MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_015948	TCG	2	6	313669	313674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210622
8003	NC_015948	GCC	2	6	313693	313698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210622
8004	NC_015948	CCT	2	6	313715	313720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210622
8005	NC_015948	CGT	2	6	313787	313792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210622
8006	NC_015948	CCGG	2	8	313828	313835	0 %	0 %	50 %	50 %	344210622
8007	NC_015948	CGG	2	6	313865	313870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210622
8008	NC_015948	CGT	2	6	313871	313876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210622
8009	NC_015948	CGC	2	6	313892	313897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210622
8010	NC_015948	GGC	2	6	313905	313910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210622
8011	NC_015948	CGG	2	6	313940	313945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210622
8012	NC_015948	CTC	2	6	314038	314043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210623
8013	NC_015948	GTG	2	6	314047	314052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210623
8014	NC_015948	TCG	2	6	314147	314152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210623
8015	NC_015948	CGCT	2	8	314197	314204	0 %	25 %	25 %	50 %	344210623
8016	NC_015948	GTC	2	6	314310	314315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210623
8017	NC_015948	GAC	2	6	314335	314340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210623
8018	NC_015948	CCG	2	6	314377	314382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210623
8019	NC_015948	GGC	2	6	314406	314411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210623
8020	NC_015948	GCC	2	6	314496	314501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210623
8021	NC_015948	TCG	2	6	314567	314572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210623
8022	NC_015948	CGAC	2	8	314618	314625	25 %	0 %	25 %	50 %	344210623
8023	NC_015948	CCG	2	6	314668	314673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8024	NC_015948	CTG	2	6	314812	314817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_015948	GAT	2	6	314823	314828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_015948	CAT	2	6	314861	314866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_015948	CGAC	2	8	315058	315065	25 %	0 %	25 %	50 %	344210624
8028	NC_015948	CT	3	6	315184	315189	0 %	50 %	0 %	50 %	344210624
8029	NC_015948	CGT	2	6	315241	315246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210624
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8031	NC_015948	GTG	2	6	315409	315414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_015948	CGA	2	6	315642	315647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210625
8033	NC_015948	CTCG	2	8	315667	315674	0 %	25 %	25 %	50 %	344210625
8034	NC_015948	CCT	2	6	315741	315746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210625
8035	NC_015948	CGT	2	6	315753	315758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210625
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8037	NC_015948	GGC	2	6	315834	315839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210625
8038	NC_015948	CGA	2	6	315876	315881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210625
8039	NC_015948	CA	3	6	315900	315905	50 %	0 %	0 %	50 %	344210625
8040	NC_015948	CGC	2	6	315907	315912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210625
8041	NC_015948	GTG	2	6	315925	315930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210625
8042	NC_015948	TGT	2	6	315933	315938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210625
8043	NC_015948	CGT	2	6	315952	315957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210625
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8045	NC_015948	CGT	2	6	316026	316031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210625
8046	NC_015948	GTCGA	2	10	316049	316058	20 %	20 %	40 %	20 %	344210625
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8051	NC_015948	ACA	2	6	316305	316310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210625
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8053	NC_015948	GTC	2	6	316354	316359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210625
8054	NC_015948	CAG	2	6	316406	316411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210625
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8056	NC_015948	CGC	2	6	316506	316511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210625
8057	NC_015948	GGC	2	6	316543	316548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210625
8058	NC_015948	CCG	2	6	316595	316600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210625
8059	NC_015948	CAGC	2	8	316630	316637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8060	NC_015948	GTCA	2	8	316662	316669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8061	NC_015948	TGG	2	6	316728	316733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210626
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8065	NC_015948	CGG	2	6	316921	316926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8068	NC_015948	CGGC	2	8	317126	317133	0 %	0 %	50 %	50 %	344210627
8069	NC_015948	GCG	2	6	317138	317143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210627
8070	NC_015948	TCG	2	6	317194	317199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210628
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8107	NC_015948	CGA	2	6	318607	318612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210630
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8243	NC_015948	CGG	2	6	323228	323233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8244	NC_015948	TTC	2	6	323243	323248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8245	NC_015948	GTTC	2	8	323312	323319	0 %	50 %	25 %	25 %	344210637
8246	NC_015948	CGCT	2	8	323329	323336	0 %	25 %	25 %	50 %	344210637
8247	NC_015948	CGT	2	6	323372	323377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210637
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8249	NC_015948	TTC	2	6	323412	323417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210637
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8251	NC_015948	CG	3	6	323460	323465	0 %	0 %	50 %	50 %	344210637
8252	NC_015948	CGG	2	6	323540	323545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210637
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8345	NC_015948	TGC	2	6	327333	327338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8348	NC_015948	GTTCG	2	10	327411	327420	0 %	40 %	40 %	20 %	344210643
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8352	NC_015948	GAC	2	6	327645	327650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210643
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8360	NC_015948	ACG	2	6	328231	328236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210643
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8362	NC_015948	ACG	2	6	328316	328321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210643
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8484	NC_015948	CGA	2	6	333120	333125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210648
8485	NC_015948	CCA	2	6	333151	333156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210648
8486	NC_015948	GCG	2	6	333188	333193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210648
8487	NC_015948	GGC	2	6	333199	333204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210648
8488	NC_015948	GCT	2	6	333286	333291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210648
8489	NC_015948	CGC	2	6	333304	333309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210648
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