MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
73001	NC_015948	GTC	2	6	2938449	2938454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213292
73002	NC_015948	TCCA	2	8	2938459	2938466	25 %	25 %	0 %	50 %	344213292
73003	NC_015948	CTC	2	6	2938509	2938514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213292
73004	NC_015948	CTC	2	6	2938530	2938535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213292
73005	NC_015948	TCTT	2	8	2938567	2938574	0 %	75 %	0 %	25 %	344213292
73006	NC_015948	CTC	2	6	2938593	2938598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213292
73007	NC_015948	CCGG	2	8	2938637	2938644	0 %	0 %	50 %	50 %	344213292
73008	NC_015948	CGT	2	6	2938710	2938715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213292
73009	NC_015948	GGC	2	6	2938744	2938749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213292
73010	NC_015948	GAA	2	6	2938758	2938763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344213292
73011	NC_015948	CGT	2	6	2938814	2938819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213292
73012	NC_015948	GTC	2	6	2938866	2938871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213292
73013	NC_015948	GCG	2	6	2938876	2938881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213292
73014	NC_015948	CGC	2	6	2938904	2938909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73015	NC_015948	TG	3	6	2938935	2938940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73016	NC_015948	GGA	2	6	2938965	2938970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73017	NC_015948	GAGCG	2	10	2939002	2939011	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73018	NC_015948	GTTC	2	8	2939037	2939044	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73019	NC_015948	GTT	2	6	2939046	2939051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73020	NC_015948	CGG	2	6	2939056	2939061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73021	NC_015948	CGC	2	6	2939070	2939075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73022	NC_015948	AGG	2	6	2939127	2939132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73023	NC_015948	TGG	2	6	2939174	2939179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213293
73024	NC_015948	GCC	2	6	2939196	2939201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213293
73025	NC_015948	CGAC	2	8	2939234	2939241	25 %	0 %	25 %	50 %	344213293
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73028	NC_015948	GGCGG	2	10	2939393	2939402	0 %	0 %	80 %	20 %	344213293
73029	NC_015948	CCGG	2	8	2939438	2939445	0 %	0 %	50 %	50 %	344213293
73030	NC_015948	ACG	2	6	2939483	2939488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213293
73031	NC_015948	CTA	2	6	2939493	2939498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213293
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73033	NC_015948	CGACC	2	10	2939535	2939544	20 %	0 %	20 %	60 %	344213293
73034	NC_015948	GCC	2	6	2939564	2939569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213293
73035	NC_015948	TCG	2	6	2939576	2939581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213293
73036	NC_015948	GCG	2	6	2939605	2939610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213293
73037	NC_015948	ACC	2	6	2939617	2939622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213293
73038	NC_015948	CGA	2	6	2939633	2939638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213293
73039	NC_015948	GAC	3	9	2939656	2939664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213293
73040	NC_015948	GCT	2	6	2939736	2939741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213293
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73042	NC_015948	ACG	2	6	2939789	2939794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213293
73043	NC_015948	CGG	2	6	2939801	2939806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213293
73044	NC_015948	CTT	2	6	2939848	2939853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73045	NC_015948	CCG	2	6	2939858	2939863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73046	NC_015948	GAC	2	6	2939872	2939877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73047	NC_015948	TCT	2	6	2939895	2939900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213294
73048	NC_015948	GAC	2	6	2939945	2939950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213294
73049	NC_015948	CAC	2	6	2940017	2940022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213294
73050	NC_015948	CGCC	2	8	2940039	2940046	0 %	0 %	25 %	75 %	344213294
73051	NC_015948	CCG	2	6	2940090	2940095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213294
73052	NC_015948	AGC	2	6	2940100	2940105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213294
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73054	NC_015948	CAT	2	6	2940184	2940189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213294
73055	NC_015948	GAC	2	6	2940203	2940208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213294
73056	NC_015948	GGC	2	6	2940209	2940214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213294
73057	NC_015948	CT	3	6	2940251	2940256	0 %	50 %	0 %	50 %	344213294
73058	NC_015948	CGG	2	6	2940420	2940425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213295
73059	NC_015948	CCGTCG	2	12	2940450	2940461	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344213295
73060	NC_015948	ACGT	2	8	2940494	2940501	25 %	25 %	25 %	25 %	344213295
73061	NC_015948	CGA	2	6	2940556	2940561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213295
73062	NC_015948	CGGG	2	8	2940592	2940599	0 %	0 %	75 %	25 %	344213295
73063	NC_015948	CG	3	6	2940637	2940642	0 %	0 %	50 %	50 %	344213295
73064	NC_015948	GAG	2	6	2940686	2940691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213295
73065	NC_015948	GCC	2	6	2940727	2940732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213295
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73067	NC_015948	GCG	2	6	2940775	2940780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213295
73068	NC_015948	GTG	2	6	2940788	2940793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213295
73069	NC_015948	CCAG	2	8	2940794	2940801	25 %	0 %	25 %	50 %	344213295
73070	NC_015948	CGGCG	2	10	2940803	2940812	0 %	0 %	60 %	40 %	344213295
73071	NC_015948	CCT	2	6	2940817	2940822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213295
73072	NC_015948	CAG	2	6	2940830	2940835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213295
73073	NC_015948	CGT	2	6	2940871	2940876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213295
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73076	NC_015948	GGCGCG	2	12	2940944	2940955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213295
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73088	NC_015948	TGG	2	6	2941425	2941430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213296
73089	NC_015948	CGT	2	6	2941441	2941446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213296
73090	NC_015948	CAG	2	6	2941492	2941497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73091	NC_015948	GGCT	2	8	2941561	2941568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73092	NC_015948	CGGC	2	8	2941659	2941666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73093	NC_015948	CAGT	2	8	2941669	2941676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73094	NC_015948	GT	3	6	2941675	2941680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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73097	NC_015948	TG	3	6	2941748	2941753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73098	NC_015948	TACA	2	8	2941812	2941819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73099	NC_015948	CCGT	2	8	2941940	2941947	0 %	25 %	25 %	50 %	344213297
73100	NC_015948	CGG	2	6	2941951	2941956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213297
73101	NC_015948	GCG	2	6	2941962	2941967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213297
73102	NC_015948	CAG	2	6	2942047	2942052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213297
73103	NC_015948	TTC	2	6	2942096	2942101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213297
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73105	NC_015948	GAC	2	6	2942143	2942148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213297
73106	NC_015948	GAC	2	6	2942195	2942200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213297
73107	NC_015948	CCG	2	6	2942205	2942210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213297
73108	NC_015948	GCC	2	6	2942222	2942227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213297
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73110	NC_015948	CGG	2	6	2942362	2942367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213297
73111	NC_015948	GACC	2	8	2942405	2942412	25 %	0 %	25 %	50 %	344213297
73112	NC_015948	GGA	2	6	2942503	2942508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213297
73113	NC_015948	GTTG	2	8	2942570	2942577	0 %	50 %	50 %	0 %	344213297
73114	NC_015948	GAGTG	2	10	2942618	2942627	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
73115	NC_015948	CAA	2	6	2942738	2942743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344213298
73116	NC_015948	ACA	2	6	2942801	2942806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344213298
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73342	NC_015948	CGA	2	6	2950894	2950899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213305
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73345	NC_015948	CGT	2	6	2951002	2951007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213305
73346	NC_015948	GTC	2	6	2951153	2951158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213305
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73348	NC_015948	CCGGC	2	10	2951192	2951201	0 %	0 %	40 %	60 %	344213305
73349	NC_015948	CGG	2	6	2951203	2951208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213305
73350	NC_015948	CAG	2	6	2951225	2951230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213305
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73451	NC_015948	TCGCT	2	10	2955214	2955223	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73452	NC_015948	GTT	2	6	2955271	2955276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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73454	NC_015948	TCGCT	2	10	2955324	2955333	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73455	NC_015948	TG	3	6	2955475	2955480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73456	NC_015948	TCGG	2	8	2955523	2955530	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73457	NC_015948	CAG	2	6	2955544	2955549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73458	NC_015948	CA	3	6	2955552	2955557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73459	NC_015948	GTC	3	9	2955663	2955671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213309
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73462	NC_015948	CTC	2	6	2955918	2955923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213309
73463	NC_015948	GAC	2	6	2955942	2955947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213309
73464	NC_015948	CGC	2	6	2955955	2955960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213309
73465	NC_015948	TCG	2	6	2955973	2955978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213309
73466	NC_015948	CGA	2	6	2955997	2956002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213309
73467	NC_015948	CCG	2	6	2956040	2956045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213309
73468	NC_015948	GCT	2	6	2956052	2956057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213309
73469	NC_015948	TGG	2	6	2956084	2956089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213309
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73472	NC_015948	CGGC	2	8	2956195	2956202	0 %	0 %	50 %	50 %	344213309
73473	NC_015948	CT	3	6	2956345	2956350	0 %	50 %	0 %	50 %	344213310
73474	NC_015948	GCG	2	6	2956378	2956383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213310
73475	NC_015948	GCC	2	6	2956398	2956403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213310
73476	NC_015948	CCGA	2	8	2956516	2956523	25 %	0 %	25 %	50 %	344213310
73477	NC_015948	CGC	2	6	2956563	2956568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213310
73478	NC_015948	CGA	2	6	2956635	2956640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213310
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73480	NC_015948	CGA	2	6	2956668	2956673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213310
73481	NC_015948	GT	3	6	2956681	2956686	0 %	50 %	50 %	0 %	344213310
73482	NC_015948	GAC	2	6	2956720	2956725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213310
73483	NC_015948	CTG	2	6	2956765	2956770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213310
73484	NC_015948	CGA	2	6	2956773	2956778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213310
73485	NC_015948	CA	4	8	2956798	2956805	50 %	0 %	0 %	50 %	344213310
73486	NC_015948	CAC	2	6	2956813	2956818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213310
73487	NC_015948	TGA	2	6	2956841	2956846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213310
73488	NC_015948	ACC	2	6	2956880	2956885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213310
73489	NC_015948	GAG	2	6	2956927	2956932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213310
73490	NC_015948	CGAG	2	8	2956952	2956959	25 %	0 %	50 %	25 %	344213310
73491	NC_015948	GAG	2	6	2957081	2957086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73492	NC_015948	GTGTG	2	10	2957112	2957121	0 %	40 %	60 %	0 %	344213311
73493	NC_015948	CCG	2	6	2957149	2957154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213311
73494	NC_015948	GAC	2	6	2957161	2957166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213311
73495	NC_015948	TCG	2	6	2957174	2957179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213311
73496	NC_015948	GAAG	2	8	2957199	2957206	50 %	0 %	50 %	0 %	344213311
73497	NC_015948	GGC	2	6	2957221	2957226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213311
73498	NC_015948	GGA	2	6	2957232	2957237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213311
73499	NC_015948	CCG	2	6	2957350	2957355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213311
73500	NC_015948	GAC	2	6	2957362	2957367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213311

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