MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_015948	CGC	2	6	2365863	2365868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212704
58502	NC_015948	CGT	2	6	2365940	2365945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212705
58503	NC_015948	TCA	2	6	2366053	2366058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212705
58504	NC_015948	CGG	2	6	2366108	2366113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212705
58505	NC_015948	CCG	2	6	2366115	2366120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212705
58506	NC_015948	CGC	2	6	2366177	2366182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212705
58507	NC_015948	AGC	2	6	2366204	2366209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212705
58508	NC_015948	CCG	2	6	2366236	2366241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212705
58509	NC_015948	GCG	2	6	2366251	2366256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212705
58510	NC_015948	GGC	2	6	2366285	2366290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212705
58511	NC_015948	CGA	2	6	2366294	2366299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212705
58512	NC_015948	GCGACG	2	12	2366317	2366328	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344212705
58513	NC_015948	GCA	2	6	2366331	2366336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212705
58514	NC_015948	ACC	2	6	2366349	2366354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212705
58515	NC_015948	GAC	2	6	2366382	2366387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212705
58516	NC_015948	CAG	2	6	2366412	2366417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212705
58517	NC_015948	GC	3	6	2366418	2366423	0 %	0 %	50 %	50 %	344212705
58518	NC_015948	CAG	2	6	2366445	2366450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212705
58519	NC_015948	CAGC	2	8	2366490	2366497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58520	NC_015948	GT	3	6	2366531	2366536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58521	NC_015948	CGT	2	6	2366538	2366543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58522	NC_015948	ACA	2	6	2366657	2366662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58523	NC_015948	CCA	2	6	2366691	2366696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212706
58524	NC_015948	TAT	2	6	2366942	2366947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58525	NC_015948	GTT	2	6	2366981	2366986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58526	NC_015948	TGTGT	2	10	2367057	2367066	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
58527	NC_015948	AGTG	2	8	2367144	2367151	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58528	NC_015948	GC	3	6	2367155	2367160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58529	NC_015948	GTT	2	6	2367342	2367347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344212707
58530	NC_015948	GTC	2	6	2367351	2367356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212707
58531	NC_015948	GCC	2	6	2367361	2367366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212707
58532	NC_015948	AGAC	2	8	2367367	2367374	50 %	0 %	25 %	25 %	344212707
58533	NC_015948	ACGT	2	8	2367421	2367428	25 %	25 %	25 %	25 %	344212707
58534	NC_015948	GAT	2	6	2367507	2367512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212707
58535	NC_015948	CGT	2	6	2367554	2367559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212707
58536	NC_015948	TCG	2	6	2367665	2367670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212707
58537	NC_015948	CCG	2	6	2367695	2367700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212707
58538	NC_015948	CCG	2	6	2367707	2367712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212707
58539	NC_015948	GGC	2	6	2367729	2367734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212707
58540	NC_015948	GACC	2	8	2367740	2367747	25 %	0 %	25 %	50 %	344212707
58541	NC_015948	GAC	2	6	2367840	2367845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212707
58542	NC_015948	GTC	2	6	2368011	2368016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212707
58543	NC_015948	TCG	2	6	2368104	2368109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212708
58544	NC_015948	CCG	2	6	2368137	2368142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212708
58545	NC_015948	GCC	2	6	2368205	2368210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212708
58546	NC_015948	AGG	2	6	2368216	2368221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212708
58547	NC_015948	GC	3	6	2368226	2368231	0 %	0 %	50 %	50 %	344212708
58548	NC_015948	CCT	2	6	2368273	2368278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212708
58549	NC_015948	CGT	2	6	2368309	2368314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212708
58550	NC_015948	CGA	2	6	2368318	2368323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212708
58551	NC_015948	TCG	2	6	2368407	2368412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212708
58552	NC_015948	CACC	2	8	2368433	2368440	25 %	0 %	0 %	75 %	344212708
58553	NC_015948	TG	3	6	2368542	2368547	0 %	50 %	50 %	0 %	344212708
58554	NC_015948	CGC	2	6	2368556	2368561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212708
58555	NC_015948	TGG	2	6	2368578	2368583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212708
58556	NC_015948	GCT	2	6	2368612	2368617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212708
58557	NC_015948	GTA	2	6	2368628	2368633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212708
58558	NC_015948	CA	3	6	2368642	2368647	50 %	0 %	0 %	50 %	344212708
58559	NC_015948	AGCC	2	8	2368668	2368675	25 %	0 %	25 %	50 %	344212708
58560	NC_015948	GTCC	2	8	2368722	2368729	0 %	25 %	25 %	50 %	344212708
58561	NC_015948	CCA	2	6	2368744	2368749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212708
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58564	NC_015948	GA	3	6	2368935	2368940	50 %	0 %	50 %	0 %	344212708
58565	NC_015948	GTCCC	2	10	2368974	2368983	0 %	20 %	20 %	60 %	344212708
58566	NC_015948	CGTC	2	8	2368987	2368994	0 %	25 %	25 %	50 %	344212708
58567	NC_015948	GTC	2	6	2369018	2369023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212708
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58569	NC_015948	CG	3	6	2369074	2369079	0 %	0 %	50 %	50 %	344212708
58570	NC_015948	CGG	2	6	2369191	2369196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212708
58571	NC_015948	CGT	2	6	2369212	2369217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212708
58572	NC_015948	CGA	2	6	2369269	2369274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212708
58573	NC_015948	CGG	2	6	2369301	2369306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212708
58574	NC_015948	CGAACA	2	12	2369527	2369538	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	344212708
58575	NC_015948	GAC	2	6	2369615	2369620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212708
58576	NC_015948	CGTCT	2	10	2369678	2369687	0 %	40 %	20 %	40 %	344212708
58577	NC_015948	CAC	2	6	2369736	2369741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58578	NC_015948	TC	3	6	2369751	2369756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58579	NC_015948	CGA	2	6	2369868	2369873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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58581	NC_015948	TCGC	2	8	2369907	2369914	0 %	25 %	25 %	50 %	344212709
58582	NC_015948	GAAC	2	8	2369950	2369957	50 %	0 %	25 %	25 %	344212709
58583	NC_015948	CAGAGC	2	12	2369973	2369984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212709
58584	NC_015948	GCGGAC	2	12	2369985	2369996	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344212709
58585	NC_015948	CAG	2	6	2370051	2370056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212709
58586	NC_015948	CAGG	2	8	2370075	2370082	25 %	0 %	50 %	25 %	344212709
58587	NC_015948	CA	3	6	2370089	2370094	50 %	0 %	0 %	50 %	344212709
58588	NC_015948	TACCG	2	10	2370114	2370123	20 %	20 %	20 %	40 %	344212709
58589	NC_015948	GAG	2	6	2370162	2370167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212709
58590	NC_015948	CAG	2	6	2370175	2370180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212709
58591	NC_015948	CGA	2	6	2370197	2370202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212709
58592	NC_015948	CCA	2	6	2370240	2370245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212709
58593	NC_015948	AACG	2	8	2370358	2370365	50 %	0 %	25 %	25 %	344212709
58594	NC_015948	GCG	2	6	2370387	2370392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58595	NC_015948	CAC	2	6	2370420	2370425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212710
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58598	NC_015948	CGC	2	6	2370469	2370474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212710
58599	NC_015948	GTC	4	12	2370480	2370491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212710
58600	NC_015948	CGTG	2	8	2370514	2370521	0 %	25 %	50 %	25 %	344212710
58601	NC_015948	CGA	2	6	2370541	2370546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212710
58602	NC_015948	CGC	2	6	2370547	2370552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212710
58603	NC_015948	CGGA	2	8	2370589	2370596	25 %	0 %	50 %	25 %	344212710
58604	NC_015948	GTCG	2	8	2370682	2370689	0 %	25 %	50 %	25 %	344212710
58605	NC_015948	GCTC	2	8	2370786	2370793	0 %	25 %	25 %	50 %	344212710
58606	NC_015948	CAG	2	6	2370811	2370816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212710
58607	NC_015948	GTC	3	9	2370821	2370829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212710
58608	NC_015948	CGT	3	9	2370850	2370858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212710
58609	NC_015948	GAT	2	6	2370964	2370969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212711
58610	NC_015948	CCT	2	6	2371152	2371157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212711
58611	NC_015948	CGT	2	6	2371173	2371178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212711
58612	NC_015948	GAG	2	6	2371198	2371203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212711
58613	NC_015948	GCC	2	6	2371205	2371210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212711
58614	NC_015948	AGGCGT	2	12	2371218	2371229	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344212711
58615	NC_015948	CAC	2	6	2371361	2371366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212712
58616	NC_015948	TCG	2	6	2371378	2371383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212712
58617	NC_015948	GCCCG	2	10	2371429	2371438	0 %	0 %	40 %	60 %	344212712
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58631	NC_015948	CGA	2	6	2371858	2371863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212712
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