MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_015948	CGT	2	6	2327203	2327208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212665
57502	NC_015948	GGAC	2	8	2327210	2327217	25 %	0 %	50 %	25 %	344212665
57503	NC_015948	CCA	2	6	2327384	2327389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212666
57504	NC_015948	TCG	2	6	2327422	2327427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212666
57505	NC_015948	GCG	2	6	2327428	2327433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212666
57506	NC_015948	CCTC	2	8	2327440	2327447	0 %	25 %	0 %	75 %	344212666
57507	NC_015948	GCG	2	6	2327454	2327459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212666
57508	NC_015948	CGT	2	6	2327519	2327524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212666
57509	NC_015948	GGC	2	6	2327577	2327582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212666
57510	NC_015948	GAC	2	6	2327649	2327654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212666
57511	NC_015948	CGGT	2	8	2327658	2327665	0 %	25 %	50 %	25 %	344212666
57512	NC_015948	CTC	2	6	2327799	2327804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212666
57513	NC_015948	CGA	2	6	2327849	2327854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212666
57514	NC_015948	CGA	2	6	2327890	2327895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212666
57515	NC_015948	CGG	2	6	2327934	2327939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212666
57516	NC_015948	GAT	2	6	2328023	2328028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212666
57517	NC_015948	CGG	2	6	2328236	2328241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212666
57518	NC_015948	CGT	2	6	2328277	2328282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212666
57519	NC_015948	TCG	2	6	2328415	2328420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212666
57520	NC_015948	ACGA	2	8	2328426	2328433	50 %	0 %	25 %	25 %	344212666
57521	NC_015948	ACCT	2	8	2328456	2328463	25 %	25 %	0 %	50 %	344212666
57522	NC_015948	TGT	2	6	2328478	2328483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344212666
57523	NC_015948	GTC	2	6	2328489	2328494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212666
57524	NC_015948	GAC	2	6	2328525	2328530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212666
57525	NC_015948	CCGG	2	8	2328607	2328614	0 %	0 %	50 %	50 %	344212666
57526	NC_015948	TCC	2	6	2328619	2328624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212666
57527	NC_015948	ACC	2	6	2328637	2328642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212666
57528	NC_015948	CGA	2	6	2328674	2328679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212666
57529	NC_015948	GAT	2	6	2328698	2328703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212666
57530	NC_015948	TCA	2	6	2328709	2328714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212666
57531	NC_015948	GACC	2	8	2328744	2328751	25 %	0 %	25 %	50 %	344212666
57532	NC_015948	GTG	2	6	2328819	2328824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212666
57533	NC_015948	CGGTC	2	10	2328841	2328850	0 %	20 %	40 %	40 %	344212666
57534	NC_015948	CCG	2	6	2328859	2328864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212666
57535	NC_015948	CTCGAC	2	12	2328876	2328887	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344212666
57536	NC_015948	C	6	6	2328896	2328901	0 %	0 %	0 %	100 %	344212666
57537	NC_015948	CCGCG	2	10	2328947	2328956	0 %	0 %	40 %	60 %	344212666
57538	NC_015948	GA	3	6	2328964	2328969	50 %	0 %	50 %	0 %	344212666
57539	NC_015948	CGG	2	6	2328975	2328980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57540	NC_015948	GT	3	6	2329026	2329031	0 %	50 %	50 %	0 %	344212667
57541	NC_015948	AC	3	6	2329036	2329041	50 %	0 %	0 %	50 %	344212667
57542	NC_015948	CGC	2	6	2329042	2329047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212667
57543	NC_015948	CGG	2	6	2329086	2329091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212667
57544	NC_015948	TCG	2	6	2329137	2329142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212667
57545	NC_015948	TTCG	2	8	2329157	2329164	0 %	50 %	25 %	25 %	344212667
57546	NC_015948	GCTC	2	8	2329218	2329225	0 %	25 %	25 %	50 %	344212667
57547	NC_015948	CTCGC	2	10	2329283	2329292	0 %	20 %	20 %	60 %	344212667
57548	NC_015948	GGGT	2	8	2329301	2329308	0 %	25 %	75 %	0 %	344212667
57549	NC_015948	GGC	2	6	2329324	2329329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212667
57550	NC_015948	GCT	2	6	2329330	2329335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212667
57551	NC_015948	CTC	2	6	2329370	2329375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212667
57552	NC_015948	ATC	2	6	2329406	2329411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212667
57553	NC_015948	TCC	2	6	2329416	2329421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212667
57554	NC_015948	CGT	2	6	2329423	2329428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212667
57555	NC_015948	CCG	2	6	2329496	2329501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212667
57556	NC_015948	TAC	2	6	2329514	2329519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212667
57557	NC_015948	TCG	2	6	2329536	2329541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212667
57558	NC_015948	CCG	2	6	2329586	2329591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212667
57559	NC_015948	AGACG	2	10	2329603	2329612	40 %	0 %	40 %	20 %	344212667
57560	NC_015948	CGG	2	6	2329674	2329679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212667
57561	NC_015948	CGA	2	6	2329711	2329716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
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57563	NC_015948	CGT	2	6	2329753	2329758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212667
57564	NC_015948	GCCG	2	8	2329765	2329772	0 %	0 %	50 %	50 %	344212667
57565	NC_015948	CGA	2	6	2329807	2329812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
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57567	NC_015948	GGT	2	6	2329831	2329836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212667
57568	NC_015948	CGA	2	6	2329843	2329848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
57569	NC_015948	TCG	2	6	2329860	2329865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212667
57570	NC_015948	GTC	2	6	2329952	2329957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212667
57571	NC_015948	GAC	2	6	2329963	2329968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
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57574	NC_015948	CGA	2	6	2330029	2330034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
57575	NC_015948	CGT	2	6	2330083	2330088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212667
57576	NC_015948	CGA	2	6	2330101	2330106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
57577	NC_015948	TCGACG	2	12	2330109	2330120	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344212667
57578	NC_015948	AAGCG	2	10	2330141	2330150	40 %	0 %	40 %	20 %	344212667
57579	NC_015948	ACG	2	6	2330160	2330165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
57580	NC_015948	CGG	2	6	2330170	2330175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212667
57581	NC_015948	CAGT	2	8	2330190	2330197	25 %	25 %	25 %	25 %	344212667
57582	NC_015948	CGG	2	6	2330242	2330247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212667
57583	NC_015948	CG	3	6	2330270	2330275	0 %	0 %	50 %	50 %	344212667
57584	NC_015948	CCG	2	6	2330292	2330297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212667
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57587	NC_015948	TGAG	2	8	2330395	2330402	25 %	25 %	50 %	0 %	344212667
57588	NC_015948	CTG	2	6	2330445	2330450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57589	NC_015948	CCA	2	6	2330507	2330512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57590	NC_015948	AGA	2	6	2330518	2330523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212668
57591	NC_015948	GTC	2	6	2330582	2330587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212668
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57598	NC_015948	ATCT	2	8	2330948	2330955	25 %	50 %	0 %	25 %	344212668
57599	NC_015948	GC	3	6	2330986	2330991	0 %	0 %	50 %	50 %	344212668
57600	NC_015948	CCT	2	6	2330998	2331003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212668
57601	NC_015948	CGG	2	6	2331007	2331012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212668
57602	NC_015948	TG	3	6	2331021	2331026	0 %	50 %	50 %	0 %	344212668
57603	NC_015948	ACG	2	6	2331066	2331071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212668
57604	NC_015948	CGT	3	9	2331121	2331129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212668
57605	NC_015948	CCA	2	6	2331155	2331160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212668
57606	NC_015948	GCG	2	6	2331170	2331175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212668
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57608	NC_015948	GTC	2	6	2331233	2331238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212668
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