MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 10408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015943	GCTG	2	8	240763	240770	0 %	25 %	50 %	25 %	344209736
5002	NC_015943	AGT	2	6	240822	240827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209736
5003	NC_015943	GAG	2	6	240943	240948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209736
5004	NC_015943	GTT	2	6	241061	241066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209736
5005	NC_015943	CAA	2	6	241146	241151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209736
5006	NC_015943	TGT	2	6	241219	241224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209736
5007	NC_015943	TGC	2	6	241225	241230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209736
5008	NC_015943	GA	3	6	241232	241237	50 %	0 %	50 %	0 %	344209736
5009	NC_015943	GAT	2	6	241276	241281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209736
5010	NC_015943	TCGA	2	8	241323	241330	25 %	25 %	25 %	25 %	344209737
5011	NC_015943	GCA	2	6	241342	241347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209737
5012	NC_015943	GT	3	6	241364	241369	0 %	50 %	50 %	0 %	344209737
5013	NC_015943	CGA	2	6	241478	241483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209737
5014	NC_015943	TCG	2	6	241580	241585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209737
5015	NC_015943	AGAA	2	8	241615	241622	75 %	0 %	25 %	0 %	344209737
5016	NC_015943	AGT	2	6	241651	241656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209737
5017	NC_015943	TCG	2	6	241774	241779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209738
5018	NC_015943	T	7	7	241795	241801	0 %	100 %	0 %	0 %	344209738
5019	NC_015943	CTT	2	6	241807	241812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209738
5020	NC_015943	CTT	2	6	241819	241824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209738
5021	NC_015943	CT	3	6	241828	241833	0 %	50 %	0 %	50 %	344209738
5022	NC_015943	GTA	2	6	241844	241849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209738
5023	NC_015943	CCGG	2	8	241852	241859	0 %	0 %	50 %	50 %	344209738
5024	NC_015943	GACG	2	8	241897	241904	25 %	0 %	50 %	25 %	344209738
5025	NC_015943	TTC	2	6	241931	241936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209738
5026	NC_015943	CTT	2	6	241990	241995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209738
5027	NC_015943	AG	3	6	242042	242047	50 %	0 %	50 %	0 %	344209738
5028	NC_015943	CTG	2	6	242050	242055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209738
5029	NC_015943	GAC	2	6	242081	242086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209738
5030	NC_015943	TCA	2	6	242100	242105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209738
5031	NC_015943	GCC	2	6	242119	242124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209738
5032	NC_015943	TCT	2	6	242193	242198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209738
5033	NC_015943	CTT	2	6	242237	242242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209738
5034	NC_015943	GTC	2	6	242273	242278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209738
5035	NC_015943	CGT	2	6	242287	242292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209738
5036	NC_015943	TTG	2	6	242377	242382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_015943	TCGG	2	8	242422	242429	0 %	25 %	50 %	25 %	344209739
5038	NC_015943	TCG	3	9	242564	242572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209739
5039	NC_015943	CGT	3	9	242592	242600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209739
5040	NC_015943	CTG	2	6	242653	242658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209739
5041	NC_015943	CAG	2	6	242668	242673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209739
5042	NC_015943	TCG	2	6	242682	242687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209739
5043	NC_015943	GAT	2	6	242743	242748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209739
5044	NC_015943	CCACGC	2	12	242780	242791	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_015943	GA	3	6	242894	242899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_015943	TGC	2	6	242901	242906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_015943	CGC	2	6	242912	242917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_015943	GCT	2	6	242957	242962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_015943	CTC	2	6	243160	243165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_015943	CGCC	2	8	243227	243234	0 %	0 %	25 %	75 %	344209740
5051	NC_015943	GGGC	2	8	243242	243249	0 %	0 %	75 %	25 %	344209740
5052	NC_015943	GAC	2	6	243250	243255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209740
5053	NC_015943	CAG	2	6	243286	243291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209740
5054	NC_015943	TGC	2	6	243292	243297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209740
5055	NC_015943	ATG	2	6	243305	243310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209740
5056	NC_015943	ACG	2	6	243320	243325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209740
5057	NC_015943	GTC	2	6	243335	243340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209740
5058	NC_015943	GCA	2	6	243360	243365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209740
5059	NC_015943	AAC	2	6	243460	243465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209740
5060	NC_015943	CGCT	2	8	243533	243540	0 %	25 %	25 %	50 %	344209740
5061	NC_015943	CGT	2	6	243559	243564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209740
5062	NC_015943	ACC	2	6	243626	243631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209740
5063	NC_015943	GCG	2	6	243635	243640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209740
5064	NC_015943	GCG	2	6	243652	243657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209740
5065	NC_015943	GCT	2	6	243679	243684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209740
5066	NC_015943	AGG	2	6	243695	243700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209740
5067	NC_015943	GAC	2	6	243814	243819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209740
5068	NC_015943	ATG	2	6	243895	243900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209740
5069	NC_015943	CGA	2	6	243999	244004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209740
5070	NC_015943	GTC	2	6	244051	244056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209740
5071	NC_015943	GAC	2	6	244123	244128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209740
5072	NC_015943	AAGGG	2	10	244175	244184	40 %	0 %	60 %	0 %	344209740
5073	NC_015943	CCG	3	9	244218	244226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209740
5074	NC_015943	ATCCAG	2	12	244261	244272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_015943	ATTCA	2	10	244298	244307	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5076	NC_015943	GCC	2	6	244341	244346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_015943	TCC	2	6	244365	244370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209741
5078	NC_015943	CGT	2	6	244390	244395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209741
5079	NC_015943	CT	3	6	244508	244513	0 %	50 %	0 %	50 %	344209741
5080	NC_015943	TTTC	2	8	244515	244522	0 %	75 %	0 %	25 %	344209741
5081	NC_015943	AGG	2	6	244602	244607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209741
5082	NC_015943	GGC	2	6	244666	244671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209741
5083	NC_015943	CGA	2	6	244810	244815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209741
5084	NC_015943	CGT	2	6	244837	244842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209741
5085	NC_015943	CT	3	6	244892	244897	0 %	50 %	0 %	50 %	344209741
5086	NC_015943	TGA	2	6	244915	244920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209741
5087	NC_015943	CGA	2	6	245021	245026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209741
5088	NC_015943	CTG	2	6	245053	245058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209741
5089	NC_015943	GTC	2	6	245167	245172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209742
5090	NC_015943	CTGT	2	8	245190	245197	0 %	50 %	25 %	25 %	344209742
5091	NC_015943	TCA	2	6	245210	245215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209742
5092	NC_015943	ATC	2	6	245275	245280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209742
5093	NC_015943	TTG	2	6	245288	245293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209742
5094	NC_015943	CGT	2	6	245343	245348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209742
5095	NC_015943	CTT	2	6	245391	245396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209742
5096	NC_015943	CGT	2	6	245451	245456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209742
5097	NC_015943	TCA	2	6	245525	245530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209742
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5100	NC_015943	GAA	2	6	245695	245700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209742
5101	NC_015943	CT	3	6	245782	245787	0 %	50 %	0 %	50 %	344209742
5102	NC_015943	TCG	2	6	245798	245803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209742
5103	NC_015943	GTA	2	6	245878	245883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209742
5104	NC_015943	GTC	2	6	245908	245913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209742
5105	NC_015943	GCTGA	2	10	246014	246023	20 %	20 %	40 %	20 %	344209742
5106	NC_015943	CT	3	6	246028	246033	0 %	50 %	0 %	50 %	344209742
5107	NC_015943	CGA	2	6	246090	246095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209742
5108	NC_015943	TC	3	6	246112	246117	0 %	50 %	0 %	50 %	344209742
5109	NC_015943	TCG	2	6	246131	246136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209742
5110	NC_015943	GC	3	6	246254	246259	0 %	0 %	50 %	50 %	344209742
5111	NC_015943	GAC	2	6	246294	246299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209742
5112	NC_015943	CAT	2	6	246300	246305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209742
5113	NC_015943	GTTCG	2	10	246336	246345	0 %	40 %	40 %	20 %	344209742
5114	NC_015943	GTG	2	6	246396	246401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209742
5115	NC_015943	CCCG	2	8	246444	246451	0 %	0 %	25 %	75 %	344209742
5116	NC_015943	GC	3	6	246455	246460	0 %	0 %	50 %	50 %	344209742
5117	NC_015943	CTG	2	6	246468	246473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209742
5118	NC_015943	GACC	2	8	246514	246521	25 %	0 %	25 %	50 %	344209742
5119	NC_015943	CCA	2	6	246611	246616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209742
5120	NC_015943	TCC	2	6	246714	246719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209742
5121	NC_015943	TCGA	2	8	246802	246809	25 %	25 %	25 %	25 %	344209742
5122	NC_015943	TCCG	2	8	246932	246939	0 %	25 %	25 %	50 %	344209742
5123	NC_015943	CAG	3	9	246960	246968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209742
5124	NC_015943	CTG	2	6	247038	247043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209742
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5126	NC_015943	GA	3	6	247210	247215	50 %	0 %	50 %	0 %	344209742
5127	NC_015943	CGA	2	6	247235	247240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209742
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5134	NC_015943	CAT	2	6	247602	247607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209742
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5146	NC_015943	CGTC	2	8	248385	248392	0 %	25 %	25 %	50 %	344209742
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5151	NC_015943	CCG	2	6	248583	248588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209742
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5153	NC_015943	GCA	2	6	248627	248632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209742
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5182	NC_015943	GTA	2	6	250218	250223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5229	NC_015943	TAC	2	6	252339	252344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5230	NC_015943	TA	3	6	252434	252439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_015943	ATCT	2	8	252449	252456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5232	NC_015943	CAG	2	6	252603	252608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5242	NC_015943	CT	3	6	253080	253085	0 %	50 %	0 %	50 %	344209745
5243	NC_015943	GAC	2	6	253108	253113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209745
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5245	NC_015943	CAG	2	6	253216	253221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209745
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5365	NC_015943	ATCG	2	8	258943	258950	25 %	25 %	25 %	25 %	344209751
5366	NC_015943	GAC	2	6	259018	259023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209751
5367	NC_015943	GTA	2	6	259095	259100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209751
5368	NC_015943	TCA	2	6	259104	259109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209751
5369	NC_015943	CCT	2	6	259203	259208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209751
5370	NC_015943	TCG	2	6	259292	259297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209751
5371	NC_015943	TGG	2	6	259346	259351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209751
5372	NC_015943	TCG	2	6	259373	259378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209751
5373	NC_015943	GAC	2	6	259408	259413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209751
5374	NC_015943	GAC	3	9	259423	259431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209751
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5377	NC_015943	GTC	2	6	259492	259497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209751
5378	NC_015943	GTTCG	2	10	259498	259507	0 %	40 %	40 %	20 %	344209751
5379	NC_015943	TCA	2	6	259545	259550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209751
5380	NC_015943	AGACG	2	10	259608	259617	40 %	0 %	40 %	20 %	344209751
5381	NC_015943	TTC	2	6	259618	259623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209751
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5383	NC_015943	GGC	2	6	259698	259703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5384	NC_015943	GAA	2	6	259742	259747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209752
5385	NC_015943	CGAC	2	8	259886	259893	25 %	0 %	25 %	50 %	344209752
5386	NC_015943	ATG	2	6	259977	259982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209752
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5389	NC_015943	AC	3	6	260032	260037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5390	NC_015943	GCTGT	2	10	260083	260092	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5391	NC_015943	TCC	2	6	260110	260115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5392	NC_015943	TCTG	2	8	260120	260127	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5393	NC_015943	AC	3	6	260222	260227	50 %	0 %	0 %	50 %	344209753
5394	NC_015943	TAGA	2	8	260271	260278	50 %	25 %	25 %	0 %	344209753
5395	NC_015943	TCG	2	6	260336	260341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209753
5396	NC_015943	ACGGC	2	10	260438	260447	20 %	0 %	40 %	40 %	344209753
5397	NC_015943	CACC	2	8	260459	260466	25 %	0 %	0 %	75 %	344209753
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5401	NC_015943	A	6	6	260570	260575	100 %	0 %	0 %	0 %	344209753
5402	NC_015943	TCAG	2	8	260656	260663	25 %	25 %	25 %	25 %	344209753
5403	NC_015943	TGA	2	6	260765	260770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209753
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5405	NC_015943	GACCA	2	10	260854	260863	40 %	0 %	20 %	40 %	344209753
5406	NC_015943	TGG	2	6	260885	260890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209753
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5411	NC_015943	TGA	2	6	261040	261045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209754
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5420	NC_015943	CGG	2	6	261445	261450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209754
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5423	NC_015943	GCT	2	6	261493	261498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5424	NC_015943	TTG	2	6	261556	261561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5443	NC_015943	GTA	2	6	262441	262446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5448	NC_015943	GT	3	6	262697	262702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5449	NC_015943	CGC	2	6	262707	262712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5450	NC_015943	C	6	6	262714	262719	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5451	NC_015943	CAT	2	6	262727	262732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5452	NC_015943	TGC	2	6	262746	262751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5454	NC_015943	GACA	2	8	262824	262831	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5455	NC_015943	CCCAT	2	10	262916	262925	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5456	NC_015943	CGT	2	6	262947	262952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5459	NC_015943	CTG	2	6	263013	263018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5461	NC_015943	GGT	2	6	263086	263091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5462	NC_015943	CTG	2	6	263215	263220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5465	NC_015943	CCA	2	6	263310	263315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5467	NC_015943	TC	3	6	263352	263357	0 %	50 %	0 %	50 %	344209756
5468	NC_015943	GTC	2	6	263364	263369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209756
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5472	NC_015943	GTCG	2	8	263573	263580	0 %	25 %	50 %	25 %	344209756
5473	NC_015943	TCG	2	6	263605	263610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209756
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5477	NC_015943	TCC	2	6	263740	263745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209756
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5482	NC_015943	TGT	2	6	263909	263914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5483	NC_015943	CTG	2	6	264009	264014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5484	NC_015943	GCTC	2	8	264041	264048	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5485	NC_015943	ACA	2	6	264063	264068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5486	NC_015943	CAT	2	6	264118	264123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5487	NC_015943	CTC	2	6	264184	264189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5488	NC_015943	AGG	2	6	264424	264429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209757
5489	NC_015943	CTGA	2	8	264480	264487	25 %	25 %	25 %	25 %	344209757
5490	NC_015943	CAG	2	6	264524	264529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209757
5491	NC_015943	A	6	6	264582	264587	100 %	0 %	0 %	0 %	344209757
5492	NC_015943	GCAG	2	8	264679	264686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5493	NC_015943	CGA	2	6	264812	264817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5494	NC_015943	TCT	2	6	264861	264866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5495	NC_015943	TCA	2	6	264873	264878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5496	NC_015943	CTC	3	9	265015	265023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209758
5497	NC_015943	ACTG	2	8	265086	265093	25 %	25 %	25 %	25 %	344209758
5498	NC_015943	ACGAC	2	10	265103	265112	40 %	0 %	20 %	40 %	344209758
5499	NC_015943	AG	3	6	265147	265152	50 %	0 %	50 %	0 %	344209758
5500	NC_015943	GAC	2	6	265311	265316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209758

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