MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 10408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015943	CTC	2	6	192061	192066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_015943	GCCA	2	8	192099	192106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_015943	TGC	2	6	192116	192121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_015943	GA	3	6	192127	192132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015943	AGA	3	9	192130	192138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_015943	TGA	2	6	192141	192146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209692
4007	NC_015943	GAC	2	6	192178	192183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209692
4008	NC_015943	CGA	2	6	192207	192212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209692
4009	NC_015943	TGG	2	6	192223	192228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209692
4010	NC_015943	CCG	2	6	192261	192266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209692
4011	NC_015943	GGA	2	6	192271	192276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209692
4012	NC_015943	TCG	2	6	192288	192293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209692
4013	NC_015943	TCGACG	2	12	192306	192317	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344209692
4014	NC_015943	ATG	2	6	192321	192326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209692
4015	NC_015943	CGT	2	6	192405	192410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_015943	CGA	2	6	192489	192494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_015943	GCT	2	6	192500	192505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_015943	GTC	2	6	192536	192541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_015943	GCC	2	6	192560	192565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_015943	GCAG	2	8	192570	192577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_015943	GTG	2	6	192639	192644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_015943	TAT	2	6	192698	192703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_015943	ATC	2	6	192704	192709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_015943	TCA	2	6	192726	192731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_015943	TCA	2	6	192747	192752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_015943	CTT	2	6	192757	192762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_015943	TCT	2	6	192813	192818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_015943	CGG	2	6	192829	192834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_015943	TC	4	8	192840	192847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_015943	ACC	2	6	192879	192884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_015943	GAT	2	6	192889	192894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015943	CAC	2	6	192934	192939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_015943	GT	3	6	193024	193029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_015943	TCA	2	6	193056	193061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_015943	CT	3	6	193081	193086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_015943	GAT	2	6	193099	193104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_015943	GTT	2	6	193146	193151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_015943	CTC	2	6	193175	193180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_015943	CCAA	2	8	193212	193219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_015943	GAA	2	6	193331	193336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015943	AAC	2	6	193486	193491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_015943	CTG	2	6	193501	193506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_015943	GAA	2	6	193531	193536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209693
4044	NC_015943	TCG	2	6	193598	193603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209693
4045	NC_015943	TCC	2	6	193658	193663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209693
4046	NC_015943	TCC	2	6	193670	193675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209693
4047	NC_015943	TGC	2	6	193694	193699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209693
4048	NC_015943	CT	3	6	193705	193710	0 %	50 %	0 %	50 %	344209693
4049	NC_015943	GTGG	2	8	193737	193744	0 %	25 %	75 %	0 %	344209693
4050	NC_015943	GCT	2	6	193911	193916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209693
4051	NC_015943	CGGT	2	8	193928	193935	0 %	25 %	50 %	25 %	344209693
4052	NC_015943	CGT	2	6	193974	193979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209693
4053	NC_015943	TCG	2	6	194006	194011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209693
4054	NC_015943	TCG	2	6	194042	194047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209693
4055	NC_015943	GGC	2	6	194092	194097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209693
4056	NC_015943	GCT	2	6	194114	194119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209693
4057	NC_015943	CGC	2	6	194151	194156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209693
4058	NC_015943	CGA	2	6	194226	194231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209693
4059	NC_015943	TAC	2	6	194239	194244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209693
4060	NC_015943	CCGA	2	8	194245	194252	25 %	0 %	25 %	50 %	344209693
4061	NC_015943	ACT	2	6	194272	194277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209693
4062	NC_015943	TCG	2	6	194285	194290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209693
4063	NC_015943	CCGT	2	8	194431	194438	0 %	25 %	25 %	50 %	344209693
4064	NC_015943	GTCA	2	8	194506	194513	25 %	25 %	25 %	25 %	344209693
4065	NC_015943	AG	3	6	194575	194580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015943	CGC	2	6	194604	194609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_015943	CCA	2	6	194619	194624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_015943	TCA	2	6	194635	194640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_015943	CGG	2	6	194648	194653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_015943	GAC	2	6	194667	194672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_015943	TGA	2	6	194721	194726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015943	TCT	2	6	194732	194737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_015943	TGA	2	6	194757	194762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_015943	CT	3	6	194892	194897	0 %	50 %	0 %	50 %	344209694
4075	NC_015943	AT	3	6	194973	194978	50 %	50 %	0 %	0 %	344209694
4076	NC_015943	GT	3	6	195014	195019	0 %	50 %	50 %	0 %	344209694
4077	NC_015943	CCA	2	6	195066	195071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209694
4078	NC_015943	TCA	2	6	195092	195097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209694
4079	NC_015943	CGC	2	6	195105	195110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209694
4080	NC_015943	GGC	2	6	195111	195116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209694
4081	NC_015943	AC	3	6	195142	195147	50 %	0 %	0 %	50 %	344209694
4082	NC_015943	GGA	2	6	195208	195213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209694
4083	NC_015943	TAT	2	6	195353	195358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344209694
4084	NC_015943	GTT	2	6	195421	195426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209694
4085	NC_015943	GCG	2	6	195441	195446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209694
4086	NC_015943	TACAA	2	10	195468	195477	60 %	20 %	0 %	20 %	344209694
4087	NC_015943	GGATG	2	10	195534	195543	20 %	20 %	60 %	0 %	344209694
4088	NC_015943	AACGA	2	10	195586	195595	60 %	0 %	20 %	20 %	344209694
4089	NC_015943	ACGA	2	8	195662	195669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_015943	TTCG	2	8	195681	195688	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4091	NC_015943	AGA	2	6	195716	195721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015943	TGA	2	6	195779	195784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209695
4093	NC_015943	GTCG	2	8	195800	195807	0 %	25 %	50 %	25 %	344209695
4094	NC_015943	CCGA	2	8	195935	195942	25 %	0 %	25 %	50 %	344209695
4095	NC_015943	ACTC	2	8	195971	195978	25 %	25 %	0 %	50 %	344209695
4096	NC_015943	CGT	2	6	196035	196040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209695
4097	NC_015943	GAG	2	6	196080	196085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209695
4098	NC_015943	GCC	2	6	196195	196200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209695
4099	NC_015943	GAT	2	6	196230	196235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209695
4100	NC_015943	TCA	2	6	196258	196263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209695
4101	NC_015943	TGC	2	6	196347	196352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209695
4102	NC_015943	GT	3	6	196373	196378	0 %	50 %	50 %	0 %	344209695
4103	NC_015943	ATC	2	6	196408	196413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209695
4104	NC_015943	GTA	2	6	196617	196622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209695
4105	NC_015943	GCT	2	6	196628	196633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209695
4106	NC_015943	CAT	2	6	196647	196652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209695
4107	NC_015943	ATCC	2	8	196686	196693	25 %	25 %	0 %	50 %	344209695
4108	NC_015943	GTG	2	6	196828	196833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209695
4109	NC_015943	CGA	3	9	196839	196847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209695
4110	NC_015943	GTC	2	6	196848	196853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209695
4111	NC_015943	GGT	2	6	196854	196859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209695
4112	NC_015943	CGC	2	6	196883	196888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209695
4113	NC_015943	TAC	2	6	196895	196900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209695
4114	NC_015943	CAG	2	6	196933	196938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209695
4115	NC_015943	TA	3	6	196987	196992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_015943	TAT	2	6	197036	197041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_015943	GAAC	2	8	197049	197056	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_015943	GCC	2	6	197119	197124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209696
4119	NC_015943	TTCA	2	8	197172	197179	25 %	50 %	0 %	25 %	344209696
4120	NC_015943	TGG	2	6	197279	197284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209696
4121	NC_015943	A	6	6	197351	197356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015943	TTC	2	6	197394	197399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_015943	CCG	2	6	197447	197452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_015943	AG	3	6	197469	197474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_015943	ACG	2	6	197498	197503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_015943	TC	3	6	197611	197616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_015943	GTT	2	6	197661	197666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209697
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4131	NC_015943	CTG	2	6	197915	197920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209697
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4139	NC_015943	TCA	2	6	198293	198298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4140	NC_015943	CTA	2	6	198339	198344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4241	NC_015943	TCG	2	6	203032	203037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4249	NC_015943	GTG	2	6	203549	203554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209705
4250	NC_015943	GCG	2	6	203578	203583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209705
4251	NC_015943	GCA	2	6	203627	203632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209705
4252	NC_015943	TTC	2	6	203684	203689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209705
4253	NC_015943	ACG	2	6	203771	203776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209705
4254	NC_015943	AC	4	8	203781	203788	50 %	0 %	0 %	50 %	344209705
4255	NC_015943	CTGC	2	8	203854	203861	0 %	25 %	25 %	50 %	344209705
4256	NC_015943	AGCA	2	8	203869	203876	50 %	0 %	25 %	25 %	344209705
4257	NC_015943	TAC	2	6	203927	203932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209705
4258	NC_015943	GAC	2	6	203998	204003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209705
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4260	NC_015943	CCA	2	6	204072	204077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209705
4261	NC_015943	ATC	2	6	204138	204143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209705
4262	NC_015943	TCG	2	6	204150	204155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209705
4263	NC_015943	GCG	2	6	204224	204229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209705
4264	NC_015943	CG	3	6	204363	204368	0 %	0 %	50 %	50 %	344209705
4265	NC_015943	AGC	2	6	204402	204407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209705
4266	NC_015943	CGAC	2	8	204441	204448	25 %	0 %	25 %	50 %	344209705
4267	NC_015943	GAC	3	9	204446	204454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209705
4268	NC_015943	CAG	2	6	204507	204512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209705
4269	NC_015943	TAC	2	6	204572	204577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209705
4270	NC_015943	GCA	2	6	204608	204613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209705
4271	NC_015943	GCACCG	2	12	204683	204694	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344209705
4272	NC_015943	CG	3	6	204693	204698	0 %	0 %	50 %	50 %	344209705
4273	NC_015943	TCCA	2	8	204813	204820	25 %	25 %	0 %	50 %	344209705
4274	NC_015943	AAT	2	6	204840	204845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344209705
4275	NC_015943	ACACA	2	10	204851	204860	60 %	0 %	0 %	40 %	344209706
4276	NC_015943	GCC	2	6	204900	204905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209706
4277	NC_015943	GATG	2	8	204918	204925	25 %	25 %	50 %	0 %	344209706
4278	NC_015943	AAGC	2	8	204928	204935	50 %	0 %	25 %	25 %	344209706
4279	NC_015943	CTCG	2	8	205008	205015	0 %	25 %	25 %	50 %	344209706
4280	NC_015943	GT	3	6	205115	205120	0 %	50 %	50 %	0 %	344209706
4281	NC_015943	CGAC	2	8	205217	205224	25 %	0 %	25 %	50 %	344209706
4282	NC_015943	TGG	2	6	205271	205276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209706
4283	NC_015943	ACC	2	6	205279	205284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209706
4284	NC_015943	CGG	2	6	205372	205377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209707
4285	NC_015943	ATGT	2	8	205415	205422	25 %	50 %	25 %	0 %	344209707
4286	NC_015943	GCT	2	6	205499	205504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209707
4287	NC_015943	GGA	2	6	205543	205548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209707
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4289	NC_015943	TGGC	2	8	205729	205736	0 %	25 %	50 %	25 %	344209707
4290	NC_015943	AAC	2	6	205737	205742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209707
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4292	NC_015943	GCT	2	6	205830	205835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209707
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4299	NC_015943	ATC	2	6	206129	206134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209707
4300	NC_015943	CAA	2	6	206141	206146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209707
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4302	NC_015943	TTC	2	6	206156	206161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209707
4303	NC_015943	TACG	2	8	206182	206189	25 %	25 %	25 %	25 %	344209707
4304	NC_015943	AAG	2	6	206190	206195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209707
4305	NC_015943	GGC	2	6	206198	206203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209707
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4307	NC_015943	T	6	6	206274	206279	0 %	100 %	0 %	0 %	344209707
4308	NC_015943	GCT	2	6	206320	206325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4352	NC_015943	AGT	2	6	208848	208853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4353	NC_015943	AC	3	6	208865	208870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4354	NC_015943	GTG	2	6	208874	208879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4355	NC_015943	CAG	2	6	208955	208960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209709
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4373	NC_015943	GCG	2	6	209783	209788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4374	NC_015943	CGG	2	6	209812	209817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209710
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4384	NC_015943	CGT	2	6	210292	210297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209711
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4480	NC_015943	GT	3	6	215095	215100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4481	NC_015943	TAC	2	6	215140	215145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4483	NC_015943	GTA	2	6	215349	215354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4484	NC_015943	TTCT	2	8	215364	215371	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4485	NC_015943	T	6	6	215454	215459	0 %	100 %	0 %	0 %	344209715
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4488	NC_015943	GAT	2	6	215544	215549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209715
4489	NC_015943	T	7	7	215637	215643	0 %	100 %	0 %	0 %	344209715
4490	NC_015943	GTTT	2	8	215673	215680	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4491	NC_015943	ACG	2	6	215715	215720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4492	NC_015943	AG	3	6	215746	215751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4493	NC_015943	AG	3	6	215801	215806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4494	NC_015943	ACC	2	6	215956	215961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209716
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4496	NC_015943	TCG	2	6	216199	216204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209716
4497	NC_015943	AAC	2	6	216247	216252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209716
4498	NC_015943	GCT	2	6	216307	216312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209716
4499	NC_015943	CCG	2	6	216325	216330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209716
4500	NC_015943	AGA	2	6	216346	216351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209716

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