MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
66001	NC_015948	CTG	2	6	2662328	2662333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213013
66002	NC_015948	GCG	3	9	2662373	2662381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213013
66003	NC_015948	CGG	2	6	2662437	2662442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213013
66004	NC_015948	GACACC	2	12	2662444	2662455	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344213013
66005	NC_015948	GTCC	2	8	2662547	2662554	0 %	25 %	25 %	50 %	344213013
66006	NC_015948	GAA	2	6	2662591	2662596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344213013
66007	NC_015948	CAT	2	6	2662632	2662637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213013
66008	NC_015948	GACG	2	8	2662677	2662684	25 %	0 %	50 %	25 %	344213013
66009	NC_015948	CA	3	6	2662778	2662783	50 %	0 %	0 %	50 %	344213013
66010	NC_015948	CGA	2	6	2662824	2662829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213013
66011	NC_015948	CGT	2	6	2662866	2662871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213013
66012	NC_015948	CCA	2	6	2662910	2662915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213013
66013	NC_015948	CGA	2	6	2663030	2663035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213013
66014	NC_015948	CA	3	6	2663089	2663094	50 %	0 %	0 %	50 %	344213013
66015	NC_015948	AC	3	6	2663119	2663124	50 %	0 %	0 %	50 %	344213013
66016	NC_015948	CGA	2	6	2663129	2663134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213013
66017	NC_015948	GAC	2	6	2663157	2663162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213013
66018	NC_015948	AGT	2	6	2663226	2663231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213014
66019	NC_015948	GAC	2	6	2663260	2663265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213014
66020	NC_015948	CGC	2	6	2663355	2663360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213014
66021	NC_015948	GAA	2	6	2663362	2663367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344213014
66022	NC_015948	CGC	2	6	2663370	2663375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213014
66023	NC_015948	AGCGA	2	10	2663411	2663420	40 %	0 %	40 %	20 %	344213014
66024	NC_015948	CAG	2	6	2663422	2663427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213014
66025	NC_015948	CGC	2	6	2663445	2663450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213014
66026	NC_015948	GAA	2	6	2663461	2663466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344213014
66027	NC_015948	GTC	2	6	2663527	2663532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213014
66028	NC_015948	GAC	2	6	2663569	2663574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213014
66029	NC_015948	CAT	2	6	2663578	2663583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213014
66030	NC_015948	GCA	2	6	2663606	2663611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213014
66031	NC_015948	CGA	2	6	2663613	2663618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213014
66032	NC_015948	CTC	2	6	2663653	2663658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213014
66033	NC_015948	CGT	3	9	2663673	2663681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213014
66034	NC_015948	GT	3	6	2663723	2663728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66035	NC_015948	A	6	6	2663747	2663752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66036	NC_015948	GAA	2	6	2663823	2663828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66037	NC_015948	GAA	2	6	2663833	2663838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66038	NC_015948	GGC	2	6	2663841	2663846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66039	NC_015948	CTG	3	9	2663941	2663949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213015
66040	NC_015948	GTC	2	6	2663968	2663973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213015
66041	NC_015948	CGA	2	6	2664009	2664014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213015
66042	NC_015948	CGG	2	6	2664078	2664083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213015
66043	NC_015948	GGC	2	6	2664088	2664093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213015
66044	NC_015948	CAT	2	6	2664126	2664131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213015
66045	NC_015948	CGT	2	6	2664132	2664137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213015
66046	NC_015948	CTG	2	6	2664166	2664171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213015
66047	NC_015948	AGG	2	6	2664203	2664208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213015
66048	NC_015948	GGT	2	6	2664303	2664308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213015
66049	NC_015948	GACG	2	8	2664327	2664334	25 %	0 %	50 %	25 %	344213015
66050	NC_015948	CGC	2	6	2664435	2664440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213015
66051	NC_015948	TG	3	6	2664455	2664460	0 %	50 %	50 %	0 %	344213015
66052	NC_015948	TGA	2	6	2664476	2664481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213015
66053	NC_015948	GAG	2	6	2664517	2664522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213015
66054	NC_015948	CGG	2	6	2664545	2664550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213015
66055	NC_015948	CCACGA	2	12	2664620	2664631	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344213016
66056	NC_015948	GCC	2	6	2664641	2664646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213016
66057	NC_015948	GTC	2	6	2664650	2664655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213016
66058	NC_015948	GGT	2	6	2664664	2664669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213016
66059	NC_015948	ACCA	2	8	2664678	2664685	50 %	0 %	0 %	50 %	344213016
66060	NC_015948	TCA	2	6	2664709	2664714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213016
66061	NC_015948	CGG	2	6	2664737	2664742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213016
66062	NC_015948	CTG	2	6	2664753	2664758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213016
66063	NC_015948	CCT	2	6	2664836	2664841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213016
66064	NC_015948	GAC	2	6	2664915	2664920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213016
66065	NC_015948	CTT	2	6	2664992	2664997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213016
66066	NC_015948	ACC	2	6	2665005	2665010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213016
66067	NC_015948	CGGG	2	8	2665015	2665022	0 %	0 %	75 %	25 %	344213016
66068	NC_015948	TCA	2	6	2665102	2665107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213016
66069	NC_015948	CCG	2	6	2665114	2665119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213016
66070	NC_015948	GAC	2	6	2665148	2665153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213016
66071	NC_015948	GC	3	6	2665166	2665171	0 %	0 %	50 %	50 %	344213016
66072	NC_015948	TCT	2	6	2665201	2665206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213016
66073	NC_015948	GAT	2	6	2665232	2665237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213016
66074	NC_015948	GCT	2	6	2665256	2665261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213016
66075	NC_015948	GGC	2	6	2665262	2665267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213016
66076	NC_015948	TGA	2	6	2665270	2665275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213016
66077	NC_015948	GAC	2	6	2665331	2665336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213016
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66079	NC_015948	GCT	2	6	2665370	2665375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213016
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66081	NC_015948	TCT	2	6	2665423	2665428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213016
66082	NC_015948	CCGG	2	8	2665471	2665478	0 %	0 %	50 %	50 %	344213016
66083	NC_015948	TCA	2	6	2665501	2665506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213016
66084	NC_015948	TGG	2	6	2665519	2665524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213016
66085	NC_015948	TCG	2	6	2665537	2665542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213016
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66087	NC_015948	CGA	2	6	2665603	2665608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213016
66088	NC_015948	ACG	2	6	2665686	2665691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213016
66089	NC_015948	GC	3	6	2665711	2665716	0 %	0 %	50 %	50 %	344213016
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66101	NC_015948	GCC	3	9	2666160	2666168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213016
66102	NC_015948	CGC	4	12	2666170	2666181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213016
66103	NC_015948	CGA	2	6	2666234	2666239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213016
66104	NC_015948	CGAC	2	8	2666299	2666306	25 %	0 %	25 %	50 %	344213016
66105	NC_015948	GACG	2	8	2666318	2666325	25 %	0 %	50 %	25 %	344213016
66106	NC_015948	GCG	2	6	2666326	2666331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213016
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66109	NC_015948	CGG	2	6	2666441	2666446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213016
66110	NC_015948	GGC	2	6	2666507	2666512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213016
66111	NC_015948	CGG	2	6	2666516	2666521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213016
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66115	NC_015948	TCG	2	6	2666806	2666811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213016
66116	NC_015948	CGC	2	6	2666825	2666830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213016
66117	NC_015948	CGC	2	6	2666858	2666863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213016
66118	NC_015948	TCG	2	6	2666866	2666871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213016
66119	NC_015948	TCA	2	6	2666899	2666904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213016
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66145	NC_015948	CGA	2	6	2667674	2667679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213018
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66152	NC_015948	CCA	2	6	2667854	2667859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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66155	NC_015948	CCGG	2	8	2667946	2667953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66156	NC_015948	TC	3	6	2668001	2668006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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66180	NC_015948	CGG	2	6	2668908	2668913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213020
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66224	NC_015948	CGGTT	2	10	2670684	2670693	0 %	40 %	40 %	20 %	344213021
66225	NC_015948	CGG	2	6	2670772	2670777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213021
66226	NC_015948	GCG	2	6	2670780	2670785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213021
66227	NC_015948	GTG	2	6	2670787	2670792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213021
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66230	NC_015948	TGCGA	2	10	2670964	2670973	20 %	20 %	40 %	20 %	344213021
66231	NC_015948	GTC	2	6	2671025	2671030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213021
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66241	NC_015948	GATTC	2	10	2671436	2671445	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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66250	NC_015948	GATTC	2	10	2671712	2671721	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66251	NC_015948	AT	3	6	2671793	2671798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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66254	NC_015948	CGA	2	6	2671893	2671898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213022
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66345	NC_015948	CCT	2	6	2676015	2676020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213027
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66463	NC_015948	GCTGT	2	10	2680571	2680580	0 %	40 %	40 %	20 %	344213032
66464	NC_015948	TCG	2	6	2680609	2680614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213032
66465	NC_015948	CGG	2	6	2680643	2680648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213032
66466	NC_015948	GCG	2	6	2680666	2680671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213032
66467	NC_015948	ATCCGC	2	12	2680693	2680704	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344213032
66468	NC_015948	CGG	2	6	2680718	2680723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213032
66469	NC_015948	CGC	2	6	2680748	2680753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213032
66470	NC_015948	TGGG	2	8	2680776	2680783	0 %	25 %	75 %	0 %	344213032
66471	NC_015948	AG	3	6	2680872	2680877	50 %	0 %	50 %	0 %	344213032
66472	NC_015948	CGG	2	6	2680950	2680955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213032
66473	NC_015948	CGCTC	2	10	2680970	2680979	0 %	20 %	20 %	60 %	344213032
66474	NC_015948	ACCG	2	8	2680987	2680994	25 %	0 %	25 %	50 %	344213032
66475	NC_015948	CGG	2	6	2681011	2681016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213032
66476	NC_015948	GC	3	6	2681071	2681076	0 %	0 %	50 %	50 %	344213032
66477	NC_015948	TCG	2	6	2681167	2681172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213032
66478	NC_015948	CGG	2	6	2681306	2681311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66479	NC_015948	GCCG	2	8	2681388	2681395	0 %	0 %	50 %	50 %	344213033
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66481	NC_015948	TCT	2	6	2681429	2681434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213033
66482	NC_015948	GGA	2	6	2681438	2681443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213033
66483	NC_015948	CGT	2	6	2681456	2681461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213033
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66485	NC_015948	CA	3	6	2681515	2681520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66486	NC_015948	CTG	2	6	2681521	2681526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66487	NC_015948	CGA	2	6	2681560	2681565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213034
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66489	NC_015948	CGG	2	6	2681646	2681651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213034
66490	NC_015948	TCG	2	6	2681658	2681663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213034
66491	NC_015948	GACC	2	8	2681669	2681676	25 %	0 %	25 %	50 %	344213034
66492	NC_015948	CTC	2	6	2681693	2681698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213034
66493	NC_015948	GGC	2	6	2681716	2681721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66494	NC_015948	CGT	2	6	2681787	2681792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213035
66495	NC_015948	GCT	2	6	2681874	2681879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213035
66496	NC_015948	AC	3	6	2681881	2681886	50 %	0 %	0 %	50 %	344213035
66497	NC_015948	GCT	2	6	2681898	2681903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213035
66498	NC_015948	GTC	3	9	2681926	2681934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213035
66499	NC_015948	GAC	2	6	2681950	2681955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213035
66500	NC_015948	TCG	2	6	2682074	2682079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213035

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