MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 8941

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015944	GA	4	8	291714	291721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_015944	CCG	2	6	291872	291877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6503	NC_015944	GCA	2	6	291939	291944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210207
6504	NC_015944	CGG	2	6	291988	291993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210207
6505	NC_015944	CTC	2	6	292014	292019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210207
6506	NC_015944	CCT	2	6	292034	292039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210207
6507	NC_015944	CCG	3	9	292063	292071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210207
6508	NC_015944	AATC	2	8	292098	292105	50 %	25 %	0 %	25 %	344210207
6509	NC_015944	CT	4	8	292130	292137	0 %	50 %	0 %	50 %	344210207
6510	NC_015944	CGA	2	6	292156	292161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_015944	GCG	2	6	292180	292185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_015944	CTCG	2	8	292261	292268	0 %	25 %	25 %	50 %	344210208
6513	NC_015944	AG	3	6	292322	292327	50 %	0 %	50 %	0 %	344210208
6514	NC_015944	CGA	2	6	292363	292368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210208
6515	NC_015944	CCA	2	6	292402	292407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210208
6516	NC_015944	GGC	2	6	292428	292433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210208
6517	NC_015944	TC	3	6	292439	292444	0 %	50 %	0 %	50 %	344210208
6518	NC_015944	GACC	2	8	292494	292501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6519	NC_015944	TG	3	6	292504	292509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_015944	CGA	2	6	292518	292523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_015944	TCG	2	6	292579	292584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_015944	CGGA	2	8	292604	292611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6523	NC_015944	TCG	3	9	292654	292662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210209
6524	NC_015944	CGGCA	2	10	292694	292703	20 %	0 %	40 %	40 %	344210209
6525	NC_015944	CTC	2	6	292740	292745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210209
6526	NC_015944	GTG	2	6	292758	292763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210209
6527	NC_015944	TGGC	2	8	292791	292798	0 %	25 %	50 %	25 %	344210209
6528	NC_015944	GGA	2	6	292811	292816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210209
6529	NC_015944	GAC	2	6	292824	292829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210209
6530	NC_015944	CCA	2	6	292847	292852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210209
6531	NC_015944	CGG	2	6	292860	292865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210209
6532	NC_015944	GAG	2	6	292887	292892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210209
6533	NC_015944	TGATGG	2	12	292900	292911	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	344210209
6534	NC_015944	CGGA	2	8	292940	292947	25 %	0 %	50 %	25 %	344210209
6535	NC_015944	GTC	3	9	292959	292967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210209
6536	NC_015944	CTC	2	6	292989	292994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210209
6537	NC_015944	GAC	3	9	292995	293003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210209
6538	NC_015944	TCA	2	6	293056	293061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210209
6539	NC_015944	GTC	2	6	293067	293072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210209
6540	NC_015944	TCG	2	6	293092	293097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210209
6541	NC_015944	CGG	2	6	293126	293131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210209
6542	NC_015944	GAT	2	6	293162	293167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210209
6543	NC_015944	CCT	2	6	293170	293175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210209
6544	NC_015944	GACGCG	2	12	293241	293252	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344210209
6545	NC_015944	CGC	2	6	293253	293258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210209
6546	NC_015944	A	6	6	293296	293301	100 %	0 %	0 %	0 %	344210209
6547	NC_015944	TTC	2	6	293499	293504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_015944	CT	3	6	293588	293593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6549	NC_015944	GCG	2	6	293653	293658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210210
6550	NC_015944	GTC	2	6	293689	293694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210210
6551	NC_015944	ACCCG	2	10	293712	293721	20 %	0 %	20 %	60 %	344210210
6552	NC_015944	GTC	2	6	293797	293802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210210
6553	NC_015944	GTCGGC	2	12	293890	293901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344210210
6554	NC_015944	CGG	2	6	293907	293912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210210
6555	NC_015944	TCC	2	6	293951	293956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210210
6556	NC_015944	TGG	2	6	293994	293999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210210
6557	NC_015944	GAC	2	6	294096	294101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210210
6558	NC_015944	CGG	2	6	294162	294167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210210
6559	NC_015944	CGGC	2	8	294200	294207	0 %	0 %	50 %	50 %	344210210
6560	NC_015944	GCC	2	6	294217	294222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210210
6561	NC_015944	TCA	2	6	294278	294283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210210
6562	NC_015944	CGG	2	6	294287	294292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210210
6563	NC_015944	CGT	2	6	294336	294341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210210
6564	NC_015944	AGTCGT	2	12	294408	294419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344210210
6565	NC_015944	CAG	2	6	294454	294459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210210
6566	NC_015944	ACGC	2	8	294503	294510	25 %	0 %	25 %	50 %	344210210
6567	NC_015944	AGTTC	2	10	294530	294539	20 %	40 %	20 %	20 %	344210210
6568	NC_015944	GAT	2	6	294606	294611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210210
6569	NC_015944	CGT	2	6	294720	294725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_015944	CCG	2	6	294786	294791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210211
6571	NC_015944	CTA	2	6	294802	294807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210211
6572	NC_015944	TCA	2	6	294810	294815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210211
6573	NC_015944	CGG	2	6	294829	294834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210211
6574	NC_015944	CGA	2	6	294835	294840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210211
6575	NC_015944	CGA	2	6	294865	294870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210211
6576	NC_015944	ACT	2	6	294871	294876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210211
6577	NC_015944	ACC	2	6	294899	294904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210211
6578	NC_015944	ACT	2	6	294919	294924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210211
6579	NC_015944	ACCACG	2	12	295071	295082	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344210211
6580	NC_015944	ACG	2	6	295095	295100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210211
6581	NC_015944	AGTCGA	2	12	295143	295154	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344210211
6582	NC_015944	CAG	2	6	295202	295207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210211
6583	NC_015944	CAA	2	6	295213	295218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210211
6584	NC_015944	G	6	6	295233	295238	0 %	0 %	100 %	0 %	344210211
6585	NC_015944	CGC	2	6	295251	295256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210211
6586	NC_015944	CTA	3	9	295261	295269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210211
6587	NC_015944	GGCC	2	8	295291	295298	0 %	0 %	50 %	50 %	344210211
6588	NC_015944	CCGA	2	8	295352	295359	25 %	0 %	25 %	50 %	344210211
6589	NC_015944	GCT	2	6	295411	295416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210211
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6591	NC_015944	CTG	2	6	295490	295495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210211
6592	NC_015944	ACG	3	9	295520	295528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210211
6593	NC_015944	TGC	2	6	295572	295577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210211
6594	NC_015944	GCT	2	6	295603	295608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210211
6595	NC_015944	AAG	2	6	295652	295657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210211
6596	NC_015944	GACC	2	8	295684	295691	25 %	0 %	25 %	50 %	344210211
6597	NC_015944	GCC	2	6	295724	295729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210211
6598	NC_015944	CGA	2	6	295741	295746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210211
6599	NC_015944	GTC	2	6	295760	295765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210211
6600	NC_015944	GAC	2	6	295808	295813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210211
6601	NC_015944	GTC	2	6	295820	295825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210211
6602	NC_015944	CAT	2	6	295867	295872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210211
6603	NC_015944	CCG	2	6	295883	295888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210211
6604	NC_015944	CCT	2	6	295899	295904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210211
6605	NC_015944	GTGCG	2	10	295914	295923	0 %	20 %	60 %	20 %	344210211
6606	NC_015944	GGT	2	6	295945	295950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210211
6607	NC_015944	GGA	2	6	295990	295995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210211
6608	NC_015944	CTG	2	6	296015	296020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210211
6609	NC_015944	CGGT	2	8	296022	296029	0 %	25 %	50 %	25 %	344210211
6610	NC_015944	GCC	2	6	296086	296091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210211
6611	NC_015944	AGG	2	6	296255	296260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_015944	GTT	2	6	296471	296476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210212
6613	NC_015944	CA	3	6	296489	296494	50 %	0 %	0 %	50 %	344210212
6614	NC_015944	TCG	2	6	296510	296515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210212
6615	NC_015944	TGG	2	6	296563	296568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210212
6616	NC_015944	TCG	2	6	296585	296590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210212
6617	NC_015944	CAG	2	6	296605	296610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210212
6618	NC_015944	GCC	2	6	296619	296624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210212
6619	NC_015944	CGA	2	6	296676	296681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210212
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6621	NC_015944	GTG	2	6	296802	296807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210212
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6741	NC_015944	GAC	2	6	301840	301845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210215
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6744	NC_015944	G	6	6	302149	302154	0 %	0 %	100 %	0 %	344210215
6745	NC_015944	GA	3	6	302184	302189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6983	NC_015944	CCG	2	6	312373	312378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210224
6984	NC_015944	CGTCGG	2	12	312424	312435	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344210224
6985	NC_015944	CGC	2	6	312494	312499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210224
6986	NC_015944	GTC	3	9	312500	312508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210224
6987	NC_015944	CGT	2	6	312529	312534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210224
6988	NC_015944	CGC	2	6	312542	312547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210224
6989	NC_015944	CGA	3	9	312589	312597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210224
6990	NC_015944	CGT	2	6	312607	312612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210224
6991	NC_015944	GAC	2	6	312644	312649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210224
6992	NC_015944	CCGG	2	8	312711	312718	0 %	0 %	50 %	50 %	344210224
6993	NC_015944	CGA	2	6	312758	312763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210224
6994	NC_015944	CGCC	2	8	312814	312821	0 %	0 %	25 %	75 %	344210224
6995	NC_015944	CGA	2	6	312844	312849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210224
6996	NC_015944	TGA	2	6	312850	312855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210224
6997	NC_015944	CGT	2	6	312869	312874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210224
6998	NC_015944	CCA	2	6	312895	312900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6999	NC_015944	ACG	2	6	312906	312911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7000	NC_015944	CAT	2	6	313037	313042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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