MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015948	CGC	2	6	415911	415916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210736
10502	NC_015948	GGC	2	6	415950	415955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210736
10503	NC_015948	CGC	2	6	415983	415988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210736
10504	NC_015948	GGT	2	6	416009	416014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210736
10505	NC_015948	CCG	2	6	416024	416029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210736
10506	NC_015948	CGG	2	6	416089	416094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210736
10507	NC_015948	TCC	2	6	416099	416104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210736
10508	NC_015948	TGGC	2	8	416127	416134	0 %	25 %	50 %	25 %	344210736
10509	NC_015948	GTC	2	6	416197	416202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210736
10510	NC_015948	CGT	2	6	416235	416240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210736
10511	NC_015948	GCT	2	6	416286	416291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210736
10512	NC_015948	GCC	2	6	416314	416319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210736
10513	NC_015948	CTG	2	6	416362	416367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210736
10514	NC_015948	CGG	3	9	416379	416387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210736
10515	NC_015948	GCC	2	6	416395	416400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210736
10516	NC_015948	GAG	2	6	416425	416430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210736
10517	NC_015948	GA	3	6	416453	416458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_015948	CGCC	2	8	416492	416499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10519	NC_015948	ACG	2	6	416508	416513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_015948	GAAA	2	8	416533	416540	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_015948	ACG	2	6	416560	416565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210737
10522	NC_015948	C	6	6	416568	416573	0 %	0 %	0 %	100 %	344210737
10523	NC_015948	AGACGA	2	12	416609	416620	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	344210737
10524	NC_015948	CG	3	6	416706	416711	0 %	0 %	50 %	50 %	344210737
10525	NC_015948	CTCCG	2	10	416763	416772	0 %	20 %	20 %	60 %	344210737
10526	NC_015948	CAC	2	6	416820	416825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210737
10527	NC_015948	CAT	2	6	416846	416851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210737
10528	NC_015948	CAG	2	6	416865	416870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210737
10529	NC_015948	ACG	2	6	416905	416910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210737
10530	NC_015948	GCC	2	6	416911	416916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210737
10531	NC_015948	CCT	2	6	416939	416944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210737
10532	NC_015948	CGA	2	6	416945	416950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210737
10533	NC_015948	CCT	2	6	416963	416968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210737
10534	NC_015948	CCGA	2	8	417067	417074	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10535	NC_015948	GAG	3	9	417114	417122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210738
10536	NC_015948	GAA	2	6	417126	417131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210738
10537	NC_015948	AGA	2	6	417142	417147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210738
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10539	NC_015948	CAG	2	6	417165	417170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210738
10540	NC_015948	CGA	2	6	417173	417178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210738
10541	NC_015948	AGG	2	6	417190	417195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210738
10542	NC_015948	AGC	2	6	417202	417207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210738
10543	NC_015948	GCAG	2	8	417224	417231	25 %	0 %	50 %	25 %	344210738
10544	NC_015948	CAG	2	6	417318	417323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210738
10545	NC_015948	GTC	2	6	417324	417329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210738
10546	NC_015948	CGA	2	6	417365	417370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210738
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10548	NC_015948	TGT	2	6	417454	417459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210739
10549	NC_015948	GGC	2	6	417485	417490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210739
10550	NC_015948	ACG	2	6	417628	417633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210739
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10552	NC_015948	CAG	2	6	417678	417683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210739
10553	NC_015948	GAC	2	6	417738	417743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210739
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10555	NC_015948	CGA	2	6	417782	417787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210739
10556	NC_015948	CGC	2	6	417856	417861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210739
10557	NC_015948	CG	3	6	417969	417974	0 %	0 %	50 %	50 %	344210739
10558	NC_015948	GCGT	2	8	418080	418087	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10559	NC_015948	TCG	2	6	418088	418093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_015948	CGGT	2	8	418130	418137	0 %	25 %	50 %	25 %	344210740
10561	NC_015948	TCGGT	2	10	418152	418161	0 %	40 %	40 %	20 %	344210740
10562	NC_015948	CGT	3	9	418212	418220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210740
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10564	NC_015948	GC	3	6	418385	418390	0 %	0 %	50 %	50 %	344210740
10565	NC_015948	CGA	3	9	418410	418418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210740
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10568	NC_015948	TCG	2	6	418502	418507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210740
10569	NC_015948	TGT	2	6	418543	418548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210740
10570	NC_015948	GA	3	6	418565	418570	50 %	0 %	50 %	0 %	344210740
10571	NC_015948	CTG	2	6	418582	418587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210740
10572	NC_015948	CGA	2	6	418590	418595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210740
10573	NC_015948	GA	3	6	418601	418606	50 %	0 %	50 %	0 %	344210740
10574	NC_015948	AGC	2	6	418637	418642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210740
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10577	NC_015948	CCCAT	2	10	418757	418766	20 %	20 %	0 %	60 %	344210740
10578	NC_015948	TGT	2	6	418794	418799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10579	NC_015948	CT	3	6	418803	418808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10580	NC_015948	ACGG	2	8	418882	418889	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10581	NC_015948	ACT	2	6	418890	418895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10583	NC_015948	TGG	2	6	418948	418953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_015948	GAAC	2	8	418967	418974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10585	NC_015948	GC	3	6	418983	418988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10586	NC_015948	GAG	2	6	419047	419052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210741
10587	NC_015948	CGG	2	6	419062	419067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210741
10588	NC_015948	CCGA	2	8	419140	419147	25 %	0 %	25 %	50 %	344210741
10589	NC_015948	GCG	2	6	419165	419170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210741
10590	NC_015948	TCG	2	6	419177	419182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210741
10591	NC_015948	GGGC	2	8	419208	419215	0 %	0 %	75 %	25 %	344210741
10592	NC_015948	TCG	2	6	419264	419269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210741
10593	NC_015948	GAG	2	6	419332	419337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210741
10594	NC_015948	CGG	2	6	419393	419398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210741
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10601	NC_015948	CG	3	6	419719	419724	0 %	0 %	50 %	50 %	344210741
10602	NC_015948	CGC	2	6	419754	419759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210741
10603	NC_015948	GAC	2	6	419799	419804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210741
10604	NC_015948	CG	4	8	419805	419812	0 %	0 %	50 %	50 %	344210741
10605	NC_015948	ACT	2	6	419819	419824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210741
10606	NC_015948	CGT	2	6	419832	419837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210741
10607	NC_015948	TTCGA	2	10	419848	419857	20 %	40 %	20 %	20 %	344210741
10608	NC_015948	GGC	3	9	419884	419892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210741
10609	NC_015948	ACG	2	6	419897	419902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210741
10610	NC_015948	CGG	2	6	419919	419924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210741
10611	NC_015948	GCCG	2	8	419934	419941	0 %	0 %	50 %	50 %	344210741
10612	NC_015948	GCCAC	2	10	419957	419966	20 %	0 %	20 %	60 %	344210741
10613	NC_015948	GC	3	6	419985	419990	0 %	0 %	50 %	50 %	344210741
10614	NC_015948	GAG	2	6	420007	420012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210741
10615	NC_015948	TAC	2	6	420025	420030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210741
10616	NC_015948	TCGC	2	8	420071	420078	0 %	25 %	25 %	50 %	344210741
10617	NC_015948	CGT	2	6	420099	420104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210741
10618	NC_015948	GC	3	6	420134	420139	0 %	0 %	50 %	50 %	344210741
10619	NC_015948	GTC	2	6	420175	420180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210741
10620	NC_015948	TCG	2	6	420182	420187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210741
10621	NC_015948	ACG	2	6	420206	420211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210741
10622	NC_015948	GAC	2	6	420232	420237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210741
10623	NC_015948	ACC	2	6	420355	420360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10624	NC_015948	AGT	2	6	420367	420372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_015948	TCG	2	6	420414	420419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210742
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10637	NC_015948	TG	3	6	421164	421169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10638	NC_015948	CCGA	2	8	421247	421254	25 %	0 %	25 %	50 %	344210744
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