MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61501	NC_015948	AGC	2	6	2488121	2488126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212821
61502	NC_015948	GCT	2	6	2488179	2488184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212821
61503	NC_015948	CGA	2	6	2488200	2488205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212821
61504	NC_015948	GCC	2	6	2488333	2488338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212821
61505	NC_015948	ACG	2	6	2488381	2488386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212821
61506	NC_015948	TC	3	6	2488392	2488397	0 %	50 %	0 %	50 %	344212821
61507	NC_015948	CGT	2	6	2488413	2488418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212821
61508	NC_015948	GAG	2	6	2488420	2488425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212821
61509	NC_015948	ACG	2	6	2488451	2488456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212821
61510	NC_015948	TCG	2	6	2488463	2488468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212821
61511	NC_015948	GAC	2	6	2488582	2488587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61512	NC_015948	CG	3	6	2488601	2488606	0 %	0 %	50 %	50 %	344212822
61513	NC_015948	GCG	2	6	2488616	2488621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212822
61514	NC_015948	ACA	2	6	2488644	2488649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344212822
61515	NC_015948	CGG	3	9	2488670	2488678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212822
61516	NC_015948	CGG	2	6	2488730	2488735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212822
61517	NC_015948	CGA	2	6	2488774	2488779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61518	NC_015948	CGG	2	6	2488780	2488785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212822
61519	NC_015948	TCG	2	6	2488789	2488794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61520	NC_015948	TCG	2	6	2488807	2488812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61521	NC_015948	CTT	2	6	2488814	2488819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212822
61522	NC_015948	CGGC	2	8	2488843	2488850	0 %	0 %	50 %	50 %	344212822
61523	NC_015948	CGC	2	6	2488859	2488864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212822
61524	NC_015948	CTG	2	6	2488872	2488877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61525	NC_015948	ACG	2	6	2488878	2488883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61526	NC_015948	CGG	2	6	2488900	2488905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212822
61527	NC_015948	GCT	2	6	2488910	2488915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61528	NC_015948	CGC	2	6	2488916	2488921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212822
61529	NC_015948	TCGC	2	8	2488938	2488945	0 %	25 %	25 %	50 %	344212822
61530	NC_015948	TAG	2	6	2488969	2488974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212822
61531	NC_015948	TCG	2	6	2489005	2489010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61532	NC_015948	TCG	2	6	2489023	2489028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61533	NC_015948	GGTC	2	8	2489029	2489036	0 %	25 %	50 %	25 %	344212822
61534	NC_015948	CTG	2	6	2489046	2489051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61535	NC_015948	TGG	2	6	2489092	2489097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212822
61536	NC_015948	TCG	2	6	2489113	2489118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61537	NC_015948	CG	3	6	2489127	2489132	0 %	0 %	50 %	50 %	344212822
61538	NC_015948	CGG	2	6	2489279	2489284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212822
61539	NC_015948	CGT	2	6	2489300	2489305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61540	NC_015948	GC	3	6	2489326	2489331	0 %	0 %	50 %	50 %	344212822
61541	NC_015948	TGGC	2	8	2489358	2489365	0 %	25 %	50 %	25 %	344212822
61542	NC_015948	CGGG	2	8	2489366	2489373	0 %	0 %	75 %	25 %	344212822
61543	NC_015948	CGA	2	6	2489417	2489422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61544	NC_015948	CTG	2	6	2489442	2489447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61545	NC_015948	GCGGG	2	10	2489448	2489457	0 %	0 %	80 %	20 %	344212822
61546	NC_015948	TTC	3	9	2489544	2489552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212822
61547	NC_015948	GCC	2	6	2489594	2489599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212822
61548	NC_015948	GCG	3	9	2489631	2489639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212822
61549	NC_015948	CGG	2	6	2489669	2489674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212822
61550	NC_015948	CGCTGA	2	12	2489692	2489703	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61551	NC_015948	TCG	2	6	2489728	2489733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61552	NC_015948	GC	3	6	2489752	2489757	0 %	0 %	50 %	50 %	344212822
61553	NC_015948	CGT	2	6	2489765	2489770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61554	NC_015948	GAC	2	6	2489774	2489779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61555	NC_015948	GTC	2	6	2489787	2489792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61556	NC_015948	CACTCG	2	12	2489845	2489856	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344212822
61557	NC_015948	CGC	2	6	2489867	2489872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212822
61558	NC_015948	CGT	2	6	2489897	2489902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61559	NC_015948	TCG	2	6	2489922	2489927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212822
61560	NC_015948	GTG	2	6	2489943	2489948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212822
61561	NC_015948	G	6	6	2490081	2490086	0 %	0 %	100 %	0 %	344212822
61562	NC_015948	AGCG	2	8	2490092	2490099	25 %	0 %	50 %	25 %	344212822
61563	NC_015948	GCC	2	6	2490141	2490146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212822
61564	NC_015948	CGACT	2	10	2490165	2490174	20 %	20 %	20 %	40 %	344212822
61565	NC_015948	GTC	2	6	2490224	2490229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212823
61566	NC_015948	CGC	2	6	2490233	2490238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212823
61567	NC_015948	CGCGGC	2	12	2490254	2490265	0 %	0 %	50 %	50 %	344212823
61568	NC_015948	CGT	2	6	2490313	2490318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212823
61569	NC_015948	GCT	2	6	2490364	2490369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212823
61570	NC_015948	TGA	2	6	2490382	2490387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212823
61571	NC_015948	AGC	2	6	2490423	2490428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212823
61572	NC_015948	CGA	2	6	2490436	2490441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212823
61573	NC_015948	GGCC	2	8	2490442	2490449	0 %	0 %	50 %	50 %	344212823
61574	NC_015948	CGCGC	2	10	2490454	2490463	0 %	0 %	40 %	60 %	344212823
61575	NC_015948	GGT	2	6	2490484	2490489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212823
61576	NC_015948	CCGC	2	8	2490532	2490539	0 %	0 %	25 %	75 %	344212823
61577	NC_015948	CGG	2	6	2490553	2490558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212823
61578	NC_015948	TCG	2	6	2490594	2490599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212823
61579	NC_015948	GTCT	2	8	2490715	2490722	0 %	50 %	25 %	25 %	344212823
61580	NC_015948	TCGGT	2	10	2490732	2490741	0 %	40 %	40 %	20 %	344212823
61581	NC_015948	CTG	2	6	2490780	2490785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61582	NC_015948	CCCG	2	8	2490808	2490815	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61583	NC_015948	CCG	2	6	2490822	2490827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61584	NC_015948	GGC	2	6	2490828	2490833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61585	NC_015948	CCG	2	6	2490867	2490872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212824
61586	NC_015948	CCG	2	6	2490879	2490884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212824
61587	NC_015948	GCG	2	6	2490897	2490902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212824
61588	NC_015948	GAC	2	6	2490918	2490923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212824
61589	NC_015948	GAC	2	6	2491056	2491061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212824
61590	NC_015948	TCG	2	6	2491063	2491068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212824
61591	NC_015948	GTC	2	6	2491098	2491103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212824
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61596	NC_015948	CCG	2	6	2491253	2491258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212824
61597	NC_015948	CGT	2	6	2491261	2491266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212824
61598	NC_015948	GTC	2	6	2491287	2491292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212824
61599	NC_015948	GTC	2	6	2491311	2491316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212824
61600	NC_015948	ACCG	2	8	2491335	2491342	25 %	0 %	25 %	50 %	344212824
61601	NC_015948	CGC	2	6	2491355	2491360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212824
61602	NC_015948	ACG	2	6	2491366	2491371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212824
61603	NC_015948	GCG	2	6	2491420	2491425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212824
61604	NC_015948	CGT	2	6	2491428	2491433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212824
61605	NC_015948	CGC	2	6	2491436	2491441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212824
61606	NC_015948	GCCGA	2	10	2491452	2491461	20 %	0 %	40 %	40 %	344212824
61607	NC_015948	CGA	2	6	2491493	2491498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212824
61608	NC_015948	GCC	2	6	2491512	2491517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212824
61609	NC_015948	TCGGC	2	10	2491534	2491543	0 %	20 %	40 %	40 %	344212824
61610	NC_015948	TGC	2	6	2491609	2491614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212824
61611	NC_015948	CGCC	2	8	2491646	2491653	0 %	0 %	25 %	75 %	344212824
61612	NC_015948	GTC	2	6	2491749	2491754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212824
61613	NC_015948	GAC	2	6	2491791	2491796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212824
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61615	NC_015948	CGA	3	9	2491952	2491960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212824
61616	NC_015948	TCGAAC	2	12	2491969	2491980	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344212824
61617	NC_015948	AAC	2	6	2491989	2491994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344212824
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61622	NC_015948	CCTCGA	2	12	2492157	2492168	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344212825
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61644	NC_015948	TCTG	2	8	2493081	2493088	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61645	NC_015948	TAAT	2	8	2493136	2493143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61847	NC_015948	GCA	2	6	2500602	2500607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212835
61848	NC_015948	ACA	2	6	2500614	2500619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344212835
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61954	NC_015948	G	6	6	2504317	2504322	0 %	0 %	100 %	0 %	344212839
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