MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 10408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015943	GAG	2	6	96468	96473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_015943	CTCC	2	8	96512	96519	0 %	25 %	0 %	75 %	344209591
2003	NC_015943	TCG	2	6	96555	96560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209591
2004	NC_015943	CAG	2	6	96596	96601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209591
2005	NC_015943	GAG	2	6	96698	96703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209591
2006	NC_015943	GCC	2	6	96761	96766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_015943	TG	3	6	96777	96782	0 %	50 %	50 %	0 %	344209592
2008	NC_015943	AGACG	2	10	96793	96802	40 %	0 %	40 %	20 %	344209592
2009	NC_015943	CAG	2	6	96809	96814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209592
2010	NC_015943	CGA	2	6	96817	96822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209592
2011	NC_015943	CGT	2	6	96895	96900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209592
2012	NC_015943	GAA	2	6	97060	97065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209592
2013	NC_015943	CGA	2	6	97111	97116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209592
2014	NC_015943	AAT	2	6	97137	97142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344209592
2015	NC_015943	GAG	2	6	97144	97149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_015943	CTCACG	2	12	97176	97187	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2017	NC_015943	CGG	2	6	97244	97249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_015943	GCC	2	6	97306	97311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2019	NC_015943	GC	3	6	97357	97362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2020	NC_015943	CAG	2	6	97408	97413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209593
2021	NC_015943	CGA	2	6	97527	97532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209593
2022	NC_015943	ACG	2	6	97543	97548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209593
2023	NC_015943	TCG	2	6	97553	97558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209593
2024	NC_015943	GAC	2	6	97577	97582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209593
2025	NC_015943	CAG	2	6	97614	97619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209594
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2029	NC_015943	AGTA	2	8	97841	97848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_015943	GGT	2	6	97971	97976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_015943	TCG	2	6	97994	97999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_015943	T	6	6	98033	98038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_015943	AGCT	2	8	98068	98075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2034	NC_015943	AG	3	6	98183	98188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_015943	GCC	2	6	98194	98199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2036	NC_015943	TCAT	2	8	98202	98209	25 %	50 %	0 %	25 %	344209595
2037	NC_015943	CAG	2	6	98237	98242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209595
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2041	NC_015943	TGA	2	6	98308	98313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209595
2042	NC_015943	CGC	2	6	98345	98350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209595
2043	NC_015943	GCGA	2	8	98488	98495	25 %	0 %	50 %	25 %	344209595
2044	NC_015943	GAC	2	6	98517	98522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209595
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2048	NC_015943	ACGA	2	8	98669	98676	50 %	0 %	25 %	25 %	344209595
2049	NC_015943	TCCT	2	8	98706	98713	0 %	50 %	0 %	50 %	344209595
2050	NC_015943	GAG	2	6	98778	98783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209595
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2054	NC_015943	GGC	2	6	99012	99017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209596
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2057	NC_015943	CAG	2	6	99126	99131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209596
2058	NC_015943	CGA	2	6	99178	99183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209596
2059	NC_015943	GCAG	2	8	99362	99369	25 %	0 %	50 %	25 %	344209596
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2061	NC_015943	CCT	2	6	99401	99406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209596
2062	NC_015943	CGC	2	6	99449	99454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209596
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2064	NC_015943	AGCG	2	8	99646	99653	25 %	0 %	50 %	25 %	344209596
2065	NC_015943	CAG	2	6	99666	99671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209596
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2068	NC_015943	GAG	2	6	99831	99836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209596
2069	NC_015943	AGCA	2	8	99900	99907	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2070	NC_015943	GA	4	8	99914	99921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_015943	CGG	2	6	99950	99955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2072	NC_015943	GCT	2	6	100073	100078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209597
2073	NC_015943	TGA	2	6	100316	100321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209597
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2083	NC_015943	CGAG	2	8	100609	100616	25 %	0 %	50 %	25 %	344209598
2084	NC_015943	TCGG	2	8	100625	100632	0 %	25 %	50 %	25 %	344209598
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2091	NC_015943	CA	3	6	101169	101174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2092	NC_015943	CAG	2	6	101229	101234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2093	NC_015943	TAA	2	6	101273	101278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_015943	AAG	2	6	101292	101297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_015943	AACCA	2	10	101375	101384	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2096	NC_015943	TGA	2	6	101395	101400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2098	NC_015943	TCATGT	2	12	101503	101514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2101	NC_015943	CA	3	6	101605	101610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2102	NC_015943	GTC	2	6	101656	101661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209600
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2109	NC_015943	A	6	6	101984	101989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_015943	GA	3	6	102038	102043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_015943	CAA	2	6	102047	102052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209601
2112	NC_015943	AGT	2	6	102055	102060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209601
2113	NC_015943	GGGCT	2	10	102212	102221	0 %	20 %	60 %	20 %	344209601
2114	NC_015943	TGA	2	6	102360	102365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209601
2115	NC_015943	GCC	2	6	102375	102380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209601
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2117	NC_015943	ACT	2	6	102449	102454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209601
2118	NC_015943	G	6	6	102461	102466	0 %	0 %	100 %	0 %	344209601
2119	NC_015943	GATT	2	8	102555	102562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_015943	GAT	2	6	102641	102646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209602
2121	NC_015943	TTC	2	6	102671	102676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209602
2122	NC_015943	ACG	2	6	102873	102878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209602
2123	NC_015943	TCT	2	6	102885	102890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209602
2124	NC_015943	CAGC	2	8	102918	102925	25 %	0 %	25 %	50 %	344209602
2125	NC_015943	CAG	2	6	102953	102958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209602
2126	NC_015943	TCG	2	6	102962	102967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209602
2127	NC_015943	TCA	2	6	102970	102975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209602
2128	NC_015943	TCA	2	6	102992	102997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2129	NC_015943	TGTCT	2	10	103003	103012	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2130	NC_015943	ACCG	2	8	103024	103031	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2131	NC_015943	ACT	2	6	103084	103089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2132	NC_015943	CAA	2	6	103115	103120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2133	NC_015943	AAC	2	6	103148	103153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2134	NC_015943	TAA	2	6	103154	103159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_015943	T	6	6	103166	103171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2136	NC_015943	AAT	2	6	103241	103246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2137	NC_015943	ACC	2	6	103284	103289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2138	NC_015943	ACCC	2	8	103331	103338	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2139	NC_015943	GTA	2	6	103452	103457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2140	NC_015943	AGC	2	6	103460	103465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2141	NC_015943	GAG	2	6	103475	103480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2142	NC_015943	AAT	2	6	103560	103565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2143	NC_015943	TA	3	6	103666	103671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2144	NC_015943	GACTCT	2	12	103683	103694	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2146	NC_015943	CGT	2	6	103854	103859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2147	NC_015943	TC	3	6	103873	103878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2148	NC_015943	CT	3	6	103964	103969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2149	NC_015943	GA	3	6	103977	103982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2150	NC_015943	TTG	2	6	104016	104021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209603
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2153	NC_015943	GGC	2	6	104233	104238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209603
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2158	NC_015943	CTG	2	6	104509	104514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209603
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2168	NC_015943	CTG	2	6	105027	105032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209604
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2172	NC_015943	TAT	2	6	105156	105161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2173	NC_015943	TGGG	2	8	105175	105182	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2174	NC_015943	AC	3	6	105201	105206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2175	NC_015943	TGA	2	6	105316	105321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209605
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2182	NC_015943	CAGTAC	2	12	105852	105863	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2184	NC_015943	CCG	2	6	105997	106002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2185	NC_015943	AC	3	6	106077	106082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2186	NC_015943	CGT	2	6	106095	106100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2191	NC_015943	CAT	2	6	106241	106246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2236	NC_015943	CCT	2	6	108383	108388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2238	NC_015943	CGC	2	6	108423	108428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2239	NC_015943	CGA	2	6	108474	108479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2240	NC_015943	TCAGG	2	10	108503	108512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2241	NC_015943	TCA	2	6	108571	108576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209608
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2243	NC_015943	TCG	2	6	108610	108615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209608
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2249	NC_015943	GA	3	6	108831	108836	50 %	0 %	50 %	0 %	344209608
2250	NC_015943	AAT	2	6	108966	108971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344209608
2251	NC_015943	CGG	2	6	109012	109017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209608
2252	NC_015943	TCT	2	6	109066	109071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209608
2253	NC_015943	CTGT	2	8	109103	109110	0 %	50 %	25 %	25 %	344209608
2254	NC_015943	CGG	2	6	109169	109174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209608
2255	NC_015943	TA	3	6	109197	109202	50 %	50 %	0 %	0 %	344209608
2256	NC_015943	GTT	2	6	109251	109256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209608
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2262	NC_015943	GTA	3	9	109581	109589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2267	NC_015943	TGA	2	6	109813	109818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2273	NC_015943	GCG	2	6	110181	110186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2355	NC_015943	CGGG	2	8	114444	114451	0 %	0 %	75 %	25 %	344209617
2356	NC_015943	TCGATC	2	12	114466	114477	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344209617
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2364	NC_015943	CTC	2	6	114861	114866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209617
2365	NC_015943	CT	3	6	114901	114906	0 %	50 %	0 %	50 %	344209617
2366	NC_015943	GTC	2	6	114960	114965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209617
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2369	NC_015943	TCG	2	6	115063	115068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209617
2370	NC_015943	TGC	2	6	115070	115075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209617
2371	NC_015943	ATGA	2	8	115105	115112	50 %	25 %	25 %	0 %	344209617
2372	NC_015943	GGC	2	6	115115	115120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2373	NC_015943	CT	3	6	115126	115131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2374	NC_015943	GTT	2	6	115178	115183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2375	NC_015943	GAGTG	2	10	115186	115195	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2376	NC_015943	GTAG	2	8	115205	115212	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2378	NC_015943	AAG	2	6	115307	115312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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