCG	2	6	637160	637165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210963
16105	NC_015948	GGC	2	6	637169	637174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210963
16106	NC_015948	TCG	2	6	637207	637212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210963
16107	NC_015948	CGA	2	6	637225	637230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210963
16108	NC_015948	GGTC	2	8	637240	637247	0 %	25 %	50 %	25 %	344210963
16109	NC_015948	CCA	2	6	637309	637314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210963
16110	NC_015948	ACCG	2	8	637319	637326	25 %	0 %	25 %	50 %	344210963
16111	NC_015948	GTC	2	6	637338	637343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210963
16112	NC_015948	CTG	2	6	637419	637424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210963
16113	NC_015948	TAT	2	6	637481	637486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344210963
16114	NC_015948	AG	3	6	637539	637544	50 %	0 %	50 %	0 %	344210963
16115	NC_015948	AGG	2	6	637591	637596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210963
16116	NC_015948	GGT	3	9	637630	637638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210963
16117	NC_015948	CGC	2	6	637643	637648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210963
16118	NC_015948	CGC	2	6	637655	637660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210963
16119	NC_015948	CGG	3	9	637697	637705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210963
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16121	NC_015948	CGA	2	6	637832	637837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210963
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16252	NC_015948	CTC	2	6	642816	642821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16253	NC_015948	CCCGTC	2	12	642855	642866	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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16328	NC_015948	TAT	2	6	645929	645934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16480	NC_015948	CTT	2	6	651935	651940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210977
16481	NC_015948	CTGA	2	8	651948	651955	25 %	25 %	25 %	25 %	344210977
16482	NC_015948	CCG	2	6	651975	651980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210977
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16491	NC_015948	GAG	2	6	652212	652217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210977
16492	NC_015948	GACATC	2	12	652221	652232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344210977
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16496	NC_015948	GTTC	2	8	652313	652320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16497	NC_015948	CGG	2	6	652383	652388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16498	NC_015948	GC	3	6	652444	652449	0 %	0 %	50 %	50 %	344210978
16499	NC_015948	CTC	2	6	652511	652516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210978
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