MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
70001	NC_015948	CGA	2	6	2821161	2821166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213179
70002	NC_015948	CGAG	2	8	2821281	2821288	25 %	0 %	50 %	25 %	344213179
70003	NC_015948	GAA	2	6	2821303	2821308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344213179
70004	NC_015948	GAAC	2	8	2821362	2821369	50 %	0 %	25 %	25 %	344213179
70005	NC_015948	CGT	2	6	2821372	2821377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213179
70006	NC_015948	GTC	2	6	2821397	2821402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213179
70007	NC_015948	CAG	2	6	2821417	2821422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213179
70008	NC_015948	TCG	2	6	2821430	2821435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213179
70009	NC_015948	CGGTG	2	10	2821487	2821496	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
70010	NC_015948	CTC	2	6	2821539	2821544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70011	NC_015948	CAGT	2	8	2821550	2821557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70012	NC_015948	TTCG	2	8	2821585	2821592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70013	NC_015948	TTCG	2	8	2821619	2821626	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70014	NC_015948	TCGCT	2	10	2821682	2821691	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70015	NC_015948	CAGT	2	8	2821727	2821734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70016	NC_015948	CTG	2	6	2821748	2821753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70017	NC_015948	GCTC	2	8	2821754	2821761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70018	NC_015948	GTCGCT	2	12	2821762	2821773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70019	NC_015948	CAGT	2	8	2821783	2821790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70020	NC_015948	GGGC	2	8	2821901	2821908	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70021	NC_015948	CAG	2	6	2822028	2822033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213180
70022	NC_015948	CGA	2	6	2822072	2822077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213180
70023	NC_015948	AGG	2	6	2822086	2822091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213180
70024	NC_015948	TTCG	2	8	2822098	2822105	0 %	50 %	25 %	25 %	344213180
70025	NC_015948	TCCGT	2	10	2822123	2822132	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70026	NC_015948	TGT	2	6	2822135	2822140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70027	NC_015948	GCC	2	6	2822187	2822192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70028	NC_015948	CCG	2	6	2822205	2822210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70029	NC_015948	TC	3	6	2822229	2822234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70030	NC_015948	GC	3	6	2822236	2822241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70031	NC_015948	G	6	6	2822250	2822255	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70032	NC_015948	TCG	2	6	2822294	2822299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213181
70033	NC_015948	CG	3	6	2822430	2822435	0 %	0 %	50 %	50 %	344213181
70034	NC_015948	CGA	2	6	2822445	2822450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213181
70035	NC_015948	GC	3	6	2822460	2822465	0 %	0 %	50 %	50 %	344213181
70036	NC_015948	CGA	2	6	2822514	2822519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213181
70037	NC_015948	ATG	2	6	2822528	2822533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213181
70038	NC_015948	CA	3	6	2822568	2822573	50 %	0 %	0 %	50 %	344213181
70039	NC_015948	TCGTC	2	10	2822586	2822595	0 %	40 %	20 %	40 %	344213181
70040	NC_015948	TCC	2	6	2822615	2822620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213181
70041	NC_015948	CGG	2	6	2822625	2822630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213181
70042	NC_015948	CGT	2	6	2822683	2822688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213181
70043	NC_015948	TCG	2	6	2822729	2822734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213181
70044	NC_015948	TGA	2	6	2822745	2822750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213181
70045	NC_015948	GGT	2	6	2822770	2822775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213181
70046	NC_015948	TGA	2	6	2822931	2822936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213181
70047	NC_015948	CGC	3	9	2822940	2822948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213181
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70051	NC_015948	CGG	2	6	2823093	2823098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213181
70052	NC_015948	CGT	2	6	2823102	2823107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213181
70053	NC_015948	GGA	2	6	2823120	2823125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213181
70054	NC_015948	GCC	2	6	2823133	2823138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213181
70055	NC_015948	GGC	2	6	2823217	2823222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213181
70056	NC_015948	GAC	2	6	2823262	2823267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213181
70057	NC_015948	GT	3	6	2823414	2823419	0 %	50 %	50 %	0 %	344213181
70058	NC_015948	GCC	2	6	2823535	2823540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70059	NC_015948	CGT	2	6	2823630	2823635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70060	NC_015948	GTGAAA	2	12	2823642	2823653	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70061	NC_015948	GTA	2	6	2823756	2823761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70062	NC_015948	CGA	2	6	2823778	2823783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213182
70063	NC_015948	CAT	2	6	2823813	2823818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213182
70064	NC_015948	TCG	2	6	2823899	2823904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213182
70065	NC_015948	TAC	2	6	2823915	2823920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213182
70066	NC_015948	TAC	2	6	2823965	2823970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213182
70067	NC_015948	TCA	2	6	2823971	2823976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213182
70068	NC_015948	CGT	2	6	2823996	2824001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213182
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70070	NC_015948	CGT	2	6	2824101	2824106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213182
70071	NC_015948	TC	3	6	2824118	2824123	0 %	50 %	0 %	50 %	344213182
70072	NC_015948	TCG	2	6	2824178	2824183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213182
70073	NC_015948	CCGGA	2	10	2824186	2824195	20 %	0 %	40 %	40 %	344213182
70074	NC_015948	TAC	2	6	2824225	2824230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213182
70075	NC_015948	CGAG	2	8	2824266	2824273	25 %	0 %	50 %	25 %	344213182
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70077	NC_015948	CG	3	6	2824291	2824296	0 %	0 %	50 %	50 %	344213182
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70081	NC_015948	GTC	2	6	2824381	2824386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213182
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70083	NC_015948	CGA	2	6	2824496	2824501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213182
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70086	NC_015948	GAG	2	6	2824609	2824614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213182
70087	NC_015948	CCCGAC	2	12	2824666	2824677	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	344213182
70088	NC_015948	CTG	2	6	2824702	2824707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213182
70089	NC_015948	CCG	2	6	2824773	2824778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213182
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70092	NC_015948	CA	3	6	2824855	2824860	50 %	0 %	0 %	50 %	344213182
70093	NC_015948	CGA	2	6	2824875	2824880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213182
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70100	NC_015948	CGC	2	6	2825199	2825204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213182
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70107	NC_015948	AGCAA	2	10	2825465	2825474	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70108	NC_015948	CGCT	2	8	2825524	2825531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70109	NC_015948	TTCG	2	8	2825558	2825565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70110	NC_015948	GA	3	6	2825608	2825613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70111	NC_015948	CGG	2	6	2825651	2825656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70112	NC_015948	CGC	2	6	2825660	2825665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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70114	NC_015948	CG	3	6	2825697	2825702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70115	NC_015948	GAC	2	6	2825743	2825748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70116	NC_015948	TCG	2	6	2825796	2825801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213183
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70118	NC_015948	GTA	2	6	2825939	2825944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213183
70119	NC_015948	GTG	2	6	2826012	2826017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213183
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70145	NC_015948	TC	3	6	2827092	2827097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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70218	NC_015948	GCCA	2	8	2830044	2830051	25 %	0 %	25 %	50 %	344213187
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70226	NC_015948	CGC	2	6	2830398	2830403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213187
70227	NC_015948	AG	3	6	2830446	2830451	50 %	0 %	50 %	0 %	344213187
70228	NC_015948	GGGC	2	8	2830489	2830496	0 %	0 %	75 %	25 %	344213187
70229	NC_015948	TTC	2	6	2830527	2830532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213187
70230	NC_015948	GACGGC	2	12	2830538	2830549	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344213187
70231	NC_015948	CGC	2	6	2830562	2830567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213187
70232	NC_015948	CGT	2	6	2830595	2830600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213187
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70234	NC_015948	CGA	2	6	2830730	2830735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213187
70235	NC_015948	GAC	2	6	2830752	2830757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213187
70236	NC_015948	GCT	2	6	2830758	2830763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213187
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70263	NC_015948	AGA	2	6	2831609	2831614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70264	NC_015948	GATT	2	8	2831630	2831637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70265	NC_015948	CGA	2	6	2831657	2831662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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70322	NC_015948	GGT	2	6	2834465	2834470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70323	NC_015948	CTCGT	2	10	2834474	2834483	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70324	NC_015948	TCG	2	6	2834524	2834529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213193
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70336	NC_015948	CTCG	2	8	2835140	2835147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70337	NC_015948	GCC	2	6	2835227	2835232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213194
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70343	NC_015948	GAC	2	6	2835530	2835535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213194
70344	NC_015948	CGC	3	9	2835593	2835601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213194
70345	NC_015948	CGACCG	2	12	2835628	2835639	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344213194
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70347	NC_015948	GTC	3	9	2835662	2835670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213194
70348	NC_015948	CG	3	6	2835827	2835832	0 %	0 %	50 %	50 %	344213194
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70350	NC_015948	TCG	2	6	2835885	2835890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213194
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70461	NC_015948	G	6	6	2840265	2840270	0 %	0 %	100 %	0 %	344213199
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70464	NC_015948	CGA	2	6	2840346	2840351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213199
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70480	NC_015948	CGA	2	6	2840874	2840879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213199
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70482	NC_015948	CCG	2	6	2840986	2840991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70483	NC_015948	ACG	2	6	2840994	2840999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213200
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70490	NC_015948	GTCTT	2	10	2841179	2841188	0 %	60 %	20 %	20 %	344213200
70491	NC_015948	GTCTT	2	10	2841200	2841209	0 %	60 %	20 %	20 %	344213200
70492	NC_015948	GTC	2	6	2841218	2841223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213200
70493	NC_015948	GTC	2	6	2841260	2841265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213200
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