MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015948	CT	3	6	495157	495162	0 %	50 %	0 %	50 %	344210815
12502	NC_015948	GA	3	6	495225	495230	50 %	0 %	50 %	0 %	344210815
12503	NC_015948	CGT	2	6	495282	495287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210815
12504	NC_015948	CGA	2	6	495290	495295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210815
12505	NC_015948	CGCA	2	8	495387	495394	25 %	0 %	25 %	50 %	344210815
12506	NC_015948	GTC	2	6	495474	495479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210815
12507	NC_015948	CAGAGA	2	12	495539	495550	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	344210815
12508	NC_015948	CGG	2	6	495566	495571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210815
12509	NC_015948	AGC	2	6	495577	495582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210815
12510	NC_015948	ACA	2	6	495586	495591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210815
12511	NC_015948	GCG	2	6	495601	495606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210815
12512	NC_015948	TCG	2	6	495638	495643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210816
12513	NC_015948	TCG	2	6	495689	495694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210816
12514	NC_015948	CTG	2	6	495721	495726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210816
12515	NC_015948	CAG	2	6	495763	495768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210816
12516	NC_015948	CTC	2	6	495838	495843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210816
12517	NC_015948	GGC	2	6	495890	495895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210816
12518	NC_015948	CAAG	2	8	495906	495913	50 %	0 %	25 %	25 %	344210816
12519	NC_015948	GCC	2	6	495951	495956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210816
12520	NC_015948	TCG	2	6	495993	495998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210816
12521	NC_015948	CGT	2	6	496017	496022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210816
12522	NC_015948	GTC	2	6	496030	496035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210816
12523	NC_015948	GCC	4	12	496057	496068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210816
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12528	NC_015948	CGA	2	6	496152	496157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210816
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12531	NC_015948	CGAG	2	8	496336	496343	25 %	0 %	50 %	25 %	344210816
12532	NC_015948	TCG	2	6	496370	496375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210816
12533	NC_015948	CGA	2	6	496437	496442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210816
12534	NC_015948	CCCG	2	8	496450	496457	0 %	0 %	25 %	75 %	344210816
12535	NC_015948	CGC	2	6	496467	496472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210816
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12541	NC_015948	CAACA	2	10	496894	496903	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12542	NC_015948	AG	3	6	496963	496968	50 %	0 %	50 %	0 %	344210817
12543	NC_015948	ACT	2	6	496971	496976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210817
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12545	NC_015948	TGAG	2	8	497024	497031	25 %	25 %	50 %	0 %	344210817
12546	NC_015948	AG	3	6	497076	497081	50 %	0 %	50 %	0 %	344210817
12547	NC_015948	CGA	2	6	497124	497129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210817
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12552	NC_015948	GAC	2	6	497382	497387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210817
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12554	NC_015948	CGT	2	6	497519	497524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210817
12555	NC_015948	CGG	2	6	497531	497536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210817
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12557	NC_015948	TCG	2	6	497584	497589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210817
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12560	NC_015948	GTC	2	6	497766	497771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210817
12561	NC_015948	CGA	2	6	497813	497818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210817
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12563	NC_015948	GAC	2	6	498009	498014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210818
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12565	NC_015948	CGA	2	6	498036	498041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210818
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12567	NC_015948	ACCG	2	8	498075	498082	25 %	0 %	25 %	50 %	344210818
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12571	NC_015948	CGA	2	6	498207	498212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210818
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12592	NC_015948	CGT	2	6	499086	499091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210820
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12598	NC_015948	GGGT	2	8	499258	499265	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_015948	AG	3	6	499358	499363	50 %	0 %	50 %	0 %	344210821
12600	NC_015948	GC	4	8	499409	499416	0 %	0 %	50 %	50 %	344210821
12601	NC_015948	GGCT	2	8	499421	499428	0 %	25 %	50 %	25 %	344210821
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12604	NC_015948	GC	3	6	499504	499509	0 %	0 %	50 %	50 %	344210821
12605	NC_015948	TCG	2	6	499534	499539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210821
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12615	NC_015948	ACG	2	6	500219	500224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12619	NC_015948	ACG	2	6	500325	500330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210823
12620	NC_015948	ACGT	2	8	500364	500371	25 %	25 %	25 %	25 %	344210823
12621	NC_015948	CGA	2	6	500386	500391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210823
12622	NC_015948	CGC	2	6	500422	500427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210823
12623	NC_015948	GAC	3	9	500447	500455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210823
12624	NC_015948	CGA	2	6	500470	500475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210823
12625	NC_015948	GCC	2	6	500530	500535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210823
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12627	NC_015948	TCG	2	6	500680	500685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210823
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12633	NC_015948	GGGAT	2	10	500991	501000	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12634	NC_015948	CAC	2	6	501142	501147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12652	NC_015948	GTC	2	6	501711	501716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210824
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12654	NC_015948	GAC	2	6	501796	501801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210825
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12740	NC_015948	GTCA	2	8	505310	505317	25 %	25 %	25 %	25 %	344210828
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12857	NC_015948	CGC	2	6	510172	510177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210832
12858	NC_015948	CG	3	6	510191	510196	0 %	0 %	50 %	50 %	344210832
12859	NC_015948	GCC	2	6	510199	510204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210832
12860	NC_015948	CGT	2	6	510226	510231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210832
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12863	NC_015948	TCG	2	6	510315	510320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210832
12864	NC_015948	GCT	2	6	510366	510371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210832
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12869	NC_015948	GCTC	2	8	510649	510656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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12961	NC_015948	ATA	2	6	514625	514630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12962	NC_015948	GCTA	2	8	514682	514689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12963	NC_015948	TCG	2	6	514718	514723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210837
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12974	NC_015948	CA	3	6	515277	515282	50 %	0 %	0 %	50 %	344210837
12975	NC_015948	CGGT	2	8	515433	515440	0 %	25 %	50 %	25 %	344210838
12976	NC_015948	CGT	2	6	515489	515494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210838
12977	NC_015948	CGA	2	6	515593	515598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210838
12978	NC_015948	CCG	2	6	515610	515615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210838
12979	NC_015948	CGC	2	6	515656	515661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210838
12980	NC_015948	CTG	2	6	515669	515674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210838
12981	NC_015948	ACG	2	6	515690	515695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210838
12982	NC_015948	CCG	2	6	515772	515777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210838
12983	NC_015948	ATC	2	6	515780	515785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210838
12984	NC_015948	CGGCGA	2	12	515790	515801	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344210838
12985	NC_015948	CGAG	2	8	515814	515821	25 %	0 %	50 %	25 %	344210838
12986	NC_015948	CTGT	2	8	515850	515857	0 %	50 %	25 %	25 %	344210838
12987	NC_015948	TCGACG	2	12	515910	515921	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344210838
12988	NC_015948	ACG	3	9	515919	515927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210838
12989	NC_015948	GGCC	2	8	515959	515966	0 %	0 %	50 %	50 %	344210838
12990	NC_015948	GCCAC	2	10	515979	515988	20 %	0 %	20 %	60 %	344210838
12991	NC_015948	GC	3	6	516009	516014	0 %	0 %	50 %	50 %	344210838
12992	NC_015948	GAAC	2	8	516028	516035	50 %	0 %	25 %	25 %	344210838
12993	NC_015948	CGA	2	6	516094	516099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210838
12994	NC_015948	TCG	2	6	516138	516143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210838
12995	NC_015948	CG	3	6	516155	516160	0 %	0 %	50 %	50 %	344210838
12996	NC_015948	CGT	2	6	516172	516177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210838
12997	NC_015948	GAC	2	6	516200	516205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210838
12998	NC_015948	CGT	2	6	516208	516213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210838
12999	NC_015948	ACG	2	6	516231	516236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210838
13000	NC_015948	TCA	2	6	516405	516410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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