MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015666	CCG	2	6	121249	121254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252222
3502	NC_015666	GCCGA	2	10	121393	121402	20 %	0 %	40 %	40 %	336252222
3503	NC_015666	GT	3	6	121480	121485	0 %	50 %	50 %	0 %	336252222
3504	NC_015666	GCG	2	6	121520	121525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252222
3505	NC_015666	CCT	2	6	121532	121537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252222
3506	NC_015666	CAG	2	6	121566	121571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252222
3507	NC_015666	CGT	2	6	121613	121618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252222
3508	NC_015666	GTGA	2	8	121668	121675	25 %	25 %	50 %	0 %	336252222
3509	NC_015666	GAC	2	6	121677	121682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252222
3510	NC_015666	CGA	2	6	121772	121777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252222
3511	NC_015666	AGG	2	6	121808	121813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252222
3512	NC_015666	CGAC	2	8	121816	121823	25 %	0 %	25 %	50 %	336252222
3513	NC_015666	TCG	3	9	121861	121869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252222
3514	NC_015666	GGC	2	6	121892	121897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252222
3515	NC_015666	TCG	2	6	121924	121929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252222
3516	NC_015666	CGG	2	6	121980	121985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252222
3517	NC_015666	GAC	2	6	121992	121997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252222
3518	NC_015666	TTC	2	6	122017	122022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252222
3519	NC_015666	GGC	2	6	122048	122053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252222
3520	NC_015666	GAC	2	6	122085	122090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252222
3521	NC_015666	CCT	2	6	122132	122137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252222
3522	NC_015666	CCT	2	6	122168	122173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252222
3523	NC_015666	CTG	2	6	122256	122261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252222
3524	NC_015666	CTT	2	6	122268	122273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252222
3525	NC_015666	CG	3	6	122279	122284	0 %	0 %	50 %	50 %	336252222
3526	NC_015666	ACC	2	6	122290	122295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252222
3527	NC_015666	GAG	2	6	122320	122325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252222
3528	NC_015666	CTCG	2	8	122346	122353	0 %	25 %	25 %	50 %	336252222
3529	NC_015666	TCG	2	6	122371	122376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252222
3530	NC_015666	TGC	2	6	122380	122385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252222
3531	NC_015666	TCG	2	6	122426	122431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_015666	GAAAC	2	10	122503	122512	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3533	NC_015666	GAACG	2	10	122527	122536	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3534	NC_015666	GGC	2	6	122548	122553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_015666	CCG	2	6	122581	122586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_015666	CCGTG	2	10	122642	122651	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3537	NC_015666	CGA	2	6	122812	122817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252223
3538	NC_015666	CGT	2	6	122848	122853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252223
3539	NC_015666	TCA	2	6	122859	122864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252223
3540	NC_015666	ACG	2	6	122865	122870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252223
3541	NC_015666	GACG	2	8	122899	122906	25 %	0 %	50 %	25 %	336252223
3542	NC_015666	CGC	2	6	122983	122988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252223
3543	NC_015666	TCG	3	9	123039	123047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252223
3544	NC_015666	CTC	2	6	123053	123058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252223
3545	NC_015666	GAC	2	6	123155	123160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252223
3546	NC_015666	CGA	2	6	123175	123180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252223
3547	NC_015666	GGC	2	6	123187	123192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252223
3548	NC_015666	GAAA	2	8	123300	123307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_015666	CCGACG	2	12	123336	123347	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336252224
3550	NC_015666	TGT	2	6	123348	123353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252224
3551	NC_015666	CTG	2	6	123409	123414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252224
3552	NC_015666	CTG	2	6	123418	123423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252224
3553	NC_015666	TTG	2	6	123424	123429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252224
3554	NC_015666	TGT	2	6	123431	123436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252224
3555	NC_015666	ATC	2	6	123443	123448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252224
3556	NC_015666	CGT	2	6	123489	123494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252224
3557	NC_015666	GTC	2	6	123556	123561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252224
3558	NC_015666	TGT	2	6	123668	123673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252224
3559	NC_015666	TCG	2	6	123674	123679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252224
3560	NC_015666	CGC	2	6	123702	123707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252224
3561	NC_015666	GGC	2	6	123746	123751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252224
3562	NC_015666	ACCGC	2	10	123767	123776	20 %	0 %	20 %	60 %	336252224
3563	NC_015666	CGT	2	6	123795	123800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252224
3564	NC_015666	GCC	2	6	123842	123847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252224
3565	NC_015666	CCGGTG	2	12	123854	123865	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336252224
3566	NC_015666	CGGG	2	8	123919	123926	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3567	NC_015666	CGT	2	6	123981	123986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_015666	CGG	2	6	124080	124085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252225
3569	NC_015666	GC	3	6	124165	124170	0 %	0 %	50 %	50 %	336252225
3570	NC_015666	GGCG	2	8	124186	124193	0 %	0 %	75 %	25 %	336252225
3571	NC_015666	CGGCG	2	10	124219	124228	0 %	0 %	60 %	40 %	336252225
3572	NC_015666	CGA	2	6	124240	124245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252225
3573	NC_015666	CAG	2	6	124250	124255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252225
3574	NC_015666	GCC	2	6	124270	124275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252225
3575	NC_015666	ACG	2	6	124287	124292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252225
3576	NC_015666	AGG	2	6	124299	124304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252225
3577	NC_015666	CGA	2	6	124342	124347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252225
3578	NC_015666	CGA	2	6	124402	124407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252225
3579	NC_015666	GAG	2	6	124433	124438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252225
3580	NC_015666	CGC	2	6	124491	124496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252225
3581	NC_015666	CGG	2	6	124518	124523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252225
3582	NC_015666	GTC	3	9	124565	124573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252225
3583	NC_015666	CGC	2	6	124586	124591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252225
3584	NC_015666	GCG	2	6	124618	124623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252225
3585	NC_015666	TCG	2	6	124680	124685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252225
3586	NC_015666	CG	3	6	124703	124708	0 %	0 %	50 %	50 %	336252225
3587	NC_015666	CTG	2	6	124715	124720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252225
3588	NC_015666	GCC	2	6	124753	124758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252225
3589	NC_015666	CAC	2	6	124814	124819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_015666	AGC	2	6	124823	124828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_015666	CGC	2	6	124845	124850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_015666	ATACG	2	10	124860	124869	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3593	NC_015666	CG	3	6	124892	124897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_015666	AACG	2	8	124918	124925	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_015666	TCG	2	6	125024	125029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252226
3596	NC_015666	TCG	3	9	125039	125047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252226
3597	NC_015666	GCC	2	6	125116	125121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252226
3598	NC_015666	TCGT	2	8	125141	125148	0 %	50 %	25 %	25 %	336252226
3599	NC_015666	CGT	2	6	125166	125171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252226
3600	NC_015666	CCG	2	6	125247	125252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252226
3601	NC_015666	GTC	2	6	125269	125274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252226
3602	NC_015666	CCT	2	6	125298	125303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252226
3603	NC_015666	CGG	2	6	125305	125310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252226
3604	NC_015666	GCG	2	6	125325	125330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252226
3605	NC_015666	CGTAGC	2	12	125349	125360	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252226
3606	NC_015666	CGT	2	6	125379	125384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252226
3607	NC_015666	CCG	2	6	125441	125446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_015666	TCG	2	6	125450	125455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_015666	CGA	2	6	125471	125476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_015666	CCG	2	6	125478	125483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_015666	TCGC	2	8	125554	125561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_015666	AGG	2	6	125562	125567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_015666	CGT	2	6	125585	125590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_015666	CGT	2	6	125629	125634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_015666	CAA	2	6	125641	125646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_015666	CGA	2	6	125702	125707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252227
3617	NC_015666	GGACCG	2	12	125735	125746	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252227
3618	NC_015666	ACCT	2	8	125835	125842	25 %	25 %	0 %	50 %	336252227
3619	NC_015666	CGG	2	6	125849	125854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252227
3620	NC_015666	TCG	2	6	125887	125892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252227
3621	NC_015666	GCC	2	6	125909	125914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252227
3622	NC_015666	GAC	2	6	125919	125924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252227
3623	NC_015666	CGT	2	6	125963	125968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252227
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3628	NC_015666	CGG	2	6	126331	126336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252228
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3740	NC_015666	GAC	2	6	130016	130021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252229
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3743	NC_015666	TCG	2	6	130176	130181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252229
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3775	NC_015666	GCG	2	6	131218	131223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3850	NC_015666	TCGAG	2	10	133570	133579	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3851	NC_015666	TCGA	2	8	133621	133628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3852	NC_015666	CGA	2	6	133636	133641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3861	NC_015666	CGA	2	6	133848	133853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252234
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3863	NC_015666	TCC	2	6	133877	133882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252234
3864	NC_015666	ACG	2	6	133898	133903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252234
3865	NC_015666	GAA	2	6	133962	133967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252234
3866	NC_015666	TCC	2	6	133970	133975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252234
3867	NC_015666	GC	3	6	133998	134003	0 %	0 %	50 %	50 %	336252234
3868	NC_015666	GTC	2	6	134044	134049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252234
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3870	NC_015666	CGA	2	6	134190	134195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252234
3871	NC_015666	CGA	2	6	134208	134213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252234
3872	NC_015666	TCG	2	6	134288	134293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252234
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3874	NC_015666	CAAGAC	2	12	134342	134353	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3875	NC_015666	CGA	2	6	134378	134383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252235
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3892	NC_015666	CCT	2	6	134845	134850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252236
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3922	NC_015666	CGA	3	9	135747	135755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252237
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3939	NC_015666	CAC	3	9	136243	136251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3940	NC_015666	GACG	2	8	136252	136259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3941	NC_015666	CGG	2	6	136300	136305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3942	NC_015666	GAC	2	6	136333	136338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252238
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3980	NC_015666	CGG	2	6	137569	137574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252240
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3982	NC_015666	GTC	2	6	137596	137601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252240
3983	NC_015666	TCC	2	6	137654	137659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252240
3984	NC_015666	GCG	2	6	137660	137665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252240
3985	NC_015666	ACG	2	6	137666	137671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252240
3986	NC_015666	GC	4	8	137715	137722	0 %	0 %	50 %	50 %	336252240
3987	NC_015666	GTC	2	6	137761	137766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252240
3988	NC_015666	CGA	2	6	137805	137810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252240
3989	NC_015666	GAA	2	6	137874	137879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252240
3990	NC_015666	GGC	2	6	137907	137912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252240
3991	NC_015666	CCG	2	6	137930	137935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252240
3992	NC_015666	GAG	2	6	137941	137946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252240
3993	NC_015666	CGC	2	6	137958	137963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252240
3994	NC_015666	CTCG	2	8	137976	137983	0 %	25 %	25 %	50 %	336252240
3995	NC_015666	GCG	2	6	138029	138034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252240
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3999	NC_015666	CGA	2	6	138141	138146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252240
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