MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015948	TCG	2	6	554428	554433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210882
14002	NC_015948	GTCG	2	8	554445	554452	0 %	25 %	50 %	25 %	344210882
14003	NC_015948	CGT	2	6	554459	554464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210882
14004	NC_015948	GCC	2	6	554478	554483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210882
14005	NC_015948	CGA	2	6	554486	554491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210882
14006	NC_015948	CGT	2	6	554522	554527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210882
14007	NC_015948	CGC	2	6	554600	554605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210882
14008	NC_015948	CGGC	2	8	554606	554613	0 %	0 %	50 %	50 %	344210882
14009	NC_015948	GTC	2	6	554631	554636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210882
14010	NC_015948	GAA	2	6	554658	554663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210882
14011	NC_015948	TCG	2	6	554695	554700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210882
14012	NC_015948	CAT	2	6	554712	554717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210882
14013	NC_015948	GGCCTC	2	12	554775	554786	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344210882
14014	NC_015948	GAA	2	6	554835	554840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210882
14015	NC_015948	GTC	2	6	554841	554846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210882
14016	NC_015948	GGT	2	6	554849	554854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210882
14017	NC_015948	CGC	2	6	554857	554862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210882
14018	NC_015948	TCC	2	6	554863	554868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210882
14019	NC_015948	TCG	2	6	554878	554883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210882
14020	NC_015948	ACCG	2	8	554935	554942	25 %	0 %	25 %	50 %	344210882
14021	NC_015948	CTT	2	6	554964	554969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210882
14022	NC_015948	ATC	2	6	555155	555160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210883
14023	NC_015948	CGA	2	6	555238	555243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210883
14024	NC_015948	TCA	2	6	555270	555275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210883
14025	NC_015948	ACG	2	6	555336	555341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210883
14026	NC_015948	GCT	2	6	555442	555447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210883
14027	NC_015948	CGGG	2	8	555456	555463	0 %	0 %	75 %	25 %	344210883
14028	NC_015948	CCA	2	6	555508	555513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210883
14029	NC_015948	CG	3	6	555532	555537	0 %	0 %	50 %	50 %	344210883
14030	NC_015948	TGA	2	6	555556	555561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210883
14031	NC_015948	CAT	2	6	555574	555579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210883
14032	NC_015948	GGGC	2	8	555585	555592	0 %	0 %	75 %	25 %	344210883
14033	NC_015948	CGG	2	6	555612	555617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210883
14034	NC_015948	TGG	2	6	555668	555673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210883
14035	NC_015948	GGA	2	6	555688	555693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210883
14036	NC_015948	ATC	2	6	555704	555709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210883
14037	NC_015948	CGA	3	9	555775	555783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210883
14038	NC_015948	ACG	2	6	555825	555830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210883
14039	NC_015948	AACGG	2	10	555881	555890	40 %	0 %	40 %	20 %	344210883
14040	NC_015948	CGA	2	6	555901	555906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210883
14041	NC_015948	CGT	3	9	555910	555918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210883
14042	NC_015948	CGA	2	6	555919	555924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210883
14043	NC_015948	CGC	2	6	555955	555960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210883
14044	NC_015948	GTCG	2	8	556042	556049	0 %	25 %	50 %	25 %	344210883
14045	NC_015948	GAG	2	6	556076	556081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210883
14046	NC_015948	ACCCG	2	10	556149	556158	20 %	0 %	20 %	60 %	344210883
14047	NC_015948	CGA	3	9	556162	556170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210883
14048	NC_015948	GGC	2	6	556200	556205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210883
14049	NC_015948	GGAC	2	8	556219	556226	25 %	0 %	50 %	25 %	344210883
14050	NC_015948	CGG	2	6	556234	556239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210883
14051	NC_015948	CAG	2	6	556262	556267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210883
14052	NC_015948	AAG	2	6	556313	556318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210883
14053	NC_015948	CTG	3	9	556322	556330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210883
14054	NC_015948	GAAG	2	8	556333	556340	50 %	0 %	50 %	0 %	344210883
14055	NC_015948	GAA	2	6	556349	556354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210883
14056	NC_015948	CGT	2	6	556457	556462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210884
14057	NC_015948	GCC	2	6	556474	556479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210884
14058	NC_015948	CGA	2	6	556514	556519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210884
14059	NC_015948	GCG	2	6	556522	556527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210884
14060	NC_015948	GCC	2	6	556590	556595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210884
14061	NC_015948	GGC	2	6	556604	556609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210884
14062	NC_015948	CA	3	6	556634	556639	50 %	0 %	0 %	50 %	344210884
14063	NC_015948	ACG	2	6	556676	556681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_015948	T	6	6	556685	556690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_015948	ATGG	2	8	556714	556721	25 %	25 %	50 %	0 %	344210885
14066	NC_015948	GCG	2	6	556727	556732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210885
14067	NC_015948	ACG	2	6	556796	556801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210885
14068	NC_015948	CG	3	6	556800	556805	0 %	0 %	50 %	50 %	344210885
14069	NC_015948	CGT	2	6	556851	556856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210885
14070	NC_015948	CTT	2	6	556893	556898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210885
14071	NC_015948	CG	3	6	556907	556912	0 %	0 %	50 %	50 %	344210885
14072	NC_015948	GAG	2	6	556918	556923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210885
14073	NC_015948	TCG	2	6	556970	556975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210885
14074	NC_015948	GAC	2	6	556981	556986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210885
14075	NC_015948	CGG	2	6	557009	557014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210885
14076	NC_015948	GGC	2	6	557049	557054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210885
14077	NC_015948	GACGAG	2	12	557098	557109	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	344210885
14078	NC_015948	CGA	2	6	557115	557120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210885
14079	NC_015948	CGG	2	6	557149	557154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14080	NC_015948	ACT	2	6	557249	557254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210886
14081	NC_015948	TGT	2	6	557312	557317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210886
14082	NC_015948	GCA	2	6	557391	557396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210886
14083	NC_015948	TCG	2	6	557491	557496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210886
14084	NC_015948	TGA	2	6	557516	557521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210886
14085	NC_015948	GGA	2	6	557560	557565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210886
14086	NC_015948	CAC	2	6	557597	557602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210886
14087	NC_015948	TCA	2	6	557632	557637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210886
14088	NC_015948	TTC	2	6	557664	557669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210886
14089	NC_015948	GCG	2	6	557701	557706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210886
14090	NC_015948	CGT	2	6	557735	557740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210886
14091	NC_015948	CCT	2	6	557750	557755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210886
14092	NC_015948	CGTT	2	8	557761	557768	0 %	50 %	25 %	25 %	344210886
14093	NC_015948	GTG	2	6	557784	557789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210886
14094	NC_015948	TCC	2	6	557821	557826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210886
14095	NC_015948	GCC	2	6	557837	557842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210886
14096	NC_015948	TCT	2	6	557869	557874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210886
14097	NC_015948	GTC	2	6	557880	557885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210886
14098	NC_015948	TCT	2	6	557890	557895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210886
14099	NC_015948	GAC	2	6	557906	557911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210886
14100	NC_015948	AC	3	6	557944	557949	50 %	0 %	0 %	50 %	344210886
14101	NC_015948	CGG	2	6	557966	557971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210886
14102	NC_015948	CG	3	6	558043	558048	0 %	0 %	50 %	50 %	344210887
14103	NC_015948	CGAACT	2	12	558068	558079	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344210887
14104	NC_015948	CGT	2	6	558161	558166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210887
14105	NC_015948	ACCCGC	2	12	558172	558183	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	344210887
14106	NC_015948	ACG	2	6	558241	558246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210887
14107	NC_015948	CAC	2	6	558260	558265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210887
14108	NC_015948	CGT	2	6	558281	558286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210887
14109	NC_015948	GGA	2	6	558290	558295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210887
14110	NC_015948	GTC	2	6	558309	558314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210887
14111	NC_015948	GCC	2	6	558315	558320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210887
14112	NC_015948	GTGA	2	8	558363	558370	25 %	25 %	50 %	0 %	344210887
14113	NC_015948	CCG	2	6	558380	558385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210887
14114	NC_015948	TCG	3	9	558397	558405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210887
14115	NC_015948	GAC	3	9	558450	558458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210887
14116	NC_015948	GAG	2	6	558474	558479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210887
14117	NC_015948	TCGACG	2	12	558493	558504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344210887
14118	NC_015948	TCG	2	6	558508	558513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210887
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14235	NC_015948	CGG	2	6	563137	563142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14236	NC_015948	GAC	2	6	563244	563249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210891
14237	NC_015948	CGG	2	6	563269	563274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210891
14238	NC_015948	CGA	2	6	563291	563296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210891
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14332	NC_015948	CGT	2	6	567212	567217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14336	NC_015948	CAT	2	6	567401	567406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210893
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14354	NC_015948	CGC	2	6	567932	567937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210893
14355	NC_015948	GACCTC	2	12	567948	567959	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344210893
14356	NC_015948	GC	3	6	567974	567979	0 %	0 %	50 %	50 %	344210893
14357	NC_015948	TCG	2	6	568021	568026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210893
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14359	NC_015948	TCG	2	6	568084	568089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210893
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14369	NC_015948	GAC	2	6	568530	568535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210894
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14378	NC_015948	GGA	2	6	568886	568891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210894
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14384	NC_015948	GACA	2	8	569027	569034	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14385	NC_015948	CGAC	2	8	569092	569099	25 %	0 %	25 %	50 %	344210895
14386	NC_015948	CGGC	2	8	569141	569148	0 %	0 %	50 %	50 %	344210895
14387	NC_015948	TCG	2	6	569152	569157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210895
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14410	NC_015948	TGT	2	6	569941	569946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14465	NC_015948	GCC	2	6	572810	572815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210898
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14467	NC_015948	CCG	2	6	572841	572846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210898
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14470	NC_015948	ACCGG	2	10	573073	573082	20 %	0 %	40 %	40 %	344210898
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14472	NC_015948	AGT	2	6	573163	573168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210898
14473	NC_015948	GAGGTC	2	12	573206	573217	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344210898
14474	NC_015948	TGG	2	6	573243	573248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210898
14475	NC_015948	CCA	2	6	573319	573324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210898
14476	NC_015948	CGT	2	6	573337	573342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210898
14477	NC_015948	GTG	2	6	573365	573370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210898
14478	NC_015948	GGC	2	6	573412	573417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210898
14479	NC_015948	GTC	3	9	573482	573490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210898
14480	NC_015948	GGC	2	6	573512	573517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210898
14481	NC_015948	CGC	2	6	573634	573639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210898
14482	NC_015948	CGA	2	6	573640	573645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210898
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14484	NC_015948	CTG	2	6	573689	573694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210898
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14487	NC_015948	GTCG	2	8	573835	573842	0 %	25 %	50 %	25 %	344210898
14488	NC_015948	CGC	2	6	573892	573897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210898
14489	NC_015948	GAC	2	6	573962	573967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210898
14490	NC_015948	CGA	2	6	573985	573990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210898
14491	NC_015948	CGA	2	6	573994	573999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210898
14492	NC_015948	CGG	2	6	574032	574037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210898
14493	NC_015948	CGG	2	6	574067	574072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210898
14494	NC_015948	CAG	2	6	574079	574084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210898
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