MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63501	NC_015948	GTC	2	6	2563863	2563868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212904
63502	NC_015948	AGG	2	6	2563894	2563899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212904
63503	NC_015948	CCG	2	6	2563978	2563983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212904
63504	NC_015948	CGG	3	9	2564102	2564110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212904
63505	NC_015948	GAC	2	6	2564160	2564165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212904
63506	NC_015948	CGT	2	6	2564192	2564197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212904
63507	NC_015948	TCG	2	6	2564209	2564214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212904
63508	NC_015948	CCT	2	6	2564243	2564248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212904
63509	NC_015948	CGA	2	6	2564261	2564266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212904
63510	NC_015948	CGGC	2	8	2564296	2564303	0 %	0 %	50 %	50 %	344212904
63511	NC_015948	GC	3	6	2564306	2564311	0 %	0 %	50 %	50 %	344212904
63512	NC_015948	CGA	2	6	2564321	2564326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212904
63513	NC_015948	TCGT	2	8	2564403	2564410	0 %	50 %	25 %	25 %	344212904
63514	NC_015948	TCG	2	6	2564447	2564452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212904
63515	NC_015948	GCGAC	2	10	2564502	2564511	20 %	0 %	40 %	40 %	344212904
63516	NC_015948	CG	3	6	2564515	2564520	0 %	0 %	50 %	50 %	344212904
63517	NC_015948	CTG	2	6	2564570	2564575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212904
63518	NC_015948	CGG	2	6	2564592	2564597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212904
63519	NC_015948	ACT	2	6	2564722	2564727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212904
63520	NC_015948	CTC	2	6	2564754	2564759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212904
63521	NC_015948	GCCG	2	8	2564802	2564809	0 %	0 %	50 %	50 %	344212904
63522	NC_015948	CGC	2	6	2564937	2564942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212904
63523	NC_015948	GCC	2	6	2564968	2564973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212904
63524	NC_015948	CTGC	2	8	2564986	2564993	0 %	25 %	25 %	50 %	344212904
63525	NC_015948	GCCG	2	8	2565036	2565043	0 %	0 %	50 %	50 %	344212904
63526	NC_015948	CAGT	2	8	2565067	2565074	25 %	25 %	25 %	25 %	344212904
63527	NC_015948	GTC	2	6	2565075	2565080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212904
63528	NC_015948	GTC	2	6	2565121	2565126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63529	NC_015948	GGC	2	6	2565128	2565133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63530	NC_015948	GAA	2	6	2565220	2565225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212905
63531	NC_015948	AGC	2	6	2565227	2565232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212905
63532	NC_015948	AGG	2	6	2565239	2565244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212905
63533	NC_015948	GCG	2	6	2565249	2565254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212905
63534	NC_015948	CCGG	2	8	2565267	2565274	0 %	0 %	50 %	50 %	344212905
63535	NC_015948	CCG	2	6	2565335	2565340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212905
63536	NC_015948	CGG	2	6	2565357	2565362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212905
63537	NC_015948	GGC	3	9	2565364	2565372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212905
63538	NC_015948	CGC	2	6	2565398	2565403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212905
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63541	NC_015948	GGA	2	6	2565465	2565470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212905
63542	NC_015948	CGG	2	6	2565595	2565600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212906
63543	NC_015948	CGG	2	6	2565631	2565636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212906
63544	NC_015948	TCCG	2	8	2565674	2565681	0 %	25 %	25 %	50 %	344212906
63545	NC_015948	GCCGT	2	10	2565738	2565747	0 %	20 %	40 %	40 %	344212906
63546	NC_015948	TCA	2	6	2565754	2565759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212906
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63548	NC_015948	TGA	2	6	2565778	2565783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212906
63549	NC_015948	ACG	2	6	2565832	2565837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212906
63550	NC_015948	GTCG	2	8	2565994	2566001	0 %	25 %	50 %	25 %	344212907
63551	NC_015948	TCGGC	2	10	2566002	2566011	0 %	20 %	40 %	40 %	344212907
63552	NC_015948	TGC	2	6	2566043	2566048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212907
63553	NC_015948	CGG	2	6	2566063	2566068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212907
63554	NC_015948	CAG	2	6	2566093	2566098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212907
63555	NC_015948	TCCG	2	8	2566208	2566215	0 %	25 %	25 %	50 %	344212907
63556	NC_015948	CAG	2	6	2566234	2566239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212907
63557	NC_015948	GCC	2	6	2566254	2566259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63558	NC_015948	CCT	2	6	2566441	2566446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212908
63559	NC_015948	GAA	2	6	2566451	2566456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212908
63560	NC_015948	ACG	2	6	2566468	2566473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212908
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63562	NC_015948	CGAG	2	8	2566510	2566517	25 %	0 %	50 %	25 %	344212908
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63564	NC_015948	GTC	2	6	2566685	2566690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212908
63565	NC_015948	GTC	2	6	2566754	2566759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212908
63566	NC_015948	GAT	2	6	2566811	2566816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212908
63567	NC_015948	GCGCC	2	10	2566828	2566837	0 %	0 %	40 %	60 %	344212908
63568	NC_015948	CGTG	2	8	2566846	2566853	0 %	25 %	50 %	25 %	344212908
63569	NC_015948	TCCCAG	2	12	2566938	2566949	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344212908
63570	NC_015948	GTA	2	6	2567006	2567011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212908
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63574	NC_015948	CGGG	2	8	2567095	2567102	0 %	0 %	75 %	25 %	344212908
63575	NC_015948	GTC	2	6	2567126	2567131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212908
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63582	NC_015948	TCG	2	6	2567415	2567420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212908
63583	NC_015948	TGA	2	6	2567446	2567451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212908
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63585	NC_015948	CCT	2	6	2567566	2567571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212908
63586	NC_015948	GCC	2	6	2567577	2567582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212908
63587	NC_015948	GT	3	6	2567633	2567638	0 %	50 %	50 %	0 %	344212908
63588	NC_015948	CT	3	6	2567643	2567648	0 %	50 %	0 %	50 %	344212908
63589	NC_015948	GTTA	2	8	2567676	2567683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63590	NC_015948	ACATT	2	10	2567689	2567698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63591	NC_015948	GCG	2	6	2567734	2567739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63592	NC_015948	GGC	2	6	2567747	2567752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63593	NC_015948	GCC	2	6	2567771	2567776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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63596	NC_015948	TCG	3	9	2567872	2567880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212909
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63599	NC_015948	GGT	2	6	2568033	2568038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212909
63600	NC_015948	CGA	2	6	2568119	2568124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212909
63601	NC_015948	GTC	3	9	2568141	2568149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212909
63602	NC_015948	GAC	2	6	2568150	2568155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212909
63603	NC_015948	GCGA	2	8	2568204	2568211	25 %	0 %	50 %	25 %	344212909
63604	NC_015948	CGG	2	6	2568218	2568223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212909
63605	NC_015948	GGT	2	6	2568275	2568280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212909
63606	NC_015948	TCG	2	6	2568283	2568288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212909
63607	NC_015948	CGC	2	6	2568329	2568334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212909
63608	NC_015948	GCCG	2	8	2568384	2568391	0 %	0 %	50 %	50 %	344212909
63609	NC_015948	ATC	2	6	2568466	2568471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212909
63610	NC_015948	GAC	2	6	2568480	2568485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212909
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63612	NC_015948	CCA	2	6	2568658	2568663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212909
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63614	NC_015948	ACG	2	6	2568788	2568793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212910
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63616	NC_015948	GAAGC	2	10	2568883	2568892	40 %	0 %	40 %	20 %	344212910
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63961	NC_015948	CGA	2	6	2581669	2581674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212922
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63989	NC_015948	TCT	2	6	2582718	2582723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212923
63990	NC_015948	GGA	2	6	2582737	2582742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212923
63991	NC_015948	TCG	2	6	2582763	2582768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63992	NC_015948	TGA	2	6	2582810	2582815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63993	NC_015948	GAG	3	9	2582956	2582964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212924
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63997	NC_015948	GGACG	2	10	2583016	2583025	20 %	0 %	60 %	20 %	344212924
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