MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015948	TAC	2	6	592736	592741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210914
15002	NC_015948	CGA	2	6	592812	592817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210914
15003	NC_015948	GCG	2	6	592852	592857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210914
15004	NC_015948	CG	3	6	592860	592865	0 %	0 %	50 %	50 %	344210914
15005	NC_015948	CCGA	2	8	592916	592923	25 %	0 %	25 %	50 %	344210914
15006	NC_015948	GTCG	2	8	592941	592948	0 %	25 %	50 %	25 %	344210914
15007	NC_015948	CGT	2	6	592958	592963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210914
15008	NC_015948	CGA	3	9	593003	593011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210914
15009	NC_015948	ACG	2	6	593147	593152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210914
15010	NC_015948	GAC	2	6	593184	593189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210915
15011	NC_015948	GACG	2	8	593199	593206	25 %	0 %	50 %	25 %	344210915
15012	NC_015948	GAC	2	6	593214	593219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210915
15013	NC_015948	CAG	2	6	593238	593243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210915
15014	NC_015948	TCG	2	6	593327	593332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210915
15015	NC_015948	TCG	2	6	593398	593403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210915
15016	NC_015948	TCC	2	6	593410	593415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210915
15017	NC_015948	CTC	2	6	593442	593447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210915
15018	NC_015948	TGA	2	6	593498	593503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210915
15019	NC_015948	CTC	2	6	593535	593540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210915
15020	NC_015948	CA	3	6	593700	593705	50 %	0 %	0 %	50 %	344210916
15021	NC_015948	GAC	2	6	593754	593759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15022	NC_015948	TTCGA	2	10	593788	593797	20 %	40 %	20 %	20 %	344210916
15023	NC_015948	CCG	2	6	593816	593821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210916
15024	NC_015948	TCG	2	6	593833	593838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15025	NC_015948	TCG	2	6	593855	593860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15026	NC_015948	TGA	2	6	593909	593914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210916
15027	NC_015948	GGC	2	6	593949	593954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210916
15028	NC_015948	GCG	2	6	594041	594046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210916
15029	NC_015948	CCG	2	6	594175	594180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210916
15030	NC_015948	GGGC	2	8	594214	594221	0 %	0 %	75 %	25 %	344210916
15031	NC_015948	CGCC	2	8	594293	594300	0 %	0 %	25 %	75 %	344210916
15032	NC_015948	TCC	2	6	594310	594315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210916
15033	NC_015948	AGC	2	6	594394	594399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15034	NC_015948	GC	3	6	594410	594415	0 %	0 %	50 %	50 %	344210916
15035	NC_015948	CGAG	2	8	594470	594477	25 %	0 %	50 %	25 %	344210916
15036	NC_015948	GGT	2	6	594509	594514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210916
15037	NC_015948	GTC	2	6	594564	594569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15038	NC_015948	CCG	2	6	594574	594579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210916
15039	NC_015948	GCG	2	6	594603	594608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210916
15040	NC_015948	CGTC	2	8	594617	594624	0 %	25 %	25 %	50 %	344210916
15041	NC_015948	GTC	2	6	594636	594641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15042	NC_015948	GAC	2	6	594678	594683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15043	NC_015948	CGA	2	6	594788	594793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15044	NC_015948	CGT	2	6	594824	594829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15045	NC_015948	GTC	2	6	594831	594836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15046	NC_015948	GGT	2	6	594859	594864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210916
15047	NC_015948	CGG	2	6	594866	594871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210916
15048	NC_015948	CGC	2	6	594887	594892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210916
15049	NC_015948	GAC	2	6	594975	594980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15050	NC_015948	GTCA	2	8	595002	595009	25 %	25 %	25 %	25 %	344210916
15051	NC_015948	CCG	2	6	595011	595016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210916
15052	NC_015948	TCG	2	6	595087	595092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15053	NC_015948	TCGC	2	8	595109	595116	0 %	25 %	25 %	50 %	344210916
15054	NC_015948	CGT	2	6	595136	595141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15055	NC_015948	GGA	2	6	595271	595276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210916
15056	NC_015948	TCC	2	6	595282	595287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210916
15057	NC_015948	CGC	2	6	595314	595319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210916
15058	NC_015948	GCCG	2	8	595347	595354	0 %	0 %	50 %	50 %	344210916
15059	NC_015948	GTC	3	9	595377	595385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15060	NC_015948	TGT	2	6	595395	595400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210916
15061	NC_015948	GTC	2	6	595440	595445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15062	NC_015948	GTC	2	6	595447	595452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15063	NC_015948	TCG	3	9	595471	595479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15064	NC_015948	GCC	2	6	595480	595485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210916
15065	NC_015948	TCG	2	6	595489	595494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210916
15066	NC_015948	CAG	2	6	595568	595573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15067	NC_015948	AACG	2	8	595606	595613	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15068	NC_015948	CCG	2	6	595660	595665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15069	NC_015948	GGC	3	9	595693	595701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15070	NC_015948	TGG	2	6	595702	595707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210917
15071	NC_015948	AGG	2	6	595750	595755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210917
15072	NC_015948	GCCGA	2	10	595923	595932	20 %	0 %	40 %	40 %	344210917
15073	NC_015948	CGC	2	6	595949	595954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210917
15074	NC_015948	GC	3	6	595977	595982	0 %	0 %	50 %	50 %	344210917
15075	NC_015948	CGA	3	9	596000	596008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210917
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15079	NC_015948	ACC	2	6	596083	596088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210917
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15082	NC_015948	TCAC	2	8	596230	596237	25 %	25 %	0 %	50 %	344210917
15083	NC_015948	CGA	3	9	596242	596250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210917
15084	NC_015948	CGA	3	9	596351	596359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210917
15085	NC_015948	ACC	2	6	596374	596379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210917
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15087	NC_015948	TG	3	6	596430	596435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_015948	CAG	2	6	596471	596476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210918
15089	NC_015948	GAG	2	6	596515	596520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210918
15090	NC_015948	GC	3	6	596537	596542	0 %	0 %	50 %	50 %	344210918
15091	NC_015948	GCG	2	6	596597	596602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210918
15092	NC_015948	CG	3	6	596675	596680	0 %	0 %	50 %	50 %	344210918
15093	NC_015948	TGGC	2	8	596738	596745	0 %	25 %	50 %	25 %	344210918
15094	NC_015948	TGACG	2	10	596754	596763	20 %	20 %	40 %	20 %	344210918
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15097	NC_015948	CCGA	2	8	596896	596903	25 %	0 %	25 %	50 %	344210919
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15100	NC_015948	CGC	2	6	597022	597027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210919
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15102	NC_015948	GT	3	6	597130	597135	0 %	50 %	50 %	0 %	344210919
15103	NC_015948	CGA	2	6	597176	597181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210919
15104	NC_015948	TGG	2	6	597203	597208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210919
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15119	NC_015948	CGT	2	6	597707	597712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210921
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15233	NC_015948	CCGA	2	8	602841	602848	25 %	0 %	25 %	50 %	344210926
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15238	NC_015948	CTG	2	6	603018	603023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210926
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15339	NC_015948	TCG	2	6	607139	607144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210930
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15343	NC_015948	TG	3	6	607286	607291	0 %	50 %	50 %	0 %	344210930
15344	NC_015948	GC	3	6	607326	607331	0 %	0 %	50 %	50 %	344210930
15345	NC_015948	TCG	2	6	607349	607354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210930
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15353	NC_015948	CGT	2	6	607566	607571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210930
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15463	NC_015948	CGG	2	6	611678	611683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210935
15464	NC_015948	CGT	2	6	611684	611689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210935
15465	NC_015948	TCG	2	6	611692	611697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210935
15466	NC_015948	GTCA	2	8	611778	611785	25 %	25 %	25 %	25 %	344210935
15467	NC_015948	CAG	2	6	611838	611843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210935
15468	NC_015948	CCGC	2	8	611946	611953	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15469	NC_015948	AACG	2	8	611954	611961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15470	NC_015948	CGG	2	6	611993	611998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210936
15471	NC_015948	AGG	2	6	612023	612028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210936
15472	NC_015948	AT	3	6	612038	612043	50 %	50 %	0 %	0 %	344210936
15473	NC_015948	GCC	2	6	612070	612075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210936
15474	NC_015948	CTC	2	6	612111	612116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210936
15475	NC_015948	GA	3	6	612146	612151	50 %	0 %	50 %	0 %	344210936
15476	NC_015948	GA	3	6	612236	612241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15479	NC_015948	GCT	2	6	612411	612416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210937
15480	NC_015948	TCG	2	6	612443	612448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210937
15481	NC_015948	CGC	2	6	612458	612463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210937
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15483	NC_015948	CGA	2	6	612661	612666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210938
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