MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015948	GAG	2	6	516422	516427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_015948	CTGT	2	8	516498	516505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13003	NC_015948	TCGA	2	8	516562	516569	25 %	25 %	25 %	25 %	344210839
13004	NC_015948	GCA	2	6	516581	516586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210839
13005	NC_015948	GT	3	6	516603	516608	0 %	50 %	50 %	0 %	344210839
13006	NC_015948	CGA	2	6	516717	516722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210839
13007	NC_015948	TCG	2	6	516819	516824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210839
13008	NC_015948	AGAA	2	8	516854	516861	75 %	0 %	25 %	0 %	344210839
13009	NC_015948	AGT	2	6	516890	516895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210839
13010	NC_015948	TCG	2	6	517013	517018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210840
13011	NC_015948	T	7	7	517034	517040	0 %	100 %	0 %	0 %	344210840
13012	NC_015948	CTT	2	6	517046	517051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210840
13013	NC_015948	CTT	2	6	517058	517063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210840
13014	NC_015948	CT	3	6	517067	517072	0 %	50 %	0 %	50 %	344210840
13015	NC_015948	GTA	2	6	517083	517088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210840
13016	NC_015948	CCGG	2	8	517091	517098	0 %	0 %	50 %	50 %	344210840
13017	NC_015948	GACG	2	8	517136	517143	25 %	0 %	50 %	25 %	344210840
13018	NC_015948	TTC	2	6	517170	517175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210840
13019	NC_015948	CTT	2	6	517229	517234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210840
13020	NC_015948	AG	3	6	517281	517286	50 %	0 %	50 %	0 %	344210840
13021	NC_015948	CTG	2	6	517289	517294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210840
13022	NC_015948	GAC	2	6	517320	517325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210840
13023	NC_015948	TCA	2	6	517339	517344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210840
13024	NC_015948	GCC	2	6	517358	517363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210840
13025	NC_015948	TCT	2	6	517432	517437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210840
13026	NC_015948	CTT	2	6	517476	517481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210840
13027	NC_015948	GTC	2	6	517512	517517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210840
13028	NC_015948	CGT	2	6	517526	517531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210840
13029	NC_015948	CT	3	6	517593	517598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13030	NC_015948	CGG	2	6	517612	517617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210841
13031	NC_015948	GCTTC	2	10	517626	517635	0 %	40 %	20 %	40 %	344210841
13032	NC_015948	TTC	2	6	517645	517650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210841
13033	NC_015948	GTA	2	6	517834	517839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210841
13034	NC_015948	CCT	2	6	517851	517856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210841
13035	NC_015948	GCC	2	6	517919	517924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210841
13036	NC_015948	CGA	2	6	517935	517940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210841
13037	NC_015948	GCCGA	2	10	517982	517991	20 %	0 %	40 %	40 %	344210841
13038	NC_015948	ATG	2	6	517994	517999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210841
13039	NC_015948	TCG	3	9	518003	518011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210841
13040	NC_015948	CAGC	2	8	518016	518023	25 %	0 %	25 %	50 %	344210841
13041	NC_015948	CGG	2	6	518061	518066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210841
13042	NC_015948	CTC	2	6	518080	518085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210841
13043	NC_015948	GTC	2	6	518119	518124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210841
13044	NC_015948	CTT	2	6	518167	518172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210841
13045	NC_015948	CGT	2	6	518283	518288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210841
13046	NC_015948	TGC	2	6	518475	518480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_015948	GTT	2	6	518482	518487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_015948	GGTC	2	8	518521	518528	0 %	25 %	50 %	25 %	344210842
13049	NC_015948	CGT	2	6	518531	518536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13050	NC_015948	CGA	2	6	518545	518550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13051	NC_015948	GAG	2	6	518564	518569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210842
13052	NC_015948	GCCGT	2	10	518574	518583	0 %	20 %	40 %	40 %	344210842
13053	NC_015948	GAC	2	6	518600	518605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13054	NC_015948	GGT	2	6	518606	518611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210842
13055	NC_015948	CG	3	6	518636	518641	0 %	0 %	50 %	50 %	344210842
13056	NC_015948	CTG	2	6	518743	518748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13057	NC_015948	GAGC	2	8	518864	518871	25 %	0 %	50 %	25 %	344210842
13058	NC_015948	GCCCC	2	10	518881	518890	0 %	0 %	20 %	80 %	344210842
13059	NC_015948	CGC	2	6	518914	518919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210842
13060	NC_015948	GGCC	2	8	518963	518970	0 %	0 %	50 %	50 %	344210842
13061	NC_015948	TCG	2	6	518995	519000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13062	NC_015948	CGT	2	6	519058	519063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13063	NC_015948	CGC	2	6	519076	519081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210842
13064	NC_015948	CTG	2	6	519128	519133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13065	NC_015948	GC	3	6	519135	519140	0 %	0 %	50 %	50 %	344210842
13066	NC_015948	TCG	2	6	519141	519146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13067	NC_015948	CAG	2	6	519167	519172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13068	NC_015948	TCG	2	6	519213	519218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13069	NC_015948	GTA	2	6	519263	519268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210842
13070	NC_015948	CGT	2	6	519301	519306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13071	NC_015948	CGT	3	9	519317	519325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13072	NC_015948	GCG	2	6	519348	519353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210842
13073	NC_015948	GCG	2	6	519411	519416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210842
13074	NC_015948	CAG	2	6	519425	519430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13075	NC_015948	GAA	2	6	519476	519481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210842
13076	NC_015948	GCC	2	6	519482	519487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210842
13077	NC_015948	GTGC	2	8	519506	519513	0 %	25 %	50 %	25 %	344210842
13078	NC_015948	GCC	2	6	519608	519613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210842
13079	NC_015948	TCG	3	9	519618	519626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13080	NC_015948	CTC	2	6	519656	519661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210842
13081	NC_015948	GGC	2	6	519687	519692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210842
13082	NC_015948	CGC	3	9	519725	519733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210842
13083	NC_015948	ACCC	2	8	519853	519860	25 %	0 %	0 %	75 %	344210842
13084	NC_015948	CG	3	6	519880	519885	0 %	0 %	50 %	50 %	344210842
13085	NC_015948	CGT	2	6	519922	519927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13086	NC_015948	CAG	2	6	520010	520015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210842
13087	NC_015948	CGG	2	6	520033	520038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210842
13088	NC_015948	GGC	2	6	520163	520168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_015948	CAG	2	6	520196	520201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13090	NC_015948	TCG	2	6	520269	520274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13091	NC_015948	ACA	2	6	520275	520280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210843
13092	NC_015948	CCG	2	6	520281	520286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210843
13093	NC_015948	TGG	2	6	520344	520349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210843
13094	NC_015948	GAC	2	6	520366	520371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13095	NC_015948	TCG	2	6	520398	520403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13096	NC_015948	CCGACG	2	12	520419	520430	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344210843
13097	NC_015948	CTG	2	6	520493	520498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13098	NC_015948	GAG	2	6	520505	520510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210843
13099	NC_015948	CAG	2	6	520517	520522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13100	NC_015948	CGC	2	6	520561	520566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210843
13101	NC_015948	CCGA	2	8	520593	520600	25 %	0 %	25 %	50 %	344210843
13102	NC_015948	GCA	2	6	520601	520606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13103	NC_015948	TCC	2	6	520638	520643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210843
13104	NC_015948	CA	3	6	520644	520649	50 %	0 %	0 %	50 %	344210843
13105	NC_015948	CGCTGA	2	12	520656	520667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13106	NC_015948	GCT	2	6	520684	520689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13107	NC_015948	GAC	2	6	520705	520710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13108	NC_015948	TACG	2	8	520743	520750	25 %	25 %	25 %	25 %	344210843
13109	NC_015948	GAAC	2	8	520803	520810	50 %	0 %	25 %	25 %	344210843
13110	NC_015948	CGA	2	6	520852	520857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13111	NC_015948	CGC	2	6	520864	520869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210843
13112	NC_015948	CGA	2	6	520906	520911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13113	NC_015948	CTG	2	6	520922	520927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13114	NC_015948	CGA	3	9	520936	520944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13115	NC_015948	CACGA	2	10	521000	521009	40 %	0 %	20 %	40 %	344210843
13116	NC_015948	CAG	2	6	521063	521068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13117	NC_015948	ACG	2	6	521076	521081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210843
13118	NC_015948	TGAA	2	8	521157	521164	50 %	25 %	25 %	0 %	344210843
13119	NC_015948	CCCG	2	8	521179	521186	0 %	0 %	25 %	75 %	344210843
13120	NC_015948	GACG	2	8	521245	521252	25 %	0 %	50 %	25 %	344210843
13121	NC_015948	GAC	2	6	521288	521293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210843
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13123	NC_015948	ACG	2	6	521301	521306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210843
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13129	NC_015948	GGGC	2	8	521615	521622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13130	NC_015948	TGC	2	6	521659	521664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210844
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13152	NC_015948	GTT	2	6	522365	522370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13153	NC_015948	CGG	2	6	522415	522420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13154	NC_015948	GCC	2	6	522481	522486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13158	NC_015948	CAA	2	6	522565	522570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13159	NC_015948	GAA	2	6	522643	522648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13162	NC_015948	ACC	2	6	522726	522731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13163	NC_015948	ATA	2	6	522733	522738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13184	NC_015948	TGTC	2	8	523708	523715	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13223	NC_015948	GACT	2	8	525591	525598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13235	NC_015948	CGTT	2	8	526192	526199	0 %	50 %	25 %	25 %	344210848
13236	NC_015948	CAT	2	6	526211	526216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210848
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13241	NC_015948	GCCA	2	8	526316	526323	25 %	0 %	25 %	50 %	344210848
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13346	NC_015948	TA	3	6	530155	530160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13347	NC_015948	ATA	2	6	530165	530170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13348	NC_015948	T	6	6	530199	530204	0 %	100 %	0 %	0 %	344210854
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13358	NC_015948	GAC	3	9	530520	530528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210854
13359	NC_015948	CGA	2	6	530597	530602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210854
13360	NC_015948	GCA	2	6	530609	530614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210854
13361	NC_015948	CGA	2	6	530621	530626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210854
13362	NC_015948	CGA	2	6	530630	530635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210854
13363	NC_015948	TTC	2	6	530637	530642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210854
13364	NC_015948	GAA	2	6	530661	530666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210854
13365	NC_015948	AAG	2	6	530671	530676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210854
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13367	NC_015948	AAG	2	6	530701	530706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210854
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13370	NC_015948	TATG	2	8	530842	530849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13371	NC_015948	T	6	6	530861	530866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13372	NC_015948	ACT	2	6	530876	530881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13377	NC_015948	CCTGA	2	10	531084	531093	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13378	NC_015948	ATT	2	6	531111	531116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344210856
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13383	NC_015948	CCCG	2	8	531267	531274	0 %	0 %	25 %	75 %	344210856
13384	NC_015948	CTG	2	6	531285	531290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210856
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13397	NC_015948	CAG	2	6	531931	531936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210856
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13399	NC_015948	CGAAC	2	10	532050	532059	40 %	0 %	20 %	40 %	344210856
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13402	NC_015948	CGT	2	6	532218	532223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210856
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13407	NC_015948	GTCG	2	8	532539	532546	0 %	25 %	50 %	25 %	344210857
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13410	NC_015948	TCG	2	6	532591	532596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210857
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13412	NC_015948	GGTCT	2	10	532692	532701	0 %	40 %	40 %	20 %	344210857
13413	NC_015948	GCG	2	6	532710	532715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210857
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13434	NC_015948	TCG	2	6	533317	533322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210857
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13437	NC_015948	GAC	2	6	533559	533564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210857
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13439	NC_015948	GCA	2	6	533812	533817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210858
13440	NC_015948	CGA	2	6	533875	533880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210858
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13442	NC_015948	ATA	2	6	534004	534009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13443	NC_015948	CG	3	6	534197	534202	0 %	0 %	50 %	50 %	344210859
13444	NC_015948	GACGGC	2	12	534234	534245	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344210859
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13447	NC_015948	TGAC	2	8	534313	534320	25 %	25 %	25 %	25 %	344210859
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13455	NC_015948	CGG	2	6	534780	534785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210860
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13460	NC_015948	CGA	3	9	534842	534850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210860
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13464	NC_015948	GCGG	2	8	535057	535064	0 %	0 %	75 %	25 %	344210860
13465	NC_015948	GCCGAA	2	12	535065	535076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210860
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13467	NC_015948	TGTCC	2	10	535118	535127	0 %	40 %	20 %	40 %	344210860
13468	NC_015948	CCG	2	6	535177	535182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210860
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13471	NC_015948	CGC	2	6	535214	535219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210860
13472	NC_015948	CTG	2	6	535250	535255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210860
13473	NC_015948	GCC	2	6	535279	535284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210860
13474	NC_015948	ACC	2	6	535450	535455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13475	NC_015948	GTC	2	6	535480	535485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210861
13476	NC_015948	TGGA	2	8	535525	535532	25 %	25 %	50 %	0 %	344210861
13477	NC_015948	CTC	2	6	535593	535598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210861
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13479	NC_015948	CGT	2	6	535680	535685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210861
13480	NC_015948	ACGGC	2	10	535712	535721	20 %	0 %	40 %	40 %	344210861
13481	NC_015948	CGT	2	6	535734	535739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210861
13482	NC_015948	CGT	2	6	535743	535748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210861
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13499	NC_015948	GGGT	2	8	536152	536159	0 %	25 %	75 %	0 %	344210861
13500	NC_015948	GAC	2	6	536227	536232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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