MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015948	GTC	2	6	536376	536381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210862
13502	NC_015948	CG	3	6	536424	536429	0 %	0 %	50 %	50 %	344210862
13503	NC_015948	ACG	2	6	536470	536475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210863
13504	NC_015948	CGT	2	6	536477	536482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210863
13505	NC_015948	GTC	2	6	536483	536488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210863
13506	NC_015948	AAC	2	6	536495	536500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210863
13507	NC_015948	TTC	2	6	536504	536509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210863
13508	NC_015948	TCG	2	6	536547	536552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210863
13509	NC_015948	ACC	2	6	536562	536567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210863
13510	NC_015948	CGA	2	6	536602	536607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210863
13511	NC_015948	CGT	2	6	536618	536623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210863
13512	NC_015948	GTC	2	6	536646	536651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210863
13513	NC_015948	CGA	2	6	536674	536679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210863
13514	NC_015948	CGTG	2	8	536707	536714	0 %	25 %	50 %	25 %	344210863
13515	NC_015948	GCC	2	6	536727	536732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210863
13516	NC_015948	CGG	2	6	536762	536767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210863
13517	NC_015948	TGG	2	6	536812	536817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210863
13518	NC_015948	ATC	2	6	536819	536824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210863
13519	NC_015948	GCC	2	6	536831	536836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210863
13520	NC_015948	CGC	2	6	536885	536890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210863
13521	NC_015948	CGG	2	6	536924	536929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210863
13522	NC_015948	AGC	2	6	536976	536981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210863
13523	NC_015948	CGA	3	9	537040	537048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210863
13524	NC_015948	GCA	2	6	537085	537090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210863
13525	NC_015948	TCC	2	6	537095	537100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210863
13526	NC_015948	GCGA	2	8	537154	537161	25 %	0 %	50 %	25 %	344210863
13527	NC_015948	GTCGCG	2	12	537173	537184	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344210863
13528	NC_015948	GTC	2	6	537220	537225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210863
13529	NC_015948	CCG	2	6	537234	537239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210863
13530	NC_015948	CCT	2	6	537277	537282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210863
13531	NC_015948	ACA	3	9	537304	537312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210864
13532	NC_015948	AC	3	6	537345	537350	50 %	0 %	0 %	50 %	344210864
13533	NC_015948	CGCC	2	8	537351	537358	0 %	0 %	25 %	75 %	344210864
13534	NC_015948	GCT	2	6	537364	537369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210864
13535	NC_015948	GTG	2	6	537374	537379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210864
13536	NC_015948	AACGA	2	10	537410	537419	60 %	0 %	20 %	20 %	344210864
13537	NC_015948	GAG	2	6	537458	537463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210864
13538	NC_015948	GCT	2	6	537487	537492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210864
13539	NC_015948	TG	3	6	537498	537503	0 %	50 %	50 %	0 %	344210864
13540	NC_015948	AAC	2	6	537504	537509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210864
13541	NC_015948	TCGATG	2	12	537510	537521	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344210864
13542	NC_015948	CGC	2	6	537526	537531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210864
13543	NC_015948	GCG	2	6	537591	537596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210864
13544	NC_015948	TTC	2	6	537612	537617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210865
13545	NC_015948	GAA	2	6	537626	537631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210865
13546	NC_015948	CCT	2	6	537649	537654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210865
13547	NC_015948	CCT	2	6	537685	537690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210865
13548	NC_015948	GAC	2	6	537719	537724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13549	NC_015948	CGG	2	6	537759	537764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210865
13550	NC_015948	CGC	2	6	537802	537807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210865
13551	NC_015948	TCGACT	2	12	537828	537839	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344210865
13552	NC_015948	CTG	2	6	537902	537907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13553	NC_015948	GTC	2	6	537917	537922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13554	NC_015948	GCC	2	6	537986	537991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210865
13555	NC_015948	GC	3	6	538003	538008	0 %	0 %	50 %	50 %	344210865
13556	NC_015948	GCCG	2	8	538046	538053	0 %	0 %	50 %	50 %	344210865
13557	NC_015948	CGT	2	6	538075	538080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13558	NC_015948	GAC	2	6	538085	538090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13559	NC_015948	TCG	2	6	538119	538124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13560	NC_015948	CGG	2	6	538149	538154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210865
13561	NC_015948	GTC	2	6	538158	538163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13562	NC_015948	GCT	2	6	538165	538170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13563	NC_015948	CTG	2	6	538190	538195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13564	NC_015948	CGT	2	6	538202	538207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13565	NC_015948	CGG	2	6	538253	538258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210865
13566	NC_015948	GTC	2	6	538277	538282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13567	NC_015948	CCGG	2	8	538291	538298	0 %	0 %	50 %	50 %	344210865
13568	NC_015948	GCT	2	6	538309	538314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13569	NC_015948	GCC	2	6	538378	538383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210865
13570	NC_015948	GCCACC	2	12	538409	538420	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	344210865
13571	NC_015948	GAA	2	6	538421	538426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210865
13572	NC_015948	GCC	2	6	538454	538459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210865
13573	NC_015948	GCC	3	9	538463	538471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210865
13574	NC_015948	GCC	2	6	538490	538495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210865
13575	NC_015948	GCC	3	9	538499	538507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210865
13576	NC_015948	GCC	2	6	538517	538522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210865
13577	NC_015948	TCG	2	6	538584	538589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13578	NC_015948	CCT	2	6	538597	538602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210865
13579	NC_015948	GTC	2	6	538643	538648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
13580	NC_015948	GGT	2	6	538660	538665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210865
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13582	NC_015948	CCT	2	6	538690	538695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210865
13583	NC_015948	GA	3	6	538720	538725	50 %	0 %	50 %	0 %	344210865
13584	NC_015948	TAG	2	6	538810	538815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_015948	AC	3	6	538834	538839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13586	NC_015948	CTG	2	6	538848	538853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13587	NC_015948	CTA	2	6	538887	538892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13588	NC_015948	GGA	2	6	538989	538994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_015948	GTC	2	6	539014	539019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210866
13590	NC_015948	CGAG	2	8	539047	539054	25 %	0 %	50 %	25 %	344210866
13591	NC_015948	CGT	2	6	539083	539088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210866
13592	NC_015948	TCG	3	9	539103	539111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210866
13593	NC_015948	GCAC	2	8	539229	539236	25 %	0 %	25 %	50 %	344210866
13594	NC_015948	TCG	2	6	539247	539252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210866
13595	NC_015948	GAC	2	6	539342	539347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210866
13596	NC_015948	CG	3	6	539349	539354	0 %	0 %	50 %	50 %	344210866
13597	NC_015948	GACGGT	2	12	539363	539374	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344210866
13598	NC_015948	CTT	2	6	539404	539409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210866
13599	NC_015948	GCG	2	6	539418	539423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210866
13600	NC_015948	GCC	2	6	539448	539453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210866
13601	NC_015948	GAC	3	9	539476	539484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210866
13602	NC_015948	CGGG	2	8	539536	539543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13603	NC_015948	GCC	2	6	539574	539579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13604	NC_015948	GGT	2	6	539583	539588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_015948	ACGG	2	8	539614	539621	25 %	0 %	50 %	25 %	344210867
13606	NC_015948	CGGTCA	2	12	539652	539663	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344210867
13607	NC_015948	GTC	2	6	539671	539676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210867
13608	NC_015948	GTC	2	6	539875	539880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210867
13609	NC_015948	GCC	2	6	539895	539900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210867
13610	NC_015948	TCTA	2	8	539930	539937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13611	NC_015948	TCA	2	6	539960	539965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13612	NC_015948	TGA	2	6	540082	540087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_015948	CTG	2	6	540147	540152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13614	NC_015948	GCA	2	6	540242	540247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13615	NC_015948	TGC	2	6	540270	540275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13616	NC_015948	ACT	2	6	540282	540287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13617	NC_015948	TG	3	6	540314	540319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_015948	AAC	2	6	540351	540356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13619	NC_015948	AC	3	6	540361	540366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13977	NC_015948	CGG	2	6	553535	553540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210881
13978	NC_015948	GCG	2	6	553627	553632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210881
13979	NC_015948	TCG	2	6	553641	553646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210881
13980	NC_015948	ACGG	2	8	553656	553663	25 %	0 %	50 %	25 %	344210881
13981	NC_015948	GAC	2	6	553670	553675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210881
13982	NC_015948	GTC	2	6	553698	553703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210881
13983	NC_015948	CGA	2	6	553705	553710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210881
13984	NC_015948	GT	3	6	553770	553775	0 %	50 %	50 %	0 %	344210881
13985	NC_015948	TCA	2	6	553780	553785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210881
13986	NC_015948	CTG	2	6	553800	553805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210881
13987	NC_015948	GC	3	6	553846	553851	0 %	0 %	50 %	50 %	344210881
13988	NC_015948	CGG	2	6	553889	553894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210881
13989	NC_015948	CGA	3	9	553958	553966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210881
13990	NC_015948	CTA	2	6	554138	554143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210881
13991	NC_015948	GCTC	2	8	554179	554186	0 %	25 %	25 %	50 %	344210881
13992	NC_015948	CGG	2	6	554189	554194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210881
13993	NC_015948	TCG	2	6	554197	554202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210881
13994	NC_015948	GCG	2	6	554244	554249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210881
13995	NC_015948	CGA	2	6	554258	554263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210881
13996	NC_015948	CGC	2	6	554266	554271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210881
13997	NC_015948	TGC	2	6	554298	554303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13998	NC_015948	CCG	2	6	554385	554390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13999	NC_015948	GCCG	2	8	554403	554410	0 %	0 %	50 %	50 %	344210882
14000	NC_015948	CGT	2	6	554420	554425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210882

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