MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015948	CTC	2	6	455153	455158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11502	NC_015948	AGGC	2	8	455309	455316	25 %	0 %	50 %	25 %	344210779
11503	NC_015948	CGT	2	6	455334	455339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210779
11504	NC_015948	CTC	2	6	455443	455448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210779
11505	NC_015948	CGT	2	6	455460	455465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210779
11506	NC_015948	TGA	2	6	455483	455488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210779
11507	NC_015948	TCGTC	2	10	455496	455505	0 %	40 %	20 %	40 %	344210779
11508	NC_015948	CCT	2	6	455534	455539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210779
11509	NC_015948	CA	3	6	455554	455559	50 %	0 %	0 %	50 %	344210779
11510	NC_015948	TCG	2	6	455636	455641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210779
11511	NC_015948	ACG	2	6	455654	455659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210779
11512	NC_015948	TCA	2	6	455669	455674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210779
11513	NC_015948	CGG	2	6	455676	455681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210779
11514	NC_015948	CGA	2	6	455718	455723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210779
11515	NC_015948	ACG	2	6	455725	455730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210779
11516	NC_015948	CG	4	8	455856	455863	0 %	0 %	50 %	50 %	344210779
11517	NC_015948	GTC	2	6	455884	455889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210779
11518	NC_015948	CGA	2	6	455901	455906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210779
11519	NC_015948	ACG	2	6	455939	455944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210779
11520	NC_015948	GTC	2	6	455965	455970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210779
11521	NC_015948	CGGAC	2	10	455991	456000	20 %	0 %	40 %	40 %	344210779
11522	NC_015948	GTC	2	6	456160	456165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210779
11523	NC_015948	CGG	2	6	456168	456173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210779
11524	NC_015948	GCTCG	2	10	456298	456307	0 %	20 %	40 %	40 %	344210779
11525	NC_015948	GGT	2	6	456351	456356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210779
11526	NC_015948	TG	3	6	456364	456369	0 %	50 %	50 %	0 %	344210780
11527	NC_015948	ATC	2	6	456372	456377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210780
11528	NC_015948	CGA	2	6	456395	456400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210780
11529	NC_015948	TCGG	2	8	456558	456565	0 %	25 %	50 %	25 %	344210780
11530	NC_015948	GCAC	2	8	456586	456593	25 %	0 %	25 %	50 %	344210780
11531	NC_015948	CCGA	2	8	456600	456607	25 %	0 %	25 %	50 %	344210780
11532	NC_015948	GTC	2	6	456651	456656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210780
11533	NC_015948	ATC	2	6	456666	456671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210780
11534	NC_015948	GA	3	6	456689	456694	50 %	0 %	50 %	0 %	344210780
11535	NC_015948	GTC	2	6	456744	456749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210780
11536	NC_015948	AG	3	6	456804	456809	50 %	0 %	50 %	0 %	344210780
11537	NC_015948	CGCCGT	2	12	456836	456847	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344210780
11538	NC_015948	CGC	2	6	456875	456880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210780
11539	NC_015948	CGC	2	6	456892	456897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210780
11540	NC_015948	GAC	2	6	456912	456917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210780
11541	NC_015948	GTC	2	6	456972	456977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210780
11542	NC_015948	TGAC	2	8	457027	457034	25 %	25 %	25 %	25 %	344210780
11543	NC_015948	GTC	2	6	457047	457052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210780
11544	NC_015948	GAG	2	6	457086	457091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210780
11545	NC_015948	CG	4	8	457144	457151	0 %	0 %	50 %	50 %	344210780
11546	NC_015948	CGA	2	6	457178	457183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210780
11547	NC_015948	TC	3	6	457220	457225	0 %	50 %	0 %	50 %	344210780
11548	NC_015948	TCG	2	6	457243	457248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210780
11549	NC_015948	CCT	2	6	457258	457263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210780
11550	NC_015948	CGC	2	6	457268	457273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210780
11551	NC_015948	GC	3	6	457282	457287	0 %	0 %	50 %	50 %	344210780
11552	NC_015948	GCCAC	2	10	457347	457356	20 %	0 %	20 %	60 %	344210780
11553	NC_015948	TCG	3	9	457372	457380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210780
11554	NC_015948	CA	3	6	457385	457390	50 %	0 %	0 %	50 %	344210780
11555	NC_015948	GCG	2	6	457393	457398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210780
11556	NC_015948	CGC	2	6	457434	457439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210780
11557	NC_015948	GC	4	8	457444	457451	0 %	0 %	50 %	50 %	344210780
11558	NC_015948	CGT	2	6	457469	457474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210780
11559	NC_015948	CGC	2	6	457541	457546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210780
11560	NC_015948	TCA	2	6	457627	457632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210780
11561	NC_015948	GC	3	6	457633	457638	0 %	0 %	50 %	50 %	344210780
11562	NC_015948	AGG	2	6	457663	457668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210780
11563	NC_015948	CGA	2	6	457673	457678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210780
11564	NC_015948	AGG	2	6	457690	457695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210780
11565	NC_015948	CTT	2	6	457727	457732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210780
11566	NC_015948	GC	3	6	457771	457776	0 %	0 %	50 %	50 %	344210780
11567	NC_015948	GAC	2	6	457893	457898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210780
11568	NC_015948	GGT	2	6	457955	457960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210780
11569	NC_015948	ACGG	2	8	457968	457975	25 %	0 %	50 %	25 %	344210780
11570	NC_015948	AGC	2	6	458153	458158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210780
11571	NC_015948	CT	3	6	458179	458184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11572	NC_015948	TGT	2	6	458222	458227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_015948	CTG	2	6	458371	458376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_015948	TCATA	2	10	458532	458541	40 %	40 %	0 %	20 %	344210781
11575	NC_015948	CACG	2	8	458556	458563	25 %	0 %	25 %	50 %	344210781
11576	NC_015948	TCGTA	2	10	458573	458582	20 %	40 %	20 %	20 %	344210781
11577	NC_015948	CGA	2	6	458724	458729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210781
11578	NC_015948	GTA	2	6	458745	458750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210781
11579	NC_015948	GCA	2	6	458790	458795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210781
11580	NC_015948	GATC	2	8	458820	458827	25 %	25 %	25 %	25 %	344210781
11581	NC_015948	ATC	2	6	458882	458887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210781
11582	NC_015948	CTG	2	6	458925	458930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210781
11583	NC_015948	TCT	2	6	458963	458968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210781
11584	NC_015948	AAT	2	6	458992	458997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344210781
11585	NC_015948	CCAGC	2	10	459015	459024	20 %	0 %	20 %	60 %	344210781
11586	NC_015948	CG	3	6	459046	459051	0 %	0 %	50 %	50 %	344210781
11587	NC_015948	GAA	2	6	459199	459204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210781
11588	NC_015948	CGA	2	6	459258	459263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210781
11589	NC_015948	CCG	2	6	459320	459325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210781
11590	NC_015948	CTT	2	6	459414	459419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210781
11591	NC_015948	GTC	2	6	459433	459438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210781
11592	NC_015948	ACG	2	6	459443	459448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210781
11593	NC_015948	GTTC	2	8	459452	459459	0 %	50 %	25 %	25 %	344210781
11594	NC_015948	GAC	2	6	459467	459472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210781
11595	NC_015948	TAA	2	6	459517	459522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344210781
11596	NC_015948	TTC	2	6	459645	459650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210781
11597	NC_015948	GCGG	2	8	459651	459658	0 %	0 %	75 %	25 %	344210781
11598	NC_015948	AC	3	6	459678	459683	50 %	0 %	0 %	50 %	344210781
11599	NC_015948	ACG	2	6	459686	459691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210781
11600	NC_015948	G	6	6	459737	459742	0 %	0 %	100 %	0 %	344210781
11601	NC_015948	GTT	2	6	459799	459804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210781
11602	NC_015948	CGG	2	6	459816	459821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210781
11603	NC_015948	ACG	3	9	459833	459841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210781
11604	NC_015948	GCCA	2	8	459867	459874	25 %	0 %	25 %	50 %	344210781
11605	NC_015948	GA	3	6	459983	459988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_015948	ACG	2	6	460027	460032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_015948	TG	3	6	460086	460091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_015948	TG	3	6	460121	460126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_015948	AGG	2	6	460282	460287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210782
11610	NC_015948	CGC	2	6	460313	460318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210782
11611	NC_015948	TCA	2	6	460382	460387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210782
11612	NC_015948	CGG	2	6	460398	460403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210782
11613	NC_015948	TCC	2	6	460405	460410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210782
11614	NC_015948	CGA	2	6	460418	460423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210782
11615	NC_015948	TTG	2	6	460444	460449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210782
11616	NC_015948	GCG	2	6	460507	460512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210782
11617	NC_015948	TCC	2	6	460522	460527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210782
11618	NC_015948	GAC	2	6	460539	460544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210782
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11620	NC_015948	GTC	3	9	460593	460601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210782
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11977	NC_015948	GCCC	2	8	474242	474249	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11978	NC_015948	GC	3	6	474260	474265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11997	NC_015948	ATCG	2	8	475052	475059	25 %	25 %	25 %	25 %	344210795
11998	NC_015948	GC	3	6	475097	475102	0 %	0 %	50 %	50 %	344210795
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