MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_015948	TCG	2	6	397159	397164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210718
10003	NC_015948	CAG	2	6	397188	397193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210718
10004	NC_015948	CAG	2	6	397236	397241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210718
10005	NC_015948	ACG	2	6	397252	397257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210718
10006	NC_015948	CAT	2	6	397292	397297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210718
10007	NC_015948	CGC	2	6	397301	397306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210718
10008	NC_015948	GAG	2	6	397359	397364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210718
10009	NC_015948	CGC	2	6	397379	397384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210718
10010	NC_015948	CGA	2	6	397433	397438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210718
10011	NC_015948	GAC	2	6	397446	397451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210718
10012	NC_015948	TCG	2	6	397530	397535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210719
10013	NC_015948	CGA	2	6	397540	397545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210719
10014	NC_015948	ACG	2	6	397557	397562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210719
10015	NC_015948	TCG	2	6	397566	397571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210719
10016	NC_015948	CCG	2	6	397597	397602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210719
10017	NC_015948	CCT	2	6	397729	397734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210719
10018	NC_015948	CGGG	2	8	397735	397742	0 %	0 %	75 %	25 %	344210719
10019	NC_015948	CGA	2	6	397792	397797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210719
10020	NC_015948	CGC	2	6	397799	397804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210719
10021	NC_015948	TCG	2	6	397809	397814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210719
10022	NC_015948	TTCA	2	8	397856	397863	25 %	50 %	0 %	25 %	344210719
10023	NC_015948	TCT	2	6	397923	397928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210719
10024	NC_015948	CG	3	6	397969	397974	0 %	0 %	50 %	50 %	344210719
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10029	NC_015948	CGT	2	6	398119	398124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210719
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10032	NC_015948	ACC	2	6	398186	398191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210719
10033	NC_015948	ACT	2	6	398253	398258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210719
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10035	NC_015948	GAG	2	6	398291	398296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210719
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10042	NC_015948	GAG	3	9	398723	398731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210719
10043	NC_015948	TCG	2	6	398733	398738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210719
10044	NC_015948	CGA	2	6	398767	398772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210719
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10048	NC_015948	CGAAGC	2	12	398887	398898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210719
10049	NC_015948	AT	3	6	398942	398947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_015948	CCT	2	6	398975	398980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10051	NC_015948	CG	3	6	399073	399078	0 %	0 %	50 %	50 %	344210720
10052	NC_015948	CAG	2	6	399097	399102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210720
10053	NC_015948	CGG	2	6	399202	399207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210720
10054	NC_015948	ACG	2	6	399254	399259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210720
10055	NC_015948	CTG	2	6	399266	399271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210720
10056	NC_015948	CTCG	2	8	399316	399323	0 %	25 %	25 %	50 %	344210720
10057	NC_015948	TGA	2	6	399339	399344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210720
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10059	NC_015948	CGGC	2	8	399393	399400	0 %	0 %	50 %	50 %	344210720
10060	NC_015948	CTGGT	2	10	399410	399419	0 %	40 %	40 %	20 %	344210720
10061	NC_015948	CTG	2	6	399440	399445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210720
10062	NC_015948	CTG	2	6	399449	399454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210720
10063	NC_015948	GGTCG	2	10	399479	399488	0 %	20 %	60 %	20 %	344210720
10064	NC_015948	TGG	2	6	399569	399574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210720
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10068	NC_015948	TCG	2	6	399645	399650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210720
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10073	NC_015948	GCG	3	9	399793	399801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_015948	A	6	6	399843	399848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10085	NC_015948	CAT	2	6	400279	400284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210721
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10090	NC_015948	AAGA	2	8	400469	400476	75 %	0 %	25 %	0 %	344210721
10091	NC_015948	AGAGGA	2	12	400477	400488	50 %	0 %	50 %	0 %	344210721
10092	NC_015948	AAG	2	6	400515	400520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210721
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10096	NC_015948	TCGTT	2	10	400634	400643	0 %	60 %	20 %	20 %	344210722
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10102	NC_015948	TACTGG	2	12	400907	400918	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344210722
10103	NC_015948	GGC	2	6	400944	400949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210722
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10105	NC_015948	GTT	2	6	400989	400994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210722
10106	NC_015948	ACG	2	6	401016	401021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_015948	GCA	2	6	401046	401051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210723
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10109	NC_015948	CAG	2	6	401077	401082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210723
10110	NC_015948	GGT	2	6	401154	401159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210723
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10113	NC_015948	TGA	2	6	401247	401252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210723
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10118	NC_015948	TCC	2	6	401414	401419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210723
10119	NC_015948	TCG	2	6	401498	401503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210723
10120	NC_015948	GTG	2	6	401548	401553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210723
10121	NC_015948	TCG	2	6	401583	401588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210723
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10238	NC_015948	GGC	2	6	406371	406376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210727
10239	NC_015948	CGT	2	6	406380	406385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210727
10240	NC_015948	GTA	2	6	406390	406395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210727
10241	NC_015948	CGT	2	6	406407	406412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210727
10242	NC_015948	GAT	2	6	406450	406455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210727
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10246	NC_015948	CTCG	2	8	406594	406601	0 %	25 %	25 %	50 %	344210727
10247	NC_015948	GGA	2	6	406602	406607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210727
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10254	NC_015948	CGG	2	6	406881	406886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_015948	CTGT	2	8	406930	406937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10256	NC_015948	TCAGG	2	10	406939	406948	20 %	20 %	40 %	20 %	344210728
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10305	NC_015948	GTTTG	2	10	408738	408747	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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10309	NC_015948	CGA	2	6	408837	408842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210729
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10335	NC_015948	ACT	2	6	409990	409995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210731
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10338	NC_015948	GCCG	2	8	410093	410100	0 %	0 %	50 %	50 %	344210731
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10341	NC_015948	TCGCC	2	10	410161	410170	0 %	20 %	20 %	60 %	344210731
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10345	NC_015948	GTC	2	6	410405	410410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210731
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10353	NC_015948	TCG	2	6	410670	410675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210731
10354	NC_015948	TGA	2	6	410680	410685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210731
10355	NC_015948	CGAGGA	2	12	410693	410704	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	344210731
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10357	NC_015948	GGGC	2	8	410860	410867	0 %	0 %	75 %	25 %	344210731
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10478	NC_015948	GTC	2	6	415312	415317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10479	NC_015948	TCGG	2	8	415346	415353	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10480	NC_015948	ATGG	2	8	415402	415409	25 %	25 %	50 %	0 %	344210736
10481	NC_015948	GTC	2	6	415426	415431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210736
10482	NC_015948	GCA	2	6	415441	415446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210736
10483	NC_015948	G	6	6	415459	415464	0 %	0 %	100 %	0 %	344210736
10484	NC_015948	CGA	2	6	415485	415490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210736
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10486	NC_015948	CTCGT	2	10	415561	415570	0 %	40 %	20 %	40 %	344210736
10487	NC_015948	TCC	2	6	415592	415597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210736
10488	NC_015948	CA	4	8	415622	415629	50 %	0 %	0 %	50 %	344210736
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