MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_015948	GAC	2	6	2623556	2623561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65002	NC_015948	CGT	2	6	2623624	2623629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65003	NC_015948	CCT	2	6	2623633	2623638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212969
65004	NC_015948	GTGCG	2	10	2623670	2623679	0 %	20 %	60 %	20 %	344212969
65005	NC_015948	CA	3	6	2623693	2623698	50 %	0 %	0 %	50 %	344212969
65006	NC_015948	CGG	2	6	2623720	2623725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212969
65007	NC_015948	CCG	2	6	2623726	2623731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212969
65008	NC_015948	GCT	2	6	2623737	2623742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65009	NC_015948	TTG	2	6	2623758	2623763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344212969
65010	NC_015948	GAA	2	6	2623780	2623785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212969
65011	NC_015948	TCGG	2	8	2623787	2623794	0 %	25 %	50 %	25 %	344212969
65012	NC_015948	CGA	3	9	2623798	2623806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65013	NC_015948	CA	3	6	2623821	2623826	50 %	0 %	0 %	50 %	344212969
65014	NC_015948	AGT	2	6	2623853	2623858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212969
65015	NC_015948	CGACGC	2	12	2623894	2623905	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344212969
65016	NC_015948	CCG	2	6	2623911	2623916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212969
65017	NC_015948	CGA	2	6	2623930	2623935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65018	NC_015948	GCG	2	6	2623953	2623958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212969
65019	NC_015948	CGG	2	6	2624020	2624025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212969
65020	NC_015948	CGG	3	9	2624029	2624037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212969
65021	NC_015948	CGG	2	6	2624047	2624052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212969
65022	NC_015948	CGC	2	6	2624078	2624083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212969
65023	NC_015948	CGA	3	9	2624146	2624154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65024	NC_015948	GAG	2	6	2624160	2624165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212969
65025	NC_015948	GCG	2	6	2624184	2624189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212969
65026	NC_015948	GTC	2	6	2624240	2624245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65027	NC_015948	TCG	2	6	2624274	2624279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65028	NC_015948	GCA	2	6	2624281	2624286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65029	NC_015948	GGTCC	2	10	2624324	2624333	0 %	20 %	40 %	40 %	344212969
65030	NC_015948	AGG	2	6	2624371	2624376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212969
65031	NC_015948	CGGG	2	8	2624413	2624420	0 %	0 %	75 %	25 %	344212969
65032	NC_015948	GTC	2	6	2624439	2624444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65033	NC_015948	GTC	3	9	2624516	2624524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65034	NC_015948	TCG	2	6	2624586	2624591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65035	NC_015948	CG	3	6	2624601	2624606	0 %	0 %	50 %	50 %	344212969
65036	NC_015948	CGT	2	6	2624635	2624640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65037	NC_015948	GCAACA	2	12	2624704	2624715	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	344212969
65038	NC_015948	GA	3	6	2624836	2624841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65039	NC_015948	GTC	2	6	2624978	2624983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212970
65040	NC_015948	CAG	2	6	2625026	2625031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212970
65041	NC_015948	CGGT	2	8	2625057	2625064	0 %	25 %	50 %	25 %	344212970
65042	NC_015948	GC	4	8	2625176	2625183	0 %	0 %	50 %	50 %	344212970
65043	NC_015948	GTA	2	6	2625188	2625193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212970
65044	NC_015948	GTCG	2	8	2625253	2625260	0 %	25 %	50 %	25 %	344212970
65045	NC_015948	CGC	2	6	2625289	2625294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212970
65046	NC_015948	CGA	2	6	2625394	2625399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212970
65047	NC_015948	CGT	2	6	2625415	2625420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212970
65048	NC_015948	CGA	2	6	2625430	2625435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212970
65049	NC_015948	GT	3	6	2625461	2625466	0 %	50 %	50 %	0 %	344212970
65050	NC_015948	CCA	2	6	2625487	2625492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212970
65051	NC_015948	ACC	2	6	2625539	2625544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212970
65052	NC_015948	CGG	2	6	2625610	2625615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212970
65053	NC_015948	GGTC	2	8	2625625	2625632	0 %	25 %	50 %	25 %	344212970
65054	NC_015948	CGG	2	6	2625691	2625696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212970
65055	NC_015948	GGC	2	6	2625719	2625724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212970
65056	NC_015948	CGA	2	6	2625745	2625750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212970
65057	NC_015948	GCC	2	6	2625759	2625764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212970
65058	NC_015948	GGCGT	2	10	2625818	2625827	0 %	20 %	60 %	20 %	344212970
65059	NC_015948	GCG	2	6	2625862	2625867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212970
65060	NC_015948	GTAC	2	8	2625893	2625900	25 %	25 %	25 %	25 %	344212970
65061	NC_015948	TG	3	6	2625980	2625985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65062	NC_015948	AGT	2	6	2626022	2626027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65063	NC_015948	GATTCT	2	12	2626030	2626041	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65064	NC_015948	TGT	2	6	2626074	2626079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65065	NC_015948	GAA	2	6	2626196	2626201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212971
65066	NC_015948	TCT	2	6	2626375	2626380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212971
65067	NC_015948	CGT	2	6	2626381	2626386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212971
65068	NC_015948	CCGCG	2	10	2626405	2626414	0 %	0 %	40 %	60 %	344212971
65069	NC_015948	TGA	2	6	2626450	2626455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212971
65070	NC_015948	TCGACG	2	12	2626473	2626484	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344212971
65071	NC_015948	GTC	2	6	2626535	2626540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212971
65072	NC_015948	GAG	2	6	2626616	2626621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212971
65073	NC_015948	TTG	2	6	2626626	2626631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344212971
65074	NC_015948	TCG	2	6	2626725	2626730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212971
65075	NC_015948	CGGC	2	8	2626754	2626761	0 %	0 %	50 %	50 %	344212971
65076	NC_015948	TGT	2	6	2626782	2626787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65077	NC_015948	GTC	3	9	2626849	2626857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212972
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65080	NC_015948	CGA	2	6	2626923	2626928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212972
65081	NC_015948	AGC	2	6	2626970	2626975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212972
65082	NC_015948	GAACG	2	10	2626978	2626987	40 %	0 %	40 %	20 %	344212972
65083	NC_015948	CGCT	2	8	2627048	2627055	0 %	25 %	25 %	50 %	344212972
65084	NC_015948	GGT	2	6	2627101	2627106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212972
65085	NC_015948	TCG	2	6	2627249	2627254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212972
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65088	NC_015948	CGT	2	6	2627511	2627516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212972
65089	NC_015948	CAGT	2	8	2627517	2627524	25 %	25 %	25 %	25 %	344212972
65090	NC_015948	CTC	2	6	2627557	2627562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212972
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65099	NC_015948	GAG	2	6	2627806	2627811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212972
65100	NC_015948	CGT	2	6	2627868	2627873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212972
65101	NC_015948	CGCTGG	2	12	2627945	2627956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344212972
65102	NC_015948	TGC	2	6	2627987	2627992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212972
65103	NC_015948	GAG	2	6	2628062	2628067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212972
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65111	NC_015948	TGG	2	6	2628296	2628301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212972
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65115	NC_015948	GC	3	6	2628436	2628441	0 %	0 %	50 %	50 %	344212972
65116	NC_015948	GAG	2	6	2628454	2628459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212972
65117	NC_015948	GTC	2	6	2628487	2628492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212972
65118	NC_015948	GCCGTC	2	12	2628499	2628510	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344212972
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65128	NC_015948	GCGG	2	8	2628863	2628870	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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65131	NC_015948	GAG	2	6	2628985	2628990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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65155	NC_015948	CTG	2	6	2629976	2629981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212975
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65215	NC_015948	CGA	2	6	2632397	2632402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212978
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65223	NC_015948	GCGGG	2	10	2632723	2632732	0 %	0 %	80 %	20 %	344212979
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65225	NC_015948	CGT	2	6	2632801	2632806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212979
65226	NC_015948	TCG	2	6	2632860	2632865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212979
65227	NC_015948	CGG	2	6	2632918	2632923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212979
65228	NC_015948	GCG	2	6	2633017	2633022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212979
65229	NC_015948	CTGAC	2	10	2633033	2633042	20 %	20 %	20 %	40 %	344212979
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65342	NC_015948	CGT	2	6	2637745	2637750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212986
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65464	NC_015948	AGCG	2	8	2641911	2641918	25 %	0 %	50 %	25 %	344212991
65465	NC_015948	CGCCGT	2	12	2641964	2641975	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344212991
65466	NC_015948	GTGTC	2	10	2642042	2642051	0 %	40 %	40 %	20 %	344212991
65467	NC_015948	GGA	2	6	2642108	2642113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212991
65468	NC_015948	GGGA	2	8	2642138	2642145	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65469	NC_015948	CCCG	2	8	2642236	2642243	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65470	NC_015948	CTT	2	6	2642272	2642277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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65479	NC_015948	GAG	2	6	2642608	2642613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212992
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65489	NC_015948	TCG	2	6	2642999	2643004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212992
65490	NC_015948	CCG	3	9	2643005	2643013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212992
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65492	NC_015948	CCG	2	6	2643059	2643064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212992
65493	NC_015948	CAGC	2	8	2643108	2643115	25 %	0 %	25 %	50 %	344212992
65494	NC_015948	GCC	2	6	2643118	2643123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212992
65495	NC_015948	CGC	2	6	2643141	2643146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212992
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65497	NC_015948	TCC	2	6	2643248	2643253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212992
65498	NC_015948	CGC	2	6	2643312	2643317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212992
65499	NC_015948	GCC	2	6	2643345	2643350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212992
65500	NC_015948	TGC	2	6	2643398	2643403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212992

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