MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 102813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015666	GAC	2	6	86449	86454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2502	NC_015666	ATC	2	6	86456	86461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252184
2503	NC_015666	TCG	2	6	86538	86543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2504	NC_015666	CGG	2	6	86593	86598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252184
2505	NC_015666	CTA	2	6	86608	86613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252184
2506	NC_015666	ATC	2	6	86630	86635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252184
2507	NC_015666	ACT	2	6	86655	86660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252184
2508	NC_015666	CGA	2	6	86667	86672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2509	NC_015666	CGGCG	2	10	86727	86736	0 %	0 %	60 %	40 %	336252184
2510	NC_015666	GAG	2	6	86774	86779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252184
2511	NC_015666	GCGA	2	8	86786	86793	25 %	0 %	50 %	25 %	336252184
2512	NC_015666	GTC	2	6	86840	86845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2513	NC_015666	CGA	2	6	86863	86868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2514	NC_015666	GTC	2	6	86873	86878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2515	NC_015666	CGT	2	6	86920	86925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2516	NC_015666	CGG	2	6	86926	86931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252184
2517	NC_015666	CAG	2	6	86983	86988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2518	NC_015666	CGA	2	6	87066	87071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2519	NC_015666	GTC	2	6	87083	87088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2520	NC_015666	CTCGCG	2	12	87089	87100	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252184
2521	NC_015666	GTC	3	9	87101	87109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2522	NC_015666	GC	3	6	87132	87137	0 %	0 %	50 %	50 %	336252184
2523	NC_015666	GC	3	6	87147	87152	0 %	0 %	50 %	50 %	336252184
2524	NC_015666	GC	3	6	87192	87197	0 %	0 %	50 %	50 %	336252184
2525	NC_015666	CGC	2	6	87210	87215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252184
2526	NC_015666	CGC	2	6	87223	87228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252184
2527	NC_015666	TCG	2	6	87258	87263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2528	NC_015666	CGA	2	6	87268	87273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2529	NC_015666	CCG	2	6	87297	87302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252184
2530	NC_015666	CGT	2	6	87307	87312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2531	NC_015666	GAC	2	6	87334	87339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2532	NC_015666	CGT	2	6	87352	87357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2533	NC_015666	CGGG	2	8	87391	87398	0 %	0 %	75 %	25 %	336252184
2534	NC_015666	G	6	6	87457	87462	0 %	0 %	100 %	0 %	336252184
2535	NC_015666	GCG	2	6	87468	87473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252184
2536	NC_015666	CGG	2	6	87508	87513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252184
2537	NC_015666	GAC	2	6	87554	87559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2538	NC_015666	GCC	2	6	87579	87584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252184
2539	NC_015666	CGT	2	6	87622	87627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2540	NC_015666	GAG	2	6	87635	87640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252184
2541	NC_015666	TCG	3	9	87642	87650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2542	NC_015666	GCG	2	6	87767	87772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252184
2543	NC_015666	TCG	3	9	87780	87788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2544	NC_015666	CGA	2	6	87790	87795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2545	NC_015666	GAG	2	6	87803	87808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252184
2546	NC_015666	GCG	2	6	87840	87845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252184
2547	NC_015666	GTC	2	6	87851	87856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2548	NC_015666	CGA	2	6	87868	87873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2549	NC_015666	GGC	2	6	87880	87885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252184
2550	NC_015666	CCG	2	6	87935	87940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252184
2551	NC_015666	CCGG	2	8	87978	87985	0 %	0 %	50 %	50 %	336252184
2552	NC_015666	ACG	2	6	88011	88016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2553	NC_015666	GGC	2	6	88027	88032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252184
2554	NC_015666	CGG	3	9	88054	88062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252184
2555	NC_015666	GCC	2	6	88073	88078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252184
2556	NC_015666	CGA	3	9	88102	88110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2557	NC_015666	TCG	2	6	88115	88120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2558	NC_015666	CG	3	6	88145	88150	0 %	0 %	50 %	50 %	336252184
2559	NC_015666	ACCG	2	8	88151	88158	25 %	0 %	25 %	50 %	336252184
2560	NC_015666	CGC	2	6	88246	88251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252184
2561	NC_015666	CAG	2	6	88267	88272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2562	NC_015666	CTG	2	6	88274	88279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2563	NC_015666	GTC	2	6	88280	88285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2564	NC_015666	CTC	2	6	88291	88296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252184
2565	NC_015666	GCT	2	6	88303	88308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252184
2566	NC_015666	CGGT	2	8	88322	88329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2567	NC_015666	CCGACC	2	12	88426	88437	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	336252185
2568	NC_015666	GGC	2	6	88460	88465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252185
2569	NC_015666	ACCG	2	8	88485	88492	25 %	0 %	25 %	50 %	336252185
2570	NC_015666	CGT	2	6	88514	88519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252185
2571	NC_015666	CTC	2	6	88527	88532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252185
2572	NC_015666	TCG	2	6	88540	88545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252185
2573	NC_015666	TCC	2	6	88546	88551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252185
2574	NC_015666	GCCC	2	8	88601	88608	0 %	0 %	25 %	75 %	336252185
2575	NC_015666	GCG	2	6	88610	88615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252185
2576	NC_015666	CTCGTC	2	12	88650	88661	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	336252185
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2579	NC_015666	CTG	2	6	88953	88958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252185
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2581	NC_015666	TCC	2	6	88996	89001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252185
2582	NC_015666	CGT	2	6	89063	89068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252185
2583	NC_015666	CGTCGC	2	12	89075	89086	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252185
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2590	NC_015666	ATC	2	6	89352	89357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252185
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2592	NC_015666	CGG	2	6	89372	89377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252185
2593	NC_015666	TCG	2	6	89380	89385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252185
2594	NC_015666	CGG	2	6	89390	89395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252185
2595	NC_015666	CGT	2	6	89417	89422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252185
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2598	NC_015666	CGAGAC	2	12	89486	89497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252185
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2601	NC_015666	CGA	2	6	89618	89623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252185
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2603	NC_015666	CGA	2	6	89645	89650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252185
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2605	NC_015666	CGA	2	6	89708	89713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252185
2606	NC_015666	CG	3	6	89730	89735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2607	NC_015666	CTC	2	6	89748	89753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252186
2608	NC_015666	TTC	2	6	89761	89766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252186
2609	NC_015666	CTC	2	6	89778	89783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252186
2610	NC_015666	CGCC	2	8	89802	89809	0 %	0 %	25 %	75 %	336252186
2611	NC_015666	CGA	2	6	89811	89816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252186
2612	NC_015666	GAC	3	9	89832	89840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252186
2613	NC_015666	AGA	2	6	89849	89854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252186
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2617	NC_015666	ACC	2	6	89965	89970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252186
2618	NC_015666	CAG	2	6	89976	89981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252186
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2620	NC_015666	CTC	2	6	90063	90068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252186
2621	NC_015666	CGCC	2	8	90144	90151	0 %	0 %	25 %	75 %	336252186
2622	NC_015666	CGA	2	6	90172	90177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252186
2623	NC_015666	GAA	2	6	90183	90188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252186
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2742	NC_015666	CGT	2	6	94191	94196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252190
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2744	NC_015666	CGA	2	6	94281	94286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252190
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2994	NC_015666	CGT	2	6	103589	103594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252202
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2996	NC_015666	CGA	2	6	103622	103627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252202
2997	NC_015666	GTT	2	6	103634	103639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252202
2998	NC_015666	CG	3	6	103680	103685	0 %	0 %	50 %	50 %	336252202
2999	NC_015666	ACG	2	6	103696	103701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252202
3000	NC_015666	GC	3	6	103714	103719	0 %	0 %	50 %	50 %	336252202

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