MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_015948	GAC	3	9	2306523	2306531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212645
57002	NC_015948	TGC	2	6	2306555	2306560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212645
57003	NC_015948	CGGT	2	8	2306575	2306582	0 %	25 %	50 %	25 %	344212645
57004	NC_015948	TAC	2	6	2306667	2306672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212645
57005	NC_015948	AG	3	6	2306719	2306724	50 %	0 %	50 %	0 %	344212645
57006	NC_015948	GGC	2	6	2306731	2306736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57007	NC_015948	TAT	2	6	2306804	2306809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57008	NC_015948	GGT	2	6	2306860	2306865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57009	NC_015948	TTCG	2	8	2306898	2306905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57010	NC_015948	AC	4	8	2306985	2306992	50 %	0 %	0 %	50 %	344212646
57011	NC_015948	GAC	2	6	2307018	2307023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
57012	NC_015948	GCTC	2	8	2307068	2307075	0 %	25 %	25 %	50 %	344212646
57013	NC_015948	CGA	3	9	2307081	2307089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
57014	NC_015948	TCG	3	9	2307122	2307130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212646
57015	NC_015948	CGA	2	6	2307135	2307140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
57016	NC_015948	GC	3	6	2307162	2307167	0 %	0 %	50 %	50 %	344212646
57017	NC_015948	CGA	3	9	2307212	2307220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
57018	NC_015948	ATG	2	6	2307223	2307228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212646
57019	NC_015948	CGA	2	6	2307245	2307250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
57020	NC_015948	CT	3	6	2307289	2307294	0 %	50 %	0 %	50 %	344212646
57021	NC_015948	AAC	2	6	2307299	2307304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344212646
57022	NC_015948	AGA	2	6	2307308	2307313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212646
57023	NC_015948	CCG	2	6	2307459	2307464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212646
57024	NC_015948	CG	3	6	2307463	2307468	0 %	0 %	50 %	50 %	344212646
57025	NC_015948	CGC	3	9	2307528	2307536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212646
57026	NC_015948	CGCT	2	8	2307556	2307563	0 %	25 %	25 %	50 %	344212646
57027	NC_015948	CGA	2	6	2307564	2307569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
57028	NC_015948	CGT	2	6	2307624	2307629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212646
57029	NC_015948	CTCG	2	8	2307639	2307646	0 %	25 %	25 %	50 %	344212646
57030	NC_015948	CCT	2	6	2307689	2307694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212646
57031	NC_015948	CGCC	2	8	2307726	2307733	0 %	0 %	25 %	75 %	344212646
57032	NC_015948	CTC	2	6	2307736	2307741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212646
57033	NC_015948	CGC	4	12	2307792	2307803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212646
57034	NC_015948	GCC	2	6	2307814	2307819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212646
57035	NC_015948	CTG	2	6	2307820	2307825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212646
57036	NC_015948	GAC	2	6	2307837	2307842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
57037	NC_015948	CTG	2	6	2307907	2307912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212646
57038	NC_015948	TGAT	2	8	2307982	2307989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57039	NC_015948	CGGC	2	8	2308045	2308052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57040	NC_015948	CTCG	2	8	2308078	2308085	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57041	NC_015948	GCC	2	6	2308126	2308131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57042	NC_015948	CCA	2	6	2308314	2308319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57043	NC_015948	AC	3	6	2308327	2308332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57044	NC_015948	CCGA	2	8	2308346	2308353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57045	NC_015948	GTC	2	6	2308370	2308375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57046	NC_015948	CTG	2	6	2308380	2308385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57047	NC_015948	GAC	2	6	2308399	2308404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212647
57048	NC_015948	AC	3	6	2308403	2308408	50 %	0 %	0 %	50 %	344212647
57049	NC_015948	CGA	2	6	2308447	2308452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212647
57050	NC_015948	TGG	2	6	2308464	2308469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212647
57051	NC_015948	GAT	2	6	2308489	2308494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212647
57052	NC_015948	GAC	2	6	2308505	2308510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212647
57053	NC_015948	GCG	2	6	2308541	2308546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212647
57054	NC_015948	ACG	2	6	2308587	2308592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212647
57055	NC_015948	CGG	2	6	2308636	2308641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212647
57056	NC_015948	GACGC	2	10	2308664	2308673	20 %	0 %	40 %	40 %	344212647
57057	NC_015948	GGA	2	6	2308681	2308686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212647
57058	NC_015948	AACC	2	8	2308720	2308727	50 %	0 %	0 %	50 %	344212647
57059	NC_015948	GACC	2	8	2308732	2308739	25 %	0 %	25 %	50 %	344212647
57060	NC_015948	GC	4	8	2308747	2308754	0 %	0 %	50 %	50 %	344212647
57061	NC_015948	GCG	2	6	2308788	2308793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212647
57062	NC_015948	GCC	2	6	2308819	2308824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212647
57063	NC_015948	GCC	3	9	2308881	2308889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212647
57064	NC_015948	GGA	2	6	2308933	2308938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212647
57065	NC_015948	CGA	2	6	2308993	2308998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212647
57066	NC_015948	CGGGAC	2	12	2309098	2309109	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344212647
57067	NC_015948	GAC	3	9	2309107	2309115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212647
57068	NC_015948	CCGG	2	8	2309133	2309140	0 %	0 %	50 %	50 %	344212647
57069	NC_015948	TCGG	2	8	2309144	2309151	0 %	25 %	50 %	25 %	344212647
57070	NC_015948	CTG	2	6	2309171	2309176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212647
57071	NC_015948	GCC	2	6	2309201	2309206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212647
57072	NC_015948	ACC	2	6	2309247	2309252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212647
57073	NC_015948	GTGG	2	8	2309257	2309264	0 %	25 %	75 %	0 %	344212647
57074	NC_015948	AAC	2	6	2309265	2309270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344212647
57075	NC_015948	ACG	2	6	2309375	2309380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212647
57076	NC_015948	TG	3	6	2309434	2309439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57077	NC_015948	CGC	2	6	2309485	2309490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212648
57078	NC_015948	GAC	2	6	2309495	2309500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212648
57079	NC_015948	GCCG	2	8	2309512	2309519	0 %	0 %	50 %	50 %	344212648
57080	NC_015948	GGAT	2	8	2309550	2309557	25 %	25 %	50 %	0 %	344212648
57081	NC_015948	CGA	2	6	2309563	2309568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212648
57082	NC_015948	ACG	2	6	2309592	2309597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212648
57083	NC_015948	GCC	2	6	2309648	2309653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212648
57084	NC_015948	GCC	2	6	2309664	2309669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212648
57085	NC_015948	ACG	2	6	2309697	2309702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212648
57086	NC_015948	GCCG	2	8	2309759	2309766	0 %	0 %	50 %	50 %	344212648
57087	NC_015948	GTC	3	9	2309801	2309809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212648
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57089	NC_015948	GAC	2	6	2309921	2309926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212648
57090	NC_015948	GTC	2	6	2310006	2310011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212648
57091	NC_015948	GCC	2	6	2310156	2310161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57092	NC_015948	TCC	2	6	2310175	2310180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57093	NC_015948	TGAC	2	8	2310234	2310241	25 %	25 %	25 %	25 %	344212649
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57099	NC_015948	TCG	3	9	2310425	2310433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212649
57100	NC_015948	TCGGT	2	10	2310462	2310471	0 %	40 %	40 %	20 %	344212649
57101	NC_015948	ACG	2	6	2310479	2310484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212649
57102	NC_015948	CGT	2	6	2310490	2310495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212649
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57105	NC_015948	CAG	2	6	2310641	2310646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212649
57106	NC_015948	GAT	2	6	2310695	2310700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212650
57107	NC_015948	TTC	2	6	2310704	2310709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212650
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57109	NC_015948	CG	3	6	2310905	2310910	0 %	0 %	50 %	50 %	344212650
57110	NC_015948	CGA	2	6	2310913	2310918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212650
57111	NC_015948	CGA	2	6	2310946	2310951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212650
57112	NC_015948	TCG	2	6	2310960	2310965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212650
57113	NC_015948	GCC	2	6	2310995	2311000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212650
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57115	NC_015948	CGA	2	6	2311120	2311125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212650
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57232	NC_015948	CGG	2	6	2316098	2316103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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57348	NC_015948	CCG	2	6	2320475	2320480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212659
57349	NC_015948	GAC	2	6	2320518	2320523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212659
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57398	NC_015948	GATCTG	2	12	2322720	2322731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57399	NC_015948	GAC	2	6	2322733	2322738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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57401	NC_015948	T	6	6	2322855	2322860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57402	NC_015948	GA	3	6	2322895	2322900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57403	NC_015948	GA	3	6	2322989	2322994	50 %	0 %	50 %	0 %	344212663
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57433	NC_015948	GCT	2	6	2324241	2324246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212664
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57443	NC_015948	GGT	2	6	2324628	2324633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212664
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57451	NC_015948	CT	3	6	2324995	2325000	0 %	50 %	0 %	50 %	344212664
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57458	NC_015948	CGG	2	6	2325227	2325232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212664
57459	NC_015948	AGCA	2	8	2325242	2325249	50 %	0 %	25 %	25 %	344212664
57460	NC_015948	TGACC	2	10	2325288	2325297	20 %	20 %	20 %	40 %	344212664
57461	NC_015948	GGC	2	6	2325336	2325341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212664
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57463	NC_015948	TCG	2	6	2325389	2325394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212664
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57465	NC_015948	GAG	2	6	2325433	2325438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212664
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57492	NC_015948	CGA	2	6	2326791	2326796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212665
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