MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64501	NC_015948	CGA	2	6	2603169	2603174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212949
64502	NC_015948	CCG	2	6	2603198	2603203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212949
64503	NC_015948	CGTCC	2	10	2603271	2603280	0 %	20 %	20 %	60 %	344212949
64504	NC_015948	CG	3	6	2603332	2603337	0 %	0 %	50 %	50 %	344212949
64505	NC_015948	TCC	2	6	2603345	2603350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212949
64506	NC_015948	CCGC	2	8	2603369	2603376	0 %	0 %	25 %	75 %	344212949
64507	NC_015948	CGCC	2	8	2603388	2603395	0 %	0 %	25 %	75 %	344212949
64508	NC_015948	TG	3	6	2603570	2603575	0 %	50 %	50 %	0 %	344212949
64509	NC_015948	CTT	2	6	2603577	2603582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212949
64510	NC_015948	CGA	2	6	2603598	2603603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212949
64511	NC_015948	TCC	2	6	2603636	2603641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212949
64512	NC_015948	ACG	2	6	2603747	2603752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212949
64513	NC_015948	GT	3	6	2603755	2603760	0 %	50 %	50 %	0 %	344212949
64514	NC_015948	GAAT	2	8	2603775	2603782	50 %	25 %	25 %	0 %	344212949
64515	NC_015948	CGA	2	6	2603790	2603795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212949
64516	NC_015948	TGC	2	6	2603872	2603877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212950
64517	NC_015948	GACC	2	8	2603879	2603886	25 %	0 %	25 %	50 %	344212950
64518	NC_015948	CGG	2	6	2603900	2603905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212950
64519	NC_015948	GGT	2	6	2603957	2603962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212950
64520	NC_015948	GTC	2	6	2604000	2604005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212950
64521	NC_015948	ACG	2	6	2604010	2604015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212950
64522	NC_015948	CGC	2	6	2604041	2604046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212950
64523	NC_015948	GGC	2	6	2604050	2604055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212950
64524	NC_015948	TC	3	6	2604134	2604139	0 %	50 %	0 %	50 %	344212950
64525	NC_015948	TCGGTG	2	12	2604145	2604156	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344212950
64526	NC_015948	GA	3	6	2604223	2604228	50 %	0 %	50 %	0 %	344212950
64527	NC_015948	GAA	2	6	2604279	2604284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212951
64528	NC_015948	ACC	2	6	2604313	2604318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212951
64529	NC_015948	TCG	3	9	2604319	2604327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212951
64530	NC_015948	TG	3	6	2604341	2604346	0 %	50 %	50 %	0 %	344212951
64531	NC_015948	CGG	2	6	2604362	2604367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212951
64532	NC_015948	CGGT	2	8	2604388	2604395	0 %	25 %	50 %	25 %	344212951
64533	NC_015948	GTA	2	6	2604402	2604407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212951
64534	NC_015948	GTC	2	6	2604429	2604434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212951
64535	NC_015948	CGA	2	6	2604449	2604454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212951
64536	NC_015948	CGT	2	6	2604470	2604475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212951
64537	NC_015948	CCG	2	6	2604534	2604539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212951
64538	NC_015948	TCG	2	6	2604544	2604549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212951
64539	NC_015948	AGCCG	2	10	2604569	2604578	20 %	0 %	40 %	40 %	344212951
64540	NC_015948	CGT	2	6	2604680	2604685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212951
64541	NC_015948	GCC	2	6	2604706	2604711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212951
64542	NC_015948	CGA	2	6	2604740	2604745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212951
64543	NC_015948	GGC	3	9	2604800	2604808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64544	NC_015948	TTG	2	6	2604818	2604823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64545	NC_015948	GAA	2	6	2604861	2604866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64546	NC_015948	AGGG	2	8	2604968	2604975	25 %	0 %	75 %	0 %	344212952
64547	NC_015948	TCG	2	6	2605044	2605049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64548	NC_015948	CGG	2	6	2605069	2605074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212952
64549	NC_015948	GC	3	6	2605089	2605094	0 %	0 %	50 %	50 %	344212952
64550	NC_015948	ACGG	2	8	2605138	2605145	25 %	0 %	50 %	25 %	344212952
64551	NC_015948	CGACAG	2	12	2605147	2605158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64552	NC_015948	TCA	2	6	2605164	2605169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212952
64553	NC_015948	CGA	2	6	2605218	2605223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64554	NC_015948	GAC	2	6	2605229	2605234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64555	NC_015948	GCG	2	6	2605290	2605295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212952
64556	NC_015948	CGG	2	6	2605369	2605374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212952
64557	NC_015948	GAT	2	6	2605384	2605389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212952
64558	NC_015948	GAG	2	6	2605550	2605555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212952
64559	NC_015948	GCT	2	6	2605576	2605581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64560	NC_015948	GCCG	2	8	2605603	2605610	0 %	0 %	50 %	50 %	344212952
64561	NC_015948	CGA	2	6	2605618	2605623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64562	NC_015948	CGG	2	6	2605642	2605647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212952
64563	NC_015948	CATCGC	2	12	2605666	2605677	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344212952
64564	NC_015948	GCC	2	6	2605686	2605691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212952
64565	NC_015948	GCT	2	6	2605696	2605701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64566	NC_015948	CGA	2	6	2605708	2605713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64567	NC_015948	CGA	2	6	2605716	2605721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64568	NC_015948	CGA	2	6	2605765	2605770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64569	NC_015948	TCA	2	6	2605803	2605808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212952
64570	NC_015948	CGT	2	6	2605822	2605827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64571	NC_015948	TCG	2	6	2605872	2605877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212952
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64573	NC_015948	GAG	2	6	2605892	2605897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212952
64574	NC_015948	TACACG	2	12	2605922	2605933	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344212952
64575	NC_015948	CTG	2	6	2605934	2605939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64576	NC_015948	GAC	2	6	2606099	2606104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64577	NC_015948	CACC	2	8	2606107	2606114	25 %	0 %	0 %	75 %	344212952
64578	NC_015948	CGC	2	6	2606176	2606181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212952
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64581	NC_015948	A	6	6	2606231	2606236	100 %	0 %	0 %	0 %	344212952
64582	NC_015948	CGA	2	6	2606251	2606256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64583	NC_015948	TCG	2	6	2606349	2606354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64584	NC_015948	CGA	2	6	2606376	2606381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212952
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64586	NC_015948	TCGC	2	8	2606727	2606734	0 %	25 %	25 %	50 %	344212952
64587	NC_015948	GC	3	6	2606733	2606738	0 %	0 %	50 %	50 %	344212952
64588	NC_015948	GGA	2	6	2606824	2606829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212952
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64591	NC_015948	CCG	2	6	2607077	2607082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212952
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64593	NC_015948	ACATCG	2	12	2607129	2607140	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344212952
64594	NC_015948	GCCATC	2	12	2607194	2607205	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344212952
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64597	NC_015948	GCC	2	6	2607280	2607285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212952
64598	NC_015948	G	6	6	2607294	2607299	0 %	0 %	100 %	0 %	344212952
64599	NC_015948	TTC	2	6	2607341	2607346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212952
64600	NC_015948	GA	3	6	2607363	2607368	50 %	0 %	50 %	0 %	344212952
64601	NC_015948	CCG	2	6	2607370	2607375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212952
64602	NC_015948	CGT	2	6	2607376	2607381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212952
64603	NC_015948	CGC	3	9	2607421	2607429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212952
64604	NC_015948	CCCA	2	8	2607495	2607502	25 %	0 %	0 %	75 %	344212952
64605	NC_015948	AGG	3	9	2607525	2607533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212952
64606	NC_015948	AAT	2	6	2607547	2607552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344212952
64607	NC_015948	AT	4	8	2607580	2607587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64608	NC_015948	AT	3	6	2607621	2607626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64609	NC_015948	CGGC	2	8	2607688	2607695	0 %	0 %	50 %	50 %	344212953
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64613	NC_015948	CGG	2	6	2607794	2607799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212953
64614	NC_015948	CGG	2	6	2607803	2607808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212953
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64846	NC_015948	CGA	2	6	2617549	2617554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212962
64847	NC_015948	CGA	2	6	2617563	2617568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212962
64848	NC_015948	TAC	2	6	2617580	2617585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212962
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64872	NC_015948	CGT	2	6	2618422	2618427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212962
64873	NC_015948	CCGT	2	8	2618442	2618449	0 %	25 %	25 %	50 %	344212962
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64961	NC_015948	CGA	2	6	2621964	2621969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212967
64962	NC_015948	GCG	2	6	2622005	2622010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212967
64963	NC_015948	CG	3	6	2622041	2622046	0 %	0 %	50 %	50 %	344212967
64964	NC_015948	AGC	2	6	2622047	2622052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212967
64965	NC_015948	GGA	2	6	2622057	2622062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212967
64966	NC_015948	GCC	2	6	2622067	2622072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212967
64967	NC_015948	GCA	2	6	2622090	2622095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212967
64968	NC_015948	GCCA	3	12	2622128	2622139	25 %	0 %	25 %	50 %	344212967
64969	NC_015948	GC	3	6	2622159	2622164	0 %	0 %	50 %	50 %	344212967
64970	NC_015948	GCG	2	6	2622185	2622190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212967
64971	NC_015948	GCC	2	6	2622289	2622294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212967
64972	NC_015948	CGC	2	6	2622340	2622345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212967
64973	NC_015948	CCG	2	6	2622393	2622398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212967
64974	NC_015948	CGG	2	6	2622399	2622404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212967
64975	NC_015948	GA	3	6	2622464	2622469	50 %	0 %	50 %	0 %	344212967
64976	NC_015948	CAG	2	6	2622544	2622549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212967
64977	NC_015948	CGT	2	6	2622583	2622588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212967
64978	NC_015948	CGA	2	6	2622658	2622663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64979	NC_015948	ACG	2	6	2622717	2622722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212968
64980	NC_015948	CTGG	2	8	2622736	2622743	0 %	25 %	50 %	25 %	344212968
64981	NC_015948	CGA	2	6	2622769	2622774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212968
64982	NC_015948	GGT	2	6	2622778	2622783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212968
64983	NC_015948	ACGG	2	8	2622836	2622843	25 %	0 %	50 %	25 %	344212968
64984	NC_015948	AGC	2	6	2622860	2622865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212968
64985	NC_015948	GTG	2	6	2622890	2622895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212968
64986	NC_015948	TG	4	8	2622894	2622901	0 %	50 %	50 %	0 %	344212968
64987	NC_015948	CCA	2	6	2622910	2622915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212968
64988	NC_015948	CGAG	2	8	2622945	2622952	25 %	0 %	50 %	25 %	344212968
64989	NC_015948	TCG	2	6	2622963	2622968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212968
64990	NC_015948	CGA	2	6	2622982	2622987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212968
64991	NC_015948	CGC	2	6	2623011	2623016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212968
64992	NC_015948	ACG	2	6	2623032	2623037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212968
64993	NC_015948	ACG	2	6	2623064	2623069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212968
64994	NC_015948	ACC	2	6	2623149	2623154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212968
64995	NC_015948	GCT	2	6	2623258	2623263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212968
64996	NC_015948	GCC	2	6	2623307	2623312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212968
64997	NC_015948	ACA	2	6	2623359	2623364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344212968
64998	NC_015948	CGCTC	2	10	2623489	2623498	0 %	20 %	20 %	60 %	344212969
64999	NC_015948	GTC	2	6	2623526	2623531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212969
65000	NC_015948	CGC	2	6	2623543	2623548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212969

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