MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015948	ACG	3	9	254966	254974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210569
6502	NC_015948	AAC	2	6	255011	255016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210569
6503	NC_015948	GCC	2	6	255112	255117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210569
6504	NC_015948	ACG	2	6	255176	255181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210569
6505	NC_015948	CGT	2	6	255192	255197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210569
6506	NC_015948	CCG	2	6	255212	255217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210569
6507	NC_015948	CGG	2	6	255257	255262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210569
6508	NC_015948	TCG	3	9	255263	255271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210569
6509	NC_015948	GCC	2	6	255295	255300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210569
6510	NC_015948	CGC	2	6	255327	255332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210569
6511	NC_015948	GCC	2	6	255365	255370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210569
6512	NC_015948	GCG	2	6	255371	255376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210569
6513	NC_015948	GCC	2	6	255388	255393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210569
6514	NC_015948	ACGA	2	8	255400	255407	50 %	0 %	25 %	25 %	344210569
6515	NC_015948	CGA	2	6	255463	255468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210570
6516	NC_015948	GC	3	6	255513	255518	0 %	0 %	50 %	50 %	344210570
6517	NC_015948	CCGG	2	8	255538	255545	0 %	0 %	50 %	50 %	344210570
6518	NC_015948	CGC	2	6	255588	255593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210570
6519	NC_015948	GTC	2	6	255626	255631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210570
6520	NC_015948	CGT	2	6	255643	255648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210570
6521	NC_015948	TCG	2	6	255654	255659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210570
6522	NC_015948	GACCG	2	10	255662	255671	20 %	0 %	40 %	40 %	344210570
6523	NC_015948	CTG	2	6	255680	255685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210570
6524	NC_015948	TCG	2	6	255801	255806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210570
6525	NC_015948	CCGG	2	8	255829	255836	0 %	0 %	50 %	50 %	344210570
6526	NC_015948	GGA	2	6	255898	255903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210570
6527	NC_015948	GCG	2	6	255930	255935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210570
6528	NC_015948	CGAC	2	8	255976	255983	25 %	0 %	25 %	50 %	344210570
6529	NC_015948	CTG	2	6	256040	256045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210570
6530	NC_015948	GGC	2	6	256052	256057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210570
6531	NC_015948	ACG	3	9	256098	256106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210570
6532	NC_015948	CGA	2	6	256119	256124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210570
6533	NC_015948	TGGCGG	2	12	256150	256161	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344210570
6534	NC_015948	GAC	2	6	256166	256171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210570
6535	NC_015948	TCG	2	6	256197	256202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210570
6536	NC_015948	GCG	2	6	256204	256209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210570
6537	NC_015948	GCG	2	6	256243	256248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210571
6538	NC_015948	TGC	2	6	256255	256260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210571
6539	NC_015948	CGC	2	6	256261	256266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210571
6540	NC_015948	AGC	2	6	256308	256313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210571
6541	NC_015948	CGC	2	6	256364	256369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210571
6542	NC_015948	CATCGA	2	12	256371	256382	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344210571
6543	NC_015948	AC	3	6	256586	256591	50 %	0 %	0 %	50 %	344210571
6544	NC_015948	TCG	2	6	256686	256691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210571
6545	NC_015948	TCG	2	6	256741	256746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_015948	GCC	2	6	256763	256768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6547	NC_015948	GTCG	2	8	256793	256800	0 %	25 %	50 %	25 %	344210572
6548	NC_015948	GGC	2	6	256817	256822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210572
6549	NC_015948	CGG	2	6	256882	256887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210572
6550	NC_015948	GTCGAG	2	12	256952	256963	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344210572
6551	NC_015948	GTCG	2	8	256991	256998	0 %	25 %	50 %	25 %	344210572
6552	NC_015948	ACGGCG	2	12	257016	257027	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344210572
6553	NC_015948	CGG	2	6	257062	257067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210572
6554	NC_015948	GCA	2	6	257074	257079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210572
6555	NC_015948	GACG	2	8	257192	257199	25 %	0 %	50 %	25 %	344210572
6556	NC_015948	GCG	2	6	257223	257228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210572
6557	NC_015948	CAG	2	6	257252	257257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210572
6558	NC_015948	CCT	2	6	257302	257307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210572
6559	NC_015948	GCC	2	6	257313	257318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210572
6560	NC_015948	TCG	2	6	257400	257405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210572
6561	NC_015948	GT	3	6	257486	257491	0 %	50 %	50 %	0 %	344210572
6562	NC_015948	CCGA	2	8	257519	257526	25 %	0 %	25 %	50 %	344210572
6563	NC_015948	GT	3	6	257536	257541	0 %	50 %	50 %	0 %	344210572
6564	NC_015948	GTT	2	6	257581	257586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_015948	CGT	2	6	257646	257651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_015948	CGA	2	6	257661	257666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_015948	GCAGC	2	10	257675	257684	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6568	NC_015948	GAAA	2	8	257760	257767	75 %	0 %	25 %	0 %	344210573
6569	NC_015948	CGG	2	6	257782	257787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210573
6570	NC_015948	CAA	2	6	257792	257797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210573
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6572	NC_015948	GA	4	8	257842	257849	50 %	0 %	50 %	0 %	344210573
6573	NC_015948	CT	3	6	257882	257887	0 %	50 %	0 %	50 %	344210573
6574	NC_015948	GCT	2	6	257983	257988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210573
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6577	NC_015948	CGA	3	9	258091	258099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210573
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6580	NC_015948	TCG	2	6	258150	258155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210573
6581	NC_015948	AGC	2	6	258189	258194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210573
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6589	NC_015948	CTG	2	6	258472	258477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210574
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6592	NC_015948	CAT	2	6	258660	258665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210574
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6599	NC_015948	GCTCCT	2	12	258852	258863	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344210574
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6603	NC_015948	TCT	2	6	259097	259102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210574
6604	NC_015948	GACC	2	8	259116	259123	25 %	0 %	25 %	50 %	344210574
6605	NC_015948	CGC	3	9	259155	259163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210574
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6607	NC_015948	CGA	2	6	259181	259186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210574
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6609	NC_015948	GTCG	2	8	259235	259242	0 %	25 %	50 %	25 %	344210574
6610	NC_015948	TC	3	6	259280	259285	0 %	50 %	0 %	50 %	344210574
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6615	NC_015948	GGC	2	6	259480	259485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_015948	ACG	3	9	259506	259514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210575
6617	NC_015948	TC	3	6	259603	259608	0 %	50 %	0 %	50 %	344210575
6618	NC_015948	CCAGA	2	10	259613	259622	40 %	0 %	20 %	40 %	344210575
6619	NC_015948	TCG	2	6	259632	259637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210575
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6621	NC_015948	AGA	2	6	259687	259692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210575
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6652	NC_015948	TAT	3	9	260703	260711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6985	NC_015948	TG	3	6	273710	273715	0 %	50 %	50 %	0 %	344210584
6986	NC_015948	CGG	2	6	273744	273749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210584
6987	NC_015948	CGG	2	6	273784	273789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210584
6988	NC_015948	CGT	2	6	273823	273828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210584
6989	NC_015948	ACG	2	6	273875	273880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210584
6990	NC_015948	TCG	2	6	273908	273913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210584
6991	NC_015948	GTC	2	6	273925	273930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210584
6992	NC_015948	A	6	6	273974	273979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6993	NC_015948	CGA	2	6	274058	274063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210585
6994	NC_015948	CAG	2	6	274101	274106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210585
6995	NC_015948	CTT	2	6	274130	274135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210585
6996	NC_015948	GATC	2	8	274142	274149	25 %	25 %	25 %	25 %	344210585
6997	NC_015948	CGT	2	6	274170	274175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210585
6998	NC_015948	GC	3	6	274196	274201	0 %	0 %	50 %	50 %	344210585
6999	NC_015948	GTC	2	6	274203	274208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210585
7000	NC_015948	CTGG	2	8	274287	274294	0 %	25 %	50 %	25 %	344210585

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