MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 10408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015943	CCA	2	6	339957	339962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209822
7002	NC_015943	CGT	3	9	339995	340003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209822
7003	NC_015943	CATC	2	8	340054	340061	25 %	25 %	0 %	50 %	344209822
7004	NC_015943	CCCGG	2	10	340094	340103	0 %	0 %	40 %	60 %	344209822
7005	NC_015943	GA	4	8	340112	340119	50 %	0 %	50 %	0 %	344209822
7006	NC_015943	GTCA	2	8	340127	340134	25 %	25 %	25 %	25 %	344209822
7007	NC_015943	ACC	2	6	340144	340149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209823
7008	NC_015943	GTT	2	6	340174	340179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209823
7009	NC_015943	TCG	2	6	340187	340192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209823
7010	NC_015943	TTC	2	6	340210	340215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209823
7011	NC_015943	CGG	2	6	340353	340358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209823
7012	NC_015943	TCG	2	6	340364	340369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209823
7013	NC_015943	GTC	2	6	340416	340421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209823
7014	NC_015943	TCG	2	6	340514	340519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209823
7015	NC_015943	GGAC	2	8	340572	340579	25 %	0 %	50 %	25 %	344209823
7016	NC_015943	TGC	2	6	340582	340587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209823
7017	NC_015943	CCG	2	6	340616	340621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209823
7018	NC_015943	TGA	2	6	340743	340748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209823
7019	NC_015943	CGT	2	6	340756	340761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209823
7020	NC_015943	CGT	2	6	340827	340832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209823
7021	NC_015943	CGG	2	6	340836	340841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209823
7022	NC_015943	GTCC	2	8	340866	340873	0 %	25 %	25 %	50 %	344209823
7023	NC_015943	GTT	2	6	340940	340945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209824
7024	NC_015943	CGA	2	6	340966	340971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7025	NC_015943	GA	3	6	340970	340975	50 %	0 %	50 %	0 %	344209824
7026	NC_015943	CGATA	2	10	340982	340991	40 %	20 %	20 %	20 %	344209824
7027	NC_015943	GAT	2	6	341033	341038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209824
7028	NC_015943	GCC	2	6	341041	341046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209824
7029	NC_015943	ACG	2	6	341059	341064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7030	NC_015943	CTC	2	6	341072	341077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209824
7031	NC_015943	GAA	2	6	341084	341089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209824
7032	NC_015943	ATG	2	6	341196	341201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209824
7033	NC_015943	GAG	2	6	341222	341227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209824
7034	NC_015943	GCC	2	6	341228	341233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209824
7035	NC_015943	CCG	2	6	341250	341255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209824
7036	NC_015943	TGA	2	6	341257	341262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209824
7037	NC_015943	CGCT	2	8	341309	341316	0 %	25 %	25 %	50 %	344209824
7038	NC_015943	TCA	2	6	341362	341367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209824
7039	NC_015943	CAG	2	6	341390	341395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7040	NC_015943	TAG	2	6	341415	341420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209824
7041	NC_015943	CTG	2	6	341429	341434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7042	NC_015943	GAG	2	6	341450	341455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209824
7043	NC_015943	CCG	2	6	341535	341540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209824
7044	NC_015943	CGA	2	6	341638	341643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7045	NC_015943	ACG	2	6	341685	341690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
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7047	NC_015943	ACG	2	6	341844	341849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7048	NC_015943	GTA	2	6	341852	341857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209824
7049	NC_015943	GCGAGC	2	12	341889	341900	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344209824
7050	NC_015943	CCG	2	6	341916	341921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209824
7051	NC_015943	C	6	6	341960	341965	0 %	0 %	0 %	100 %	344209824
7052	NC_015943	GAC	2	6	342149	342154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7053	NC_015943	CGA	2	6	342157	342162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7054	NC_015943	CCG	2	6	342168	342173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209824
7055	NC_015943	GCC	2	6	342200	342205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209824
7056	NC_015943	GAC	3	9	342209	342217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7057	NC_015943	AACG	2	8	342218	342225	50 %	0 %	25 %	25 %	344209824
7058	NC_015943	GAT	2	6	342230	342235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209824
7059	NC_015943	GCC	2	6	342272	342277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209824
7060	NC_015943	AGCG	2	8	342299	342306	25 %	0 %	50 %	25 %	344209824
7061	NC_015943	CACCGA	2	12	342310	342321	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344209824
7062	NC_015943	GTA	2	6	342332	342337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209824
7063	NC_015943	GTCGAT	2	12	342341	342352	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344209824
7064	NC_015943	ATC	2	6	342399	342404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209824
7065	NC_015943	CAG	2	6	342422	342427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7066	NC_015943	AGC	2	6	342447	342452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7067	NC_015943	AGCT	2	8	342536	342543	25 %	25 %	25 %	25 %	344209824
7068	NC_015943	CGT	2	6	342577	342582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7069	NC_015943	CACGAG	2	12	342587	342598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7070	NC_015943	GAT	2	6	342746	342751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209824
7071	NC_015943	CGG	2	6	342838	342843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209824
7072	NC_015943	CAG	2	6	342881	342886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7073	NC_015943	GCA	2	6	342903	342908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209824
7074	NC_015943	CTAC	2	8	342918	342925	25 %	25 %	0 %	50 %	344209825
7075	NC_015943	CTGG	2	8	342944	342951	0 %	25 %	50 %	25 %	344209825
7076	NC_015943	GAG	2	6	342982	342987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209825
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7081	NC_015943	CGA	2	6	343242	343247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209825
7082	NC_015943	CGAG	2	8	343269	343276	25 %	0 %	50 %	25 %	344209825
7083	NC_015943	GCC	2	6	343291	343296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209825
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7085	NC_015943	CAC	2	6	343422	343427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209825
7086	NC_015943	TGA	2	6	343476	343481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209825
7087	NC_015943	GTC	2	6	343537	343542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209825
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7089	NC_015943	TTG	2	6	343634	343639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209825
7090	NC_015943	GCAG	2	8	343708	343715	25 %	0 %	50 %	25 %	344209825
7091	NC_015943	GCC	2	6	343738	343743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209825
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7093	NC_015943	GTC	2	6	343924	343929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209825
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7095	NC_015943	GGCCC	2	10	343974	343983	0 %	0 %	40 %	60 %	344209825
7096	NC_015943	GA	3	6	343984	343989	50 %	0 %	50 %	0 %	344209825
7097	NC_015943	CCT	2	6	344034	344039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209825
7098	NC_015943	GC	3	6	344079	344084	0 %	0 %	50 %	50 %	344209825
7099	NC_015943	GCG	3	9	344096	344104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209825
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7101	NC_015943	CGC	2	6	344239	344244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7102	NC_015943	CCG	2	6	344288	344293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7103	NC_015943	GTC	2	6	344312	344317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209826
7104	NC_015943	CTGT	2	8	344318	344325	0 %	50 %	25 %	25 %	344209826
7105	NC_015943	CAGT	2	8	344365	344372	25 %	25 %	25 %	25 %	344209826
7106	NC_015943	GGC	2	6	344393	344398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209826
7107	NC_015943	CT	3	6	344433	344438	0 %	50 %	0 %	50 %	344209826
7108	NC_015943	CCG	2	6	344460	344465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209826
7109	NC_015943	GTCT	2	8	344480	344487	0 %	50 %	25 %	25 %	344209826
7110	NC_015943	TCG	2	6	344500	344505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209826
7111	NC_015943	GGC	2	6	344582	344587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209826
7112	NC_015943	AAC	3	9	344595	344603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209826
7113	NC_015943	GTC	2	6	344639	344644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209826
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7115	NC_015943	CGGG	2	8	344692	344699	0 %	0 %	75 %	25 %	344209826
7116	NC_015943	CTGC	2	8	344710	344717	0 %	25 %	25 %	50 %	344209826
7117	NC_015943	GTC	2	6	344720	344725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209826
7118	NC_015943	GAC	2	6	344735	344740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209826
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7243	NC_015943	TCAG	2	8	350514	350521	25 %	25 %	25 %	25 %	344209831
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7484	NC_015943	GTT	2	6	360063	360068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209841
7485	NC_015943	GA	3	6	360076	360081	50 %	0 %	50 %	0 %	344209841
7486	NC_015943	GCAC	2	8	360100	360107	25 %	0 %	25 %	50 %	344209841
7487	NC_015943	TCG	3	9	360142	360150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209841
7488	NC_015943	GC	3	6	360178	360183	0 %	0 %	50 %	50 %	344209841
7489	NC_015943	CCG	2	6	360211	360216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209841
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7491	NC_015943	CCT	2	6	360295	360300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209842
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