MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_015948	CTC	2	6	613148	613153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210938
15502	NC_015948	ATG	2	6	613203	613208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210938
15503	NC_015948	CGT	2	6	613330	613335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
15504	NC_015948	TCG	2	6	613344	613349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
15505	NC_015948	CGA	2	6	613366	613371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210938
15506	NC_015948	TCG	2	6	613392	613397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
15507	NC_015948	AGCG	2	8	613563	613570	25 %	0 %	50 %	25 %	344210938
15508	NC_015948	CGT	2	6	613589	613594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
15509	NC_015948	GTC	2	6	613643	613648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
15510	NC_015948	TCG	2	6	613659	613664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
15511	NC_015948	CGG	2	6	613732	613737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210938
15512	NC_015948	CGTC	2	8	613768	613775	0 %	25 %	25 %	50 %	344210938
15513	NC_015948	GAT	2	6	613793	613798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210938
15514	NC_015948	GAT	2	6	613802	613807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210938
15515	NC_015948	TCG	2	6	613830	613835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
15516	NC_015948	TCC	2	6	613836	613841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210938
15517	NC_015948	CTG	2	6	613853	613858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
15518	NC_015948	TCG	2	6	613863	613868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
15519	NC_015948	ATCGTA	2	12	613883	613894	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344210938
15520	NC_015948	AAAG	2	8	613968	613975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_015948	GAC	2	6	613995	614000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15522	NC_015948	GT	3	6	614034	614039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_015948	TGCA	2	8	614049	614056	25 %	25 %	25 %	25 %	344210939
15524	NC_015948	CGG	2	6	614069	614074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210939
15525	NC_015948	CGC	2	6	614126	614131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210939
15526	NC_015948	CGG	3	9	614143	614151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210939
15527	NC_015948	ATCCG	2	10	614195	614204	20 %	20 %	20 %	40 %	344210939
15528	NC_015948	TGA	2	6	614269	614274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210939
15529	NC_015948	CGA	2	6	614276	614281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210939
15530	NC_015948	GGTCG	2	10	614283	614292	0 %	20 %	60 %	20 %	344210939
15531	NC_015948	GCG	2	6	614295	614300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210939
15532	NC_015948	CGC	2	6	614324	614329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210939
15533	NC_015948	CAC	2	6	614359	614364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210939
15534	NC_015948	GGCA	2	8	614402	614409	25 %	0 %	50 %	25 %	344210939
15535	NC_015948	CCT	2	6	614475	614480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210939
15536	NC_015948	ATC	2	6	614497	614502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210939
15537	NC_015948	CGAC	2	8	614554	614561	25 %	0 %	25 %	50 %	344210939
15538	NC_015948	CGG	2	6	614575	614580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210939
15539	NC_015948	CCG	2	6	614590	614595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210939
15540	NC_015948	GGTCG	2	10	614616	614625	0 %	20 %	60 %	20 %	344210939
15541	NC_015948	GAC	2	6	614661	614666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210939
15542	NC_015948	GCGCGA	2	12	614674	614685	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344210939
15543	NC_015948	CGC	2	6	614724	614729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210939
15544	NC_015948	GCC	2	6	614766	614771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210939
15545	NC_015948	GAG	2	6	614772	614777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210939
15546	NC_015948	GCG	2	6	614784	614789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210939
15547	NC_015948	GC	3	6	614810	614815	0 %	0 %	50 %	50 %	344210939
15548	NC_015948	CCG	2	6	614866	614871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210939
15549	NC_015948	CGA	2	6	614884	614889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210939
15550	NC_015948	GCC	2	6	614914	614919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15551	NC_015948	TGAC	2	8	614939	614946	25 %	25 %	25 %	25 %	344210940
15552	NC_015948	CGA	2	6	615129	615134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210940
15553	NC_015948	GGC	2	6	615138	615143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210940
15554	NC_015948	CCACG	2	10	615144	615153	20 %	0 %	20 %	60 %	344210940
15555	NC_015948	CGA	3	9	615162	615170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210940
15556	NC_015948	GAG	2	6	615184	615189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210940
15557	NC_015948	CCG	2	6	615239	615244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210940
15558	NC_015948	CCG	2	6	615287	615292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210940
15559	NC_015948	CGC	2	6	615303	615308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210940
15560	NC_015948	GAG	2	6	615361	615366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210940
15561	NC_015948	CGT	2	6	615393	615398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210940
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15564	NC_015948	GAG	2	6	615634	615639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210940
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15566	NC_015948	CGC	2	6	615700	615705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210940
15567	NC_015948	CAG	2	6	615712	615717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210940
15568	NC_015948	GTCA	2	8	615766	615773	25 %	25 %	25 %	25 %	344210940
15569	NC_015948	AC	3	6	615780	615785	50 %	0 %	0 %	50 %	344210940
15570	NC_015948	ATC	2	6	615790	615795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210940
15571	NC_015948	GAC	2	6	615816	615821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210940
15572	NC_015948	CTT	2	6	615879	615884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15573	NC_015948	TC	3	6	615902	615907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15574	NC_015948	TGGG	2	8	615932	615939	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_015948	GT	3	6	615940	615945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_015948	GGTGG	2	10	615982	615991	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_015948	GGGTG	2	10	615992	616001	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15578	NC_015948	TG	3	6	616000	616005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_015948	GTT	2	6	616018	616023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210941
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15581	NC_015948	CTGT	2	8	616116	616123	0 %	50 %	25 %	25 %	344210941
15582	NC_015948	CGT	2	6	616191	616196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210941
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15584	NC_015948	TA	3	6	616392	616397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_015948	TGG	2	6	616431	616436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15586	NC_015948	GAG	2	6	616498	616503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210942
15587	NC_015948	GAC	3	9	616549	616557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210942
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15589	NC_015948	TCC	2	6	616598	616603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210942
15590	NC_015948	AAC	2	6	616606	616611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210942
15591	NC_015948	CACACC	2	12	616648	616659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210942
15592	NC_015948	CGA	3	9	616677	616685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210942
15593	NC_015948	CGGC	2	8	616790	616797	0 %	0 %	50 %	50 %	344210942
15594	NC_015948	GAC	2	6	616807	616812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210942
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15598	NC_015948	AGT	2	6	616985	616990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210942
15599	NC_015948	CGGC	2	8	616992	616999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15600	NC_015948	AAG	2	6	617124	617129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210943
15601	NC_015948	CGC	3	9	617177	617185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210943
15602	NC_015948	GAC	2	6	617227	617232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210943
15603	NC_015948	CGG	2	6	617236	617241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210943
15604	NC_015948	GGT	3	9	617279	617287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210943
15605	NC_015948	ACCG	2	8	617331	617338	25 %	0 %	25 %	50 %	344210943
15606	NC_015948	CCGT	2	8	617390	617397	0 %	25 %	25 %	50 %	344210943
15607	NC_015948	GCG	2	6	617451	617456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210943
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15609	NC_015948	CGC	2	6	617500	617505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210943
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15612	NC_015948	GAC	2	6	617759	617764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210943
15613	NC_015948	CTG	2	6	617857	617862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210943
15614	NC_015948	CCA	2	6	617932	617937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210943
15615	NC_015948	CGA	2	6	617961	617966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210943
15616	NC_015948	CGG	2	6	618027	618032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15617	NC_015948	CGC	2	6	618057	618062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210944
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15738	NC_015948	GTC	2	6	622314	622319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210948
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15853	NC_015948	GA	3	6	627040	627045	50 %	0 %	50 %	0 %	344210954
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15975	NC_015948	CGT	2	6	631428	631433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210958
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15982	NC_015948	TCGC	2	8	631837	631844	0 %	25 %	25 %	50 %	344210958
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