MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_015948	TGG	2	6	359067	359072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210671
9002	NC_015948	TAC	2	6	359118	359123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210671
9003	NC_015948	TTCGGC	2	12	359154	359165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210671
9004	NC_015948	CGC	2	6	359168	359173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210671
9005	NC_015948	AACT	2	8	359260	359267	50 %	25 %	0 %	25 %	344210671
9006	NC_015948	CGTT	2	8	359308	359315	0 %	50 %	25 %	25 %	344210671
9007	NC_015948	CGA	2	6	359350	359355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210672
9008	NC_015948	TCG	2	6	359370	359375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210672
9009	NC_015948	GAA	2	6	359423	359428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210672
9010	NC_015948	GCC	2	6	359462	359467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210672
9011	NC_015948	GTC	2	6	359468	359473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210672
9012	NC_015948	CCG	2	6	359500	359505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210672
9013	NC_015948	CGG	2	6	359540	359545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210672
9014	NC_015948	TCG	2	6	359550	359555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210672
9015	NC_015948	TGA	2	6	359569	359574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210672
9016	NC_015948	A	6	6	359609	359614	100 %	0 %	0 %	0 %	344210672
9017	NC_015948	CCG	2	6	359661	359666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210672
9018	NC_015948	TCC	2	6	359688	359693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210672
9019	NC_015948	GAC	3	9	359741	359749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210672
9020	NC_015948	CCCA	2	8	359759	359766	25 %	0 %	0 %	75 %	344210672
9021	NC_015948	GGA	2	6	359809	359814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_015948	ACT	2	6	359853	359858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_015948	AGGA	2	8	359913	359920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_015948	ACCAT	2	10	359946	359955	40 %	20 %	0 %	40 %	344210673
9025	NC_015948	GAA	2	6	359977	359982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210673
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9029	NC_015948	GAG	2	6	360124	360129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210674
9030	NC_015948	GTC	2	6	360133	360138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210674
9031	NC_015948	CG	3	6	360156	360161	0 %	0 %	50 %	50 %	344210674
9032	NC_015948	CCGAA	2	10	360164	360173	40 %	0 %	20 %	40 %	344210674
9033	NC_015948	GC	3	6	360180	360185	0 %	0 %	50 %	50 %	344210674
9034	NC_015948	GAT	2	6	360195	360200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210674
9035	NC_015948	CGA	2	6	360237	360242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210674
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9038	NC_015948	TCG	2	6	360359	360364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210674
9039	NC_015948	CG	3	6	360393	360398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9040	NC_015948	GTC	2	6	360410	360415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_015948	GT	3	6	360424	360429	0 %	50 %	50 %	0 %	344210675
9042	NC_015948	CGAC	2	8	360439	360446	25 %	0 %	25 %	50 %	344210675
9043	NC_015948	GCT	2	6	360482	360487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210675
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9050	NC_015948	CGC	2	6	360677	360682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210675
9051	NC_015948	CGT	2	6	360689	360694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210675
9052	NC_015948	CTG	2	6	360695	360700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210675
9053	NC_015948	CT	3	6	360732	360737	0 %	50 %	0 %	50 %	344210675
9054	NC_015948	CCG	2	6	360820	360825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210675
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9056	NC_015948	ACGG	2	8	360867	360874	25 %	0 %	50 %	25 %	344210675
9057	NC_015948	GCCG	2	8	360908	360915	0 %	0 %	50 %	50 %	344210675
9058	NC_015948	GGT	2	6	360936	360941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210675
9059	NC_015948	TCG	2	6	360946	360951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210675
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9061	NC_015948	TGG	2	6	361090	361095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_015948	CCA	2	6	361109	361114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9063	NC_015948	CCTG	2	8	361187	361194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9064	NC_015948	CCGCA	2	10	361205	361214	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9065	NC_015948	GTC	2	6	361228	361233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_015948	GCTG	2	8	361243	361250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9067	NC_015948	AAT	2	6	361308	361313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9069	NC_015948	ACT	2	6	361396	361401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210676
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9073	NC_015948	TGG	2	6	361543	361548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_015948	GACG	2	8	361549	361556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9075	NC_015948	CCCTG	2	10	361573	361582	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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9082	NC_015948	GCG	2	6	361781	361786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210678
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9088	NC_015948	CG	3	6	361978	361983	0 %	0 %	50 %	50 %	344210678
9089	NC_015948	CGA	2	6	361998	362003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210678
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9101	NC_015948	CGA	3	9	362296	362304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210679
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9121	NC_015948	CAG	2	6	362915	362920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210679
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9239	NC_015948	CGA	2	6	367797	367802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210686
9240	NC_015948	GAC	2	6	367804	367809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210686
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9482	NC_015948	GCT	2	6	376548	376553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210695
9483	NC_015948	G	6	6	376581	376586	0 %	0 %	100 %	0 %	344210695
9484	NC_015948	GCT	2	6	376716	376721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210696
9485	NC_015948	CGT	2	6	376730	376735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210696
9486	NC_015948	TGCTCG	2	12	376736	376747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210696
9487	NC_015948	GCA	2	6	376781	376786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210696
9488	NC_015948	CGCGG	2	10	376791	376800	0 %	0 %	60 %	40 %	344210696
9489	NC_015948	CCT	2	6	376824	376829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210696
9490	NC_015948	GAC	2	6	376846	376851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210696
9491	NC_015948	TCG	2	6	376907	376912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210696
9492	NC_015948	CTC	2	6	376927	376932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210696
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9494	NC_015948	CTG	2	6	377002	377007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210696
9495	NC_015948	TGCT	2	8	377012	377019	0 %	50 %	25 %	25 %	344210696
9496	NC_015948	TCG	2	6	377021	377026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210696
9497	NC_015948	GAC	2	6	377028	377033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210696
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