MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA02

Total Repeats: 4180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015667	AGA	2	6	22810	22815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251583
502	NC_015667	GAG	2	6	22853	22858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251583
503	NC_015667	CCGA	2	8	22860	22867	25 %	0 %	25 %	50 %	336251583
504	NC_015667	CGT	2	6	22923	22928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251583
505	NC_015667	CCA	2	6	22996	23001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251583
506	NC_015667	ACA	2	6	23025	23030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251583
507	NC_015667	CCA	2	6	23066	23071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251583
508	NC_015667	CGG	2	6	23080	23085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251583
509	NC_015667	GTA	2	6	23105	23110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251583
510	NC_015667	CCAT	2	8	23115	23122	25 %	25 %	0 %	50 %	336251583
511	NC_015667	ATG	2	6	23157	23162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251583
512	NC_015667	ACGA	2	8	23177	23184	50 %	0 %	25 %	25 %	336251583
513	NC_015667	CTGG	2	8	23208	23215	0 %	25 %	50 %	25 %	336251583
514	NC_015667	TGA	2	6	23224	23229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251583
515	NC_015667	TCA	2	6	23406	23411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251583
516	NC_015667	CAGC	2	8	23430	23437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
517	NC_015667	CT	3	6	23457	23462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_015667	ATCT	2	8	23489	23496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_015667	TCA	2	6	23515	23520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_015667	TC	3	6	23573	23578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_015667	GTA	2	6	23594	23599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015667	GTA	2	6	23699	23704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251584
523	NC_015667	AAG	2	6	23744	23749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251584
524	NC_015667	GCG	2	6	23773	23778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251584
525	NC_015667	GAT	2	6	23779	23784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251584
526	NC_015667	AGG	2	6	23828	23833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251584
527	NC_015667	GA	3	6	23902	23907	50 %	0 %	50 %	0 %	336251584
528	NC_015667	CCT	3	9	23970	23978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251584
529	NC_015667	GAA	2	6	24007	24012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251584
530	NC_015667	GAG	2	6	24046	24051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251584
531	NC_015667	GCG	2	6	24078	24083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251584
532	NC_015667	TGAG	2	8	24212	24219	25 %	25 %	50 %	0 %	336251584
533	NC_015667	GCA	2	6	24220	24225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251584
534	NC_015667	GGA	2	6	24237	24242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251584
535	NC_015667	CGGA	2	8	24244	24251	25 %	0 %	50 %	25 %	336251584
536	NC_015667	GCG	2	6	24253	24258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251584
537	NC_015667	GCG	2	6	24301	24306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251584
538	NC_015667	CCGG	2	8	24330	24337	0 %	0 %	50 %	50 %	336251584
539	NC_015667	GCCA	2	8	24370	24377	25 %	0 %	25 %	50 %	336251584
540	NC_015667	TG	3	6	24404	24409	0 %	50 %	50 %	0 %	336251584
541	NC_015667	TGAG	2	8	24434	24441	25 %	25 %	50 %	0 %	336251584
542	NC_015667	CTG	2	6	24487	24492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251584
543	NC_015667	GA	3	6	24503	24508	50 %	0 %	50 %	0 %	336251584
544	NC_015667	GGA	2	6	24528	24533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251584
545	NC_015667	GCA	2	6	24625	24630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251584
546	NC_015667	GAT	2	6	24670	24675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251584
547	NC_015667	CAG	3	9	24690	24698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251584
548	NC_015667	GCGGTG	2	12	24713	24724	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	336251584
549	NC_015667	CGG	2	6	24803	24808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251584
550	NC_015667	AGC	2	6	24810	24815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251584
551	NC_015667	GGA	2	6	24816	24821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251584
552	NC_015667	GGTC	2	8	24838	24845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
553	NC_015667	GTAGA	2	10	24851	24860	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015667	TCG	2	6	24884	24889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_015667	CTC	2	6	24972	24977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_015667	CGG	2	6	24998	25003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_015667	CCA	2	6	25035	25040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_015667	CAGC	2	8	25053	25060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
559	NC_015667	CGC	2	6	25106	25111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_015667	GCC	2	6	25113	25118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_015667	TTCG	2	8	25141	25148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_015667	CGAC	2	8	25157	25164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
563	NC_015667	CTGC	3	12	25174	25185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
564	NC_015667	CGGG	2	8	25191	25198	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
565	NC_015667	GCC	2	6	25288	25293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_015667	CCG	2	6	25354	25359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_015667	CGCT	2	8	25395	25402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
568	NC_015667	GC	3	6	25415	25420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_015667	CTCA	2	8	25439	25446	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_015667	GC	3	6	25448	25453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_015667	TCGC	2	8	25456	25463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
572	NC_015667	GCGA	2	8	25488	25495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
573	NC_015667	GC	3	6	25498	25503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_015667	GTCG	2	8	25514	25521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
575	NC_015667	GTC	2	6	25524	25529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_015667	GGC	2	6	25559	25564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015667	GTC	2	6	25691	25696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251585
578	NC_015667	GCAA	2	8	25738	25745	50 %	0 %	25 %	25 %	336251585
579	NC_015667	ACC	2	6	25758	25763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251585
580	NC_015667	GCA	2	6	25882	25887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251585
581	NC_015667	GAA	2	6	25912	25917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251585
582	NC_015667	CGA	2	6	25936	25941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251585
583	NC_015667	AC	3	6	25950	25955	50 %	0 %	0 %	50 %	336251585
584	NC_015667	TCAA	2	8	26001	26008	50 %	25 %	0 %	25 %	336251585
585	NC_015667	GAC	2	6	26027	26032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251585
586	NC_015667	AC	3	6	26046	26051	50 %	0 %	0 %	50 %	336251585
587	NC_015667	CAT	2	6	26215	26220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251585
588	NC_015667	CCTG	2	8	26234	26241	0 %	25 %	25 %	50 %	336251585
589	NC_015667	CAG	3	9	26249	26257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251585
590	NC_015667	GGA	2	6	26283	26288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251585
591	NC_015667	AAG	2	6	26331	26336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251585
592	NC_015667	TGG	2	6	26441	26446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251585
593	NC_015667	GACC	2	8	26491	26498	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
594	NC_015667	CCACC	2	10	26508	26517	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
595	NC_015667	CTCCG	2	10	26518	26527	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
596	NC_015667	GCTC	2	8	26529	26536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
597	NC_015667	TC	3	6	26535	26540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_015667	GC	3	6	26551	26556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_015667	ACA	2	6	26672	26677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_015667	GAA	2	6	26732	26737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251586
601	NC_015667	AGG	2	6	26744	26749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251586
602	NC_015667	GTC	2	6	26767	26772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251586
603	NC_015667	GCT	2	6	26789	26794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251586
604	NC_015667	AG	3	6	26844	26849	50 %	0 %	50 %	0 %	336251586
605	NC_015667	ACT	2	6	26866	26871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251586
606	NC_015667	CAG	2	6	26872	26877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251586
607	NC_015667	AAG	2	6	26962	26967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251586
608	NC_015667	GCC	2	6	27102	27107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251586
609	NC_015667	CAT	2	6	27120	27125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251586
610	NC_015667	GAA	2	6	27156	27161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251586
611	NC_015667	CGA	2	6	27176	27181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251586
612	NC_015667	ACCG	2	8	27194	27201	25 %	0 %	25 %	50 %	336251586
613	NC_015667	CGG	2	6	27249	27254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251586
614	NC_015667	GCA	2	6	27282	27287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251586
615	NC_015667	GTC	2	6	27304	27309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251586
616	NC_015667	ATCA	2	8	27340	27347	50 %	25 %	0 %	25 %	336251586
617	NC_015667	GAA	2	6	27465	27470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251586
618	NC_015667	TCA	2	6	27491	27496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251586
619	NC_015667	GAGC	2	8	27546	27553	25 %	0 %	50 %	25 %	336251586
620	NC_015667	ACT	2	6	27646	27651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015667	TAC	2	6	27695	27700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015667	AG	3	6	27817	27822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015667	GAA	2	6	27852	27857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015667	CGGT	2	8	27867	27874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
625	NC_015667	GGT	2	6	27893	27898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015667	GGT	2	6	27926	27931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015667	GTC	3	9	27943	27951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015667	T	7	7	27955	27961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015667	CGC	2	6	27988	27993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_015667	CTCCG	2	10	28001	28010	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
631	NC_015667	GCTC	2	8	28012	28019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
632	NC_015667	GC	4	8	28032	28039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_015667	TAG	2	6	28074	28079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015667	GCT	2	6	28091	28096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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