MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_015948	TCG	2	6	2346300	2346305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212681
58002	NC_015948	CGG	2	6	2346376	2346381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212681
58003	NC_015948	TCG	2	6	2346386	2346391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212681
58004	NC_015948	GCG	2	6	2346461	2346466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212681
58005	NC_015948	CT	3	6	2346630	2346635	0 %	50 %	0 %	50 %	344212681
58006	NC_015948	GACTG	2	10	2346637	2346646	20 %	20 %	40 %	20 %	344212681
58007	NC_015948	CTGG	2	8	2346685	2346692	0 %	25 %	50 %	25 %	344212681
58008	NC_015948	CGC	2	6	2346703	2346708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212681
58009	NC_015948	CGA	2	6	2346739	2346744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212681
58010	NC_015948	CGGC	2	8	2346774	2346781	0 %	0 %	50 %	50 %	344212681
58011	NC_015948	GTC	2	6	2346788	2346793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212681
58012	NC_015948	CTG	2	6	2346794	2346799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212681
58013	NC_015948	TCG	2	6	2346825	2346830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212681
58014	NC_015948	CTC	2	6	2346836	2346841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212681
58015	NC_015948	GCG	2	6	2346848	2346853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212681
58016	NC_015948	TCG	2	6	2346906	2346911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212681
58017	NC_015948	TCG	2	6	2346960	2346965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212681
58018	NC_015948	CGT	3	9	2347027	2347035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212681
58019	NC_015948	GCG	3	9	2347143	2347151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212682
58020	NC_015948	GTC	2	6	2347237	2347242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212682
58021	NC_015948	TCG	4	12	2347244	2347255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212682
58022	NC_015948	CG	3	6	2347274	2347279	0 %	0 %	50 %	50 %	344212682
58023	NC_015948	GTC	2	6	2347384	2347389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212682
58024	NC_015948	TCG	2	6	2347409	2347414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212682
58025	NC_015948	AGC	2	6	2347424	2347429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212682
58026	NC_015948	CGT	2	6	2347446	2347451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212682
58027	NC_015948	GAT	2	6	2347480	2347485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212682
58028	NC_015948	ACG	2	6	2347527	2347532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212682
58029	NC_015948	CGGT	2	8	2347560	2347567	0 %	25 %	50 %	25 %	344212682
58030	NC_015948	CGT	2	6	2347581	2347586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58031	NC_015948	GATT	2	8	2347618	2347625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58032	NC_015948	AGAC	2	8	2347630	2347637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58033	NC_015948	TGGG	2	8	2347685	2347692	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58034	NC_015948	CTA	2	6	2347716	2347721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58035	NC_015948	CCG	2	6	2347833	2347838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58036	NC_015948	TCG	2	6	2347957	2347962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212683
58037	NC_015948	CGA	2	6	2347973	2347978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212683
58038	NC_015948	CGT	3	9	2348012	2348020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212683
58039	NC_015948	GAA	2	6	2348022	2348027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212683
58040	NC_015948	GCG	2	6	2348079	2348084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212683
58041	NC_015948	AGA	2	6	2348117	2348122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212683
58042	NC_015948	GTC	2	6	2348142	2348147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212683
58043	NC_015948	ACG	2	6	2348183	2348188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212683
58044	NC_015948	TGTCGT	2	12	2348198	2348209	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	344212683
58045	NC_015948	GC	4	8	2348228	2348235	0 %	0 %	50 %	50 %	344212683
58046	NC_015948	GCC	2	6	2348246	2348251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212683
58047	NC_015948	CGCT	2	8	2348256	2348263	0 %	25 %	25 %	50 %	344212683
58048	NC_015948	CGG	2	6	2348352	2348357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212683
58049	NC_015948	CGC	2	6	2348480	2348485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212683
58050	NC_015948	CGT	3	9	2348504	2348512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212683
58051	NC_015948	CCG	2	6	2348599	2348604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212683
58052	NC_015948	CGT	2	6	2348676	2348681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212683
58053	NC_015948	GTC	2	6	2348682	2348687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212683
58054	NC_015948	GTC	2	6	2348709	2348714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212683
58055	NC_015948	GTTG	2	8	2348724	2348731	0 %	50 %	50 %	0 %	344212683
58056	NC_015948	ATC	2	6	2348739	2348744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212683
58057	NC_015948	CGC	2	6	2348793	2348798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212683
58058	NC_015948	CGA	2	6	2348807	2348812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212683
58059	NC_015948	CGTC	2	8	2348814	2348821	0 %	25 %	25 %	50 %	344212683
58060	NC_015948	AT	3	6	2348888	2348893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58061	NC_015948	CGG	2	6	2348941	2348946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58062	NC_015948	TCG	2	6	2349008	2349013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212684
58063	NC_015948	TCG	2	6	2349073	2349078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212684
58064	NC_015948	GCC	2	6	2349096	2349101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212684
58065	NC_015948	GGA	2	6	2349170	2349175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212684
58066	NC_015948	TTC	2	6	2349181	2349186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212684
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58069	NC_015948	CGT	2	6	2349356	2349361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212684
58070	NC_015948	GCC	3	9	2349370	2349378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212684
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58074	NC_015948	GTG	3	9	2349633	2349641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212684
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58079	NC_015948	CGT	3	9	2349791	2349799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212684
58080	NC_015948	GATCG	2	10	2349918	2349927	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58081	NC_015948	TCG	2	6	2349946	2349951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58082	NC_015948	CGT	2	6	2349997	2350002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58083	NC_015948	CA	3	6	2350043	2350048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58084	NC_015948	CA	3	6	2350079	2350084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58085	NC_015948	CTG	2	6	2350141	2350146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212685
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58088	NC_015948	GGT	2	6	2350268	2350273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212685
58089	NC_015948	CTG	2	6	2350311	2350316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212685
58090	NC_015948	CGT	2	6	2350355	2350360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212685
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58098	NC_015948	GGGA	2	8	2350805	2350812	25 %	0 %	75 %	0 %	344212685
58099	NC_015948	GTC	2	6	2350852	2350857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212686
58100	NC_015948	TCGG	2	8	2350910	2350917	0 %	25 %	50 %	25 %	344212686
58101	NC_015948	CCG	2	6	2350930	2350935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212686
58102	NC_015948	GTC	2	6	2350936	2350941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212686
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58105	NC_015948	TCGT	2	8	2350996	2351003	0 %	50 %	25 %	25 %	344212686
58106	NC_015948	CGC	2	6	2351025	2351030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212686
58107	NC_015948	TCG	2	6	2351039	2351044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212686
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58111	NC_015948	GCG	2	6	2351224	2351229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212687
58112	NC_015948	CGA	2	6	2351232	2351237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212687
58113	NC_015948	GGTC	2	8	2351343	2351350	0 %	25 %	50 %	25 %	344212687
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58115	NC_015948	CGT	2	6	2351523	2351528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212687
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58228	NC_015948	GGA	2	6	2356111	2356116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212692
58229	NC_015948	CAGT	2	8	2356176	2356183	25 %	25 %	25 %	25 %	344212692
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58348	NC_015948	CGA	2	6	2360395	2360400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212698
58349	NC_015948	TC	3	6	2360404	2360409	0 %	50 %	0 %	50 %	344212698
58350	NC_015948	GAC	2	6	2360416	2360421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212698
58351	NC_015948	CTG	2	6	2360423	2360428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212698
58352	NC_015948	CGA	2	6	2360431	2360436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212698
58353	NC_015948	CGA	2	6	2360455	2360460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212698
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58424	NC_015948	CT	3	6	2363368	2363373	0 %	50 %	0 %	50 %	344212702
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58441	NC_015948	GCG	3	9	2364104	2364112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212703
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58443	NC_015948	CGA	2	6	2364150	2364155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212703
58444	NC_015948	TCA	2	6	2364182	2364187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212703
58445	NC_015948	CGCT	2	8	2364205	2364212	0 %	25 %	25 %	50 %	344212703
58446	NC_015948	CGA	2	6	2364228	2364233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212703
58447	NC_015948	GGACC	2	10	2364240	2364249	20 %	0 %	40 %	40 %	344212703
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58449	NC_015948	ACG	2	6	2364278	2364283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212703
58450	NC_015948	GCC	2	6	2364318	2364323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212703
58451	NC_015948	CGT	2	6	2364339	2364344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212703
58452	NC_015948	CGA	2	6	2364366	2364371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212703
58453	NC_015948	GCC	2	6	2364481	2364486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212703
58454	NC_015948	CGA	2	6	2364489	2364494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212703
58455	NC_015948	GGT	2	6	2364504	2364509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212703
58456	NC_015948	CGA	2	6	2364534	2364539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212703
58457	NC_015948	CTG	2	6	2364541	2364546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212703
58458	NC_015948	GCC	2	6	2364572	2364577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212703
58459	NC_015948	CGT	2	6	2364597	2364602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212703
58460	NC_015948	GGC	2	6	2364613	2364618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212703
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