MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60001	NC_015948	ACG	2	6	2425017	2425022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60002	NC_015948	CAA	2	6	2425062	2425067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60003	NC_015948	TGG	2	6	2425081	2425086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60004	NC_015948	CTG	2	6	2425194	2425199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60005	NC_015948	A	6	6	2425229	2425234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60006	NC_015948	GA	3	6	2425269	2425274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60007	NC_015948	TGT	2	6	2425327	2425332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60008	NC_015948	AT	3	6	2425366	2425371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60009	NC_015948	GAA	2	6	2425389	2425394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212753
60010	NC_015948	ACG	2	6	2425444	2425449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212753
60011	NC_015948	AGA	2	6	2425472	2425477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212753
60012	NC_015948	CGA	2	6	2425508	2425513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212753
60013	NC_015948	GGT	2	6	2425535	2425540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212753
60014	NC_015948	CAG	2	6	2425575	2425580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212753
60015	NC_015948	GTC	2	6	2425620	2425625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212753
60016	NC_015948	CAC	2	6	2425700	2425705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212753
60017	NC_015948	CAC	2	6	2425718	2425723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60018	NC_015948	CCGG	2	8	2425727	2425734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60019	NC_015948	ATG	2	6	2425765	2425770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60020	NC_015948	CAC	2	6	2425892	2425897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60021	NC_015948	AACA	2	8	2425912	2425919	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60022	NC_015948	GTGC	2	8	2425952	2425959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60023	NC_015948	GGT	2	6	2426100	2426105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212754
60024	NC_015948	CGT	2	6	2426109	2426114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212754
60025	NC_015948	CGCAC	2	10	2426141	2426150	20 %	0 %	20 %	60 %	344212754
60026	NC_015948	CTG	2	6	2426187	2426192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212754
60027	NC_015948	CGT	2	6	2426247	2426252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212754
60028	NC_015948	GTC	2	6	2426317	2426322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212754
60029	NC_015948	CGC	2	6	2426367	2426372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212754
60030	NC_015948	GGT	2	6	2426406	2426411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212754
60031	NC_015948	CCT	2	6	2426508	2426513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212754
60032	NC_015948	GAA	2	6	2426515	2426520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212754
60033	NC_015948	CGC	2	6	2426625	2426630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212754
60034	NC_015948	GTA	2	6	2426689	2426694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212754
60035	NC_015948	CGG	2	6	2426704	2426709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212754
60036	NC_015948	TCG	2	6	2426835	2426840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212754
60037	NC_015948	TCG	2	6	2426852	2426857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212754
60038	NC_015948	TCG	2	6	2426870	2426875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212754
60039	NC_015948	CGG	2	6	2426922	2426927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212754
60040	NC_015948	TCC	2	6	2426981	2426986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212754
60041	NC_015948	CAC	2	6	2427006	2427011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212754
60042	NC_015948	CGT	2	6	2427045	2427050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212754
60043	NC_015948	GTC	2	6	2427056	2427061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212754
60044	NC_015948	GTC	2	6	2427069	2427074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212754
60045	NC_015948	CGG	2	6	2427097	2427102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60046	NC_015948	TGG	2	6	2427108	2427113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60047	NC_015948	A	6	6	2427136	2427141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60048	NC_015948	GCAG	2	8	2427160	2427167	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60049	NC_015948	CGG	2	6	2427219	2427224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212755
60050	NC_015948	ACG	2	6	2427271	2427276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212755
60051	NC_015948	TCC	2	6	2427312	2427317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212755
60052	NC_015948	CGA	2	6	2427350	2427355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212755
60053	NC_015948	CA	3	6	2427357	2427362	50 %	0 %	0 %	50 %	344212755
60054	NC_015948	CAT	2	6	2427409	2427414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212755
60055	NC_015948	TCG	2	6	2427416	2427421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60056	NC_015948	GA	3	6	2427491	2427496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60057	NC_015948	GTC	2	6	2427516	2427521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60058	NC_015948	AG	3	6	2427556	2427561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60059	NC_015948	TCA	2	6	2427588	2427593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60060	NC_015948	AC	3	6	2427598	2427603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60061	NC_015948	ACC	2	6	2427639	2427644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212756
60062	NC_015948	CGC	2	6	2427710	2427715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212756
60063	NC_015948	CCT	2	6	2427768	2427773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212756
60064	NC_015948	ACA	2	6	2427794	2427799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344212756
60065	NC_015948	CGT	2	6	2427858	2427863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212756
60066	NC_015948	CGA	2	6	2427890	2427895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212756
60067	NC_015948	GC	3	6	2427933	2427938	0 %	0 %	50 %	50 %	344212756
60068	NC_015948	GCG	2	6	2427941	2427946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212756
60069	NC_015948	CGT	2	6	2427948	2427953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212756
60070	NC_015948	CGG	3	9	2427989	2427997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212756
60071	NC_015948	CGA	2	6	2428011	2428016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212756
60072	NC_015948	TCC	2	6	2428067	2428072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212756
60073	NC_015948	CCGT	2	8	2428075	2428082	0 %	25 %	25 %	50 %	344212756
60074	NC_015948	ACG	2	6	2428112	2428117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212756
60075	NC_015948	GCG	2	6	2428151	2428156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212756
60076	NC_015948	CGA	2	6	2428170	2428175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212756
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60078	NC_015948	CGCTCA	2	12	2428241	2428252	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344212756
60079	NC_015948	ACG	3	9	2428253	2428261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212756
60080	NC_015948	GCT	2	6	2428320	2428325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212756
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60083	NC_015948	GC	3	6	2428463	2428468	0 %	0 %	50 %	50 %	344212756
60084	NC_015948	CGA	2	6	2428512	2428517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212756
60085	NC_015948	CGA	2	6	2428563	2428568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212756
60086	NC_015948	CTG	2	6	2428588	2428593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212756
60087	NC_015948	GGCG	2	8	2428635	2428642	0 %	0 %	75 %	25 %	344212756
60088	NC_015948	CTG	2	6	2428699	2428704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212756
60089	NC_015948	CGTGGA	2	12	2428743	2428754	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344212756
60090	NC_015948	GCTGG	2	10	2428756	2428765	0 %	20 %	60 %	20 %	344212756
60091	NC_015948	GAGC	2	8	2428773	2428780	25 %	0 %	50 %	25 %	344212756
60092	NC_015948	CGA	2	6	2428808	2428813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60093	NC_015948	CTG	2	6	2428829	2428834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60094	NC_015948	TGG	2	6	2428990	2428995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60095	NC_015948	GAC	2	6	2429104	2429109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212757
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60101	NC_015948	GAAG	2	8	2429343	2429350	50 %	0 %	50 %	0 %	344212757
60102	NC_015948	GAG	2	6	2429362	2429367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212757
60103	NC_015948	TCGG	2	8	2429373	2429380	0 %	25 %	50 %	25 %	344212757
60104	NC_015948	CCG	2	6	2429409	2429414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212757
60105	NC_015948	GAG	2	6	2429518	2429523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212757
60106	NC_015948	GTCTCA	2	12	2429528	2429539	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344212757
60107	NC_015948	TCAG	2	8	2429603	2429610	25 %	25 %	25 %	25 %	344212757
60108	NC_015948	TGA	2	6	2429664	2429669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212757
60109	NC_015948	CT	3	6	2429684	2429689	0 %	50 %	0 %	50 %	344212757
60110	NC_015948	GA	3	6	2429731	2429736	50 %	0 %	50 %	0 %	344212757
60111	NC_015948	CTA	2	6	2429760	2429765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212757
60112	NC_015948	TCAC	2	8	2429879	2429886	25 %	25 %	0 %	50 %	344212757
60113	NC_015948	GTC	2	6	2429914	2429919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212757
60114	NC_015948	GGAT	2	8	2429927	2429934	25 %	25 %	50 %	0 %	344212757
60115	NC_015948	AGG	2	6	2429978	2429983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212757
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60117	NC_015948	CCG	2	6	2430090	2430095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212758
60118	NC_015948	GAA	2	6	2430116	2430121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212758
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60145	NC_015948	GAA	2	6	2431624	2431629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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60147	NC_015948	TGA	2	6	2431668	2431673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60148	NC_015948	AGTGG	2	10	2431690	2431699	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60149	NC_015948	AG	3	6	2431716	2431721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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60231	NC_015948	CAG	2	6	2435334	2435339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212765
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60468	NC_015948	CGCGT	2	10	2443321	2443330	0 %	20 %	40 %	40 %	344212773
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60494	NC_015948	CGC	2	6	2444460	2444465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212774
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60496	NC_015948	CGGT	2	8	2444545	2444552	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60497	NC_015948	GAC	2	6	2444584	2444589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60498	NC_015948	CGGG	2	8	2444636	2444643	0 %	0 %	75 %	25 %	344212775
60499	NC_015948	GCG	2	6	2444714	2444719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212775
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