MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 74493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_015948	CCG	2	6	2285933	2285938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212626
56502	NC_015948	CG	3	6	2285985	2285990	0 %	0 %	50 %	50 %	344212626
56503	NC_015948	CCGTCG	2	12	2286002	2286013	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344212626
56504	NC_015948	GCC	2	6	2286017	2286022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212626
56505	NC_015948	ACG	2	6	2286068	2286073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212626
56506	NC_015948	TCG	2	6	2286137	2286142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212626
56507	NC_015948	G	6	6	2286151	2286156	0 %	0 %	100 %	0 %	344212626
56508	NC_015948	CCG	2	6	2286167	2286172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212626
56509	NC_015948	GTC	2	6	2286178	2286183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212626
56510	NC_015948	GAC	2	6	2286184	2286189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212626
56511	NC_015948	CGGA	2	8	2286199	2286206	25 %	0 %	50 %	25 %	344212626
56512	NC_015948	CCGA	2	8	2286221	2286228	25 %	0 %	25 %	50 %	344212626
56513	NC_015948	ACCGTC	2	12	2286295	2286306	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344212626
56514	NC_015948	CGC	2	6	2286432	2286437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212626
56515	NC_015948	AGGC	2	8	2286481	2286488	25 %	0 %	50 %	25 %	344212626
56516	NC_015948	CG	3	6	2286590	2286595	0 %	0 %	50 %	50 %	344212626
56517	NC_015948	CCCGGT	2	12	2286609	2286620	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344212626
56518	NC_015948	CCGG	2	8	2286625	2286632	0 %	0 %	50 %	50 %	344212626
56519	NC_015948	CG	3	6	2286703	2286708	0 %	0 %	50 %	50 %	344212626
56520	NC_015948	TGG	2	6	2286731	2286736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212626
56521	NC_015948	CGC	2	6	2286774	2286779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212626
56522	NC_015948	CGT	2	6	2286786	2286791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212626
56523	NC_015948	CGAA	2	8	2286857	2286864	50 %	0 %	25 %	25 %	344212626
56524	NC_015948	CGCT	2	8	2286890	2286897	0 %	25 %	25 %	50 %	344212626
56525	NC_015948	GAG	2	6	2286940	2286945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212626
56526	NC_015948	GAC	3	9	2286948	2286956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212626
56527	NC_015948	CTGG	2	8	2286960	2286967	0 %	25 %	50 %	25 %	344212626
56528	NC_015948	AC	3	6	2287040	2287045	50 %	0 %	0 %	50 %	344212626
56529	NC_015948	CGG	2	6	2287046	2287051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212626
56530	NC_015948	GCGCTG	2	12	2287057	2287068	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344212626
56531	NC_015948	CGG	2	6	2287220	2287225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212626
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56533	NC_015948	GAA	2	6	2287299	2287304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212626
56534	NC_015948	CCG	2	6	2287348	2287353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212626
56535	NC_015948	TGG	2	6	2287384	2287389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212626
56536	NC_015948	CCG	2	6	2287441	2287446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212626
56537	NC_015948	ACC	2	6	2287465	2287470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212626
56538	NC_015948	GAC	3	9	2287507	2287515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212626
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56541	NC_015948	CG	3	6	2287598	2287603	0 %	0 %	50 %	50 %	344212626
56542	NC_015948	CCG	2	6	2287625	2287630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212626
56543	NC_015948	GGA	2	6	2287632	2287637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212626
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56545	NC_015948	GAG	2	6	2287761	2287766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212627
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56548	NC_015948	ACCC	2	8	2287926	2287933	25 %	0 %	0 %	75 %	344212627
56549	NC_015948	CCGG	2	8	2287937	2287944	0 %	0 %	50 %	50 %	344212627
56550	NC_015948	TCC	2	6	2287978	2287983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212627
56551	NC_015948	GAC	2	6	2287994	2287999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212627
56552	NC_015948	CGA	3	9	2288036	2288044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212627
56553	NC_015948	CAG	2	6	2288064	2288069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212627
56554	NC_015948	CCT	2	6	2288111	2288116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212627
56555	NC_015948	AGC	2	6	2288210	2288215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212628
56556	NC_015948	CGA	2	6	2288242	2288247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212628
56557	NC_015948	GACC	2	8	2288299	2288306	25 %	0 %	25 %	50 %	344212628
56558	NC_015948	CGG	2	6	2288319	2288324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212628
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56563	NC_015948	ACG	2	6	2288496	2288501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212628
56564	NC_015948	CGA	2	6	2288512	2288517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212628
56565	NC_015948	CGG	2	6	2288602	2288607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212628
56566	NC_015948	TCGC	2	8	2288619	2288626	0 %	25 %	25 %	50 %	344212628
56567	NC_015948	CGGC	2	8	2288688	2288695	0 %	0 %	50 %	50 %	344212628
56568	NC_015948	CTG	2	6	2288744	2288749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212628
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56570	NC_015948	GGA	2	6	2288764	2288769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212628
56571	NC_015948	GTC	2	6	2288780	2288785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212628
56572	NC_015948	GAC	2	6	2288786	2288791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212628
56573	NC_015948	CTGG	2	8	2288821	2288828	0 %	25 %	50 %	25 %	344212628
56574	NC_015948	CCG	2	6	2288852	2288857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212628
56575	NC_015948	GAC	2	6	2288863	2288868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212628
56576	NC_015948	CGA	2	6	2288884	2288889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212628
56577	NC_015948	TTA	2	6	2289053	2289058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56578	NC_015948	GCC	2	6	2289096	2289101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212629
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56580	NC_015948	CTG	2	6	2289150	2289155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212629
56581	NC_015948	TTC	2	6	2289175	2289180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212629
56582	NC_015948	CTC	2	6	2289186	2289191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212629
56583	NC_015948	GCGA	2	8	2289235	2289242	25 %	0 %	50 %	25 %	344212629
56584	NC_015948	ACCCGG	2	12	2289295	2289306	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344212629
56585	NC_015948	CAAC	2	8	2289332	2289339	50 %	0 %	0 %	50 %	344212629
56586	NC_015948	TCG	2	6	2289340	2289345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212629
56587	NC_015948	CGT	2	6	2289364	2289369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212629
56588	NC_015948	CGC	2	6	2289390	2289395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212629
56589	NC_015948	CTGGAT	2	12	2289423	2289434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344212629
56590	NC_015948	CGA	2	6	2289455	2289460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212629
56591	NC_015948	GTC	2	6	2289477	2289482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212629
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56593	NC_015948	ACC	2	6	2289550	2289555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212629
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56595	NC_015948	AC	3	6	2289664	2289669	50 %	0 %	0 %	50 %	344212629
56596	NC_015948	TATCGA	2	12	2289683	2289694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344212629
56597	NC_015948	GATGG	2	10	2289822	2289831	20 %	20 %	60 %	0 %	344212629
56598	NC_015948	GGC	2	6	2289980	2289985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212629
56599	NC_015948	CGG	2	6	2290015	2290020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212629
56600	NC_015948	TCG	2	6	2290021	2290026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212629
56601	NC_015948	GAA	2	6	2290037	2290042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212629
56602	NC_015948	GAC	2	6	2290074	2290079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212629
56603	NC_015948	CGT	2	6	2290109	2290114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212629
56604	NC_015948	CGA	2	6	2290115	2290120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212629
56605	NC_015948	GCG	2	6	2290138	2290143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212629
56606	NC_015948	GCG	2	6	2290159	2290164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212629
56607	NC_015948	GGCC	2	8	2290187	2290194	0 %	0 %	50 %	50 %	344212629
56608	NC_015948	CGATG	2	10	2290244	2290253	20 %	20 %	40 %	20 %	344212629
56609	NC_015948	GCG	2	6	2290255	2290260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212629
56610	NC_015948	GAC	2	6	2290374	2290379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212630
56611	NC_015948	ACG	2	6	2290381	2290386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212630
56612	NC_015948	CG	3	6	2290391	2290396	0 %	0 %	50 %	50 %	344212630
56613	NC_015948	CGG	2	6	2290407	2290412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212630
56614	NC_015948	CGT	2	6	2290424	2290429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212630
56615	NC_015948	GCATCG	2	12	2290435	2290446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344212630
56616	NC_015948	CGACC	2	10	2290460	2290469	20 %	0 %	20 %	60 %	344212630
56617	NC_015948	ACG	2	6	2290492	2290497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212630
56618	NC_015948	CGT	2	6	2290529	2290534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212630
56619	NC_015948	GTC	2	6	2290575	2290580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212630
56620	NC_015948	CGA	2	6	2290630	2290635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212630
56621	NC_015948	AGG	2	6	2290637	2290642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212630
56622	NC_015948	CGG	2	6	2290669	2290674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212630
56623	NC_015948	CGA	2	6	2290727	2290732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212630
56624	NC_015948	TCG	2	6	2290735	2290740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212630
56625	NC_015948	GAC	2	6	2290773	2290778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212630
56626	NC_015948	CGCT	2	8	2290788	2290795	0 %	25 %	25 %	50 %	344212630
56627	NC_015948	CTA	2	6	2290826	2290831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212630
56628	NC_015948	GGA	2	6	2290913	2290918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212630
56629	NC_015948	GC	3	6	2290919	2290924	0 %	0 %	50 %	50 %	344212630
56630	NC_015948	TC	3	6	2291000	2291005	0 %	50 %	0 %	50 %	344212630
56631	NC_015948	GTC	2	6	2291016	2291021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212630
56632	NC_015948	GC	3	6	2291024	2291029	0 %	0 %	50 %	50 %	344212630
56633	NC_015948	CGC	2	6	2291033	2291038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212630
56634	NC_015948	CG	3	6	2291073	2291078	0 %	0 %	50 %	50 %	344212630
56635	NC_015948	ACG	2	6	2291131	2291136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212630
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56637	NC_015948	GAC	2	6	2291241	2291246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212630
56638	NC_015948	GGC	2	6	2291249	2291254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212630
56639	NC_015948	GC	3	6	2291282	2291287	0 %	0 %	50 %	50 %	344212630
56640	NC_015948	CGCA	2	8	2291297	2291304	25 %	0 %	25 %	50 %	344212630
56641	NC_015948	GC	3	6	2291305	2291310	0 %	0 %	50 %	50 %	344212630
56642	NC_015948	CGGT	2	8	2291375	2291382	0 %	25 %	50 %	25 %	344212630
56643	NC_015948	TAGC	2	8	2291424	2291431	25 %	25 %	25 %	25 %	344212630
56644	NC_015948	TTCC	2	8	2291436	2291443	0 %	50 %	0 %	50 %	344212631
56645	NC_015948	CCGT	2	8	2291538	2291545	0 %	25 %	25 %	50 %	344212631
56646	NC_015948	GGC	2	6	2291634	2291639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56647	NC_015948	GTT	2	6	2291650	2291655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56648	NC_015948	TCG	2	6	2291686	2291691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212632
56649	NC_015948	GTC	2	6	2291744	2291749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212632
56650	NC_015948	CAC	2	6	2291754	2291759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212632
56651	NC_015948	CGA	2	6	2291778	2291783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212632
56652	NC_015948	CTG	2	6	2291867	2291872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212632
56653	NC_015948	GAC	2	6	2291929	2291934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212632
56654	NC_015948	CGCGTT	2	12	2291941	2291952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212632
56655	NC_015948	GTT	2	6	2291962	2291967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344212632
56656	NC_015948	TCG	2	6	2291970	2291975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212632
56657	NC_015948	GCG	2	6	2292000	2292005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212632
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56659	NC_015948	CGGCC	2	10	2292053	2292062	0 %	0 %	40 %	60 %	344212632
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56661	NC_015948	GC	3	6	2292108	2292113	0 %	0 %	50 %	50 %	344212632
56662	NC_015948	TCGT	2	8	2292125	2292132	0 %	50 %	25 %	25 %	344212632
56663	NC_015948	TCG	2	6	2292138	2292143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212632
56664	NC_015948	CGC	2	6	2292178	2292183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212632
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56666	NC_015948	CGGCG	2	10	2292265	2292274	0 %	0 %	60 %	40 %	344212632
56667	NC_015948	CG	3	6	2292273	2292278	0 %	0 %	50 %	50 %	344212632
56668	NC_015948	CAT	2	6	2292289	2292294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212632
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56671	NC_015948	GGC	2	6	2292505	2292510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212632
56672	NC_015948	TG	3	6	2292521	2292526	0 %	50 %	50 %	0 %	344212632
56673	NC_015948	CGT	3	9	2292574	2292582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212632
56674	NC_015948	CGG	2	6	2292609	2292614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212632
56675	NC_015948	GCTCG	2	10	2292628	2292637	0 %	20 %	40 %	40 %	344212632
56676	NC_015948	CG	3	6	2292653	2292658	0 %	0 %	50 %	50 %	344212632
56677	NC_015948	ATG	2	6	2292686	2292691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212632
56678	NC_015948	GC	3	6	2292711	2292716	0 %	0 %	50 %	50 %	344212632
56679	NC_015948	TCG	2	6	2292717	2292722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212632
56680	NC_015948	TCG	2	6	2292786	2292791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212632
56681	NC_015948	GCTG	2	8	2292906	2292913	0 %	25 %	50 %	25 %	344212633
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56683	NC_015948	GCTC	2	8	2292932	2292939	0 %	25 %	25 %	50 %	344212633
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56685	NC_015948	GCG	2	6	2292965	2292970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212633
56686	NC_015948	CGG	2	6	2293016	2293021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212633
56687	NC_015948	TCG	2	6	2293052	2293057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212633
56688	NC_015948	CGA	2	6	2293062	2293067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212633
56689	NC_015948	CGC	2	6	2293071	2293076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212633
56690	NC_015948	AGACG	2	10	2293083	2293092	40 %	0 %	40 %	20 %	344212633
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56692	NC_015948	CGTCC	2	10	2293164	2293173	0 %	20 %	20 %	60 %	344212633
56693	NC_015948	CG	4	8	2293182	2293189	0 %	0 %	50 %	50 %	344212633
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56702	NC_015948	GGCGA	2	10	2293542	2293551	20 %	0 %	60 %	20 %	344212634
56703	NC_015948	ACC	2	6	2293573	2293578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212634
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56710	NC_015948	GAC	2	6	2293719	2293724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212634
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56712	NC_015948	CTT	2	6	2293907	2293912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212634
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56714	NC_015948	GAC	3	9	2294025	2294033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212634
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56716	NC_015948	CGA	2	6	2294051	2294056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212634
56717	NC_015948	GGC	2	6	2294163	2294168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212635
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56719	NC_015948	CCG	2	6	2294312	2294317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212635
56720	NC_015948	CAC	2	6	2294328	2294333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212635
56721	NC_015948	GAC	2	6	2294368	2294373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212635
56722	NC_015948	GCCG	2	8	2294391	2294398	0 %	0 %	50 %	50 %	344212635
56723	NC_015948	TC	3	6	2294436	2294441	0 %	50 %	0 %	50 %	344212635
56724	NC_015948	GGA	2	6	2294442	2294447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212635
56725	NC_015948	GCGG	2	8	2294478	2294485	0 %	0 %	75 %	25 %	344212635
56726	NC_015948	CGA	2	6	2294490	2294495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212635
56727	NC_015948	CTC	2	6	2294569	2294574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212635
56728	NC_015948	GAC	2	6	2294580	2294585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212635
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56730	NC_015948	CGGTC	2	10	2294712	2294721	0 %	20 %	40 %	40 %	344212635
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56846	NC_015948	CGA	2	6	2299589	2299594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212640
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56850	NC_015948	TTA	2	6	2299873	2299878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56975	NC_015948	CGT	2	6	2305383	2305388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212644
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56983	NC_015948	GCG	2	6	2305697	2305702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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56988	NC_015948	CGG	2	6	2305931	2305936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212645
56989	NC_015948	TGA	2	6	2305937	2305942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212645
56990	NC_015948	GAC	2	6	2306001	2306006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212645
56991	NC_015948	CTGAA	2	10	2306008	2306017	40 %	20 %	20 %	20 %	344212645
56992	NC_015948	ACAGAG	2	12	2306028	2306039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	344212645
56993	NC_015948	CGA	2	6	2306078	2306083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212645
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