MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 10408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015943	GGTT	2	8	121108	121115	0 %	50 %	50 %	0 %	344209628
2502	NC_015943	CCG	2	6	121150	121155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_015943	ATG	3	9	121186	121194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209629
2504	NC_015943	TG	3	6	121224	121229	0 %	50 %	50 %	0 %	344209629
2505	NC_015943	GGC	2	6	121346	121351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209629
2506	NC_015943	TGG	2	6	121392	121397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209629
2507	NC_015943	CGG	2	6	121454	121459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209629
2508	NC_015943	GAAT	2	8	121475	121482	50 %	25 %	25 %	0 %	344209629
2509	NC_015943	C	6	6	121491	121496	0 %	0 %	0 %	100 %	344209629
2510	NC_015943	ACCGGC	2	12	121549	121560	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344209629
2511	NC_015943	TTTGC	2	10	121594	121603	0 %	60 %	20 %	20 %	344209629
2512	NC_015943	TCG	2	6	121645	121650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209629
2513	NC_015943	GTA	2	6	121656	121661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209629
2514	NC_015943	CGT	2	6	121694	121699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209629
2515	NC_015943	GTCC	2	8	121802	121809	0 %	25 %	25 %	50 %	344209629
2516	NC_015943	GTCG	2	8	121966	121973	0 %	25 %	50 %	25 %	344209630
2517	NC_015943	CTGC	2	8	122034	122041	0 %	25 %	25 %	50 %	344209630
2518	NC_015943	TCGACG	2	12	122051	122062	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344209630
2519	NC_015943	TCG	2	6	122131	122136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209630
2520	NC_015943	GCT	2	6	122147	122152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209630
2521	NC_015943	TTC	2	6	122161	122166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209630
2522	NC_015943	CGG	2	6	122248	122253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209630
2523	NC_015943	TC	3	6	122268	122273	0 %	50 %	0 %	50 %	344209630
2524	NC_015943	AAT	2	6	122487	122492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344209630
2525	NC_015943	CGC	2	6	122514	122519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209630
2526	NC_015943	TCGTA	2	10	122535	122544	20 %	40 %	20 %	20 %	344209630
2527	NC_015943	AG	3	6	122587	122592	50 %	0 %	50 %	0 %	344209630
2528	NC_015943	ACG	2	6	122676	122681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209630
2529	NC_015943	TCG	2	6	122711	122716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209630
2530	NC_015943	CGC	2	6	122727	122732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209630
2531	NC_015943	AGT	2	6	122776	122781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209630
2532	NC_015943	AGTT	2	8	122870	122877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_015943	TGA	2	6	122957	122962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_015943	CGG	3	9	123041	123049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_015943	GCC	2	6	123053	123058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_015943	CAC	2	6	123072	123077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2537	NC_015943	GAA	2	6	123113	123118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209631
2538	NC_015943	GTC	2	6	123122	123127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209631
2539	NC_015943	GGC	2	6	123226	123231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209631
2540	NC_015943	GC	3	6	123230	123235	0 %	0 %	50 %	50 %	344209631
2541	NC_015943	GAGT	2	8	123289	123296	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_015943	TTAA	2	8	123302	123309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_015943	GCC	2	6	123344	123349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2544	NC_015943	GAT	2	6	123454	123459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209632
2545	NC_015943	GTTG	2	8	123460	123467	0 %	50 %	50 %	0 %	344209632
2546	NC_015943	GGT	2	6	123515	123520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209632
2547	NC_015943	GCA	2	6	123599	123604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209632
2548	NC_015943	GTT	2	6	123655	123660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209632
2549	NC_015943	ACC	2	6	123798	123803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209632
2550	NC_015943	TATTG	2	10	123850	123859	20 %	60 %	20 %	0 %	344209632
2551	NC_015943	ACT	2	6	124030	124035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209632
2552	NC_015943	GATCA	2	10	124063	124072	40 %	20 %	20 %	20 %	344209632
2553	NC_015943	TTA	2	6	124119	124124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344209632
2554	NC_015943	TGG	2	6	124205	124210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209632
2555	NC_015943	TCA	2	6	124248	124253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209632
2556	NC_015943	CG	3	6	124294	124299	0 %	0 %	50 %	50 %	344209632
2557	NC_015943	ACT	2	6	124306	124311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209632
2558	NC_015943	T	6	6	124316	124321	0 %	100 %	0 %	0 %	344209632
2559	NC_015943	CGT	2	6	124360	124365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209632
2560	NC_015943	CCG	2	6	124367	124372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209632
2561	NC_015943	ACG	2	6	124378	124383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209632
2562	NC_015943	CAG	2	6	124425	124430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209632
2563	NC_015943	TGTC	2	8	124473	124480	0 %	50 %	25 %	25 %	344209632
2564	NC_015943	AGC	2	6	124504	124509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209632
2565	NC_015943	GA	3	6	124598	124603	50 %	0 %	50 %	0 %	344209632
2566	NC_015943	GAT	2	6	124607	124612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209632
2567	NC_015943	CTT	2	6	124666	124671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209633
2568	NC_015943	GTC	2	6	124756	124761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209633
2569	NC_015943	ATG	2	6	124802	124807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209633
2570	NC_015943	AAG	2	6	124896	124901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209633
2571	NC_015943	CGG	2	6	124939	124944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209633
2572	NC_015943	TTG	2	6	124967	124972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209633
2573	NC_015943	ACGAC	2	10	124996	125005	40 %	0 %	20 %	40 %	344209633
2574	NC_015943	AGA	2	6	125058	125063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209633
2575	NC_015943	GAACA	2	10	125085	125094	60 %	0 %	20 %	20 %	344209633
2576	NC_015943	TTG	2	6	125144	125149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209633
2577	NC_015943	ACG	2	6	125196	125201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209633
2578	NC_015943	CCA	2	6	125227	125232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209633
2579	NC_015943	ATG	2	6	125347	125352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209633
2580	NC_015943	TTC	2	6	125366	125371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209633
2581	NC_015943	ATG	2	6	125405	125410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209633
2582	NC_015943	CCG	2	6	125430	125435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209633
2583	NC_015943	TCG	2	6	125493	125498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209633
2584	NC_015943	CCG	2	6	125517	125522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209633
2585	NC_015943	AC	3	6	125565	125570	50 %	0 %	0 %	50 %	344209633
2586	NC_015943	GAC	2	6	125578	125583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209633
2587	NC_015943	ACG	2	6	125627	125632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209633
2588	NC_015943	GGA	2	6	125658	125663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209633
2589	NC_015943	ATT	2	6	125664	125669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344209633
2590	NC_015943	GAC	2	6	125751	125756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209633
2591	NC_015943	CA	3	6	125778	125783	50 %	0 %	0 %	50 %	344209633
2592	NC_015943	AGG	2	6	125791	125796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209633
2593	NC_015943	CGA	2	6	125828	125833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209634
2594	NC_015943	TTA	2	6	125838	125843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344209634
2595	NC_015943	CAG	2	6	125919	125924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209634
2596	NC_015943	GTT	2	6	125990	125995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209634
2597	NC_015943	GCT	2	6	126020	126025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209634
2598	NC_015943	CTA	2	6	126039	126044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209634
2599	NC_015943	GACGGG	2	12	126053	126064	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	344209634
2600	NC_015943	TC	4	8	126069	126076	0 %	50 %	0 %	50 %	344209634
2601	NC_015943	TCGC	2	8	126121	126128	0 %	25 %	25 %	50 %	344209634
2602	NC_015943	GC	3	6	126141	126146	0 %	0 %	50 %	50 %	344209634
2603	NC_015943	ATC	2	6	126316	126321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209634
2604	NC_015943	TGC	2	6	126337	126342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209634
2605	NC_015943	CGC	2	6	126436	126441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209634
2606	NC_015943	GCC	2	6	126455	126460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209634
2607	NC_015943	TAA	2	6	126484	126489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344209634
2608	NC_015943	GATT	2	8	126529	126536	25 %	50 %	25 %	0 %	344209634
2609	NC_015943	CAG	2	6	126608	126613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209634
2610	NC_015943	GCG	2	6	126683	126688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209634
2611	NC_015943	CAA	2	6	126708	126713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209634
2612	NC_015943	GGC	2	6	126811	126816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209634
2613	NC_015943	CCG	2	6	126883	126888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209634
2614	NC_015943	ATC	3	9	126933	126941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209634
2615	NC_015943	TCG	2	6	126981	126986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209634
2616	NC_015943	AGA	2	6	127017	127022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209634
2617	NC_015943	TCGC	2	8	127077	127084	0 %	25 %	25 %	50 %	344209634
2618	NC_015943	GTC	2	6	127174	127179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209634
2619	NC_015943	GAC	2	6	127189	127194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209634
2620	NC_015943	ATG	2	6	127274	127279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209634
2621	NC_015943	CTA	3	9	127343	127351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209634
2622	NC_015943	GGT	2	6	127463	127468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209634
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2989	NC_015943	GCCA	2	8	145546	145553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2990	NC_015943	AT	3	6	145585	145590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2991	NC_015943	GGTTG	2	10	145645	145654	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2992	NC_015943	ACT	2	6	145697	145702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209650
2993	NC_015943	T	7	7	145726	145732	0 %	100 %	0 %	0 %	344209650
2994	NC_015943	AG	3	6	145759	145764	50 %	0 %	50 %	0 %	344209650
2995	NC_015943	GCC	2	6	145805	145810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209650
2996	NC_015943	TGG	2	6	145813	145818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209650
2997	NC_015943	TCC	2	6	146005	146010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209650
2998	NC_015943	GCT	2	6	146012	146017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209650
2999	NC_015943	GCC	2	6	146045	146050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209650
3000	NC_015943	CGG	2	6	146057	146062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209650

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