MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 10408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015943	CTC	2	6	25634	25639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209508
502	NC_015943	GTC	2	6	25715	25720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209508
503	NC_015943	GATC	2	8	25757	25764	25 %	25 %	25 %	25 %	344209508
504	NC_015943	ACG	2	6	25794	25799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209508
505	NC_015943	TGT	2	6	25839	25844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209508
506	NC_015943	GCG	2	6	25860	25865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209508
507	NC_015943	CCA	2	6	25873	25878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209508
508	NC_015943	GTG	2	6	25887	25892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209508
509	NC_015943	TCG	2	6	25896	25901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209508
510	NC_015943	GTG	2	6	25937	25942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209508
511	NC_015943	GGA	2	6	25954	25959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209508
512	NC_015943	GTC	2	6	25994	25999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209508
513	NC_015943	CGC	2	6	26049	26054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209508
514	NC_015943	CGG	2	6	26112	26117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209508
515	NC_015943	CAA	2	6	26368	26373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209509
516	NC_015943	GTC	2	6	26406	26411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209509
517	NC_015943	AT	3	6	26462	26467	50 %	50 %	0 %	0 %	344209509
518	NC_015943	CA	3	6	26489	26494	50 %	0 %	0 %	50 %	344209509
519	NC_015943	TCG	2	6	26566	26571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209509
520	NC_015943	GCT	2	6	26614	26619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015943	GCA	2	6	26689	26694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015943	ACT	2	6	26867	26872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209510
523	NC_015943	CTG	2	6	26878	26883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209510
524	NC_015943	AT	3	6	26908	26913	50 %	50 %	0 %	0 %	344209510
525	NC_015943	TAA	2	6	27015	27020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344209510
526	NC_015943	ACG	2	6	27075	27080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015943	CCGG	2	8	27139	27146	0 %	0 %	50 %	50 %	344209511
528	NC_015943	CGA	2	6	27163	27168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209511
529	NC_015943	CGC	2	6	27213	27218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209511
530	NC_015943	GTC	2	6	27393	27398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015943	GAA	2	6	27425	27430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015943	CGT	2	6	27446	27451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015943	GAC	2	6	27502	27507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_015943	GTA	2	6	27559	27564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015943	TTG	2	6	27569	27574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209512
536	NC_015943	TTC	2	6	27647	27652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209512
537	NC_015943	GTT	2	6	27691	27696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209512
538	NC_015943	GTT	2	6	27766	27771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209512
539	NC_015943	CAGG	2	8	27799	27806	25 %	0 %	50 %	25 %	344209512
540	NC_015943	CGT	2	6	27843	27848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209512
541	NC_015943	GTT	2	6	27883	27888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209512
542	NC_015943	TCA	2	6	27894	27899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015943	TAA	2	6	27910	27915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015943	GCAT	2	8	27928	27935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NC_015943	TAC	2	6	27982	27987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015943	GTA	2	6	28063	28068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015943	AAT	2	6	28083	28088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015943	TGAA	2	8	28093	28100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015943	TGAC	3	12	28101	28112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_015943	CAC	2	6	28182	28187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_015943	CGG	2	6	28260	28265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015943	AGC	2	6	28321	28326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015943	TCG	2	6	28332	28337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_015943	TCTG	2	8	28345	28352	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_015943	ACG	2	6	28416	28421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_015943	CGTCC	2	10	28456	28465	0 %	20 %	20 %	60 %	344209513
557	NC_015943	TCG	2	6	28508	28513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209513
558	NC_015943	CGA	2	6	28533	28538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209513
559	NC_015943	TCC	2	6	28550	28555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209513
560	NC_015943	CGG	2	6	28560	28565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209513
561	NC_015943	TCG	2	6	28614	28619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209513
562	NC_015943	TCG	2	6	28625	28630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209513
563	NC_015943	GTC	2	6	28643	28648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209513
564	NC_015943	TTC	2	6	28687	28692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_015943	CTGG	2	8	28719	28726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
566	NC_015943	GGA	2	6	28759	28764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015943	CCTT	2	8	28784	28791	0 %	50 %	0 %	50 %	344209514
568	NC_015943	GAG	2	6	28793	28798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209514
569	NC_015943	GACTG	2	10	28832	28841	20 %	20 %	40 %	20 %	344209514
570	NC_015943	CGG	2	6	28897	28902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209514
571	NC_015943	GAC	3	9	28928	28936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209514
572	NC_015943	CGG	2	6	28960	28965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209514
573	NC_015943	CAGG	2	8	29101	29108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_015943	CACT	2	8	29192	29199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_015943	TGC	2	6	29231	29236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_015943	GCG	3	9	29249	29257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015943	ACC	2	6	29275	29280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_015943	GT	3	6	29315	29320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015943	CCA	2	6	29342	29347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209515
580	NC_015943	CAA	2	6	29394	29399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209515
581	NC_015943	CGA	2	6	29504	29509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209515
582	NC_015943	GTC	2	6	29511	29516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209515
583	NC_015943	GCC	2	6	29517	29522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209515
584	NC_015943	TTCC	2	8	29571	29578	0 %	50 %	0 %	50 %	344209515
585	NC_015943	CGG	2	6	29585	29590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209515
586	NC_015943	CGC	2	6	29627	29632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209515
587	NC_015943	TCGTG	2	10	29643	29652	0 %	40 %	40 %	20 %	344209515
588	NC_015943	CG	3	6	29685	29690	0 %	0 %	50 %	50 %	344209515
589	NC_015943	CGA	2	6	29717	29722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209515
590	NC_015943	GGC	2	6	29744	29749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209515
591	NC_015943	GAA	2	6	29757	29762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209515
592	NC_015943	GCG	2	6	29768	29773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209515
593	NC_015943	GCT	2	6	29801	29806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209515
594	NC_015943	CTG	2	6	29817	29822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209515
595	NC_015943	GGT	2	6	29880	29885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209515
596	NC_015943	TGCTT	2	10	29890	29899	0 %	60 %	20 %	20 %	344209515
597	NC_015943	GTC	2	6	29904	29909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209515
598	NC_015943	TCGT	2	8	29920	29927	0 %	50 %	25 %	25 %	344209515
599	NC_015943	GGC	2	6	29928	29933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209515
600	NC_015943	TGG	2	6	29948	29953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209515
601	NC_015943	TGA	2	6	30080	30085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209515
602	NC_015943	GGT	2	6	30137	30142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209515
603	NC_015943	TCG	4	12	30169	30180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209515
604	NC_015943	TTGT	2	8	30188	30195	0 %	75 %	25 %	0 %	344209515
605	NC_015943	CCCCG	2	10	30312	30321	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
606	NC_015943	CGT	2	6	30335	30340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_015943	CGA	3	9	30351	30359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_015943	GT	3	6	30367	30372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015943	GTC	2	6	30376	30381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_015943	TGG	2	6	30424	30429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015943	TGG	2	6	30468	30473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015943	GTA	2	6	30544	30549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209516
613	NC_015943	TGA	2	6	30637	30642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209516
614	NC_015943	CCT	2	6	30697	30702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209517
615	NC_015943	GCT	2	6	30720	30725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209517
616	NC_015943	TCG	3	9	30898	30906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209517
617	NC_015943	TGG	2	6	30938	30943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209517
618	NC_015943	CGA	2	6	30953	30958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209517
619	NC_015943	GGGT	2	8	30973	30980	0 %	25 %	75 %	0 %	344209517
620	NC_015943	GTG	2	6	31131	31136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209518
621	NC_015943	GTA	2	6	31147	31152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209518
622	NC_015943	TCCGGA	2	12	31158	31169	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344209518
623	NC_015943	TGG	2	6	31198	31203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209518
624	NC_015943	CCA	2	6	31242	31247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209518
625	NC_015943	TGAGTC	2	12	31301	31312	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344209518
626	NC_015943	CGGT	2	8	31341	31348	0 %	25 %	50 %	25 %	344209518
627	NC_015943	C	6	6	31371	31376	0 %	0 %	0 %	100 %	344209518
628	NC_015943	ACCC	2	8	31381	31388	25 %	0 %	0 %	75 %	344209518
629	NC_015943	ATC	2	6	31392	31397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209518
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757	NC_015943	GA	4	8	37730	37737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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759	NC_015943	GAC	2	6	37843	37848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209526
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881	NC_015943	ACC	2	6	43122	43127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
882	NC_015943	CGT	2	6	43173	43178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209535
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886	NC_015943	CGG	2	6	43281	43286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209535
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